Pseudomonas: Porovnání verzí

Z Wikipedie, otevřené encyklopedie
Interaktivně procházet historii
← Přejít na předchozí porovnáníPřejít na další porovnání →
Smazaný obsah Přidaný obsah
VizuálníWikitext
fix
částečně překlad z en, částečně dle Medical Microbiology
Řádek 1: Řádek 1:
{{Taxobox
{{ve výstavbě}}
| jméno= ''Pseudomonas''
'''''Pseudomonas''''' je rod [[gramnegativní]]ch [[bakterie|bakterií]] ze skupiny [[Gammaproteobacteria]]. Z hlediska medicíny je významný druh ''[[Pseudomonas aeruginosa|P. aeruginosa]]''.
| barva = lightgrey
| obrázek = Pseudomonas aeruginosa 01.jpg
| šířka obrázku = 280px
| popis obrázku = ''[[Pseudomonas aeruginosa|P. aeruginosa]]'' na živném médiu
| doména = [[bakterie]] (Bacteria)
| oddělení = [[Proteobacteria]]
| třída = [[Gamma Proteobacteria]]
| řád = [[Pseudomonadales]]
| čeleď = [[Pseudomonadaceae]]
| rod = '''''Pseudomonas'''''
| druhotné dělení = Druhy
| podřazené taxony =
'''skupina ''P. aeruginosa'''''
:''[[Pseudomonas aeruginosa|P. aeruginosa]]''
:''[[Pseudomonas alcaligenes|P. alcaligenes]]''
:''[[Pseudomonas anguilliseptica|P. anguilliseptica]]''
:''[[Pseudomonas argentinensis|P. argentinensis]]''
:''[[Pseudomonas borbori|P. borbori]]''
:''[[Pseudomonas citronellolis|P. citronellolis]]''
:''[[Pseudomonas flavescens|P. flavescens]]''
:''[[Pseudomonas mendocina|P. mendocina]]''
:''[[Pseudomonas nitroreducens|P. nitroreducens]]''
:''[[Pseudomonas oleovorans|P. oleovorans]]''
:''[[Pseudomonas pseudoalcaligenes|P. pseudoalcaligenes]]''
:''[[Pseudomonas resinovorans|P. resinovorans]]''
:''[[Pseudomonas straminea|P. straminea]]''
'''Skupina ''P. chlororaphis'''''
:''[[Pseudomonas aurantiaca|P. aurantiaca]]''
:''[[Pseudomonas aureofaciens|P. aureofaciens]]''
:''[[Pseudomonas chlororaphis|P. chlororaphis]]''
:''[[Pseudomonas fragi|P. fragi]]''
:''[[Pseudomonas lundensis|P. lundensis]]''
:''[[Pseudomonas taetrolens|P. taetrolens]]''
''' Skupina ''P. fluorescens'''''
:''[[Pseudomonas antarctica|P. antarctica]]''
:''[[Pseudomonas azotoformans|P. azotoformans]]''
:''[[Pseudomonas blatchfordae|'P. blatchfordae']] ''
:''[[Pseudomonas brassicacearum|P. brassicacearum]]''
:''[[Pseudomonas brenneri|P. brenneri]]''
:''[[Pseudomonas cedrina|P. cedrina]]''
:''[[Pseudomonas corrugata|P. corrugata]]''
:''[[Pseudomonas fluorescens|P. fluorescens]]''
:''[[Pseudomonas gessardii|P. gessardii]]''
:''[[Pseudomonas libanensis|P. libanensis]]''
:''[[Pseudomonas mandelii|P. mandelii]]''
:''[[Pseudomonas marginalis|P. marginalis]]''
:''[[Pseudomonas mediterranea|P. mediterranea]]''
:''[[Pseudomonas meridiana|P. meridiana]]
:''[[Pseudomonas migulae|P. migulae]]''
:''[[Pseudomonas mucidolens|P. mucidolens]]''
:''[[Pseudomonas orientalis|P. orientalis]]''
:''[[Pseudomonas panacis|P. panacis]]''
:''[[Pseudomonas proteolytica|P. proteolytica]]''
:''[[Pseudomonas rhodesiae|P. rhodesiae]]''
:''[[Pseudomonas synxantha|P. synxantha]]''
:''[[Pseudomonas thivervalensis|P. thivervalensis]]''
:''[[Pseudomonas tolaasii|P. tolaasii]]''
:''[[Pseudomonas veronii|P. veronii]]''
'''Skupina ''P. pertucinogena'''''
:''[[Pseudomonas denitrificans|P. denitrificans]]''
:''[[Pseudomonas pertucinogena|P. pertucinogena]]''
'''Skupina ''P. putida'''''
:''[[Pseudomonas cremoricolorata|P. cremoricolorata]]''
:''[[Pseudomonas fulva|P. fulva]]''
:''[[Pseudomonas monteilii|P. monteilii]]''
:''[[Pseudomonas mosselii|P. mosselii]]''
:''[[Pseudomonas oryzihabitans|P. oryzihabitans]]''
:''[[Pseudomonas parafulva|P. parafulva]]''
:''[[Pseudomonas plecoglossicida|P. plecoglossicida]]''
:''[[Pseudomonas putida|P. putida]]''
'''Skupina ''P. stutzeri'''''
:''[[Pseudomonas balearica|P. balearica]]''
:''[[Pseudomonas luteola|P. luteola]]''
:''[[Pseudomonas stutzeri|P. stutzeri]]''
'''Skupina ''P. syringae'''''
:''[[Pseudomonas amygdali|P. amygdali]]''
:''[[Pseudomonas avellanae|P. avellanae]]''
:''[[Pseudomonas caricapapayae|P. caricapapayae]]''
:''[[Pseudomonas cichorii|P. cichorii]]''
:''[[Pseudomonas coronafaciens|P. coronafaciens]]''
:''[[Pseudomonas ficuserectae|P. ficuserectae]]''
:''[[Pseudomonas helianthi|'P. helianthi']]''
:''[[Pseudomonas meliae|P. meliae]]''
:''[[Pseudomonas savastanoi|P. savastanoi]]''
:''[[Pseudomonas syringae|P. syringae]]''
:''[[Pseudomonas tomato|'P. tomato']]''
:''[[Pseudomonas viridiflava|P. viridiflava]]''
''[[incertae sedis]]''
:''[[Pseudomonas abietaniphila|P. abietaniphila]]''
:''[[Pseudomonas acidophila|P. acidophila]]''
:''[[Pseudomonas agarici|P. agarici]]''
:''[[Pseudomonas alcaliphila|P. alcaliphila]]''
:''[[Pseudomonas alkanolytica|P. alkanolytica]]''
:''[[Pseudomonas amyloderamosa|P. amyloderamosa]]''
:''[[Pseudomonas asplenii|P. asplenii]]''
:''[[Pseudomonas azotifigens|P. azotifigens]]''
:''[[Pseudomonas cannabina|P. cannabina]]''
:''[[Pseudomonas coenobios|P. coenobios]]''
:''[[Pseudomonas congelans|P. congelans]]''
:''[[Pseudomonas costantinii|P. costantinii]]''
:''[[Pseudomonas cruciviae|P. cruciviae]]''
:''[[Pseudomonas delhiensis|P. delhiensis]]''
:''[[Pseudomonas excibis|P. excibis]]''
:''[[Pseudomonas extremorientalis|P. extremorientalis]]''
:''[[Pseudomonas frederiksbergensis|P. frederiksbergensis]]''
:''[[Pseudomonas fuscovaginae|P. fuscovaginae]]''
:''[[Pseudomonas gelidicola|P. gelidicola]]''
:''[[Pseudomonas grimontii|P. grimontii]]''
:''[[Pseudomonas indica|P. indica]]''
:''[[Pseudomonas jessenii|P. jessenii]]''
:''[[Pseudomonas jinjuensis|P. jinjuensis]]''
:''[[Pseudomonas kilonensis|P. kilonensis]]''
:''[[Pseudomonas knackmussii|P. knackmussii]]''
:''[[Pseudomonas koreensis|P. koreensis]]''
:''[[Pseudomonas lini|P. lini]]''
:''[[Pseudomonas lutea|P. lutea]]''
:''[[Pseudomonas moraviensis|P. moraviensis]]''
:''[[Pseudomonas otitidis|P. otitidis]]''
:''[[Pseudomonas pachastrellae|P. pachastrellae]]''
:''[[Pseudomonas palleroniana|P. palleroniana]]''
:''[[Pseudomonas papaveris|P. papaveris]]''
:''[[Pseudomonas peli|P. peli]]''
:''[[Pseudomonas perolens|P. perolens]]''
:''[[Pseudomonas poae|P. poae]]''
:''[[Pseudomonas pohangensis|P. pohangensis]]''
:''[[Pseudomonas psychrophila|P. psychrophila]]''
:''[[Pseudomonas psychrotolerans|P. psychrotolerans]]''
:''[[Pseudomonas rathonis|P. rathonis]]
:''[[Pseudomonas reptilivora|P. reptilivora]]''
:''[[Pseudomonas resiniphila|P. resiniphila]]''
:''[[Pseudomonas rhizosphaerae|P. rhizosphaerae]]''
:''[[Pseudomonas rubescens|P. rubescens]]''
:''[[Pseudomonas salomonii|P. salomonii]]''
:''[[Pseudomonas segitis|P. segitis]]''
:''[[Pseudomonas septica|P. septica]]''
:''[[Pseudomonas simiae|P. simiae]]''
:''[[Pseudomonas suis|P. suis]]''
:''[[Pseudomonas thermotolerans|P. thermotolerans]]''
:''[[Pseudomonas tremae|P. tremae]]''
:''[[Pseudomonas trivialis|P. trivialis]]''
:''[[Pseudomonas turbinellae|P. turbinellae]]''
:''[[Pseudomonas tuticorinensis|P. tuticorinensis]]''
:''[[Pseudomonas umsongensis|P. umsongensis]]''
:''[[Pseudomonas vancouverensis|P. vancouverensis]]''
:''[[Pseudomonas vranovensis|P. vranovensis]]''
:''[[Pseudomonas xanthomarina|P. xanthomarina]]''
}}
'''''Pseudomonas''''' (též '''pseudomonáda''') je rod [[gramnegativní]]ch [[bakterie|bakterií]] ze skupiny [[Gammaproteobacteria]]. V přírodě jsou velice hojné a díky své přizpůsobivosti osídlují velmi rozmanitá stanoviště. Některé druhy způsobují i onemocnění rostlin a živočichů včetně člověka. Co se týše vlastností, jsou pohyblivé a [[tyčinky (bakterie)|tyčinkovitého]] tvaru, obvykle [[aerobní]] a netvořící [[spora (bakterie)|spory]].


V nedávně době proběhla revize tohoto a dalších příbuzných rodů pomocí analýzy genů pro 16S [[rRNA]].<ref name="Anzai2000">{{cite journal |author=Anzai Y, Kim H, Park, JY, Wakabayashi H |title=Phylogenetic affiliation of the pseudomonads based on 16S rRNA sequence |journal=Int J Syst Evol Microbiol |volume=50 |issue= |pages=1563–89 |year=2000 |pmid=10939664}}</ref> Některé druhy, dříve řazené k rodům ''[[Chryseomonas]]'' a ''[[Flavimonas]]'', jsou dnes řazeny mezi pseudomonády,<ref>{{cite journal |title=The phylogeny of the genera ''Chryseomonas'', ''Flavimonas'', and ''Pseudomonas'' supports synonymy of these three genera |journal=Int J Syst Bacteriol |volume=47 |issue=2 |pages=249–51 |year=1997 |pmid=9103607 |unused_data=Anzai, ''et al.'' }}</ref> a naopak, jisté druhy původně považované za pseudomonády dnes vědci spíše řadí do rodů ''[[Burkholderia]]'' či ''[[Ralstonia]]''.
{{pahýl - mikrobiologie}}


==Historie výzkumu==
[[Kategorie:Gammaproteobacteria]]
''Pseudomonad'' doslova v překladu znamená „zdánlivá jednotka“ a pochází z řeckých slov ''pseudo'' (''ψευδο'' – zdánlivý, falešný) a ''monas'' (''μονάς'' či ''μονάδα'' – jednotka, jednotlivina). Termín monáda se používal dříve v přírodovědě pro jednobuněčné organizmy, které první mikrobiologové spatřili pod mikroskopem.

Bakterie rodu ''Pseudomonas'' jsou v přírodě velmi hojné a vyskytují se například ve vodě či uvnitř tě rostlin, a proto byly objeveny již prvními mikrobiology. Rodový název ''Pseudomonas'' byl nejprve v roce 1894 definován poměrně volně jako označení pro [[gramnegativní]] [[tyčinky (bakterie)|tyčinkovité]] bakterie s polárním [[bičík]]em. Vbrzku začalo množství druhů narůstat, neboť byly pseudomonády nacházeny v nejrůznějších prostředích. Až použití nových metod umožnilo vytvoření modernější klasifikace.<ref name=Cornelis>{{cite book | author=Cornelis P (editor) | title=Pseudomonas: Genomics and Molecular Biology | edition=1st | publisher=Caister Academic Press | year=2008 | url=http://www.horizonpress.com/pseudo | id=[http://www.horizonpress.com/pseudo ISBN 978-1-904455-19-6] }}</ref> Po roce 2000 byly přečteny kompletní genomy několika kmenů bakterií z rodu ''Pseudomonas'': např. ''[[P. aeruginosa|P. aeruginosa]]'' kmen PAO1, ''[[P. putida|P. putida]]'' kmen KT2440, ''[[P. fluorescens|P. fluorescens]]'' kmen Pf-5, ''[[P. syringae|P. syringae]]'' [[patovar]] tomato DC3000, ''P. syringae'' patovar ''syringae'' B728a, ''P. syringae'' patovar ''phaseolica'' 1448A, ''P. fluorescens'' PfO-1 a ''[[P. entomophila|P. entomophila]]'' L48.<ref name="Cornelis"/>

==Popis==
Pro rod ''Pseudomonas'' jsou podle [[Bergey's Manual of Systematic Bacteriology|Bergeyho manuálu]] typické následující vlastnosti:<ref name=Bergey_1984>{{cite book | last = Krieg | first = Noel | title = Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, Volume 1 | publisher = Williams & Wilkins | location = Baltimore | year = 1984 | isbn = 0683041088 }}</ref>
* [[tyčinky (bakterie)|tyčinkovitý tvar]]
* [[gramnegativita]]
* jeden nebo více polárních [[bičík]]ů, umožňujících pohyb
* [[aerobní]] metabolismus (spotřebovávající [[kyslík]])
* netvoří [[spora (bakterie)|spory]] (nesporuluje)
* při [[kataláza|katalázovém]] testu jsou [[kataláza-pozitivní]]

Dalšími poměrně typickými rysy pseudomonád je (až na výjimky) vylučování [[pyoverdin]]u (fluoresceinu), žlutozelené [[fluorescence|fluorescenční]] látky, které umožňuje bakteriím získávat železo v prostředí chudém na tento prvek (tzv. [[siderofor]]).<ref name=Meyer_2002>{{cite journal | author = Meyer JM, Geoffroy VA, Baida N, ''et al.'' | title = Siderophore typing, a powerful tool for the identification of fluorescent and nonfluorescent pseudomonads | journal = Appl. Environ. Microbiol. | volume = 68 | issue = 6 | pages = 2745–53 | year = 2002 | pmid = 12039729 | doi = 10.1128/AEM.68.6.2745-2753.2002| accessdate = 2007-05-27}}</ref> K dalším vylučovaným sideroforním látkám patří [[pyocyanin]] u ''[[Pseudomonas aeruginosa]]''<ref name=Lau_2004>{{cite journal | author = Lau GW, Hassett DJ, Ran H, Kong F | title = The role of pyocyanin in Pseudomonas aeruginosa infection | journal = Trends in molecular medicine | volume = 10 | issue = 12 | pages = 599–606 | year = 2004 | pmid = 15567330 | doi = 10.1016/j.molmed.2004.10.002 | accessdate = 2007-05-27}}</ref> a [[thiochinolobaktin]] u ''[[Pseudomonas fluorescens]]''.<ref name=Matthijs_2007>{{cite journal | author = Matthijs S, Tehrani KA, Laus G, Jackson RW, Cooper RM, Cornelis P | title = Thioquinolobactin, a Pseudomonas siderophore with antifungal and anti-Pythium activity | journal = Environ. Microbiol. | volume = 9 | issue = 2 | pages = 425–34 | year = 2007 | pmid = 17222140 | doi = 10.1111/j.1462-2920.2006.01154.x | accessdate = 2007-05-27}}</ref> Obvykle jsou pseudomonády pozitivní při [[oxidáza|oxidázovém]] testu, bývají beta-[[hemolýza|hemolytické]] (na [[krevní agar|krevním agaru]]), [[indol]] negativní, při aplikaci [[methylová červeň|methylové červeni]] i při [[Voges–Proskauer|Voges–Proskauerovu testu]] jsou negativní, ale zase jsou [[citrát]]–pozitivní.

V rámci rodu je možné pozorovat velkou metabolickou rozmanitost, což umožňuje těmto bakteriím usídlovat široké rozpětí různýh prostředí.<ref name=Brock>{{cite book | author = Madigan M; Martinko J (editors). | title = Brock Biology of Microorganisms | edition = 11th | publisher = Prentice Hall | year = 2005 | isbn = 0131443291 }}</ref> Snadná kultivace ve skle (''[[in vitro]]'') a dostupnost přečtených genomů z nich činí výborné modelové organizmy pro vědecký výzkum; nejčastěji se zkoumá ''P. aeruginosa'' jako významný lidský patogen, ''[[Pseudomonas syringae|P. syringae]]'' jako patogen rostlin, půdní bakterie ''[[Pseudomonas putida|P. putida]]'' a ''[[P. fluorescens]]'', jenž stimuluje růst rostlin.

===Tvorba biofilmu===
Poměrně velké množství pseudomonád je schopno tvorby [[biofilm]]ů. Spočívá to ve vylučování lepkavých [[polysacharid]]ů do okolí buněk. Díky tomu mají [[bílá krvinka|bílé krvinky]] větší problém se pseudomonád v těle zbavit - [[fagocytóza]] v prostředí biofilmu je náročnější.<ref name=Sherris>{{cite book | author = Ryan KJ; Ray CG (editors) | title = Sherris Medical Microbiology | edition = 4th | publisher = McGraw Hill | year = 2004 | isbn = 0838585299 }}</ref> Navíc tyto bakterie lépe přilnou k povrchu a je například mnohem náročnější omýt takový biofilm z povrchu kuchyňských nástrojů. Díky tvorbě biofilmů mohou pseudomonády přežít i například v nádobách, v nichž se vyrábí léčiva. Mezi další podobně pozoruhovná místa, kde by možná málokdo čekal bakterie, jsou nádoby s antiseptickými [[kvartérní amoniové sloučeniny|kvartérními amoniovými sloučeninami]] nebo láhve s balenou minerální vodou.

===Odolnost k antibiotikům===

Pseudomonády jsou gramnegativní, což je přirozeně činí [[antibiotická rezistence|odolné k takovým antibiotikům]], jako jsou
[[penicilin]] a ostatní [[beta-laktamová antibiotika]], ale na druhou stranu jsou citlivé k [[piperacilin]]u, [[imipenem]]u, [[tobramycin]]u a [[ciprofloxacin]]u.<ref name=Sherris /> Odolnost k některým antibiotikům je často dána tím, že jsou schopné velmi rychle [[pumpa (buňka)|vypumpovat]] tato antibiotika z buňky. Z toho plynoucí rezistence vůči většině antibiotik je značný problém u patogenní bakterie ''Pseudomonas aeruginosa''. Tato bakterie vlastní charakteristické geny pro odolnost – nazývají se ''mexAB-oprM'', ''mexXY'' a další.<ref>[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/14706082?ordinalpos=1&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_DefaultReportPanel.Pubmed_RVDocSum]</ref> Jsou navíc velmi přizpůsobivé a často u nich mutací vznikne odolnost k antibiotiku, jež na ně doposud účinkovalo. Mnohdy si geny pro odolnost bakterie předávají takzvaně [[horizontální genový transfer|horizontálně]]. Navíc jim pomáhá život v [[biofilm]]ech, kde jsou před antibiotiky lépe chráněny.<ref name="Cornelis"/>

==Škodlivost==
===Onemocnění živočichů===
Bakterie rodu ''Pseudomonas'', zejména ''[[Pseudomonas aeruginosa|P. aeruginosa]]'', ale i např. ''[[Pseudomonas oryzihabitans|P. oryzihabitans]]''<ref name=Levitski-Heikkila_2005>{{cite journal | author = Levitski-Heikkila TV, Ullian ME | title = Peritonitis with multiple rare environmental bacteria in a patient receiving long-term peritoneal dialysis | journal = Am. J. Kidney Dis. | volume = 46 | issue = 6 | pages = e119–24 | year = 2005 | pmid = 16310563 | doi = 10.1053/j.ajkd.2005.08.021 | accessdate = 2007-05-27}}</ref> a ''[[Pseudomonas plecoglossicida|P. plecoglossicida]]'',<ref name=Nishimori_2000>{{cite journal | author = Nishimori E, Kita-Tsukamoto K, Wakabayashi H | title = Pseudomonas plecoglossicida sp. nov., the causative agent of bacterial haemorrhagic ascites of ayu, Plecoglossus altivelis | journal = Int. J. Syst. Evol. Microbiol. | volume = 50 Pt 1 | issue = | pages = 83–9 | year = 2000 | pmid = 10826790 | doi = | accessdate = 2007-05-27}}</ref> jsou původci významných infekčních onemocnění člověka nebo jiných živočichů. Zejména infekce ''P. aeruginosa'' u člověka působí velké problémy v nemocničním prostředí (těžko léčitelné tzv. [[nozokomiální infekce]]). Vyvolává široké spektrum chorob: [[zánět průdušek]], [[zánět plic]], záněty různých ran a popálenin na kůži, infekce související s [[katetr]]y v [[močová trubice|močové trubici]], infekce ucha a očí, ale i celotělní často fatální záněty ([[bakteriémie]]). Zvláště u pacientů s cystickou fibrózou nebo s jinými onemocněními je obvykle infekce pseudomonádami smrtelná.<ref name=microbio>{{Citace monografie
| příjmení = Murray
| jméno = Patrick R.
| příjmení2 = Rosenthal
| jméno2 = Ken S.
| příjmení3 = Pfaller
| jméno3 = Michael A.
| titul = Medical Microbiology, Fifth edition
| rok = 2005
| vydavatel = Elsevier
}}</ref>

===Onemocnění rostlin a hub===
Zejména ''[[Pseudomonas syringae|P. syringae]]'' je významným rostlinným patogenem. Rozlišuje se více než 50 různých [[patovar]]ů, tedy jakýchsi kmenů s typickými patogenními vlastnostmi. Mnohé jsou například specializované na výhradního rostlinného hostitele a jiné napadají zřídka. Existují i další druhy pseudomonád schopné vyvolat onemocnění rostlin, a to zejména v podskupině pseudomonád kolem ''P. syringae''.

Mimo to působí problémy v zemědělství i druh ''[[Pseudomonas tolaasii|P. tolaasii]]'', jenž je zajímavý tím, že způsobuje hnití pěstovaných hub.<ref name=Brodey_1991>{{cite journal | author=Brodey CL, Rainey PB, Tester M, Johnstone K | title=Bacterial blotch disease of the cultivated mushroom is caused by an ion channel forming lipodepsipeptide toxin | journal=Molecular Plant–Microbe Interaction | year=1991 | volume=1 | pages=407–11 }}</ref> ''[[Pseudomonas agarici|P. agarici]]'' způsobuje zase nákazu v [[lupen]]ech pěstovaných druhů hub.<ref name=Young_1970>{{cite journal | author = Young JM | title = Drippy gill: a bacterial disease of cultivated mushrooms caused by ''Pseudomonas agarici'' n. sp | journal = NZ J Agric Res | year = 1970 | volume = 13 | pages = 977–90 }}</ref>

===Kažení potravin===
Pseudomonády jsou schopné růst za nízkých teplot a za nestandardních podmínek prostředí, takže nepřekvapí, že mnohé z nich mohou způsobovat i [[kažení potravin]]. Mléčné produkty napadá bakterie ''[[Pseudomonas fragi|P. fragi]]'',<ref>{{cite journal |author=Pereira, JN, and Morgan, ME |title=Nutrition and physiology of ''Pseudomonas fragi'' |journal=J Bacteriol |volume=74 |issue=6 |pages=710–3 |year=1957 Dec |pmid=13502296 }}</ref> [[vejce]] kolonizuje např. ''[[Pseudomonas taetrolens|P. taetrolens]]'' and ''[[Pseudomonas mucidolens|P. mudicolens]]'',<ref>{{cite journal |author=Levine, M, and Anderson, DQ |title=Two New Species of Bacteria Causing Mustiness in Eggs |journal=J Bacteriol |volume=23 |issue=4 |pages=337–47 |year=1932 Apr |pmid=16559557 }}</ref> zatímco ''[[Pseudomonas lundensis|P. lundensis]]'' způsobuje kažení [[mléko|mléka]], [[sýr]]u a [[maso|masa]] včetně rybího.<ref>{{cite journal |author=Gennari, M, and Dragotto, F |title=A study of the incidence of different fluorescent ''Pseudomonas'' species and biovars in the microflora of fresh and spoiled meat and fish, raw milk, cheese, soil and water |journal=J Appl Bacteriol |volume=72 |issue=4 |pages=281–8 |year=1992 Apr |pmid=1517169 }}</ref>

== Využití ==

=== Přípravky ke zvýšení výnosů ===
Od poloviny 80. let 19. století jsou pseudomonády využívány v [[biokontrola|biokontrole]] či také [[biologický boj|biologickém boji]] se škůdci zemědělských plodin. Nejlépe jsou v tomto ohledu známy výsledky postřiků obsahujících různé kmeny ''[[Pseudomonas fluorescens|P. fluorescens]]'' (např. CHA0 nebo Pf-5). Přesto není jasné, jak ''P. fluorescens'' pomáhá růstu plodin. Podle jedné z hypotéz vyvolávají bakterie jakousi imunitní odpověď v rostlině, čímž zlepšují její následné schopnosti boje se skutečnými bakteriemi. Další možností je, že se pseudomonády po postřiku dostanou do půdy a vytlačí z ní patogenní bakterie, například pomocí [[siderofor]]ních sloučenin „nasávajících“ z půdy železo. Možné také je, že pseudomonáda produkuje antibakteriální sloučeniny, jako jsou [[fenazi]]nová [[antibiotika]] nebo [[kyanovodík]]. Všechny zmíněné teorie jsou do jisté míry podporovány experimentálními daty, ale situace není zcela vyřešena.<ref>{{cite journal |author=Haas D, Defago G |title=Biological control of soil-borne pathogens by fluorescent pseudomonads |journal=Nature Reviews in Microbiology |volume=3 |issue=4 |pages=307–19 |year=2005 |pmid=15759041 |doi=10.1038/nrmicro1129}}</ref>

Dalšími pseudomonádami se schopností biokontroly jsou ''[[Pseudomonas chlororaphis|P. chlororaphis]]'' (produkuje antibiotika ničící některé patogenní houby)<ref>{{cite journal |author=Chin-A-Woeng TF, ''et al.'' |title=Root colonization by phenazine-1-carboxamide-producing bacterium ''Pseudomonas chlororaphis'' PCL1391 is essential for biocontrol of tomato foot and root rot |journal=Mol Plant Microbe Interact |volume=13 |issue=12 |pages=1340–5 |year=2000 |pmid=11106026 |doi=10.1094/MPMI.2000.13.12.1340}}</ref> nebo jí blízce příbuzný druh ''[[Pseudomonas aurantiaca|P. aurantiaca]]'' (produkuje jistý [[fluoroglucid]], antibiotikum proti [[grampozitivní]]m mikrobům)<ref>{{cite journal |author=Esipov, ''et al.'' |title=New antibiotically active fluoroglucide from ''Pseudomonas aurantiaca'' |journal=Antibiotiki |volume=20 |issue=12 |pages=1077–81 |year=1975 |pmid=1225181 }}</ref>.

===Bioremediace===
Někteří zástupci pseudomonád jsou schopné přijímat z prostředí jisté [[polutant|znečišťující látky]] a [[metabolismus|metabolizovat]] je. Díky tomu mohou být použity v [[bioremediace|bioremediaci]] znečištěných půd či vod. Mezi druhy, jež je v této souvislosti možné zmínit, patří:
* ''[[Pseudomonas alcaligenes|P. alcaligenes]]'', schopný rozkládat [[polyaromatické uhlovodíky]] (PAU).<ref name=O>{{cite journal | author = O'Mahony MM, Dobson AD, Barnes JD, Singleton I | title = The use of ozone in the remediation of polycyclic aromatic hydrocarbon contaminated soil | journal = Chemosphere | volume = 63 | issue = 2 | pages = 307–14 | year = 2006 | pmid = 16153687 | doi = 10.1016/j.chemosphere.2005.07.018 | accessdate = 2007-05-27}}</ref>
* ''[[Pseudomonas mendocina|P. mendocina]]'', schopný rozkládat [[toluen]].<ref name=Yen_1991>{{cite journal | author = Yen KM, Karl MR, Blatt LM, ''et al.'' | title = Cloning and characterization of a Pseudomonas mendocina KR1 gene cluster encoding toluene-4-monooxygenase | journal = J. Bacteriol. | volume = 173 | issue = 17 | pages = 5315–27 | year = 1991 | pmid = 1885512 | doi = | accessdate = 2007-05-27}}</ref>
* ''[[Pseudomonas pseudoalcaligenes|P. pseudoalcaligenes]]'' přijímá [[kyanid]]y jako zdroj dusíku.<ref name=Huertas_2006>{{cite journal | author = Huertas MJ, Luque-Almagro VM, Martínez-Luque M, ''et al.'' | title = Cyanide metabolism of Pseudomonas pseudoalcaligenes CECT5344: role of siderophores | journal = Biochem. Soc. Trans. | volume = 34 | issue = Pt 1 | pages = 152–5 | year = 2006 | pmid = 16417508 | doi = 10.1042/BST0340152 | accessdate = 2007-05-27}}</ref>
* ''[[Pseudomonas resinovorans|P. resinovorans]]'' rozkládá [[karbazol]].<ref name=Nojiri_2002>{{cite journal | author = Nojiri H, Maeda K, Sekiguchi H, ''et al.'' | title = Organization and transcriptional characterization of catechol degradation genes involved in carbazole degradation by Pseudomonas resinovorans strain CA10 | journal = Biosci. Biotechnol. Biochem. | volume = 66 | issue = 4 | pages = 897–901 | year = 2002 | pmid = 12036072 | doi = 10.1271/bbb.66.897| accessdate = 2007-05-27}}</ref>
* ''[[Pseudomonas veronii|P. veronii]]'' rozkládá různé jednoduché aromatické organické sloučeniny.<ref>{{cite journal |author=Nam, ''et al.'' |title=A novel catabolic activity of ''Pseudomonas veronii'' in biotransformation of pentachlorophenol |journal=Applied Microbiology and Biotechnology |volume=62 |pages=284–90 |year=2003 |pmid=12883877 |doi=10.1007/s00253-003-1255-1}}</ref><ref>{{cite journal |author=Onaca, ''et al.'' |title=Degradation of alkyl methyl ketones by ''Pseudomonas veronii'' |journal=Journal of Bacteriology |year=2007 Mar 9 |pmid=17351032 |unused_data=|[Epub ahead of print] }}</ref>
* ''[[Pseudomonas putida|P. putida]]'' rozkládá různá organická rozpouštědla včetně toluenu.<ref name="Marqués_1993">{{cite journal | author = Marqués S, Ramos JL | title = Transcriptional control of the Pseudomonas putida TOL plasmid catabolic pathways | journal = Mol. Microbiol. | volume = 9 | issue = 5 | pages = 923–9 | year = 1993 | pmid = 7934920 | doi = 10.1111/j.1365-2958.1993.tb01222.x| accessdate = 2007-05-27}}</ref> Jeden kmen dokonce ve vodném roztoku převádí morfin na silné drahé léčivo, [[hydromorfon]] (Dilaudid).
* ''[[Pseudomonas stutzeri|P. stutzeri]]'', kmen KC, rozkládá [[tetrachlormethan]].<ref>{{cite journal |author=Sepulveda-Torres, ''et al.'' |title=Generation and initial characterization of ''Pseudomonas stutzeri'' KC mutants with impaired ability to degrade carbon tetrachloride |journal=Arch Microbiol |volume=171 |issue=6 |pages=424–9 |year=1999 |pmid=10369898 |doi=10.1007/s002030050729}}</ref>

==Klasifikace==
Moderní studie zabývající se [[taxonomie|taxonomií]] tohoto složitého rodu poněkud pokulhávaly za tradičními morfologickými postupy používanými v lékařské praxi, dokud se nenaskytla možnost srovnávat jedince pomocí stavby jejich [[ribozomální RNA]] (a dalších genů bakterií).<ref name="Anzai2000"/> Tyto postupy spolehlivě prokázaly, že rod ''Pseudomonas'' tak, jak byl dříve chápán, je nepřirozený shluk mnoha různých rodů. Od té doby došlo k velkému pokroku a původní pseudomonády byly pomocí rRNA roztříděny do 5 skupin podle příbuznosti. Výzkumníci díky tomu byli schopni vyřešit problém s hromaděním druhů v rodu ''Pseudomonas''. V první polovině 20. století byl tento rod zahlcen obrovským množstvím zástupců, od té doby se však počet uznávaných druhů zmenšil více než desetkrát. Jen velmi málo druhů přežilo toto období revize a většina pseudomonád v dnešním slova smyslu jsou druhy popsané v posledních letech.<ref name="Cornelis"/>

Druhy, které byly vyčleněny z rodu ''Pseudomonas'', jsou uvedeny níže. Interní odkazy vedou na současné převládající taxonomické označení – povšimněte si, že mnohé dnes patří např. do rodů ''[[Burkholderia]]'' a ''[[Ralstonia]]''.

* [[α proteobakterie]]: ''[[Sphingomonas abikonensis|P. abikonensis]]'', ''[[Aminobacter aminovorans|P. aminovorans]]'', ''[[Sphingomonas trueperi|P. azotocolligans]]'', ''[[Bradyrhizobium|P. carboxydohydrogena]]'', ''[[Oligotropha carboxidovorans|P. carboxidovorans]]'', ''[[Zavarzinia compransoris|P. compransoris]]'', ''[[Brevundimonas diminuta|P. diminuta]]'', ''[[Sphingomonas echinoides|P. echinoides]]'', ''[[Methylobacterium extorquens|P. extorquens]]'', ''[[Zymomonas mobilis|P. lindneri]]'', ''[[Methylobacterium mesophilicum|P. mesophilica]]'', ''[[Sphingomonas paucimobilis|P. paucimobilis]]'', ''[[Methylobacterium radiotolerans|P. radiora]]'', ''[[Methylobacterium rhodinum|P. rhodos]]'', ''[[Devosia riboflavina|P. riboflavina]]'', ''[[Methylobacterium extorquens|P. rosea]]'', ''[[Brevundimonas vesicularis|P. vesicularis]]''.
* [[β proteobakterie]]: ''[[Comamonas acidovorans|P. acidovorans]]'', ''[[Burkholderia gladioli|P. alliicola]]'', ''[[Burkholderia gladioli|P. antimicrobica]]'', ''[[Acidovorax avenae|P. avenae]]'', ''[[Thauera|P. butanovorae]]'', ''[[Burkholderia caryophylli|P. caryophylli]]'', ''[[Acidovorax avenae|P. cattleyae]]'', ''[[Burkholderia cepacia|P. cepacia]]'', ''[[Burkholderia cocovenenans|P. cocovenenans]]'', ''[[Acidovorax delafieldii|P. delafieldii]]'', ''[[Acidovorax facilis|P. facilis]]'', ''[[Hydrogenophaga flava|P. flava]]'', ''[[Burkholderia gladioli|P. gladioli]]'', ''[[Burkholderia glathei|P. glathei]]'', ''[[Burkholderia glumae|P. glumae]]'', ''[[Burkholderia graminis|P. graminis]]'', ''[[Herbaspirillum huttiense|P. huttiensis]]'', ''[[Vogesella indigofera|P. indigofera]]'', ''[[Comamonadaceae|P. lanceolata]]'', ''[[Paucimonas lemoignei|P. lemoignei]]'', ''[[Burkholderia mallei|P. mallei]]'', ''[[Janthinobacterium|P. mephitica]]'', ''[[Telluria mixta|P. mixta]]'', ''[[Hydrogenophaga palleronii|P. palleronii]]'', ''[[Burkholderia phenazinium|P. phenazinium]]'', ''[[Ralstonia pickettii|P. pickettii]]'', ''[[Burkholderia plantarii|P. plantarii]]'', ''[[Hydrogenophaga pseudoflava|P. pseudoflava]]'', ''[[Burkholderia pseudomallei|P. pseudomallei]]'', ''[[Burkholderia pyrrocinia|P. pyrrocinia]]'', ''[[Acidovorax avenae|P. rubrilineans]]'', ''[[Herbaspirillum rubrisubalbicans|P. rubrisubalbicans]]'', ''[[Matsuebacter|P. saccharophila]]'', ''[[Ralstonia solanacearum|P. solanacearum]]'', ''[[Hydrogenophaga|P. spinosa]]'', ''[[Ralstonia syzygii|P. syzygii]]'', ''[[Hydrogenophaga taeniospiralis|P. taeniospiralis]]'', ''[[Comamonas terrigena|P. terrigena]]'', ''[[Comamonas testosteroni|P. testosteroni]]''.
* [[γ-β proteobakterie]]: ''[[Stenotrophomonas|P. beteli]]'', ''[[Xanthomonas|P. boreopolis]]'', ''[[Xanthomonas|P. cissicola]]'', ''[[Stenotrophomonas|P. geniculata]]'', ''[[Stenotrophomonas|P. hibiscicola]]'', ''[[Stenotrophomonas maltophilia|P. maltophilia]]'', ''[[Stenotrophomonas|P. pictorum]]''.
* [[γ proteobakterie]]: ''[[Chromohalobacter|P. beijerinckii]]'', ''[[Brevundimonas diminuta|P. diminuta]]'', ''[[Aeromonas|P. doudoroffii]]'', ''[[Microbulbifer elongatus|P. elongata]]'', ''[[Enterobacteriaceae|P. flectens]]'', ''[[Halomonas halodurans|P. halodurans]]'', ''[[Marinobacter|P. halophila]]'', ''[[Marinobacterium georgiense|P. iners]]'', ''[[Halomonadaceae|P. marina]]'', ''[[Marinobacter hydrocarbonoclasticus|P. nautica]]'', ''[[Pseudoalteromonas nigrifaciens|P. nigrifaciens]]'', ''[[Acinetobacter|P. pavonacea]]'', ''[[Pseudoalteromonas piscicida|P. piscicida]]'', ''[[Marinobacterium stanieri|P. stanieri]]''.
* [[δ proteobakterie]]: ''[[Aeromonas caviae|P. formicans]]''...

== Odkazy ==
===Reference===
{{překlad|en|Pseudomonas|333554658}}
<references />

===Externí odkazy===
* [http://www.time.com/time/magazine/article/0,9171,894282,00.html?promoid=googlep Pseudomonády přežijí v jaderném reaktoru]
* [http://www.pseudomonas.com ''Pseudomonas'' databáze genomů]
* [http://www.horizonpress.com/gateway/pseudomonas.html ''Pseudomonas'' obecně na horizonpress]
* [http://www.tgw1916.net/movies.html Video obarvených pseudomonád]

[[Kategorie:Pseudomonadaceae]]


[[ar:سودوموناس]]
[[ar:سودوموناس]]

Verze z 26. 12. 2009, 18:28

Jak číst taxoboxPseudomonas
alternativní popis obrázku chybí
Vědecká klasifikace
Doménabakterie (Bacteria)
OdděleníProteobacteria
TřídaGamma Proteobacteria
ŘádPseudomonadales
ČeleďPseudomonadaceae
RodPseudomonas
Druhy

skupina P. aeruginosa

P. aeruginosa
P. alcaligenes
P. anguilliseptica
P. argentinensis
P. borbori
P. citronellolis
P. flavescens
P. mendocina
P. nitroreducens
P. oleovorans
P. pseudoalcaligenes
P. resinovorans
P. straminea

Skupina P. chlororaphis

P. aurantiaca
P. aureofaciens
P. chlororaphis
P. fragi
P. lundensis
P. taetrolens

Skupina P. fluorescens

P. antarctica
P. azotoformans
'P. blatchfordae'
P. brassicacearum
P. brenneri
P. cedrina
P. corrugata
P. fluorescens
P. gessardii
P. libanensis
P. mandelii
P. marginalis
P. mediterranea
P. meridiana
P. migulae
P. mucidolens
P. orientalis
P. panacis
P. proteolytica
P. rhodesiae
P. synxantha
P. thivervalensis
P. tolaasii
P. veronii

Skupina P. pertucinogena

P. denitrificans
P. pertucinogena

Skupina P. putida

P. cremoricolorata
P. fulva
P. monteilii
P. mosselii
P. oryzihabitans
P. parafulva
P. plecoglossicida
P. putida

Skupina P. stutzeri

P. balearica
P. luteola
P. stutzeri

Skupina P. syringae

P. amygdali
P. avellanae
P. caricapapayae
P. cichorii
P. coronafaciens
P. ficuserectae
'P. helianthi'
P. meliae
P. savastanoi
P. syringae
'P. tomato'
P. viridiflava

incertae sedis

P. abietaniphila
P. acidophila
P. agarici
P. alcaliphila
P. alkanolytica
P. amyloderamosa
P. asplenii
P. azotifigens
P. cannabina
P. coenobios
P. congelans
P. costantinii
P. cruciviae
P. delhiensis
P. excibis
P. extremorientalis
P. frederiksbergensis
P. fuscovaginae
P. gelidicola
P. grimontii
P. indica
P. jessenii
P. jinjuensis
P. kilonensis
P. knackmussii
P. koreensis
P. lini
P. lutea
P. moraviensis
P. otitidis
P. pachastrellae
P. palleroniana
P. papaveris
P. peli
P. perolens
P. poae
P. pohangensis
P. psychrophila
P. psychrotolerans
P. rathonis
P. reptilivora
P. resiniphila
P. rhizosphaerae
P. rubescens
P. salomonii
P. segitis
P. septica
P. simiae
P. suis
P. thermotolerans
P. tremae
P. trivialis
P. turbinellae
P. tuticorinensis
P. umsongensis
P. vancouverensis
P. vranovensis
P. xanthomarina
Některá data mohou pocházet z datové položky.

Pseudomonas (též pseudomonáda) je rod gramnegativních bakterií ze skupiny Gammaproteobacteria. V přírodě jsou velice hojné a díky své přizpůsobivosti osídlují velmi rozmanitá stanoviště. Některé druhy způsobují i onemocnění rostlin a živočichů včetně člověka. Co se týše vlastností, jsou pohyblivé a tyčinkovitého tvaru, obvykle aerobní a netvořící spory.

V nedávně době proběhla revize tohoto a dalších příbuzných rodů pomocí analýzy genů pro 16S rRNA.[1] Některé druhy, dříve řazené k rodům Chryseomonas a Flavimonas, jsou dnes řazeny mezi pseudomonády,[2] a naopak, jisté druhy původně považované za pseudomonády dnes vědci spíše řadí do rodů Burkholderia či Ralstonia.

Historie výzkumu

Pseudomonad doslova v překladu znamená „zdánlivá jednotka“ a pochází z řeckých slov pseudo (ψευδο – zdánlivý, falešný) a monas (μονάς či μονάδα – jednotka, jednotlivina). Termín monáda se používal dříve v přírodovědě pro jednobuněčné organizmy, které první mikrobiologové spatřili pod mikroskopem.

Bakterie rodu Pseudomonas jsou v přírodě velmi hojné a vyskytují se například ve vodě či uvnitř tě rostlin, a proto byly objeveny již prvními mikrobiology. Rodový název Pseudomonas byl nejprve v roce 1894 definován poměrně volně jako označení pro gramnegativní tyčinkovité bakterie s polárním bičíkem. Vbrzku začalo množství druhů narůstat, neboť byly pseudomonády nacházeny v nejrůznějších prostředích. Až použití nových metod umožnilo vytvoření modernější klasifikace.[3] Po roce 2000 byly přečteny kompletní genomy několika kmenů bakterií z rodu Pseudomonas: např. P. aeruginosa kmen PAO1, P. putida kmen KT2440, P. fluorescens kmen Pf-5, P. syringae patovar tomato DC3000, P. syringae patovar syringae B728a, P. syringae patovar phaseolica 1448A, P. fluorescens PfO-1 a P. entomophila L48.[3]

Popis

Pro rod Pseudomonas jsou podle Bergeyho manuálu typické následující vlastnosti:[4]

Dalšími poměrně typickými rysy pseudomonád je (až na výjimky) vylučování pyoverdinu (fluoresceinu), žlutozelené fluorescenční látky, které umožňuje bakteriím získávat železo v prostředí chudém na tento prvek (tzv. siderofor).[5] K dalším vylučovaným sideroforním látkám patří pyocyanin u Pseudomonas aeruginosa[6] a thiochinolobaktin u Pseudomonas fluorescens.[7] Obvykle jsou pseudomonády pozitivní při oxidázovém testu, bývají beta-hemolytické (na krevním agaru), indol negativní, při aplikaci methylové červeni i při Voges–Proskauerovu testu jsou negativní, ale zase jsou citrát–pozitivní.

V rámci rodu je možné pozorovat velkou metabolickou rozmanitost, což umožňuje těmto bakteriím usídlovat široké rozpětí různýh prostředí.[8] Snadná kultivace ve skle (in vitro) a dostupnost přečtených genomů z nich činí výborné modelové organizmy pro vědecký výzkum; nejčastěji se zkoumá P. aeruginosa jako významný lidský patogen, P. syringae jako patogen rostlin, půdní bakterie P. putida a P. fluorescens, jenž stimuluje růst rostlin.

Tvorba biofilmu

Poměrně velké množství pseudomonád je schopno tvorby biofilmů. Spočívá to ve vylučování lepkavých polysacharidů do okolí buněk. Díky tomu mají bílé krvinky větší problém se pseudomonád v těle zbavit - fagocytóza v prostředí biofilmu je náročnější.[9] Navíc tyto bakterie lépe přilnou k povrchu a je například mnohem náročnější omýt takový biofilm z povrchu kuchyňských nástrojů. Díky tvorbě biofilmů mohou pseudomonády přežít i například v nádobách, v nichž se vyrábí léčiva. Mezi další podobně pozoruhovná místa, kde by možná málokdo čekal bakterie, jsou nádoby s antiseptickými kvartérními amoniovými sloučeninami nebo láhve s balenou minerální vodou.

Odolnost k antibiotikům

Pseudomonády jsou gramnegativní, což je přirozeně činí odolné k takovým antibiotikům, jako jsou penicilin a ostatní beta-laktamová antibiotika, ale na druhou stranu jsou citlivé k piperacilinu, imipenemu, tobramycinu a ciprofloxacinu.[9] Odolnost k některým antibiotikům je často dána tím, že jsou schopné velmi rychle vypumpovat tato antibiotika z buňky. Z toho plynoucí rezistence vůči většině antibiotik je značný problém u patogenní bakterie Pseudomonas aeruginosa. Tato bakterie vlastní charakteristické geny pro odolnost – nazývají se mexAB-oprM, mexXY a další.[10] Jsou navíc velmi přizpůsobivé a často u nich mutací vznikne odolnost k antibiotiku, jež na ně doposud účinkovalo. Mnohdy si geny pro odolnost bakterie předávají takzvaně horizontálně. Navíc jim pomáhá život v biofilmech, kde jsou před antibiotiky lépe chráněny.[3]

Škodlivost

Onemocnění živočichů

Bakterie rodu Pseudomonas, zejména P. aeruginosa, ale i např. P. oryzihabitans[11] a P. plecoglossicida,[12] jsou původci významných infekčních onemocnění člověka nebo jiných živočichů. Zejména infekce P. aeruginosa u člověka působí velké problémy v nemocničním prostředí (těžko léčitelné tzv. nozokomiální infekce). Vyvolává široké spektrum chorob: zánět průdušek, zánět plic, záněty různých ran a popálenin na kůži, infekce související s katetry v močové trubici, infekce ucha a očí, ale i celotělní často fatální záněty (bakteriémie). Zvláště u pacientů s cystickou fibrózou nebo s jinými onemocněními je obvykle infekce pseudomonádami smrtelná.[13]

Onemocnění rostlin a hub

Zejména P. syringae je významným rostlinným patogenem. Rozlišuje se více než 50 různých patovarů, tedy jakýchsi kmenů s typickými patogenními vlastnostmi. Mnohé jsou například specializované na výhradního rostlinného hostitele a jiné napadají zřídka. Existují i další druhy pseudomonád schopné vyvolat onemocnění rostlin, a to zejména v podskupině pseudomonád kolem P. syringae.

Mimo to působí problémy v zemědělství i druh P. tolaasii, jenž je zajímavý tím, že způsobuje hnití pěstovaných hub.[14] P. agarici způsobuje zase nákazu v lupenech pěstovaných druhů hub.[15]

Kažení potravin

Pseudomonády jsou schopné růst za nízkých teplot a za nestandardních podmínek prostředí, takže nepřekvapí, že mnohé z nich mohou způsobovat i kažení potravin. Mléčné produkty napadá bakterie P. fragi,[16] vejce kolonizuje např. P. taetrolens and P. mudicolens,[17] zatímco P. lundensis způsobuje kažení mléka, sýru a masa včetně rybího.[18]

Využití

Přípravky ke zvýšení výnosů

Od poloviny 80. let 19. století jsou pseudomonády využívány v biokontrole či také biologickém boji se škůdci zemědělských plodin. Nejlépe jsou v tomto ohledu známy výsledky postřiků obsahujících různé kmeny P. fluorescens (např. CHA0 nebo Pf-5). Přesto není jasné, jak P. fluorescens pomáhá růstu plodin. Podle jedné z hypotéz vyvolávají bakterie jakousi imunitní odpověď v rostlině, čímž zlepšují její následné schopnosti boje se skutečnými bakteriemi. Další možností je, že se pseudomonády po postřiku dostanou do půdy a vytlačí z ní patogenní bakterie, například pomocí sideroforních sloučenin „nasávajících“ z půdy železo. Možné také je, že pseudomonáda produkuje antibakteriální sloučeniny, jako jsou fenazinová antibiotika nebo kyanovodík. Všechny zmíněné teorie jsou do jisté míry podporovány experimentálními daty, ale situace není zcela vyřešena.[19]

Dalšími pseudomonádami se schopností biokontroly jsou P. chlororaphis (produkuje antibiotika ničící některé patogenní houby)[20] nebo jí blízce příbuzný druh P. aurantiaca (produkuje jistý fluoroglucid, antibiotikum proti grampozitivním mikrobům)[21].

Bioremediace

Někteří zástupci pseudomonád jsou schopné přijímat z prostředí jisté znečišťující látky a metabolizovat je. Díky tomu mohou být použity v bioremediaci znečištěných půd či vod. Mezi druhy, jež je v této souvislosti možné zmínit, patří:

Klasifikace

Moderní studie zabývající se taxonomií tohoto složitého rodu poněkud pokulhávaly za tradičními morfologickými postupy používanými v lékařské praxi, dokud se nenaskytla možnost srovnávat jedince pomocí stavby jejich ribozomální RNA (a dalších genů bakterií).[1] Tyto postupy spolehlivě prokázaly, že rod Pseudomonas tak, jak byl dříve chápán, je nepřirozený shluk mnoha různých rodů. Od té doby došlo k velkému pokroku a původní pseudomonády byly pomocí rRNA roztříděny do 5 skupin podle příbuznosti. Výzkumníci díky tomu byli schopni vyřešit problém s hromaděním druhů v rodu Pseudomonas. V první polovině 20. století byl tento rod zahlcen obrovským množstvím zástupců, od té doby se však počet uznávaných druhů zmenšil více než desetkrát. Jen velmi málo druhů přežilo toto období revize a většina pseudomonád v dnešním slova smyslu jsou druhy popsané v posledních letech.[3]

Druhy, které byly vyčleněny z rodu Pseudomonas, jsou uvedeny níže. Interní odkazy vedou na současné převládající taxonomické označení – povšimněte si, že mnohé dnes patří např. do rodů Burkholderia a Ralstonia.

Odkazy

Reference

V tomto článku byl použit překlad textu z článku Pseudomonas na anglické Wikipedii.

  1. ↑ a b Anzai Y, Kim H, Park, JY, Wakabayashi H. Phylogenetic affiliation of the pseudomonads based on 16S rRNA sequence. Int J Syst Evol Microbiol. 2000, s. 1563–89. PMID 10939664. 
  2. ↑ The phylogeny of the genera Chryseomonas, Flavimonas, and Pseudomonas supports synonymy of these three genera. Int J Syst Bacteriol. 1997, s. 249–51. PMID 9103607. 
  3. ↑ a b c d Cornelis P (editor). Pseudomonas: Genomics and Molecular Biology. 1st. vyd. [s.l.]: Caister Academic Press, 2008. Dostupné online. ISBN 978-1-904455-19-6. 
  4. ↑ KRIEG, Noel. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, Volume 1. Baltimore: Williams & Wilkins, 1984. ISBN 0683041088. 
  5. ↑ Meyer JM, Geoffroy VA, Baida N, et al.. Siderophore typing, a powerful tool for the identification of fluorescent and nonfluorescent pseudomonads. Appl. Environ. Microbiol.. 2002, s. 2745–53. DOI 10.1128/AEM.68.6.2745-2753.2002. PMID 12039729. 
  6. ↑ Lau GW, Hassett DJ, Ran H, Kong F. The role of pyocyanin in Pseudomonas aeruginosa infection. Trends in molecular medicine. 2004, s. 599–606. DOI 10.1016/j.molmed.2004.10.002. PMID 15567330. 
  7. ↑ Matthijs S, Tehrani KA, Laus G, Jackson RW, Cooper RM, Cornelis P. Thioquinolobactin, a Pseudomonas siderophore with antifungal and anti-Pythium activity. Environ. Microbiol.. 2007, s. 425–34. DOI 10.1111/j.1462-2920.2006.01154.x. PMID 17222140. 
  8. ↑ Madigan M; Martinko J (editors). Brock Biology of Microorganisms. 11th. vyd. [s.l.]: Prentice Hall, 2005. ISBN 0131443291. 
  9. ↑ a b Ryan KJ; Ray CG (editors). Sherris Medical Microbiology. 4th. vyd. [s.l.]: McGraw Hill, 2004. ISBN 0838585299. 
  10. ↑ [1]
  11. ↑ Levitski-Heikkila TV, Ullian ME. Peritonitis with multiple rare environmental bacteria in a patient receiving long-term peritoneal dialysis. Am. J. Kidney Dis.. 2005, s. e119–24. DOI 10.1053/j.ajkd.2005.08.021. PMID 16310563. 
  12. ↑ Nishimori E, Kita-Tsukamoto K, Wakabayashi H. Pseudomonas plecoglossicida sp. nov., the causative agent of bacterial haemorrhagic ascites of ayu, Plecoglossus altivelis. Int. J. Syst. Evol. Microbiol.. 2000, s. 83–9. PMID 10826790. 
  13. ↑ MURRAY, Patrick R.; ROSENTHAL, Ken S.; PFALLER, Michael A. Medical Microbiology, Fifth edition. [s.l.]: Elsevier, 2005. 
  14. ↑ Brodey CL, Rainey PB, Tester M, Johnstone K. Bacterial blotch disease of the cultivated mushroom is caused by an ion channel forming lipodepsipeptide toxin. Molecular Plant–Microbe Interaction. 1991, s. 407–11. 
  15. ↑ Young JM. Drippy gill: a bacterial disease of cultivated mushrooms caused by Pseudomonas agarici n. sp. NZ J Agric Res. 1970, s. 977–90. 
  16. ↑ Pereira, JN, and Morgan, ME. Nutrition and physiology of Pseudomonas fragi. J Bacteriol. 1957 Dec, s. 710–3. PMID 13502296. 
  17. ↑ Levine, M, and Anderson, DQ. Two New Species of Bacteria Causing Mustiness in Eggs. J Bacteriol. 1932 Apr, s. 337–47. PMID 16559557. 
  18. ↑ Gennari, M, and Dragotto, F. A study of the incidence of different fluorescent Pseudomonas species and biovars in the microflora of fresh and spoiled meat and fish, raw milk, cheese, soil and water. J Appl Bacteriol. 1992 Apr, s. 281–8. PMID 1517169. 
  19. ↑ Haas D, Defago G. Biological control of soil-borne pathogens by fluorescent pseudomonads. Nature Reviews in Microbiology. 2005, s. 307–19. DOI 10.1038/nrmicro1129. PMID 15759041. 
  20. ↑ Chin-A-Woeng TF, et al.. Root colonization by phenazine-1-carboxamide-producing bacterium Pseudomonas chlororaphis PCL1391 is essential for biocontrol of tomato foot and root rot. Mol Plant Microbe Interact. 2000, s. 1340–5. DOI 10.1094/MPMI.2000.13.12.1340. PMID 11106026. 
  21. ↑ Esipov, et al.. New antibiotically active fluoroglucide from Pseudomonas aurantiaca. Antibiotiki. 1975, s. 1077–81. PMID 1225181. 
  22. ↑ O'Mahony MM, Dobson AD, Barnes JD, Singleton I. The use of ozone in the remediation of polycyclic aromatic hydrocarbon contaminated soil. Chemosphere. 2006, s. 307–14. DOI 10.1016/j.chemosphere.2005.07.018. PMID 16153687. 
  23. ↑ Yen KM, Karl MR, Blatt LM, et al.. Cloning and characterization of a Pseudomonas mendocina KR1 gene cluster encoding toluene-4-monooxygenase. J. Bacteriol.. 1991, s. 5315–27. PMID 1885512. 
  24. ↑ Huertas MJ, Luque-Almagro VM, Martínez-Luque M, et al.. Cyanide metabolism of Pseudomonas pseudoalcaligenes CECT5344: role of siderophores. Biochem. Soc. Trans.. 2006, s. 152–5. DOI 10.1042/BST0340152. PMID 16417508. 
  25. ↑ Nojiri H, Maeda K, Sekiguchi H, et al.. Organization and transcriptional characterization of catechol degradation genes involved in carbazole degradation by Pseudomonas resinovorans strain CA10. Biosci. Biotechnol. Biochem.. 2002, s. 897–901. DOI 10.1271/bbb.66.897. PMID 12036072. 
  26. ↑ Nam, et al.. A novel catabolic activity of Pseudomonas veronii in biotransformation of pentachlorophenol. Applied Microbiology and Biotechnology. 2003, s. 284–90. DOI 10.1007/s00253-003-1255-1. PMID 12883877. 
  27. ↑ Onaca, et al.. Degradation of alkyl methyl ketones by Pseudomonas veronii. Journal of Bacteriology. 2007 Mar 9. PMID 17351032. 
  28. ↑ Marqués S, Ramos JL. Transcriptional control of the Pseudomonas putida TOL plasmid catabolic pathways. Mol. Microbiol.. 1993, s. 923–9. DOI 10.1111/j.1365-2958.1993.tb01222.x. PMID 7934920. 
  29. ↑ Sepulveda-Torres, et al.. Generation and initial characterization of Pseudomonas stutzeri KC mutants with impaired ability to degrade carbon tetrachloride. Arch Microbiol. 1999, s. 424–9. DOI 10.1007/s002030050729. PMID 10369898. 

Externí odkazy

Citováno z „https://cs.wikipedia.org/w/index.php?title=Pseudomonas&oldid=4748719“