RNA
Z Wikipedie, otevřené encyklopedie
Ribonukleová kyselina (RNA, česky někdy také RNK) je nukleová kyselina seskládající se z vlákna kovalentně navázaných nukleotidů. Je biochemicky rozlišitelná od DNA, jednak přítomností dodatečné hydroxylové skupiny, připojené ke každé pentózové molekule řetězce, jednak využitím uracilu na místo thyminu. Jednou z nejpodstatnějších funkcí RNA je okopírovat genetickou informaci z DNA (skrze transkripci) a fyzicky ji přenést do místa, kde po té dojde k jejímu přeložení (translaci) na výsledný protein. (přímo tuto funkci však naplňuje pouze jedna třída RNA - mediátorová RNA (mRNA)).
Obsah |
[editovat] Chemická struktura
RNA má čtyři rozdílné báze: adenin (A), guanin (G), cytosin (C), a uracil (U). První tři jsou totožné s těmi, které se nacházejí v DNA, ale uracil v DNA nahrazuje thymin (T) v jeho komplementární funkci k adeninu. Mohlo by to mít odůvodnění v tom, že uracil je energeticky méně nákladný a to i přesto, že snadno dochází k jeho degeneraci na cytosin. Tedy, uracil by byl vhodný pro RNA, kde je množství významné, životnost však nikoliv, kdežto thymin vhodný pro DNA.
Mimo těchto čtyř základních bází se v RNA běžně nachází i množství minoritních bází jako například dihydrouridin (D), pseudouridin (ψ), inosin (I), hypoxantin či 5-methylcytosin (m5C). Také výskyt thyminu není v RNA výjimkou.
[editovat] Srovnání s DNA
V principu má stejnou strukturu jako DNA. Obdobným způsobem je vlákno RNA složeno z nukleotidů. Rozdílem je však přítomnost hydroxylových skupin, které jsou připojené na druhý uhlík pentózového cyklu (ribosa). DNA má v této pozici pouze atom vodíku (deoxyribosa). Hydroxylová skupina činí RNA méně stabilní než DNA vůči bazicky katalyzované hydrolýze.
Rozdílné je již zmíněné zastoupení nukleových bází. V DNA se vyskytuje namísto uracilu nukleová báze thymin (5-methyluracil).
DNA vytváří dlouhou dvoušroubovici (složená ze dvou komplementárních vláken). RNA vytváří relativně kratší jednoduchá vlákna, která se za obvyklých okolností komplementují pouze s DNA a jen za svého vzniku a pak s tRNA v případné proteosyntéze (v některých případech ovšem, má komplementarita dvou molekul RNA i fyziologickou funkci viz: RNAi)
[editovat] Biologická role
RNA v biologii plní několik možných úloh:
- Mediátorová RNA (mRNA anglicky - Messenger RNA) je překládána přímo z genové sekvence DNA (u eukaryot je pak exportována do cytoplazmy) a využita pro přepis na protein.
- tRNA transferová RNA
- rRNA ribozomální RNA
- RNA, podobně jako bílkovinné enzymy, může plnit katalytickou (často autokatalytickou) funkci. Taková RNA se nazývá ribozym. Schopnost RNA nést genetickou informaci a zároveň působit jako katalyzátor biologických reakcí je základem jedné z teorii vzniku života - RNA světa
[editovat] Syntéza RNA
RNA je syntetizovaná enzymy RNA-polymerasami (RNA-poly, RNAP) podle matrice DNA. RNA-polymerasy rozpoznávájí specifické úseky DNA, které označují počátek transkripce (přepis DNA na RNA) - promotory. Zatímco v případě prokaryot jsou veškeré RNA syntetizovány jedinou RNA-polymerasou, u eukaryot se nachází tři základní typy: RNA-polymerasa I, II a III, z nichž každá syntetizuje jiné RNA.
- RNA-poly I syntetizuje rRNA, nachází se převážně v jadérku
- RNA-poly II syntetizuje hnRNA (prekurzor mRNA])
- RNA-poly III syntetizuje tRNA a 5S rRNA
Jednotlivé RNA-poly rozpoznávájí různé promotory. Jejich interakce s protomotory je ovlivněna specifickými proteiny tzv. transkribčními faktory, pomocí kterých dochází k regulaci transkripce.
| Nukleové kyseliny a genetická informace editovat tuto šablonu |
|---|
| Nukleové báze: Purinové: Adenin - Guanin; Pyrimidinové: Thymin - Uracil - Cytosin |
| Nukleosidy: Adenosin - 5-Methyluridin - Uridin - Guanosin - Cytidin - Deoxyadenosin - Thymidin - Deoxyuridin - Deoxyguanosin - Deoxycytidin - Ribosa - Deoxyribosa |
| Nukleotidy: AMP - UMP - GMP - CMP - ADP - UDP - GDP - CDP - ATP - UTP - GTP - CTP - cAMP - cGMP |
| Deoxynukleotidy: dAMP - dTMP - dUMP - dGMP - dCMP - dADP - dTDP - dUDP - dGDP - dCDP - dATP - dTTP - dUTP - dGTP - dCTP |
| Nukleové kyseliny: DNA - RNA - mRNA - ncRNA - rRNA - tRNA - shRNA - mtDNA - miRNA - siRNA - Oligonukleotid - Z-DNA |
| Genetická informace: Genom - Gen - Genetický kód - Kodón - Triplet - Ribozym - Epigenetika - RNA interference |
| Analogy nukleových kyselin: PNA - LNA |

