Nukleová báze

Z Wikipedie, otevřené encyklopedie
Skočit na: Navigace, Hledání
Párování komplementárních bází - zde G a C

Nukleová báze jsou základní součástí nukleových kyselin. Dělí se na báze purinové (adenin, guanin) a báze pyrimidinové (cytosin, uracil, thymin).

Vytvářejí doplňkové dvojice (komplementární páry, zkratka bp), v nichž se typicky vždy 1 purinová a 1 pyrimidinová báze vzájemně vážou vodíkovými vazbami (tzv. komplementarita bází). Guanin se váže s cytosinem a adenin s thyminem nebo s uracilem. Tvoří kód k zápisu genetické informace. Komplementární párování pak umožňuje tuto informaci realizovat při procesech replikace, transkripce a translace.

Galerie[editovat | editovat zdroj]

Chemical structure of adenine
Adenin
Chemical structure of guanine
Guanin
Chemical structure of thymine
Thymin
Chemical structure of cytosine
Cytosin
Chemical structure of uracil
Uracil

Počet bází v genomu[editovat | editovat zdroj]

Genom daného organizmu má poměrně stálý počet komplementárních párů bází (bp). Udává se často v kilobázích (resp. kbp - kilobase pair, tedy 1000 bp), megabázích (resp. Mbp - megabase pair, tedy milion bp) či gigabázích (resp. Gbp - gigabase pair, tedy miliarda bp).

Modifikované báze[editovat | editovat zdroj]

Příklad modifikace bází v tRNA, která obsahuje nejvíce variant nukleových bází. Zde tRNAAla ze S. cerevisiae

Kromě základních pěti bází je známo více než 100 modifikovaných bází.[1] Nejběžnější z nich tvoří následující nukleosidy:

Nejčastější modifikované purinové báze

Nukleová báze Chemical structure of hypoxanthine
Hypoxanthin
Chemical structure of xanthine
Xanthin
Chemical structure of 7-methylguanine
7-Methylguanin
Odpovídající nukleosid Chemical structure of inosine
Inosin
I
Chemical structure of xanthosine
Xanthosin
X
Chemical structure of 7-methylguanosine
7-Methylguanosin
m7G

Nejčastější modifikované pyrimidinové báze

Nukleová báze' Chemical structure of dihydrouracil
Dihydrouracil
Chemical structure of 5-methylcytosine
5-methylcytosin
Chemical structure of 5-hydroxymethylcytosine
5-hydroxymethylcytosin
Odpovídající nukleosid Chemical structure of dihydrouridine
Dihydrouridin
D
Chemical structure of 5-methylcytidine
5-Methylcytidin
m5C

Nepřirozené báze[editovat | editovat zdroj]

Vědcům se podařilo syntetizovat již mnoho kandidátů na nepřirozené nukleové báze, jen naprostá menšina z nich je však skutečně replikovatelná DNA polymerázami a ještě menší počet umožňuje transkripci do RNA. Pouze u jediného umělého páru nukleových bází byla dosud prokázána in vivo funkční ekvivalence s přirozenými páry (cytosin-guanin, adenin-thymin). Jedná se o báze "5SICS" a "NaM" (jako deoxynukleotidy značeny d5SICS resp. dNaM), které nejsou odvozeny z purinu a pyrimidinu, ale obě obsahují dva kondenzované aromatické cykly.

Podrobnější informace naleznete v článku Párování bází#Nepřirozené páry bází.

Reference[editovat | editovat zdroj]

  1. CANTARA, W. A., Crain, P. F.; Rozenski, J.; McCloskey, J. A.; Harris, K. A.; Zhang, X.; Vendeix, F. A. P.; Fabris, D.; Agris, P. F. The RNA modification database, RNAMDB: 2011 update. Nucleic Acids Research. 2010-11-10, roč. 39, čís. Database, s. D195–D201. DOI:10.1093/nar/gkq1028.  
  2. a b c Scientists identify seventh and eighth bases of DNA, PhysOrg podle Science, 21. 7. 2011 (anglicky)