Z-DNA
Z Wikipedie, otevřené encyklopedie
Z-DNA je jedna z mnoha možných dvojitě zakroucených struktur DNA. Jedná se o levotočivý útvar, ve kterém se šroubovice stáčí vlevo (na rozdíl od běžnější B-DNA, jejíž šroubovice se stáčí doprava) podle "cik-cak" vzoru. Společně s A-DNA a B-DNA je Z-DNA uznávána za jednu ze tří biologicky činných dvojitě zakroucených struktur.
Obsah |
[editovat] Historie
Z-DNA byla první objasněná krystalická struktra DNA molekuly. Tento objev učinili Andrew Wang, Alexander Rich a jejich spolupracovníci v roce 1979 v MIT. Pokusná krystalizace z B- na Z-DNA spojení v roce 2005 umožnila lepší pochopení úlohy, kterou hraje Z-DNA pro buňky.
V roce 2007 byla RNA varianta Z-DNA popsána jako transformace A-RNA dvojité šroubovice na dvojitou levotočivou šroubovici.
[editovat] Struktura
Z-DNA je poměrně odlišná od pravotočivých forem. Ve skutečnosti se Z-DNA často porovnává s B-DNA pro pochopení největších rozdílů. Jak již bylo řečeno, šroubovice Z-DNA je levotočivá a její struktura se opakuje vždy po dvou základních párech. Majoritní a minoritní rýhování na rozdíl od A- a B-DNA vykazuje rozdílnou šířku. Z-DNA může vytvořit spojení s B-DNA ve struktuře, která umožňuje extruzi základního páru.
[editovat] Předpovídání Z-DNA struktury
Je možné předem určit pravděpodobnost, s jakou DNA sekvence zformuje Z-DNA strukturu. Algoritmus pro výpočet náchylnosti reformace z B- na Z- formu, ZHunt, byl vytvořen doktorem P. Shing Ho v roce 1984 v MIT. Tento algoritmus později vyvíjeli Tracy Camp, P. Christoph Champ, Sandor Maurice, a Jeffrey M. Vargason v čele s P. Shing Ho pro použití k mapování genetických informací uložených v Z-DNA.
[editovat] Biologický význam
Ačkoli definitivní bilogický význam Z-DNA nebyl stanoven, usuzuje se, že jejím účelem je zajišťovat podporu transkripce DNA. Potenciál pro zformování Z-DNA formace také koreluje s regiony aktivní transkripce.
[editovat] Porovnání sestavení některých form DNA
| Atribut | A-forma | B-forma | Z-forma |
| Točivá tendence šroubovice | pravotočivá | pravotočivá | levotočivá |
| Opakování | po každém páru | po každém páru | po každých dvou párech |
| Otočení po každém opakování | 33.6° | 35.9° | 60°/2 páry |
| Průměrný počet párů na jedno otočení šroubovice | 10,7 | 10 | 12 |
| Sklon páru k ose | ~+19° | ~-1,2° | ~-9° |
| Vzestup vůči ose na jeden pár | 2,3 Å (0,23 nm) | 3,32 Å (0,332 nm) | 3,8 Å (0,38 nm) |
| Průměr | 26 Å (2,6 nm) | 20 Å (2,0 nm) | 18 Å (1,8 nm) |
