Dihydrouridin

Z Wikipedie, otevřené encyklopedie
Skočit na: Navigace, Hledání
Dihydrouridin
Chemická struktura dihydrouridinu
Registrační číslo CAS 5627-05-4
Sumární vzorec C9H14N2O6
Systematický název 5,6-dihydrouridin
Molární hmotnost 246,217  g/mol

Dihydrouridin (5,6-dihydrouracil, zkratka: D) je pyrimidin vznikají redukcí uracilu přidáním dvou molekul vodíku. Dihydrouridin se běžně vyskytuje v tRNA a rRNA. Molekula dihydrouridinu není na rozdíl od běžných bází planární (v rovině), a ruší patrové interakce (stacking), takže destabilizuje strukturu RNA. Dihydrouridin také ve svém 5' okolí stabilizuje C2'-endo konformaci ribózy, která je více flexibilní, než konformace C3’-endo. Má tedy opačný efekt, než pseudouridin a 2’-O-metylace.[1]

Dihydrouridin se v tRNA vyskytuje v D-smyčce, která zaujímá správné prostorové uspořádání pouze tehdy, když je příslušný uridin redukován na dihydrouracil enzymem dihydrouridin syntázou, která má vyšší afinitu právě pro nesprávně uspořádanou tRNA.[2]

U řady psychrofilů (organismy žijící v nižších teplotách) bylo nalezeno vyšší zastoupení dihydrouracilu v molekulách RNA, což zajišťuje jejich vyšší pohyblibovost v nízkých teplotách.[3]

Reference[editovat | editovat zdroj]

V tomto článku byl použit překlad textu z článku Dihydrouridine na anglické Wikipedii.

  1. DALLUGE, J.. Conformational flexibility in RNA: the role of dihydrouridine. Nucleic Acids Research. 1996, roč. 24, čís. 6, s. 1073–1079. DOI:10.1093/nar/24.6.1073.  
  2. YU, F., Tanaka, Y.; Yamashita, K.; Suzuki, T.; Nakamura, A.; Hirano, N.; Suzuki, T.; Yao, M.; Tanaka, I. Molecular basis of dihydrouridine formation on tRNA. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2011-11-28, roč. 108, čís. 49, s. 19593–19598. DOI:10.1073/pnas.1112352108.  
  3. DALLUGE, JJ.; HAMAMOTO, T.; HORIKOSHI, K., et al. Posttranscriptional modification of tRNA in psychrophilic bacteria.. J Bacteriol. Mar 1997, roč. 179, čís. 6, s. 1918-23. PMID 9068636.  

Související články[editovat | editovat zdroj]