Ministerstvo financí sídlí v Praze, přičemž hlavní budova (včetně vedení úřadu) se nachází na adrese Letenská 525/15 na Malé Straně v Praze 1. Vnitřní členění úřadu na odborné sekce, odbory a oddělení určuje organizační řád. Vedle samotného ministerstva spadá do resortu také řada samostatných podřízených úřadů a státních podniků.
Podrobná organizační struktura Ministerstva financí (stav k 05/2026)
Ministerstvo financí
Vedení ministerstva financí ČR (Ministr a nejbližší aparát)
sekce 02 - ICT a projektové řízení
odbor 13 - Hospodářská správa
oddělení 1301 - Ekonomické a investiční
oddělení 1302 – Závodní kuchyně
oddělení 1303 - Provozní činnosti
oddělení 1304 - Podatelna a správní archiv
oddělení 1305 – Správa a údržba budov
oddělení 1306 – Autoprovoz
oddělení 1307 - Dětská skupina
odbor 59 - Provoz ICT
oddělení 5901 - Provoz a uživatelská podpora IS
oddělení 5902 - Provoz infrastruktury a uživatelská podpora
oddělení 5903 - Informační podpora a knihovna
odbor 70 - Řízení rozvoje ICT
oddělení 7001 - Rozvoj a provoz Státní pokladny
oddělení 7002 - Informační sysémy
oddělení 7003 - Strategické a projektové řízení
samostatné oddělení 9006 - Finanční řízení a smluvní zajištění ICT
sekce 03 - Právní a majetek státu
odbor 29 - Legislativní
oddělení 2901 - Vnitřní legislativa
oddělení 2902 - Vnější legislativa
odbor 41 - Právní služby
oddělení 4101 - Právní zastupování a poradenství
oddělení 4102 - Náhradové agendy
odbor 72 - Státní majetek
oddělení 7201 - Právní podpora a majetkové
oddělení 7202 - Metodický dohled a schvalování právního jednání při hospodaření s majetkem státu
oddělení 7203 - Převody majetku státu a zabezpečení schvalovacího procesu při privatizaci
oddělení 7204 - Prodej majetku, správa majetkových účastí a ostatních aktiv
oddělení 7205 - Schvalování dispozic s majetkem státu
odbor 78 – Mezinárodní arbitráže
oddělení 7801 - Mezinárodní arbitráže a ochrana zahraničních investic
odbor 79 - Strategické společnosti a ekologické závazky
oddělení 7901 - Kontrola a realizace ekologických závazků
oddělení 7902 - Podpora energetických společností
oddělení 7903 - Podpora exportu a společnosti strategického významu
oddělení 7904 - Podpora podnikání a investic
sekce 04 - Finanční řízení a audit
odbor 17 - Kontrola
oddělení 1701 - Přezkum hospodaření: Centrální pracoviště
oddělení 1702 – Přezkum hospodaření: Regionální pracoviště I.
oddělení 1703 – Přezkum hospodaření: Regionální pracoviště II.
oddělení 1704 - Veřejnosprávní kontrola: Centrální pracoviště
oddělení 1705 – Veřejnosprávní kontrola: Regionální pracoviště I.
oddělení 1706 - Veřejnosprávní kontrola: Regionální pracoviště II.
oddělení 1707 – Veřejnosprávní kontrola: Regionální pracoviště III.
odbor 47 - Centrální harmonizační jednotka
oddělení 4701 - Harmonizace interního auditu
oddělení 4702 - Harmonizace finančního řízení a dalších agend
oddělení 4703 - Centrální kontaktní bod AFCOS
sekce 07 - Evropská unie, mezinárodní vztahy a finanční trhy
odbor 27 - Mezinárodní vztahy
oddělení 2701 - Bilaterální vztahy a protokoly
oddělení 2702 - Mezinárodní organizace
odbor 35 - Finanční trhy I
oddělení 3501 - Bankovnictví
oddělení 3502 - Kapitálový trh
odbor 36 - Finanční trhy II
oddělení 3601 - Pojišťovnictví
oddělení 3602 - Metodika finančního trhu
odbor 53 - Záležitosti Evropské unie
oddělení 5301 - Koordinace záležitostí EU a hospodářské politiky
oddělení 5302 - Rozpočet EU
oddělení 5303 - Evropské a mezinárodní právo
odbor 55 - Evropské fondy
oddělení 5501 - Metodika finančního řízení a plateb
oddělení 5502 - Certifikace
oddělení 5503 - Účetnictví a finanční informace
oddělení 5504 - Právní
oddělení 5505 - Certifikace FM EHP/Norska
oddělení 5506 - Certifikace a akreditace
odbor 58 - Mezinárodní vztahy
oddělení 5801 - Centrum pro zahraniční pomoc
oddělení 5802 - Mezinárodní finanční spolupráce a zahraniční pohledávky
oddělení 5803 - Mezinárodní finanční instituce a rozvojová spolupráce
oddělení 5804 - Národní koordinace finančních mechanismů
oddělení 5805 – Centrální finanční a kontraktační jednotka
sekce 08 - Státní tajemník
odbor 23 - Finanční
oddělení 2301 - Rozpočet resortu a správa programů kapitoly
oddělení 2302 - Metodika vybraných ekonomických procesů
oddělení 2303 - Evidence majetku a pokladní služba
oddělení 2304 - Centrální účtárna
odbor 30 - Personální
oddělení 3001 - Vzdělávání
oddělení 3002 - Nábor a personální
oddělení 3003 - Systemizace a PIS
oddělení 3004 - Platové a hodnocení
odbor 66 - Veřejné zakázky
oddělení 6601 - Právní a metodické
oddělení 6602 - Zadávání veřejných zakázek
samostatné oddělení 9004 - Kancelář státního tajemníka