Klasifikace virů: Porovnání verzí
Bez shrnutí editace značka: editace z Vizuálního editoru |
→Nezařazené do realmů: možná příbuznost do poznámky + ref |
||
Řádek 690: | Řádek 690: | ||
::::*:* Čeleď: ''[[Avsunviroidae]]'' (3 rody) |
::::*:* Čeleď: ''[[Avsunviroidae]]'' (3 rody) |
||
::::*:*:* Rod: ''[[Avsunviroid]]'', ''[[Elaviroid]]'', ''[[Pelamoviroid]]'' |
::::*:*:* Rod: ''[[Avsunviroid]]'', ''[[Elaviroid]]'', ''[[Pelamoviroid]]'' |
||
::::*:* Čeleď: ''[[Baculoviridae]]''{{#tag:ref|Dosud nezařazené čeledi ''Baculoviridae'', ''Hytrosaviridae'', ''Nimoviridae'', ''Nudiviridae'' a ''Polydnaviridae'' sdílejí část genů s viry kmene ''Nucleocytoviricota'' (realm ''Varidnaviria''), což může naznačovat jejich společnou příslušnost k vyššímu, dosud nezavedenému řádu.<ref>{{Citace elektronického periodika |
|||
::::*:* Čeleď: ''[[Baculoviridae]]'' (4 rody) |
|||
| příjmení1 = Koonin |
|||
| jméno1 = Eugene V. |
|||
| příjmení2 = Yutin |
|||
| jméno2 = Natalya |
|||
| titul = Chapter Five - Evolution of the Large Nucleocytoplasmic DNA Viruses of Eukaryotes and Convergent Origins of Viral Gigantism |
|||
| periodikum = Advances in Virus Research |
|||
| vydavatel = Elsevier Inc. |
|||
| ročník = 103 |
|||
| typ ročníku = svazek |
|||
| datum_vydání = 2018-11-10 |
|||
| strany = 167-202 |
|||
| url = https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0065352718300551 |
|||
| issn = 0065-3527 |
|||
| jazyk = anglicky |
|||
| doi = 10.1016/bs.aivir.2018.09.002 |
|||
}}</ref><ref>{{Citace elektronického periodika |
|||
| příjmení1 = Koonin |
|||
| jméno1 = Eugene V. |
|||
| příjmení2 = Dolja |
|||
| jméno2 = Valerian V. |
|||
| příjmení3 = Krupovic |
|||
| jméno3 = Mart |
|||
| titul = Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity |
|||
| periodikum = Virology |
|||
| vydavatel = Elsevier Inc. |
|||
| ročník = 479–480 |
|||
| typ ročníku = svazek |
|||
| datum_vydání = 2015-03-12 |
|||
| strany = 2-25 |
|||
| url = https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0042682215000859 |
|||
| issn = 0042-6822 |
|||
| jazyk = anglicky |
|||
| doi = 10.1016/j.virol.2015.02.039 |
|||
}}</ref>|group="pozn."|name="Koonin_2015,2019"}} (4 rody) |
|||
::::*:*:* Rod: ''[[Alphabaculovirus]]'', ''[[Betabaculovirus]]'', ''[[Deltabaculovirus]]'', ''[[Gammabaculovirus]]'' |
::::*:*:* Rod: ''[[Alphabaculovirus]]'', ''[[Betabaculovirus]]'', ''[[Deltabaculovirus]]'', ''[[Gammabaculovirus]]'' |
||
::::*:* Čeleď: ''[[Bicaudaviridae]]'' (1 rod) |
::::*:* Čeleď: ''[[Bicaudaviridae]]'' (1 rod) |
||
Řádek 706: | Řádek 740: | ||
::::*:* Čeleď: ''[[Halspiviridae]]'' (1 rod) |
::::*:* Čeleď: ''[[Halspiviridae]]'' (1 rod) |
||
::::*:*:* Rod: ''[[Salterprovirus]]'' |
::::*:*:* Rod: ''[[Salterprovirus]]'' |
||
::::*:* Čeleď: ''[[Hytrosaviridae]]'' (2 rody) |
::::*:* Čeleď: ''[[Hytrosaviridae]]''<ref name="Koonin_2015,2019" group="pozn." /> (2 rody) |
||
::::*:*:* Rod: ''[[Glossinavirus]]'', ''[[Muscavirus]]'' |
::::*:*:* Rod: ''[[Glossinavirus]]'', ''[[Muscavirus]]'' |
||
::::*:* Čeleď: ''[[Nimaviridae]]'' (1 rod) |
::::*:* Čeleď: ''[[Nimaviridae]]''<ref name="Koonin_2015,2019" group="pozn." /> (1 rod) |
||
::::*:*:* Rod: ''[[Whispovirus]]'' |
::::*:*:* Rod: ''[[Whispovirus]]'' |
||
::::*:* Čeleď: ''[[Nudiviridae]]'' (2 rody) |
::::*:* Čeleď: ''[[Nudiviridae]]''<ref name="Koonin_2015,2019" group="pozn." /> (2 rody) |
||
::::*:*:* Rod: ''[[Alphanudivirus]]'', ''[[Betanudivirus]]'' |
::::*:*:* Rod: ''[[Alphanudivirus]]'', ''[[Betanudivirus]]'' |
||
::::*:* Čeleď: ''[[Ovaliviridae]]'' (1 rod) |
::::*:* Čeleď: ''[[Ovaliviridae]]'' (1 rod) |
||
Řádek 716: | Řádek 750: | ||
::::*:* Čeleď: ''[[Plasmaviridae]]'' (1 rod) |
::::*:* Čeleď: ''[[Plasmaviridae]]'' (1 rod) |
||
::::*:*:* Rod: ''[[Plasmavirus]]'' |
::::*:*:* Rod: ''[[Plasmavirus]]'' |
||
::::*:* Čeleď: ''[[Polydnaviridae]]'' (2 rody) |
::::*:* Čeleď: ''[[Polydnaviridae]]''<ref name="Koonin_2015,2019" group="pozn." /> (2 rody) |
||
::::*:*:* Rod: ''[[Bracovirus]]'', ''[[Ichnovirus]]'' |
::::*:*:* Rod: ''[[Bracovirus]]'', ''[[Ichnovirus]]'' |
||
::::*:* Čeleď: ''[[Portogloboviridae]]'' (1 rod) |
::::*:* Čeleď: ''[[Portogloboviridae]]'' (1 rod) |
Verze z 24. 3. 2021, 18:10
Klasifikace virů je vzhledem k jejich rozmanitosti a proměnlivosti problematičtější než u buněčných organismů. Existuje proto více možných přístupů a z nich vzniklých klasifikačních systémů.
Nejstarší klasifikační systémy virů vycházely z klasifikace napadaných organismů. Byla to například Holmesova klasifikace z r. 1948, aplikující linnéovskou biologickou nomenklaturu a členící viry na fágy (napadající bakterie), fytofágy (napadající rostliny) a zoofágy (napadající živočichy).
Později se viry začaly klasifikovat podle strukturních fyzikálních a chemických vlastností, jako je nosič genetické informace (RNA nebo DNA), velikost, tvar a symetrie kapsidy apod. K takovým klasifikačním systémům patří např. hierarchická klasifikace LHT z roku 1962, dnes již zastaralá.
Aktuální snahou biologických klasifikačních systémů je přirozenost z hlediska fylogenetické příbuznosti. O tu se snaží podrobný, každoročně aktualizovaný systém Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV).
V současnosti se stále používá zjednodušená klasifikace podle nosiče genetické informace a způsobu jejího přepisu, tak zvaná Baltimorova klasifikace z r. 1971. V některých aspektech je však již neslučitelná s moderní fylogenetickou klasifikací ICTV.
Vzhledem k tomu, že není známo příliš mnoho typů subvirových činitelů (viroidy, satelitní viry včetně virofágů, satelitní nukleové kyseliny včetně virusoidů), dlouho pro ně neexistoval odpovídající systém a byly klasifikovány pouze podle nosiče genetické informace, případně i její velikosti. Výjimkou byl klasifikační systém viroidů podle Florese z roku 1998,[1] revidovaný Dienerem v r. 2001,[2] používající čeledi a rody. Později byl včleněn do systému ICTV, do kterého jsou od r. 2015 zahrnuty i vybrané satelitní viry (včetně virofágů) a satelitní nukleové kyseliny, obojí se snahou respektovat jejich pravděpodobnou fylogenetickou příbuznost k jiným virům.[3]
Systém ICTV
Mezinárodní komise pro klasifikaci virů (International Committee on Taxonomy of Viruses - ICTV) klasifikuje jednotlivé druhy virů podobně jako buněčné organismy do říší, kmenů (případně i podkmenů), tříd, řádů (podřádů), čeledí (podčeledí) a rodů (podrodů). Nejvyšším taxonem, nadřazeným říším, je realm[pozn. 1]. Systém ICTV důsledně používá metagenomický přístup.[9][4] Snahou je přitom respektovat fylogenetickou příbuznost, tedy na základě genetické informace sdružovat taxony dané úrovně do skupin, u kterých lze předpokládat společného předka.
Standardními příponami v taxonomii jsou:[3]
- u virů (včetně satelitních virů a retrotranspozonů)
- pro realm: -viria
- pro říši: -virae
- pro kmen: -viricota
- pro podkmen: -virales
- pro třídu: -viricetes
- pro řád: -virales
- pro podřád: -virineae
- pro čeleď: -viridae
- pro podčeleď: -virinae
- pro rod a podrod: -virus
- u viroidů:
- pro čeleď: -viroidae
- pro rod: -viroid
- u satelitních nukleových kyselin:
- pro čeleď: -satellitidae
- pro podčeleď: -satellitinae
- pro rod: -satellite
Virologická nomenklatura nemá předepsáno binomiální názvosloví pro druhy, třebaže probíhají diskuse o jeho možném zavedení, které by mělo odstranit nejednotný přístup (názvy virových druhů jsou tvořeny mnoha různými způsoby, vedoucími k výsledným jednoslovným až šestislovným názvům).[10]
Podle názvoslovného kódu ICTV se názvy všech vyšších taxonů píší stejně jako jména druhů kurzívou.[3]
Aktuální klasifikace byla přijata v červenci 2019 a ratifikována v březnu 2020. Viry (druhy uznané ICTV) jsou systematicky kategorizovány do 4 realmů; vedle nich jeden řád, 24 čeledí a tři rody zůstávají nezařazeny.[11][12]
Klasifikace ICTV zahrnuje také viroidy (nezařazené čeledi Avsunviroidae a Pospiviroidae), vybrané virofágy (čeleď Lavidaviridae) a jiné satelitní viry (např. v čeledích Parvoviridae, Tombusviridae a Virgaviridae a nezařazených rodech Albetovirus, Aumaivirus, Papanivirus, Virtovirus), retrotranspozony (čeledi Metaviridae a Pseudoviridae z řádu Ortervirales) a satelitní nukleové kyseliny (nezařazené čeledi Alphasatellitidae a Tolecusatellitidae).
V následujícím přehledu (do úrovně rodů) jsou navíc pro úplnost uvedeny i dosud neuznané navrhované taxony, vždy označené závorkou "(neuznaný/á)". Návrh plyne z uvedené reference (zpravidla vědeckého periodika nebo webové složky ICTV s návrhy, u kterých dosud neskončil proces k jejich uznání[13]).
Realm: Duplodnaviria (1 říše)
- Říše: Heunggongvirae (2 kmeny)
- Kmen: Peploviricota (1 třída)
- Třída: Herviviricetes (1 řád)
- Řád: Herpesvirales (3 čeledi)
- Čeleď: Alloherpesviridae (4 rody)
- Čeleď: Herpesviridae (3 podčeledi)
- Podčeleď: Alphaherpesvirinae (5 rodů)
- Podčeleď: Betaherpesvirinae (4 rody)
- Podčeleď: Gammaherpesvirinae (4 rody)
- Čeleď: Malacoherpesviridae (2 rody)
- Rod: Aurivirus, Ostreavirus
- Řád: Herpesvirales (3 čeledi)
- Třída: Herviviricetes (1 řád)
- Kmen: Uroviricota (1 třída)
- Třída: Caudoviricetes (1 řád)
- Řád: Caudovirales (9 čeledí, 1 neuznaná čeleď)
- (nezařazené do čeledí)
- Rod: Lilyvirus
- Čeleď: Ackermannviridae (2 podčeledi)
- (nezařazené do podčeledí)
- Rod: Taipeivirus
- Podčeleď: Aglimvirinae (2 rody)
- Rod: Agtrevirus, Limestonevirus
- Podčeleď: Cvivirinae (1 rod)
- Rod: Kuttervirus
- (nezařazené do podčeledí)
- Čeleď: Autographiviridae (9 podčeledí)
- (nezařazené do podčeledí)
- Rod: Aegirvirus, Aqualcavirus, Ashivirus, Atuphduovirus, Ayakvirus, Ayaqvirus, Banchanvirus, Bifseptvirus, Bonnellvirus, Cheungvirus, Chosvirus, Cuernavacavirus, Cyclitvirus, Ermolevavirus, Foturvirus, Foussvirus, Fussvirus, Gajwadongvirus, Gyeongsanvirus, Igirivirus, Jalkavirus, Jiaoyazivirus, Kafavirus, Kajamvirus, Kakivirus, Kalppathivirus, Kelmasvirus, Kembevirus, Krakvirus, Lauvirus, Limelightvirus, Lingvirus, Lirvirus, Lullwatervirus, Maculvirus, Napahaivirus, Nohivirus, Oinezvirus, Paadamvirus, Pagavirus, Pairvirus, Pedosvirus, Pekhitvirus, Pelagivirus, Percyvirus, Piedvirus, Podivirus, Pollyceevirus, Poseidonvirus, Powvirus, Pradovirus, Qadamvirus, Scottvirus, Sednavirus, Serkorvirus, Sieqvirus, Stompelvirus, Stopalavirus, Stopavirus, Stupnyavirus, Tangaroavirus, Tawavirus, Tiamatvirus, Tiilvirus, Tritonvirus, Voetvirus, Votkovvirus, Waewaevirus, Wuhanvirus
- Podčeleď: Beijerinckvirinae (3 rody)
- Rod: Daemvirus, Friunavirus, Pettyvirus
- Podčeleď: Colwellvirinae (5 rodů)
- Podčeleď: Corkvirinae (4 rody)
- Rod: Kantovirus, Kotilavirus, Phimunavirus, Stompvirus
- Podčeleď: Krylovirinae (4 rody)
- Podčeleď: Melnykvirinae (8 rodů)
- Podčeleď: Molineuxvirinae (6 rodů)
- Podčeleď: Okabevirinae (5 rodů)
- Rod: Ampunavirus, Higashivirus, Mguuvirus, Risjevirus, Sukuvirus
- Podčeleď: Slopekvirinae (4 rody)
- Podčeleď: Studiervirinae (23 rodů)
- Rod: Aarhusvirus, Apdecimavirus, Berlinvirus, Caroctavirus, Chatterjeevirus, Eapunavirus, Elunavirus, Foetvirus, Ghunavirus, Helsettvirus, Jarilovirus, Kayfunavirus, Minipunavirus, Ningirsuvirus, Pektosvirus, Phutvirus, Pifdecavirus, Pijolavirus, Przondovirus, Teetrevirus, Teseptimavirus, Troedvirus, Unyawovirus
- (nezařazené do podčeledí)
- Čeleď (neuznaná): Autolykiviridae[14][15][16] (1 neuznaný rod)
- Rod (neuznaný): Autolykivirus[14][15][16]
- Čeleď: Chaseviridae (6 rodů)
- Čeleď: Demerecviridae (3 podčeledi)
- (nezařazené do podčeledí)
- Podčeleď: Ermolyevavirinae (3 rody)
- Rod: Cetovirus, Jesfedecavirus, Vipunavirus
- Podčeleď: Markadamsvirinae (3 rody)
- Podčeleď: Mccorquodalevirinae (2 rody)
- Rod: Hongcheonvirus, Myunavirus
- Čeleď: Drexlerviridae (4 podčeledi)
- (nezařazené do podčeledí)
- Podčeleď: Braunvirinae (4 rody)
- Podčeleď: Rogunavirinae (4 rody)
- Podčeleď: Tempevirinae (3 rody)
- Rod: Hanrivervirus, Tlsvirus, Warwickvirus
- Podčeleď: Tunavirinae (3 rody)
- Rod: Badaguanvirus, Sertoctavirus, Tunavirus
- Čeleď: Herelleviridae (5 podčeledí)
- Podčeleď: Bastillevirinae (7 rodů)
- Podčeleď: Brockvirinae (2 rody)
- Rod: Kochikohdavirus, Schiekvirus
- Podčeleď: Jasinkavirinae (1 rod)
- Rod: Pecentumvirus
- Podčeleď: Spounavirinae (2 rody)
- Rod: Okubovirus, Siminovitchvirus
- Podčeleď: Twortvirinae (7 rodů)
- Čeleď: Myoviridae (5 podčeledí)
- (nezařazené do podčeledí)
- Rod: Abouovirus, Acionnavirus, Agricanvirus, Ahtivirus, Alcyoneusvirus, Alexandravirus, Anamdongvirus, Anaposvirus, Aokuangvirus, Aphroditevirus, Asteriusvirus, Atlauavirus, Aurunvirus, Baikalvirus, Barbavirus, Bcepmuvirus, Bellamyvirus, Bendigovirus, Biquartavirus, Bixzunavirus, Brigitvirus, Brizovirus, Brunovirus, Busanvirus, Carpasinavirus, Chakrabartyvirus, Charybdisvirus, Chiangmaivirus, Cymopoleiavirus, Derbicusvirus, Elvirus, Emdodecavirus, Eneladusvirus, Eponavirus, Erskinevirus, Eurybiavirus, Ficleduovirus, Flaumdravirus, Gofduovirus, Goslarvirus, Hapunavirus, Heilongjiangvirus, Iapetusvirus, Iodovirus, Ionavirus, Jedunavirus, Jilinvirus, Jimmervirus, Kanaloavirus, Kleczkowskavirus, Lagaffevirus, Leucotheavirus, Libanvirus, Llyrvirus, Loughboroughvirus, Lubbockvirus, Machinavirus, Marthavirus, Mazuvirus, Metrivirus, Mieseafarmvirus, Mimasvirus, Mushuvirus, Muvirus, Myohalovirus, Naesvirus, Namakavirus, Nankokuvirus, Neptunevirus, Nereusvirus, Nerrivikvirus, Nodensvirus, Noxifervirus, Obolenskvirus, Otagovirus, Pakpunavirus, Palaemonvirus, Pbunavirus, Peatvirus, Petsuvirus, Phabquatrovirus, Phapecoctavirus, Phikzvirus, Plaisancevirus, Polybotosvirus, Pontusvirus, Popoffvirus, Punavirus, Qingdaovirus, Radnorvirus, Ripduovirus, Risingsunvirus, Rosemountvirus, Saclayvirus, Salacisavirus, Salmondvirus, Sasquatchvirus, Schmittlotzvirus, Seoulvirus, Shalavirus, Svunavirus, Tabernariusvirus, Tamkungvirus, Taranisvirus, Tefnutvirus, Tegunavirus, Thaumasvirus, Thetisvirus, Thornevirus, Tidunavirus, Tijeunavirus, Toutatisvirus, Tulanevirus, Vellamovirus, Vhmlvirus, Viunavirus, Wellingtonvirus, Wifcevirus, Winklervirus, Yokohamavirus, Yoloswagvirus
- Podčeleď: Eucampyvirinae (2 rody)
- Rod: Firehammervirus, Fletchervirus
- Podčeleď: Ounavirinae (4 rody)
- Podčeleď: Peduovirinae (26 rodů)
- Rod: Aresaunavirus, Baylorvirus, Bielevirus, Canoevirus, Catalunyavirus, Citexvirus, Eganvirus, Entnonagintavirus, Felsduovirus, Hpunavirus, Irtavirus, Kisquattuordecimvirus, Kisquinquevirus, Longwoodvirus, Nampongvirus, Peduovirus, Phitrevirus, Playavirus, Reginaelenavirus, Senquatrovirus, Seongnamvirus, Simpcentumvirus, Stockinghallvirus, Tigrvirus, Vulnificusvirus, Xuanwuvirus
- Podčeleď: Tevenvirinae (11 rodů)
- Podčeleď: Vequintavirinae (4 rody)
- Rod: Avunavirus, Certrevirus, Seunavirus, Vequintavirus
- (nezařazené do podčeledí)
- Čeleď: Podoviridae (3 podčeledi)
- (nezařazené do podčeledí)
- Rod: Baltimorevirus, Bjornvirus, Bruynoghevirus, Enhodamvirus, Enquatrovirus, Fipvunavirus, Fischettivirus, Gamaleyavirus, Giessenvirus, Hollowayvirus, Ithacavirus, Jasminevirus, Johnsonvirus, Jwalphavirus, Kafunavirus, Kelquatrovirus, Kochitakasuvirus, Krylovvirus, Kuravirus, Lederbergvirus, Lessievirus, Lightbulbvirus, Litunavirus, Luzseptimavirus, Mukerjeevirus, Myxoctovirus, Pagevirus, Perisivirus, Rauchvirus, Ryyoungvirus, Schmidvirus, Shizishanvirus, Skarprettervirus, Sortsnevirus, Uetakevirus, Vicosavirus, Xuquatrovirus
- Podčeleď: Picovirinae (3 rody)
- Rod: Cepunavirus, Negarvirus, Salasvirus
- Podčeleď: Rakietenvirinae (2 rody)
- Rod: Andhravirus, Rosenblumvirus
- Podčeleď: Sepvirinae (3 rody)
- Rod: Diegovirus, Oslovirus, Traversvirus
- (nezařazené do podčeledí)
- Čeleď: Siphoviridae (13 podčeledí)
- (nezařazené do podčeledí)
- Rod: Abbeymikolonvirus, Abidjanvirus, Ahduovirus, Amigovirus, Anatolevirus, Andrewvirus, Andromedavirus, Appavirus, Apricotvirus, Armstrongvirus, Attisvirus, Attoomivirus, Austintatiousvirus, Bantamvirus, Barnyardvirus, Beetrevirus, Bernalvirus, Betterkatzvirus, Bingvirus, Biseptimavirus, Bowservirus, Bridgettevirus, Britbratvirus, Bronvirus, Brussowvirus, Casadabanvirus, Cbastvirus, Cecivirus, Ceduovirus, Ceetrepovirus, Cequinquevirus, Chenonavirus, Cheoctovirus, Chivirus, Chunghsingvirus, Cimpunavirus, Cinunavirus, Coetzeevirus, Coralvirus, Corndogvirus, Cronusvirus, Daredevilvirus, Decurrovirus, Delepquintavirus, Demosthenesvirus, Detrevirus, Dhillonvirus, Dismasvirus, Doucettevirus, Edenvirus, Efquatrovirus, Eiauvirus, Eisenstarkvirus, Elerivirus, Emalynvirus, Eyrevirus, Fairfaxidumvirus, Farahnazvirus, Feofaniavirus, Fibralongavirus, Franklinbayvirus, Fromanvirus, Gaiavirus, Galaxyvirus, Galunavirus, Gamtrevirus, Gesputvirus, Getseptimavirus, Ghobesvirus, Gilesvirus, Gillianvirus, Godonkavirus, Goodmanvirus, Gordonvirus, Gordtnkvirus, Gorganvirus, Gorjumvirus, Gustavvirus, Harrisonvirus, Hedwigvirus, Helsingorvirus, Hendrixvirus, Hiyaavirus, Holosalinivirus, Homburgvirus, Ikedavirus, Ilzatvirus, Incheonvrus, Inhavirus, Jacevirus, Jenstvirus, Juiceboxvirus, Kairosalinivirus, Kelleziovirus, Kilunavirus, Klementvirus, Kojivirus, Korravirus, Kostyavirus, Krampusvirus, Kryptosalinivirus, Lacusarxvirus, Lambdavirus, Lanavirus, Laroyevirus, Lebronvirus[17] (neuznaný), Lentavirus, Liebevirus, Liefievirus, Lokivirus, Lomovskayavirus, Luckybarnesvirus, Luckytenvirus, Lughvirus, Lwoffvirus, Magadivirus, Majavirus, Manhattanvirus, Mapvirus, Mardecavirus, Marvinvirus, Maxrubnervirus, Mementomorivirus, Metamorphoovirus, Minunavirus, Moineauvirus, Montyvirus, Mudcatvirus, Murrayvirus, Nanhaivirus, Nazgulvirus, Neferthenavirus, Nickievirus, Nipunavirus, Nonagvirus, Nonanavirus, Nyceiraevirus, Oengusvirus, Omegavirus, Oneupvirus, Orchidvirus, Oshimavirus, Pahexavirus, Pamexvirus, Papyrusvirus, Patiencevirus, Pbi1virus, Pepyhexavirus, Phietavirus, Phifelvirus, Picardvirus, Pikminvirus, Poushouvirus, Priunavirus, Psavirus, Psimunavirus, Pulverervirus, Quhwahvirus, Raleighvirus, Ravinvirus, Rerduovirus, Rigallicvirus, Rimavirus, Rogerhendrixvirus, Ronaldovirus, Roufvirus, Rowavirus, Ruthyvirus, Samistivirus, Samunavirus, Samwavirus, Sanovirus, Sansavirus, Saphexavirus, Sashavirus, Sasvirus, Saundersvirus, Scapunavirus, Schnabeltiervirus, Schubertvirus, Septimatrevirus, Seuratvirus, Seussvirus, Sextaecvirus, Sitaravirus, Skunavirus, Slashvirus, Smoothievirus, Sonalivirus, Soupsvirus, Sourvirus, Spbetavirus, Squashvirus, Stanholtvirus, Steinhofvirus, Tankvirus, Terapinvirus, Tigunavirus, Timquatrovirus, Tinduovirus, Titanvirus, Tortellinivirus, Triavirus, Trigintaduovirus, Trinavirus, Trinevirus, Trippvirus, Unahavirus, Vashvirus, Vegasvirus, Vendettavirus, Vhulanivirus, Vidquintavirus, Vieuvirus, Vividuovirus, Vojvodinavirus, Wbetavirus, Weaselvirus, Wildcatvirus, Wilnyevirus, Wizardvirus, Woesvirus, Woodruffvirus, Xiamenvirus, Xipdecavirus, Yangvirus, Yuavirus, Yvonnevirus, Zetavirus
- Podčeleď: Arquatrovirinae (3 rody)
- Rod: Arequatrovirus, Camvirus, Likavirus
- Podčeleď: Bclasvirinae (5 rodů)
- Podčeleď: Chebruvirinae (1 rod)
- Rod: Brujitavirus
- Podčeleď: Dclasvirinae (2 rody)
- Rod: Hawkeyevirus, Plotvirus
- Podčeleď: Dolichocephalovirinae (4 rody)
- Podčeleď: Guernseyvirinae (3 rody)
- Rod: Cornellvirus, Jerseyvirus, Kagunavirus
- Podčeleď: Langleyhallvirinae (3 rody)
- Rod: Getalongvirus, Horusvirus, Phistoryvirus
- Podčeleď: Mccleskeyvirinae (2 rody)
- Rod: Limdunavirus, Unaquatrovirus
- Podčeleď: Mclasvirinae (2 rody)
- Rod: Bongovirus, Reyvirus
- Podčeleď: Nclasvirinae (3 rody)
- Rod: Buttersvirus, Charlievirus, Redivirus
- Podčeleď: Nymbaxtervirinae (2 rody)
- Rod: Baxtervirus, Nymphadoravirus
- Podčeleď: Pclasvirinae (3 rody)
- Podčeleď: Tybeckvirinae (4 rody)
- (nezařazené do podčeledí)
- (nezařazené do čeledí)
- Řád: Caudovirales (9 čeledí, 1 neuznaná čeleď)
- Třída: Caudoviricetes (1 řád)
- Kmen: Peploviricota (1 třída)
Realm: Monodnaviria (4 říše)
- Říše: Loebvirae (1 kmen)
- Kmen: Hofneiviricota (1 třída)
- Třída: Faserviricetes (1 řád)
- Řád: Tubulavirales (2 čeledi)
- Čeleď: Inoviridae (23 rodů)
- Rod: Affertcholeramvirus, Bifilivirus, Capistrivirus, Coriovirus, Fibrovirus, Habenivirus, Infulavirus, Inovirus, Lineavirus, Parhipatevirus, Primolicivirus, Psecadovirus, Restivirus, Saetivirus, Scuticavirus, Staminivirus, Subteminivirus, Tertilicivirus, Thomixvirus, Versovirus, Vicialiavirus, Villovirus, Xylivirus
- Čeleď: Plectroviridae (3 rody)
- Čeleď: Inoviridae (23 rodů)
- Řád: Tubulavirales (2 čeledi)
- Třída: Faserviricetes (1 řád)
- Kmen: Hofneiviricota (1 třída)
- Říše: Sangervirae (1 kmen)
- Kmen: Phixviricota (1 třída)
- Třída: Malgrandaviricetes (1 řád)
- Řád: Petitvirales (1 čeleď)
- Čeleď: Microviridae (2 podčeledi)
- Podčeleď: Bullavirinae (3 rody)
- Podčeleď: Gokushovirinae (3 rody)
- Čeleď: Microviridae (2 podčeledi)
- Řád: Petitvirales (1 čeleď)
- Třída: Malgrandaviricetes (1 řád)
- Kmen: Phixviricota (1 třída)
- Říše: Shotokuvirae (2 kmeny)
- Kmen: Cossaviricota (3 třídy)
- Třída: Mouviricetes (1 řád)
- Řád: Polivirales (1 čeleď)
- Čeleď: Bidnaviridae (1 rod)
- Rod: Bidensovirus
- Čeleď: Bidnaviridae (1 rod)
- Řád: Polivirales (1 čeleď)
- Třída: Papovaviricetes (2 řády)
- Řád: Sepolyvirales (1 čeleď)
- Čeleď: Polyomaviridae (4 rody)
- Řád: Zurhausenvirales (1 čeleď)
- Čeleď: Papillomaviridae (2 podčeledi)
- Podčeleď: Firstpapillomavirinae (52 rodů)
- Rod: Alphapapillomavirus, Betapapillomavirus, Chipapillomavirus, Deltapapillomavirus, Dyochipapillomavirus, Dyodeltapapillomavirus, Dyoepsilonpapillomavirus, Dyoetapapillomavirus, Dyoiotapapillomavirus, Dyokappapapillomavirus, Dyolambdapapillomavirus, Dyomupapillomavirus, Dyonupapillomavirus, Dyoomegapapillomavirus, Dyoomikronpapillomavirus, Dyophipapillomavirus, Dyopipapillomavirus, Dyopsipapillomavirus, Dyorhopapillomavirus, Dyosigmapapillomavirus, Dyotaupapillomavirus, Dyothetapapillomavirus, Dyoupsilonpapillomavirus, Dyoxipapillomavirus, Dyozetapapillomavirus, Epsilonpapillomavirus, Etapapillomavirus, Gammapapillomavirus, Iotapapillomavirus, Kappapapillomavirus, Lambdapapillomavirus, Mupapillomavirus, Nupapillomavirus, Omegapapillomavirus, Omikronpapillomavirus, Phipapillomavirus, Pipapillomavirus, Psipapillomavirus, Rhopapillomavirus, Sigmapapillomavirus, Taupapillomavirus, Thetapapillomavirus, Treisdeltapapillomavirus, Treisepsilonpapillomavirus, Treisetapapillomavirus, Treisiotapapillomavirus, Treiskappapapillomavirus, Treisthetapapillomavirus, Treiszetapapillomavirus, Upsilonpapillomavirus, Xipapillomavirus, Zetapapillomavirus
- Podčeleď: Secondpapillomavirinae (1 rod)
- Rod: Alefpapillomavirus
- Podčeleď: Firstpapillomavirinae (52 rodů)
- Čeleď: Papillomaviridae (2 podčeledi)
- Řád: Sepolyvirales (1 čeleď)
- Třída: Quintoviricetes (1 řád)
- Řád: Piccovirales (1 čeleď)
- Čeleď: Parvoviridae (3 podčeledi)
- Podčeleď: Densovirinae (9 rodů)
- Podčeleď: Hamaparvovirinae (4 rody)
- Podčeleď: Parvovirinae (10 rodů)
- Čeleď: Parvoviridae (3 podčeledi)
- Řád: Piccovirales (1 čeleď)
- Třída: Mouviricetes (1 řád)
- Kmen: Cressdnaviricota (2 třídy)
- Třída: Arfiviricetes (5 řádů)
- Řád: Baphyvirales (1 čeleď)
- Čeleď: Bacilladnaviridae (3 rody)
- Řád: Cirlivirales (1 čeleď)
- Čeleď: Circoviridae (2 rody)
- Rod: Circovirus, Cyclovirus
- Čeleď: Circoviridae (2 rody)
- Řád: Cremevirales (1 čeleď)
- Čeleď: Smacoviridae (6 rodů)
- Řád: Mulpavirales (1 čeleď)
- Čeleď: Nanoviridae (2 rody)
- Řád: Recrevirales (1 čeleď)
- Čeleď: Redondoviridae (1 rod)
- Rod: Torbevirus
- Čeleď: Redondoviridae (1 rod)
- Řád: Baphyvirales (1 čeleď)
- Třída: Repensiviricetes (1 řád)
- Řád: Geplafuvirales (2 čeledi, 1 neuznaná čeleď)
- Čeleď: Geminiviridae (9 rodů, 1 neuznaný rod)
- Rod: Becurtovirus, Begomovirus, Capulavirus, Curtovirus, Eragrovirus, Grablovirus, Graingemvirus[18] (neuznaný), Mastrevirus, Topocuvirus, Turncurtovirus
- Čeleď: Genomoviridae (9 rodů)
- Čeleď (neuznaná): Naminiviridae[19] (1 neuznaný rod)
- Rod (neuznaný): Cofodevirus[19]
- Čeleď: Geminiviridae (9 rodů, 1 neuznaný rod)
- Řád: Geplafuvirales (2 čeledi, 1 neuznaná čeleď)
- Třída: Arfiviricetes (5 řádů)
- Kmen: Cossaviricota (3 třídy)
- Říše: Trapavirae (1 kmen)
- Kmen: Saleviricota (1 třída)
- Třída: Huolimaviricetes (1 řád)
- Řád: Haloruvirales (1 čeleď)
- Čeleď: Pleolipoviridae (3 rody)
- Řád: Haloruvirales (1 čeleď)
- Třída: Huolimaviricetes (1 řád)
- Kmen: Saleviricota (1 třída)
Riboviria
Realm: Riboviria (2 říše) [pozn. 2]
- (nezařazené do říší)
- Rod: Albetovirus, Aumaivirus, Papanivirus, Virtovirus
- Čeleď: Polymycoviridae (1 rod)
- Rod: Polymycovirus
- Čeleď: Sarthroviridae (1 rod)
- Rod: Macronovirus
- Říše: Orthornavirae (5 kmenů)
- (nezařazené do kmene)
- Rod: Botybirnavirus
- Čeleď: Birnaviridae (7 rodů)
- Čeleď: Permutotetraviridae (1 rod)
- Kmen: Duplornaviricota (3 třídy)
- Třída: Chrymotiviricetes (1 řád)
- Řád: Ghabrivirales (4 čeledi)
- Čeleď: Chrysoviridae (2 rody)
- Čeleď: Megabirnaviridae (1 rod)
- Rod: Megabirnavirus
- Čeleď: Quadriviridae (1 rod)
- Rod: Quadrivirus
- Čeleď: Totiviridae (5 rodů)
- Řád: Ghabrivirales (4 čeledi)
- Třída: Resentoviricetes (1 řád)
- Řád: Reovirales (1 čeleď)
- Čeleď: Reoviridae (2 podčeledi)
- Podčeleď: Sedoreovirinae (6 rodů)
- Podčeleď: Spinareovirinae (9 rodů)
- Čeleď: Reoviridae (2 podčeledi)
- Řád: Reovirales (1 čeleď)
- Třída: Vidaverviricetes (1 řád)
- Řád: Mindivirales (1 čeleď)
- Čeleď: Cystoviridae (1 rod)
- Rod: Cystovirus
- Čeleď: Cystoviridae (1 rod)
- Řád: Mindivirales (1 čeleď)
- Třída: Chrymotiviricetes (1 řád)
- Kmen: Kitrinoviricota (4 třídy)
- Třída: Alsuviricetes (3 řády)
- Řád: Hepelivirales (4 čeledi)
- Čeleď: Alphatetraviridae (2 rody)
- Čeleď: Benyviridae (1 rod)
- Rod: Benyvirus
- Čeleď: Hepeviridae (2 rody)
- Rod: Orthohepevirus, Piscihepevirus
- Čeleď: Matonaviridae (1 rod)
- Rod: Rubivirus
- Řád: Martellivirales (7 čeledí)
- Čeleď: Bromoviridae (6 rodů)
- Rod: Alfamovirus, Anulavirus, Bromovirus, Cucumovirus, Ilarvirus, Oleavirus
- Čeleď: Closteroviridae (4 rody)
- Čeleď: Endornaviridae (2 rody)
- Čeleď: Kitaviridae (3 rody)
- Rod: Blunervirus, Cilevirus, Higrevirus
- Čeleď: Mayoviridae (2 rody)
- Rod: Idaeovirus, Pteridovirus
- Čeleď: Togaviridae (1 rod)
- Rod: Alphavirus
- Čeleď: Virgaviridae (7 rodů)
- Čeleď: Bromoviridae (6 rodů)
- Řád: Tymovirales (5 čeledí)
- Čeleď: Alphaflexiviridae (7 rodů)
- Čeleď: Betaflexiviridae (2 podčeledi)
- Podčeleď: Quinvirinae (3 rody)
- Rod: Carlavirus, Foveavirus, Robigovirus
- Podčeleď: Trivirinae (10 rodů)
- Podčeleď: Quinvirinae (3 rody)
- Čeleď: Deltaflexiviridae (1 rod)
- Rod: Deltaflexivirus
- Čeleď: Gammaflexiviridae (1 rod)
- Rod: Mycoflexivirus
- Čeleď: Tymoviridae (3 rody)
- Rod: Maculavirus, Marafivirus, Tymovirus
- Řád: Hepelivirales (4 čeledi)
- Třída: Flasuviricetes (1 řád)
- Řád: Amarillovirales (1 čeleď)
- Čeleď: Flaviviridae (4 rody)
- Rod: Flavivirus, Hepacivirus, Pegivirus, Pestivirus
- Čeleď: Flaviviridae (4 rody)
- Řád: Amarillovirales (1 čeleď)
- Třída: Magsaviricetes (1 řád)
- Řád: Nodamuvirales (2 čeledi)
- Čeleď: Nodaviridae (2 rody)
- Rod: Alphanodavirus, Betanodavirus
- Čeleď: Sinhaliviridae (1 rod)
- Rod: Sinaivirus
- Čeleď: Nodaviridae (2 rody)
- Řád: Nodamuvirales (2 čeledi)
- Třída: Tolucaviricetes (1 řád)
- Řád: Tolivirales (3 čeledi)
- Čeleď: Carmotetraviridae (1 rod)
- Rod: Alphacarmotetravirus
- Čeleď: Luteoviridae (3 rody)
- Rod: Enamovirus, Luteovirus, Polerovirus
- Čeleď: Tombusviridae (3 podčeledi)
- Podčeleď: Calvusvirinae (1 rod)
- Rod: Umbravirus
- Podčeleď: Procedovirinae (14 rodů)
- Podčeleď: Regressovirinae (1 rod)
- Rod: Dianthovirus
- Podčeleď: Calvusvirinae (1 rod)
- Čeleď: Carmotetraviridae (1 rod)
- Řád: Tolivirales (3 čeledi)
- Třída: Alsuviricetes (3 řády)
- Kmen: Lenarviricota (4 třídy)
- Třída: Allassoviricetes (1 řád)
- Řád: Levivirales (1 čeleď)
- Čeleď: Leviviridae (2 rody)
- Rod: Allolevivirus, Levivirus
- Čeleď: Leviviridae (2 rody)
- Řád: Levivirales (1 čeleď)
- Třída: Amabiliviricetes (1 řád)
- Řád: Wolframvirales (1 čeleď)
- Čeleď: Narnaviridae (1 rod)
- Rod: Narnavirus
- Čeleď: Narnaviridae (1 rod)
- Řád: Wolframvirales (1 čeleď)
- Třída: Howeltoviricetes (1 řád)
- Řád: Cryppavirales (1 čeleď)
- Čeleď: Mitoviridae (1 rod)
- Rod: Mitovirus
- Čeleď: Mitoviridae (1 rod)
- Řád: Cryppavirales (1 čeleď)
- Třída: Miaviricetes (1 řád)
- Řád: Ourlivirales (1 čeleď)
- Čeleď: Botourmiaviridae (4 rody, 1 neuznaný rod)
- Rod: Botoulivirus, Magoulivirus, Ourmiavirus, Ostravirus[21][22] (neuznaný), Scleroulivirus
- Čeleď: Botourmiaviridae (4 rody, 1 neuznaný rod)
- Řád: Ourlivirales (1 čeleď)
- Třída: Allassoviricetes (1 řád)
- Kmen: Negarnaviricota (2 podkmeny)
- Podkmen: Haploviricotina (4 třídy)
- Třída: Chunqiuviricetes (1 řád)
- Řád: Muvirales (1 čeleď)
- Čeleď: Qinviridae (1 rod)
- Rod: Yingvirus
- Čeleď: Qinviridae (1 rod)
- Řád: Muvirales (1 čeleď)
- Třída: Milneviricetes (1 řád)
- Řád: Serpentovirales (1 čeleď)
- Čeleď: Aspiviridae (1 rod)
- Rod: Ophiovirus
- Čeleď: Aspiviridae (1 rod)
- Řád: Serpentovirales (1 čeleď)
- Třída: Monjiviricetes (2 řády)
- Řád: Jingchuvirales (1 čeleď)
- Čeleď: Chuviridae (1 rod)
- Rod: Mivirus
- Čeleď: Chuviridae (1 rod)
- Řád: Mononegavirales (11 čeledí)
- Čeleď: Artoviridae (2 rody)
- Rod: Hexartovirus, Peropuvirus
- Čeleď: Bornaviridae (3 rody)
- Rod: Carbovirus, Cultervirus, Orthobornavirus
- Čeleď: Filoviridae (6 rodů)
- Čeleď: Lispiviridae (1 rod)
- Rod: Arlivirus
- Čeleď: Mymonaviridae (2 rody)
- Čeleď: Nyamiviridae (6 rodů)
- Rod: Berhavirus, Crustavirus, Nyavirus, Orinovirus, Socyvirus, Tapwovirus
- Čeleď: Paramyxoviridae (4 podčeledi)
- (nezařazené do podčeledí)
- Podčeleď: Avulavirinae (3 rody)
- Podčeleď: Metaparamyxovirinae (1 rod)
- Rod: Synodonvirus
- Podčeleď: Orthoparamyxovirinae (8 rodů)
- Podčeleď: Rubulavirinae (2 rody)
- Čeleď: Pneumoviridae (2 rody)
- Čeleď: Rhabdoviridae (26 rodů)
- Rod: Almendravirus, Alphanemrhavirus, Alphanucleorhabdovirus, Arurhavirus, Betanucleorhabdovirus, Caligrhavirus, Curiovirus, Cytorhabdovirus, Dichorhavirus, Ephemerovirus, Gammanucleorhabdovirus, Hapavirus, Ledantevirus, Lyssavirus, Mousrhavirus, Novirhabdovirus, Ohlsrhavirus, Perhabdovirus, Sigmavirus, Sprivivirus, Sripuvirus, Sunrhavirus, Tibrovirus, Tupavirus, Varicosavirus, Vesiculovirus
- Čeleď: Sunviridae (1 rod)
- Rod: Sunshinevirus
- Čeleď: Xinmoviridae (1 rod)
- Rod: Anphevirus
- Čeleď: Artoviridae (2 rody)
- Řád: Jingchuvirales (1 čeleď)
- Třída: Yunchangviricetes (1 řád)
- Řád: Goujianvirales (1 čeleď)
- Čeleď: Yueviridae (1 rod)
- Rod: Yuyuevirus
- Čeleď: Yueviridae (1 rod)
- Řád: Goujianvirales (1 čeleď)
- Třída: Chunqiuviricetes (1 řád)
- Podkmen: Polyploviricotina (2 třídy)
- Třída: Ellioviricetes (1 řád)
- Řád: Bunyavirales (12 čeledí)
- Čeleď: Arenaviridae (4 rody)
- Čeleď: Cruliviridae (1 rod)
- Rod: Lincruvirus
- Čeleď: Fimoviridae (1 rod)
- Rod: Emaravirus
- Čeleď: Hantaviridae (4 podčeledi)
- Podčeleď: Actantavirinae (1 rod)
- Rod: Actinovirus
- Podčeleď: Agantavirinae (1 rod)
- Rod: Agnathovirus
- Podčeleď: Mammantavirinae (4 rody)
- Podčeleď: Repantavirinae (1 rod)
- Rod: Reptillovirus
- Podčeleď: Actantavirinae (1 rod)
- Čeleď: Leishbuviridae (1 rod)
- Rod: Shilevirus
- Čeleď: Mypoviridae (1 rod)
- Rod: Hubavirus
- Čeleď: Nairoviridae (3 rody)
- Čeleď: Peribunyaviridae (4 rody)
- Čeleď: Phasmaviridae (5 rodů)
- Čeleď: Phenuiviridae (19 rodů)
- Čeleď: Tospoviridae (1 rod)
- Rod: Orthotospovirus
- Čeleď: Wupedeviridae (1 rod)
- Rod: Wumivirus
- Řád: Bunyavirales (12 čeledí)
- Třída: Insthoviricetes (1 řád)
- Řád: Articulavirales (2 čeledi)
- Čeleď: Amnoonviridae (1 rod)
- Rod: Tilapinevirus
- Čeleď: Orthomyxoviridae (7 rodů)
- Čeleď: Amnoonviridae (1 rod)
- Řád: Articulavirales (2 čeledi)
- Třída: Ellioviricetes (1 řád)
- Podkmen: Haploviricotina (4 třídy)
- Kmen: Pisuviricota (3 třídy)
- Třída: Duplopiviricetes (1 řád)
- Řád: Durnavirales (4 čeledi)
- Čeleď: Amalgaviridae (2 rody)
- Rod: Amalgavirus, Zybavirus
- Čeleď: Hypoviridae (1 rod)
- Rod: Hypovirus
- Čeleď: Partitiviridae (5 rodů)
- Čeleď: Picobirnaviridae (1 rod)
- Rod: Picobirnavirus
- Čeleď: Amalgaviridae (2 rody)
- Řád: Durnavirales (4 čeledi)
- Třída: Pisoniviricetes (3 řády)
- Řád: Nidovirales (8 podřádů)
- Podřád: Abnidovirineae (1 čeleď)
- Čeleď: Abyssoviridae (1 podčeleď)
- Podčeleď: Tiamatvirinae (1 rod)
- Rod: Alphaabyssovirus
- Podčeleď: Tiamatvirinae (1 rod)
- Čeleď: Abyssoviridae (1 podčeleď)
- Podřád: Arnidovirineae (4 čeledi)
- Čeleď: Arteriviridae (6 podčeledí)
- Podčeleď: Crocarterivirinae (1 rod)
- Rod: Muarterivirus
- Podčeleď: Equarterivirinae (1 rod)
- Rod: Alphaarterivirus
- Podčeleď: Heroarterivirinae (1 rod)
- Rod: Lambdaarterivirus
- Podčeleď: Simarterivirinae (6 rodů)
- Podčeleď: Variarterivirinae (3 rody)
- Podčeleď: Zealarterivirinae (1 rod)
- Rod: Kappaarterivirus
- Podčeleď: Crocarterivirinae (1 rod)
- Čeleď: Cremegaviridae (1 podčeleď)
- Podčeleď: Rodepovirinae (1 rod)
- Rod: Pontunivirus
- Podčeleď: Rodepovirinae (1 rod)
- Čeleď: Gresnaviridae (1 podčeleď)
- Podčeleď: Reternivirinae (1 rod)
- Rod: Cyclophivirus
- Podčeleď: Reternivirinae (1 rod)
- Čeleď: Olifoviridae (1 podčeleď)
- Podčeleď: Gofosavirinae (1 rod)
- Rod: Kukrinivirus
- Podčeleď: Gofosavirinae (1 rod)
- Čeleď: Arteriviridae (6 podčeledí)
- Podřád: Cornidovirineae (1 čeleď)
- Čeleď: Coronaviridae (2 podčeledi)
- Podčeleď: Letovirinae (1 rod)
- Rod: Alphaletovirus
- Podčeleď: Orthocoronavirinae (4 rody)
- Podčeleď: Letovirinae (1 rod)
- Čeleď: Coronaviridae (2 podčeledi)
- Podřád: Mesnidovirineae (2 čeledi)
- Čeleď: Medioniviridae (2 podčeledi)
- Podčeleď: Medionivirinae (1 rod)
- Rod: Turrinivirus
- Podčeleď: Tunicanivirinae (1 rod)
- Rod: Bolenivirus
- Podčeleď: Medionivirinae (1 rod)
- Čeleď: Mesoniviridae (1 podčeleď)
- Podčeleď: Hexponivirinae (1 rod)
- Rod: Alphamesonivirus
- Podčeleď: Hexponivirinae (1 rod)
- Čeleď: Medioniviridae (2 podčeledi)
- Podřád: Monidovirineae (1 čeleď)
- Čeleď: Mononiviridae (1 podčeleď)
- Podčeleď: Mononivirinae (1 rod)
- Rod: Alphamononivirus
- Podčeleď: Mononivirinae (1 rod)
- Čeleď: Mononiviridae (1 podčeleď)
- Podřád: Nanidovirineae (2 čeledi)
- Čeleď: Nanghoshaviridae (1 podčeleď)
- Podčeleď: Chimanivirinae (1 rod)
- Rod: Chimshavirus
- Podčeleď: Chimanivirinae (1 rod)
- Čeleď: Nanhypoviridae (1 podčeleď)
- Podčeleď: Hyporhamsavirinae (1 rod)
- Rod: Sajorinivirus
- Podčeleď: Hyporhamsavirinae (1 rod)
- Čeleď: Nanghoshaviridae (1 podčeleď)
- Podřád: Ronidovirineae (2 čeledi)
- Čeleď: Euroniviridae (2 podčeledi)
- Podčeleď: Ceronivirinae (1 rod)
- Rod: Charybnivirus
- Podčeleď: Crustonivirinae (1 rod)
- Rod: Paguronivirus
- Podčeleď: Ceronivirinae (1 rod)
- Čeleď: Roniviridae (1 podčeleď)
- Podčeleď: Okanivirinae (1 rod)
- Rod: Okavirus
- Podčeleď: Okanivirinae (1 rod)
- Čeleď: Euroniviridae (2 podčeledi)
- Podřád: Tornidovirineae (1 čeleď)
- Čeleď: Tobaniviridae (4 podčeledi)
- Podčeleď: Piscanivirinae (2 rody)
- Rod: Bafinivirus, Oncotshavirus
- Podčeleď: Remotovirinae (1 rod)
- Rod: Bostovirus
- Podčeleď: Serpentovirinae (4 rody)
- Rod: Infratovirus, Lyctovirus, Pregotovirus, Sectovirus
- Podčeleď: Torovirinae (1 rod)
- Rod: Torovirus
- Podčeleď: Piscanivirinae (2 rody)
- Čeleď: Tobaniviridae (4 podčeledi)
- Podřád: Abnidovirineae (1 čeleď)
- Řád: Picornavirales (8 čeledí)
- Čeleď: Caliciviridae (11 rodů)
- Čeleď: Dicistroviridae (3 rody)
- Rod: Aparavirus, Cripavirus, Triatovirus
- Čeleď: Iflaviridae (1 rod)
- Rod: Iflavirus
- Čeleď: Marnaviridae (7 rodů)
- Čeleď: Picornaviridae (63 rodů)
- Rod: Aalivirus, Ailurivirus, Ampivirus, Anativirus, Aphthovirus, Aquamavirus, Avihepatovirus, Avisivirus, Boosepivirus, Bopivirus, Cardiovirus, Cosavirus, Crahelivirus, Crohivirus, Dicipivirus, Diresapivirus, Enterovirus, Erbovirus, Felipivirus, Fipivirus, Gallivirus, Gruhelivirus, Grusopivirus, Harkavirus, Hemipivirus, Hepatovirus, Hunnivirus, Kobuvirus, Kunsagivirus, Limnipivirus, Livupivirus, Ludopivirus, Malagasivirus, Megrivirus, Mischivirus, Mosavirus, Mupivirus, Myrropivirus, Orivirus, Oscivirus, Parabovirus, Parechovirus, Pasivirus, Passerivirus, Pemapivirus, Poecivirus, Potamipivirus, Rabovirus, Rafivirus, Rohelivirus, Rosavirus, Sakobuvirus, Salivirus, Sapelovirus, Senecavirus, Shanbavirus, Sicinivirus, Symapivirus, Teschovirus, Torchivirus, Tottorivirus, Tremovirus, Tropivirus
- Čeleď: Polycipiviridae (3 rody)
- Čeleď: Secoviridae (1 podčeleď)
- (nezařazené do podčeledí)
- Rod: Cheravirus, Sadwavirus, Sequivirus, Torradovirus, Waikavirus
- Podčeleď: Comovirinae (3 rody)
- (nezařazené do podčeledí)
- Čeleď: Solinviviridae (2 rody)
- Rod: Invictavirus, Nyfulvavirus
- Řád: Sobelivirales (3 čeledi)
- Čeleď: Alvernaviridae (1 rod)
- Rod: Dinornavirus
- Čeleď: Barnaviridae (1 rod)
- Rod: Barnavirus
- Čeleď: Solemoviridae (2 rody)
- Rod: Polemovirus, Sobemovirus
- Čeleď: Alvernaviridae (1 rod)
- Řád: Nidovirales (8 podřádů)
- Třída: Stelpaviricetes (2 řády)
- Řád: Patatavirales (1 čeleď)
- Čeleď: Potyviridae (12 rodů)
- Řád: Stellavirales (1 čeleď)
- Čeleď: Astroviridae (2 rody)
- Rod: Avastrovirus, Mamastrovirus
- Čeleď: Astroviridae (2 rody)
- Řád: Patatavirales (1 čeleď)
- Třída: Duplopiviricetes (1 řád)
- (nezařazené do kmene)
- Říše: Pararnavirae (1 kmen)
- Kmen: Artverviricota (1 třída)
- Třída: Revtraviricetes (2 řády)
- Řád: Blubervirales (1 čeleď, 1 neuznaná čeleď)
- Čeleď: Hepadnaviridae (5 rodů)
- Čeleď (neuznaná): Nackednaviridae[23] (1 neuznaný rod)
- Rod (neuznaný): Nackednavirus[23]
- Řád: Ortervirales (5 čeledí)
- Čeleď: Belpaoviridae (1 rod)
- Rod: Semotivirus
- Čeleď: Caulimoviridae (10 rodů)
- Čeleď: Metaviridae (2 rody)
- Rod: Errantivirus, Metavirus
- Čeleď: Pseudoviridae (3 rody)
- Rod: Hemivirus, Pseudovirus, Sirevirus
- Čeleď: Retroviridae (2 podčeledi)
- Podčeleď: Orthoretrovirinae (6 rodů)
- Podčeleď: Spumaretrovirinae (5 rodů)
- Čeleď: Belpaoviridae (1 rod)
- Řád: Blubervirales (1 čeleď, 1 neuznaná čeleď)
- Třída: Revtraviricetes (2 řády)
- Kmen: Artverviricota (1 třída)
Realm: Varidnaviria (2 říše)
- Říše: Bamfordvirae (2 kmeny)
- Kmen: Nucleocytoviricota[pozn. 3] (2 třídy) [pozn. 4]
- (nezařazené do tříd)
- Třída: Megaviricetes (3 řády)
- Řád: Algavirales (1 čeleď, 2 neuznané čeledi)
- (nezařazené do čeledí)
- Rod (neuznaný): Mollivirus[29]
- Čeleď (neuznaná): Medusaviridae[30] (1 neuznaný rod)
- Rod (neuznaný): Medusavirus[30][31]
- Čeleď (neuznaná): Pandoraviridae[32][33][34] (1 neuznaný rod)
- Rod (neuznaný): Pandoravirus[32][33][34]
- Čeleď: Phycodnaviridae (6 rodů)
- (nezařazené do čeledí)
- Řád: Imitervirales (1 čeleď)
- Čeleď: Mimiviridae (2 rody, 1 neuznaný rod, 1 neuznaná podčeleď)
- Rod: Cafeteriavirus, Mimivirus (vč. Megavirus[35], Moumouvirus[36], Lentillevirus[37], někdy navrhovaných vyčlenit do samostatných rodů) [38], Tupanvirus[39][38] (neuznaný)
- Podčeleď (neuznaná): Klosneuvirinae[40] (4 neuznané rody)
- Čeleď: Mimiviridae (2 rody, 1 neuznaný rod, 1 neuznaná podčeleď)
- Řád: Pimascovirales[pozn. 5] (3 čeledi, 1 neuznaná čeleď)
- Čeleď: Ascoviridae (2 rody)
- Rod: Ascovirus, Toursvirus
- Čeleď: Iridoviridae (2 podčeledi)
- Podčeleď: Alphairidovirinae (3 rody)
- Podčeleď: Betairidovirinae (3 rody)
- Čeleď: Marseilleviridae (1 rod)
- Rod: Marseillevirus (vč. Lausannevirus)
- Čeleď (neuznaná): Pithoviridae[41][42][43] (3 neuznané rody)
- Rod (neuznaný): Cedratvirus[44], Orpheovirus[45], Pithovirus[41]
- Čeleď: Ascoviridae (2 rody)
- Řád: Algavirales (1 čeleď, 2 neuznané čeledi)
- Třída: Pokkesviricetes (2 řády)
- Řád: Asfuvirales (1 čeleď)
- Čeleď: Asfarviridae (1 rod)
- Rod: Asfivirus
- (nezařazené do čeledí)
- Rod (neuznaný): Faustovirus[46][47], Kaumoebavirus[48], Pacmanvirus[49]
- Čeleď: Asfarviridae (1 rod)
- Řád: Chitovirales (1 čeleď)
- Čeleď: Poxviridae (2 podčeledi)
- Podčeleď: Chordopoxvirinae (18 rodů)
- Podčeleď: Entomopoxvirinae (4 rody)
- Čeleď: Poxviridae (2 podčeledi)
- Řád: Asfuvirales (1 čeleď)
- Kmen: Preplasmiviricota (2 třídy)
- Třída: Maveriviricetes (1 řád)
- Řád: Priklausovirales (1 čeleď)
- Čeleď: Lavidaviridae (2 rody) [pozn. 6]
- Rod: Mavirus, Sputnikvirus
- Čeleď: Lavidaviridae (2 rody) [pozn. 6]
- Řád: Priklausovirales (1 čeleď)
- Třída: Tectiliviricetes (4 řády)
- Řád: Belfryvirales (1 čeleď)
- Čeleď: Turriviridae (1 rod)
- Rod: Alphaturrivirus
- Čeleď: Turriviridae (1 rod)
- Řád: Kalamavirales (1 čeleď)
- Čeleď: Tectiviridae (3 rody)
- Řád: Rowavirales (1 čeleď)
- Čeleď: Adenoviridae (5 rodů)
- Řád: Vinavirales (1 čeleď)
- Čeleď: Corticoviridae (1 rod)
- Rod: Corticovirus
- Čeleď: Corticoviridae (1 rod)
- Řád: Belfryvirales (1 čeleď)
- Třída: Maveriviricetes (1 řád)
- Kmen: Nucleocytoviricota[pozn. 3] (2 třídy) [pozn. 4]
- Říše: Helvetiavirae (1 kmen)
- Kmen: Dividoviricota (1 třída)
- Třída: Laserviricetes (1 řád)
- Řád: Halopanivirales (1 čeleď)
- Čeleď: Sphaerolipoviridae (3 rody)
- Řád: Halopanivirales (1 čeleď)
- Třída: Laserviricetes (1 řád)
- Kmen: Dividoviricota (1 třída)
Nezařazené do realmů
- (nezařazené do řádů)
- (nezařazené do čeledí)
- Rod: Barhavirus, Deltavirus, Dinodnavirus, Lostrhavirus, Rhizidiovirus, Sawgrhavirus, Tornovirus[51] (neuznaný), Zarhavirus
- Čeleď: Alphasatellitidae (2 podčeledi)
- Podčeleď: Geminialphasatellitinae (4 rody)
- Podčeleď: Nanoalphasatellitinae (7 rodů)
- Čeleď: Ampullaviridae (1 rod)
- Rod: Ampullavirus
- Čeleď: Anelloviridae (14 rodů)
- Čeleď: Avsunviroidae (3 rody)
- Rod: Avsunviroid, Elaviroid, Pelamoviroid
- Čeleď: Baculoviridae[pozn. 7] (4 rody)
- Čeleď: Bicaudaviridae (1 rod)
- Rod: Bicaudavirus
- Čeleď: Clavaviridae (1 rod)
- Rod: Clavavirus
- Čeleď: Finnlakeviridae (1 rod)
- Rod: Finnlakevirus
- Čeleď: Fuselloviridae (2 rody)
- Čeleď: Globuloviridae (1 rod)
- Rod: Globulovirus
- Čeleď: Guttaviridae (2 rody)
- Čeleď: Halspiviridae (1 rod)
- Rod: Salterprovirus
- Čeleď: Hytrosaviridae[pozn. 7] (2 rody)
- Rod: Glossinavirus, Muscavirus
- Čeleď: Nimaviridae[pozn. 7] (1 rod)
- Rod: Whispovirus
- Čeleď: Nudiviridae[pozn. 7] (2 rody)
- Rod: Alphanudivirus, Betanudivirus
- Čeleď: Ovaliviridae (1 rod)
- Rod: Alphaovalivirus
- Čeleď: Plasmaviridae (1 rod)
- Rod: Plasmavirus
- Čeleď: Polydnaviridae[pozn. 7] (2 rody)
- Rod: Bracovirus, Ichnovirus
- Čeleď: Portogloboviridae (1 rod)
- Rod: Alphaportoglobovirus
- Čeleď: Pospiviroidae (5 rodů)
- Čeleď: Spiraviridae (1 rod)
- Rod: Alphaspiravirus
- Čeleď: Thaspiviridae (1 rod)
- Rod: Nitmarvirus
- Čeleď: Tolecusatellitidae (2 rody)
- Rod: Betasatellite, Deltasatellite
- Čeleď: Tristromaviridae (1 rod)
- Rod: Alphatristromavirus
- (nezařazené do čeledí)
- Řád: Ligamenvirales (2 čeledi)
- Čeleď: Lipothrixviridae (4 rody)
- Čeleď: Rudiviridae (1 rod)
- Rod: Rudivirus
- (nezařazené do řádů)
Baltimorova klasifikace
Baltimorova klasifikace je systém klasifikace virů do sedmi skupin podle typu genetického materiálu, který je obsažen ve virových částicích, a způsobu jeho přepisu do virové mRNA. Klasifikaci poprvé navrhl v roce 1971 David Baltimore, pozdější nositel Nobelovy ceny za fyziologii nebo lékařství.[54] V jeho původním návrhu bylo šest skupin virů (I.-VI.), sedmá skupina byla vytvořena pro později objevenou skupinu hepadnavirů s unikátně stavěným genomem. Systém umožňuje zjednodušit si nesmírně komplikované a rozmanité typy forem a životních cyklů, jimiž viry oplývají,[55] ale protože není hierarchicky strukturovaný, na skutečnou systematiku tisíců známých virů již nestačí. Vzhledem k definici skupin nemůže začlenit viroidy, v tradičním pojetí nezahrnuje ani retrotranspozony a satelitní nukleové kyseliny (pojetí ICTV tyto tři skupiny mezi viry řadí a taxonomicky je klasifikuje).
Jedná se tak o jednoduché, jednoúrovňové, dosud běžně používané třídění, které dříve (do r. 2019, kdy byl vytvořen první realm – Riboviria, zahrnující skupiny III.-V.) bylo možno až na drobné výjimky nadřadit systému ICTV. To ale neznamená, že se u skupin Baltimorovy klasifikace jedná o fylogeneticky přirozené taxony;[pozn. 8] ani jejich vymezení podle genomu nemusí být úplně přesné vzhledem k podřazeným nižším taxonům ICTV.[pozn. 9][pozn. 10][pozn. 11] To je důvod, proč Baltimorova klasifikace postupně zastarává.
- Skupina I.: dsDNA viry, tedy viry s dvouvláknovou DNA
- Patří sem:
- realm: Duplodnaviria
- realm: Varidnaviria
- třída: Papovaviricetes (realm Monodnaviria)
- a dále:
- nezařazený řád: Ligamenvirales
- nezařazená čeleď: Ampullaviridae
- nezařazená čeleď: Baculoviridae
- nezařazená čeleď: Bicaudaviridae
- nezařazená čeleď: Clavaviridae
- nezařazená čeleď: Fuselloviridae
- nezařazená čeleď: Globuloviridae
- nezařazená čeleď: Guttaviridae
- nezařazená čeleď: Halspiviridae
- nezařazená čeleď: Hytrosaviridae
- nezařazená čeleď: Nimaviridae
- nezařazená čeleď: Nudiviridae
- nezařazená čeleď: Ovaliviridae
- nezařazená čeleď: Plasmaviridae
- nezařazená čeleď: Polydnaviridae
- nezařazená čeleď: Portogloboviridae
- nezařazená čeleď: Thaspiviridae
- nezařazená čeleď: Tristromaviridae
- nezařazené rody: Dinodnavirus, Rhizidiovirus
- Patří sem:
- Skupina II.: ssDNA viry, tedy viry s jednovláknovou DNA přepisovanou do mRNA totožné polarity
- Patří sem:
- většina realmu Monodnaviria, jmenovitě:
- říše: Loebvirae
- říše: Sangervirae
- říše: Trapavirae = čeleď Pleolipoviridae[pozn. 9]
- kmen: Cressdnaviricota
- třída: Mouviricetes = čeleď Bidnaviridae
- třída: Quintoviricetes
- a dále:
- nezařazená čeleď: Anelloviridae
- nezařazená čeleď: Finnlakeviridae
- nezařazená čeleď: Spiraviridae
- nezařazené rody: Tornovirus (neuznaný)
- většina realmu Monodnaviria, jmenovitě:
- Ačkoli oficiální Baltimorova klasifikace nezahrnuje satelitní nukleové kyseliny, z hlediska genomu by se ke skupině II. mohly přiřadit i
- Patří sem:
- nezařazená čeleď: Alphasatellitidae a
- nezařazená čeleď: Tolecusatellitidae.
- Skupina III.: dsRNA viry, tedy viry s dvouvláknovou RNA
- Patří sem následující taxony z realmu Riboviria:
- kmen: Duplornaviricota
- čeleď: Amalgaviridae
- čeleď: Birnaviridae
- čeleď: Partitiviridae
- čeleď: Picobirnaviridae
- čeleď: Polymycoviridae
- rod: Botybirnavirus
- Patří sem následující taxony z realmu Riboviria:
- Skupina IV.: ssRNA viry s pozitivní polaritou, tedy viry s jednovláknovou RNA přepisovanou do mRNA totožné polarity
- Patří sem následující taxony z realmu Riboviria:
- kmen: Kitrinoviricota
- kmen: Lenarviricota
- třída: Pisoniviricetes
- třída: Stelpaviricetes
- čeleď: Hypoviridae
- čeleď: Permutotetraviridae
- čeleď: Sarthroviridae
- rody: Albetovirus, Aumaivirus, Papanivirus, Virtovirus
- Patří sem následující taxony z realmu Riboviria:
- Skupina V.: ssRNA viry s negativní polaritou, tedy viry s jednovláknovou RNA přepisovanou do mRNA opačné polarity
- Patří sem:
- kmen Negarnaviricota (realm Riboviria)[pozn. 10]
- a dále:
- nezařazený rod: Deltavirus
- Patří sem:
- Skupina VI.: ssRNA viry s reverzní transkriptázou, tedy viry s jednovláknovou RNA reverzně přepisovanou do DNA
- Patří sem:
- většina řádu Ortervirales (realm Riboviria), jmenovitě:
- čeleď: Belpaoviridae
- čeleď: Retroviridae
- většina řádu Ortervirales (realm Riboviria), jmenovitě:
- Ačkoli oficiální Baltimorova klasifikace nezahrnuje retrotranspozony, z hlediska genomu by se ke skupině VI. mohly přiřadit i:
- čeleď: Metaviridae
- čeleď: Pseudoviridae
- Patří sem:
- Skupina VII.: dsDNA viry s reverzní transkriptázou, tedy viry s dvouvláknovou (částečně i jednovláknovou) DNA nejprve přepisovanou do RNA a následně reverzně přepisovanou do DNA
- Patří sem:
- řád Blubervirales = čeleď Hepadnaviridae (realm Riboviria)
- čeleď Caulimoviridae z řádu Ortervirales (realm Riboviria)
- Patří sem:
Systém LHT
Systém navrhli v r. 1962 André Lwoff, R. W. Horne a P. Tournier. K zařazení druhů využili standardní taxony kmen, podkmen, třída, řád, podřád, čeleď, podčeleď a rod. Kritériem sdružování byly společně sdílené vlastnosti, nikoli napadané organismy. 5 hlavních charakteristik používaných ke klasifikaci bylo:
- druh nukleové kyseliny genomu (DNA, RNA)
- symetrie kapsidy (šroubovice, dvacetistěn, složitý tvar)
- přítomnost či nepřítomnost obálky
- rozměry virionu a kapsidy
- počet kapsomer
V témž roce byla klasifikace schválena Prozatímním výborem pro nomenklaturu virů (Provisional Committee on Nomenclature of Virus – PNVC) Mezinárodní asociace mikrobiologických společností (International Association of Microbiological Societies – IAMS).
V dnešní době se již systém LHT nepoužívá, ale názvy některých taxonů přetrvávají v systému ICTV. Do úrovně čeledí vypadal následovně:[59]
- Kmen Vira (rozdělen na 2 podkmeny)
- Podkmen Deoxyvira (DNA viry)
- Třída Deoxybinala (duální symetrie)
- Řád Urovirales
- Čeleď Phagoviridae
- Řád Urovirales
- Třída Deoxyhelica (helikální symetrie – šroubovice)
- Řád Chitovirales
- Čeleď Poxviridae
- Řád Chitovirales
- Třída Deoxycubica (kubická symetrie – mnohostěn)
- Řád Peplovirales
- Čeleď Herpesviridae (162 kapsomer)
- Řád Haplovirales (bez obálky)
- Čeleď Iridoviridae (812 kapsomer)
- Čeleď Adenoviridae (252 kapsomer)
- Čeleď Papiloviridae (72 kapsomer)
- Čeleď Paroviridae (32 kapsomer)
- Čeleď Microviridae (12 kapsomer)
- Řád Peplovirales
- Třída Deoxybinala (duální symetrie)
- Podkmen Ribovira (RNA viry)
- Třída Ribocubica (kubická symetrie – mnohostěn)
- Řád Togovirales
- Čeleď Arboviridae
- Řád Lymovirales
- Čeleď Napoviridae
- Čeleď Reoviridae
- Řád Togovirales
- Třída Ribohelica (helikální symetrie – šroubovice)
- Řád Sagovirales
- Čeleď Stomataviridae
- Čeleď Paramyxoviridae
- Čeleď Myxoviridae
- Řád Rhabdovirales
- Podřád Flexiviridales
- Čeleď Mesoviridae
- Čeleď Peptoviridae
- Podřád Rigidovirales
- Čeleď Pachyviridae
- Čeleď Protoviridae
- Čeleď Polichoviridae
- Podřád Flexiviridales
- Řád Sagovirales
- Třída Ribocubica (kubická symetrie – mnohostěn)
- Podkmen Deoxyvira (DNA viry)
Odkazy
Poznámky
- ↑ Český ekvivalent anglického realm není dosud ustálen. Někdy se překládá jako doména[4], tou je však zpravidla míněn taxon, anglicky zvaný domain. Takto míněná doména je však ve vztahu k virům používána výjimečně a nemá jednoznačné vymezení: Buď zahrnuje všechny viry, nebo se používá jen na skupinu velkých jaderně-cytoplazmatických DNA virů (NCLDV), pro které jedna z hypotéz předpokládá, že jsou reliktem samostatné linie, tzv. čtvrté domény buněčných organismů, které svou stavbou připomínají a jejichž redukcí vznikly.[5][6][7] Vzájemné vztahy NCLDV a buněčných organismů jsou však komplexnější.[8] I sám ICTV ve svém „Prohlášení o shodě“ na hierarchii nových úrovních taxonomie virů[9] uvádí, že nejvyšší taxon je pojmenován realm, na rozdíl od domény v jiných taxonomiích, aby byl reflektován komplexní vzájemný vztah taxonomie virů vzhledem k jejich protějškům u buněčných organismů.
- ↑ Metagenomické analýzy odhalily mnoho nových fylogeneticky odlišných linií, které neodpovídají stávajícím klasifikačním schématům; lze proto očekávat vytváření nejen nových taxonů na úrovni čeledí a rodů, ale i možné hlubší změny v obsahu vyšších taxonů a topologii jejich fylogenetických stromů[20]
- ↑ Dříve používané názvy pro skupinu téhož vymezení: „NCLDV group“, „Megavirales“ (před zavedením taxonů vyšších než řád, proto s příponou řádu) [7][24][25][26]
- ↑ Metagenomické analýzy odhalily mnoho nových kladů na úrovni podčeledí či rodů, dosud neuznaných jako samostatné taxony[27]
- ↑ Dříve používaný název pro skupinu téhož vymezení: „superklad MAPI“ [8]
- ↑ Metagenomické analýzy odhalily mnoho nových kladů na úrovni rodů, dosud neuznaných jako samostatné taxony[50]
- ↑ a b c d e Dosud nezařazené čeledi Baculoviridae, Hytrosaviridae, Nimoviridae, Nudiviridae a Polydnaviridae sdílejí část genů s viry kmene Nucleocytoviricota (realm Varidnaviria), což může naznačovat jejich společnou příslušnost k vyššímu, dosud nezavedenému řádu.[52][53]
- ↑ Např. III. skupina (dsRNA viry) je považována za polyfyletickou, k ní patřící čeleď Amalgaviridae dokonce s velkou pravděpodobností vznikla rekombinací RNA virů dvou různých skupin Baltimorovy klasifikace.[56]
- ↑ a b Viry z čeleď Pleolipoviridae, řazené tradičně do skupiny II, tedy ssDNA virů, mohou mít ve skutečnosti genom různého druhu; Haloarcula hispanica pleomorphic virus 1 (HHPV-1) typu má např. kruhovou dsDNA, His2 virus lineární dsDNA, Halorunbrum pleomorphic virus 3 (HRPV-3) a Halogeometricum pleomorphic virus 1 (HGPV-1) mají v dsDNA úseky ssDNA.[57]
Reference
- ↑ FLORES, R.; RANDLES, J. W.; BAR-JOSEPH, M., DIENER, T. O. A proposed scheme for viroid classification and nomenclature. S. 623-629. Arch Virol. [online]. 1998. Svazek 143, s. 623-629. (anglicky)
- ↑ DIENER, T. O. The viroid: biological oddity or evolutionary fossil?. S. 137-184. Adv Virus Res. [online]. 2001. Svazek 57, s. 137-184. (anglicky)
- ↑ a b c The International Code of Virus Classification and Nomenclature. Odstavce 3.23, 3.27, 3.28, 3.29, 3.30. ICTV, říjen 2018. Dostupné online (anglicky)
- ↑ a b FORSTOVÁ, Jitka; FRAIBERK, Martin. Diverzita virů. S. 212-215. Živa [online]. Academia, 17. říjen 2019. Roč. 2019, čís. 5, s. 212-215. Dostupné online. ISSN 0044-4812.
- ↑ BOYER, Mickaël; MADOUI, Mohammed-Amine; GIMENEZ, Gregory, Bernard La Scola, Didier Raoult. Phylogenetic and Phyletic Studies of Informational Genes in Genomes Highlight Existence of a 4th Domain of Life Including Giant Viruses. E15530. PLoS One [online]. 2. prosinec 2010 [cit. 2011-05-03]. Svazek 5, čís. 12. Dostupné online. PDF [1]. ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0015530. (anglicky)
- ↑ COLSON, Philippe; GIMENEZ, Gregory; BOYER, Mickaël, Ghislain Fournous, Didier Raoult. The Giant Cafeteria roenbergensis Virus That Infects a Widespread Marine Phagocytic Protist Is a New Member of the Fourth Domain of Life. E18935. PLoS One [online]. 29. duben 2011 [cit. 2011-05-03]. Svazek 6, čís. 4. Dostupné online. PDF [2]. ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0018935. (anglicky)
- ↑ a b COLSON, Philippe; LAMBALLERIE, Xavier de; FOURNOUS, Ghislain; RAOULT, Didier. Reclassification of Giant Viruses Composing a Fourth Domain of Life in the New Order Megavirales. S. 321–332. Intervirology [online]. S. Karger AG, 14. duben 2012. Svazek 55, čís. 5, s. 321–332. Dostupné online. ISSN 1423-0100. DOI 10.1159/000336562. PMID 22508375. (anglicky)
- ↑ a b GUGLIELMINI, Julien; WOO, Anthony C.; KRUPOVIC, Mart; FORTERRE, Patrick; GAIA, Morgan. Diversification of giant and large eukaryotic dsDNA viruses predated the origin of modern eukaryotes. S. 19585-19592. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. National Academy of Sciences, 10. září 2019. Svazek 116, čís. 39, s. 19585-19592. Dostupné online. Dostupné také na: [3]. preprint [4]. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1912006116. PMID 31506349. (anglicky)
- ↑ a b GORBALENYA, Alexander E.; KRUPOVIC, Mart; MUSHEGIAN, Arcady, et al . (International Committee on Taxonomy of Viruses Executive Committee). The new scope of virus taxonomy: partitioning the virosphere into 15 hierarchical ranks. S. 668–674. Nature Microbiology [online]. Springer Nature Limited, 27. duben 2020. Svazek 5, čís. 5, s. 668–674. Dostupné online. Dostupné také na: [5]. ISSN 2058-5276. DOI 10.1038/s41564-020-0709-x. (anglicky)
- ↑ SIDDELL, Stuart G.; WALKER, Peter J.; LEFKOWITZ, Elliot J., et al . Binomial nomenclature for virus species: a consultation. S. 519–525. Archives of Virology [online]. Springer Nature Switzerland AG, 3. prosinec 2019. Svazek 165, čís. 2, s. 519–525. Dostupné online. Dostupné také na: [6]. ISSN 1432-8798. DOI 10.1007/s00705-019-04477-6. PMID 31797129. (anglicky)
- ↑ International Committee on Taxonomy of Viruses, Virus Taxonomy: 2019 Release. Dostupné online (anglicky)
- ↑ a b ICTV Master Species List 2019. Verze 1, 24. duben 2020. [https:// talk.ictvonline.org/files/master-species-lists/m/msl/9601 Dostupné online] (anglicky)
- ↑ International Committee on Taxonomy of Viruses, Pending Proposals Dostupné online (anglicky)
- ↑ a b KAUFFMAN, Kathryn M.; HUSSAIN, Fatima A.; YANG, Joy; AREVALO, Philip; BROWN, Julia M.; CHANG, William K.; VANINSBERGHE, David, ELSHERBINI, Joseph; SHARMA, Radhey S.; CUTLER, Michael B.; KELLY, Libusha; POLZ, Martin F. A major lineage of non-tailed dsDNA viruses as unrecognized killers of marine bacteria. Kapitola Letters. Nature [online]. Macmillan Publishers Limited, 24. leden 2018. Online před tiskem. Dostupné online. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/nature25474. (anglicky)
- ↑ a b IGNACIO-ESPINOZA, Julio Cesar; FUHRMAN, Jed A. A non-tailed twist in the viral tale. S. 38-39. Nature [online]. Macmillan Publishers Limited, 24. leden 2018. Svazek 554, čís. 7690, s. 38-39. Dostupné online. Dostupné také na: [7]. Dále dostupné na: [8]. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/d41586-018-00923-8. PMID 29388959. (anglicky)
- ↑ a b MIHULKA, Stanislav. Nově objevené viry jsou lstiví zabijáci bakterií. OSEL.cz [online]. 27. leden 2018. Dostupné online. ISSN 1214-6307.
- ↑ ADRIAENSSENS, Evelien M.; EDWARDS, Rob; NASH, John H. E., MAHADEVAN, Padmanabhan; SETO, Donald; ACKERMANN, Hans-Wolfgang; LAVIGNE, Rob; KROPINSKI, Andrew M. Integration of genomic and proteomic analyses in the classification of the Siphoviridae family. S. 144–154. Virology [online]. 14. listopad 2014. Svazek 477, s. 144–154. Dostupné online. ISSN 0042-6822. DOI 10.1016/j.virol.2014.10.016. PMID 25466308. (anglicky)
- ↑ POOJARI, Sudarsana; ALABI, Olufemi J.; FOFANOV, Viacheslav Y., NAIDU, Rayapati A. A Leafhopper-Transmissible DNA Virus with Novel Evolutionary Lineage in the Family Geminiviridae Implicated in Grapevine Redleaf Disease by Next-Generation Sequencing. S. 1-17. PLoS ONE [online]. 5. červen 2013. Svazek 8, čís. 6: e64194, s. 1-17. Dostupné online. ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0064194. (anglicky)
- ↑ a b GRONENBORN, Bruno; RANDLES, John W.; KNIERIM, Dennis; BARRIÈRE, Quentin; VETTEN, H. Josef; WARTHMANN, Norman; CORNU, David, SILEYE, Tiata; WINTER, Stephan; TIMCHENKO, Tatiana. Analysis of DNAs associated with coconut foliar decay disease implicates a unique single-stranded DNA virus representing a new taxon. Scientific Reports [online]. Macmillan Publishers Limited, 9. duben 2018. Svazek 8: 5698. Dostupné online. ISSN 2045-2322. DOI 10.1038/s41598-018-23739-y. (anglicky)
- ↑ SHI, Mang; LIN, Xian-Dan; TIAN, Jun-Hua; CHEN, Liang-Jun; CHEN, Xiao; LI, Ci-Xiu; QIN, Xin-Cheng, LI, Jun; CAO, Jian-Ping; EDEN, John-Sebastian; BUCHMANN, Jan; WANG, Wen; XU, Jianguo; HOLMES, Edward C.; ZHANG, Yong-Zhen. Redefining the invertebrate RNA virosphere. Nature [online]. 23. listopad 2016 [cit. 2016-12-07]. Online před tiskem. Dostupné online. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/nature20167. PMID 27880757. (anglicky)
- ↑ GRYBCHUK, Danyil; AKOPYANTS, Natalia S.; KOSTYGOV, Alexei Y.; KONOVALOVAS, Aleksandras; LYE, Lon-Fye; DOBSON, Deborah E.; ZANGGER, Haroun, FASEL, Nicolas; BUTENKO, Anzhelika; FROLOV, Alexander O.; VOTÝPKA, Jan; d’AVILA-LEVY, Claudia M.; KULICH, Pavel; MORAVCOVÁ, Jana; PLEVKA, Pavel; ROGOZIN, Igor B.; SERVA, Saulius; LUKEŠ, Julius; BEVERLEY, Stephen M.; YURCHENKO, Vyacheslav. Viral discovery and diversity in trypanosomatid protozoa with a focus on relatives of the human parasite Leishmania. S. E506-E515. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 28. prosinec 2017. Svazek 115, čís. 3, s. E506-E515. Dostupné online. PDF [9]. Dále dostupné na: [10]. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1717806115. PMID 29284754. (anglicky)
- ↑ kar (ČTK). Ostrava má svůj virus. Podle vědců se OstraVirus nepodobá žádnému jinému na Zemi. Kapitola Všda. ČT24.cz [online]. Česká televize, 4. duben 2018. Dostupné online.
- ↑ a b LAUBER, Chris; SEITZ, Stefan; MATTEI, Simone; SUH, Alexander; BECK, Jürgen; HERSTEIN, Jennifer; BÖROLD, Jacob, SALZBURGER, Walter; KADERALI, Lars; BARTENSCHLAGER, Ralf; BRIGGS, John A. G. Deciphering the Origin and Evolution of Hepatitis B Viruses by Means of a Family of Non-enveloped Fish Viruses. S. 387-399.e6. Cell Host & Microbe [online]. Cell Press, Elsevier Inc., 31. srpen 2017. Svazek 22, čís. 3, s. 387-399.e6. Dostupné online. Dostupné také na: [11]. ISSN 1931-3128. DOI 10.1016/j.chom.2017.07.019. PMID 28867387. (anglicky)
- ↑ COLSON, Philippe, a kol. “Megavirales”, a proposed new order for eukaryotic nucleocytoplasmic large DNA viruses. S. 2517-2521. Archives of Virology [online]. 29. červen 2013. Svazek 158, čís. 12, s. 2517-2521. Dostupné online. ISSN 1432-8798. DOI 10.1007/s00705-013-1768-6. PMID 23812617. (anglicky)
- ↑ FISCHER, Matthias G. Giant viruses come of age. S. 50-57. Current Opinion in Microbiology [online]. 19. březen 2016. Svazek 31, s. 50-57. Dostupné online. ISSN 1369-5274. DOI 10.1016/j.mib.2016.03.001. (anglicky)
- ↑ HALARY, S.; TEMMAM, S.; RAOULT, D.; DESNUES, C. Viral metagenomics: are we missing the giants?. S. 34-43. Current Opinion in Microbiology [online]. 19. březen 2016. Svazek 31, s. 34-43. Dostupné online. ISSN 1369-5274. DOI 10.1016/j.mib.2016.01.005. (anglicky)
- ↑ SCHULZ, Frederik; ROUX, Simon; PAEZ-ESPINO, David, et al . Giant virus diversity and host interactions through global metagenomics. S. 432–436. Nature [online]. Springer Nature Limited, 22. leden 2020. Svazek 578, čís. 7795, s. 432–436. Dostupné online. Dostupné také na: [12]. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/s41586-020-1957-x. (anglicky)
- ↑ BORATTO, Paulo V. M.; OLIVEIRA, Graziele P.; MACHADO, Talita B.; ANDRADE, Ana Cláudia S. P.; BAUDOIN, Jean-Pierre; KLOSE, Thomas; SCHULZ, Frederik, CHABRIÈRE, Eric; COLSON, Philippe; LEVASSEUR, Anthony; La SCOLA, Bernard; ABRAHÃO, Jônatas S. A mysterious 80 nm amoeba virus with a near-complete “ORFan genome” challenges the classification of DNA viruses. bioRχiv [online]. Cold Spring Harbor Laboratory, 28. leden 2020. Preprint. Dostupné online. Dostupné také na: [13]. DOI 10.1101/2020.01.28.923185. (anglicky)
- ↑ LEGENDRE, Matthieu; LARTIGUE, Audrey; BERTAUX, Lionel; JEUDY, Sandra; BARTOLI, Julia; LESCOT, Magali; ALEMPIC, Jean-Marie, RAMUS, Claire; BRULEY, Christophe; LABADIE, Karine; SHMAKOVA, Lyubov; RIVKINA, Elizaveta; COUTÉ, Yohann; ABERGEL, Chantal; CLAVERIE, Jean-Michel. In-depth study of Mollivirus sibericum, a new 30,000-y-old giant virus infecting Acanthamoeba. S. E5327–E5335. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 8. září 2015. Svazek 112, čís. 38, s. E5327–E5335. Dostupné online. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1510795112. PMID 26351664. (anglicky)
- ↑ a b YOSHIKAWA, Genki; BLANC-MATHIEU, Romain; SONG, Chihong; KAYAMA, Yoko; MOCHIZUKI, Tomohiro; MURATA, Kazuyoshi; OGATA, Hiroyuki, TAKEMURA, Masaharu. Medusavirus, a novel large DNA virus discovered from hot spring water. Journal of Virology [online]. American Society for Microbiology, 6. únor 2019. Svazek 93, čís. 8: e02130-18. Dostupné online. Dostupné také na: [14]. ISSN 1098-5514. DOI 10.1128/JVI.02130-18. PMID 30728258. (anglicky)
- ↑ MIHULKA, Stanislav. Veliký Medusavirus promění bezbranné améby v kámen. OSEL.cz [online]. 25. únor 2019. Dostupné online. ISSN 1214-6307.
- ↑ a b YUTIN, Natalya; KOONIN, Eugene V. Pandoraviruses are highly derived phycodnaviruses. S. 1-8. Biology Direct [online]. 23. říjen 2013. Svazek 8, čís. 25, s. 1-8. Dostupné online. PDF [15]. DOI 10.1186/1745-6150-8-25. (anglicky)
- ↑ a b PHILIPPE, Nadège, et al. Pandoraviruses: Amoeba Viruses with Genomes Up to 2.5 Mb Reaching That of Parasitic Eukaryotes. S. 281-286. Science [online]. 19. červenec 2013. Svazek 341, čís. 6143, s. 281-286. Dostupné online. ISSN 1095-9203. DOI 10.1126/science.1239181. (anglicky)
- ↑ a b MIHULKA, Stanislav: Mimiviry jsou out, teď vládnou pandoraviry! O.S.E.L., 20. červenec 2013. Dostupné online
- ↑ ARSLAN, Defne, et al. Distant Mimivirus relative with a larger genome highlights the fundamental features of Megaviridae. S. 17486–17491. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 18. říjen 2011. Svazek 108, čís. 42, s. 17486–17491. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1110889108. (anglicky)
- ↑ YOOSUF, Niyaz, et al. Related Giant Viruses in Distant Locations and Different Habitats: Acanthamoeba polyphaga moumouvirus Represents a Third Lineage of the Mimiviridae That Is Close to the Megavirus Lineage. S. 1324-1330. Genome Biol. Evol. [online]. 4. prosinec 2012. Svazek 4, čís. 12, s. 1324-1330. ISSN 1759-6653. DOI 10.1093/gbe/evs109. (anglicky)
- ↑ DESNUES, Christelle; LA SCOLA, Bernard; YUTIN, Natalya, FOURNOUS, Ghislain; ROBERT, Catherine; AZZA, Saïd; JARDOT, Priscilla; MONTEIL, Sonia; CAMPOCASSO, Angélique; KOONIN, Eugene V.; RAOULT, Didier. Provirophages and transpovirons as the diverse mobilome of giant viruses. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 15. říjen 2012. Online před tiskem. Dostupné online. DOI 10.1073/pnas.1208835109. (anglicky)
- ↑ a b RODRIGUES, Rodrigo Araújo Lima; MOUGARI, Said; COLSON, Phillipe; LA SCOLA, Bernard; ABRAHÃO, Jônatas Santos. “ Tupanvirus”, a new genus in the family Mimiviridae. S. 325–331. Archives of Virology [online]. Springer Nature Switzerland AG, 5. říjen 2018. Svazek 164, čís. 1, s. 325–331. Dostupné online. Dostupné také na: [16]. ISSN 1432-8798. DOI 10.1007/s00705-018-4067-4. PMID 30291500. (anglicky)
- ↑ ABRAHÃO, Jônatas; SILVA, Lorena; SANTOS SILVA, Ludmila; KHALIL, Jacques Yaacoub Bou; RODRIGUES, Rodrigo; ARANTES, Thalita; ASSIS, Felipe, BORATTO, Paulo; ANDRADE, Miguel; GEESSIEN KROON, Erna; RIBEIRO, Bergmann; BERGIER, Ivan; SELIGMANN, Herve; GHIGO, Eric; COLSON, Philippe; LEVASSEUR, Anthony KROEMER, ; Guido; RAOULT, Didier; La SCOLA, Bernard. Tailed giant Tupanvirus possesses the most complete translational apparatus of the known virosphere. Nature Communications [online]. Macmillan Publishers Limited, 27. únor 2018. Svazek 9: 749. Dostupné online. ISSN 2041-1723. DOI 10.1038/s41467-018-03168-1. (anglicky)
- ↑ a b c d e SCHULZ, Frederik; YUTIN, Natalya; IVANOVA, Natalia N.; ORTEGA, Davi R.; LEE, Tae Kwon; VIERHEILIG, Julia; DAIMS, Holger, HORN, Matthias; WAGNER, Michael; JENSEN, Grant J.; KYRPIDES, Nikos C.; KOONIN, Eugene V.; WOYKE, Tanja. Giant viruses with an expanded complement of translation system components. S. 82-85. Science [online]. 7. duben 2017. Svazek 356, čís. 6333, s. 82-85. Dostupné online. ISSN 1095-9203. DOI 10.1126/science.aal4657. PMID 28386012. (anglicky)
- ↑ a b LEGENDRE, Matthieu; BARTOLI, Julia; SHMAKOVA, Lyubov, JEUDY, Sandra; LABADIE, Karine; ADRAIT, Annie; LESCOT, Magali; POIROT, Olivier; BERTAUX, Lionel; BRULEY, Christophe; COUTÉ, Yohann; RIVKINA, Elizaveta; ABERGEL, Chantal; CLAVERIE, Jean-Michel. Thirty-thousand-year-old distant relative of giant icosahedral DNA viruses with a pandoravirus morphology. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 3. březen 2014. Online před tiskem. Dostupné online. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1320670111. (anglicky)
- ↑ YONG, Ed. Giant virus resurrected from 30,000-year-old ice. Nature News [online]. 3. březen 2014. Dostupné online. ISSN 1476-4687. DOI doi:10.1038/nature.2014.14801. (anglicky)
- ↑ Vědci oživili 30 tisíc let starý virus z ledu. Týden [online]. 4. březen 2014. Dostupné online.
- ↑ ANDREANI, Julien; AHERFI, Sarah; KHALIL, Jacques Yaacoub Bou; DI PINTO, Fabrizio; BITAM, Idir; RAOULT, Didier; COLSON, Philippe, La SCOLA, Bernard. Cedratvirus, a Double-Cork Structured Giant Virus, is a Distant Relative of Pithoviruses. S. 1-11. Viruses [online]. MDPI AG, 3. listopad 2016. Svazek 8, čís. 11: 300, s. 1-11. Dostupné online. Dostupné také na: [17]. ISSN 1999-4915. DOI 10.3390/v8110300. PMID 27827884. (anglicky)
- ↑ ANDREANI, Julien; KHALIL, Jacques Y. B.; BAPTISTE, Emeline; HASNI, Issam; MICHELLE, Caroline; RAOULT, Didier; LEVASSEUR, Anthony. Orpheovirus IHUMI-LCC2: A New Virus among the Giant Viruses. Frontiers in Microbiology [online]. Frontiers Media SA, 22. leden 2018. Roč. 8: 2643. Dostupné online. Dostupné také na: [18]. Dále dostupné na: [19]. ISSN 1664-302X. DOI 10.3389/fmicb.2017.02643. PMID 29403444. (anglicky)
- ↑ RETENO, Dorine Gaëlle I.; BENAMAR, Samia; KHALIL, Jacques Bou; ANDREANI, Julien; ARMSTRONG, Nicholas; KLOSE, Thomas; ROSSMANN, Michael, COLSON, Philippe; RAOULT, Didier; La SCOLA, Bernard. Faustovirus, an Asfarvirus-Related New Lineage of Giant Viruses Infecting Amoebae. S. 6585-6594. Journal of Virology [online]. 15. duben 2015. Svazek 89, čís. 13, s. 6585-6594. Dostupné online. ISSN 1098-5514. DOI 10.1128/JVI.00115-15. (anglicky)
- ↑ BENAMAR, Samia; RETENO, Dorine Gaëlle I.; BANDALY, Victor; LABAS, Noémie; RAOULT, Didier; LA SCOLA, Bernard. Faustoviruses: Comparative Genomics of New Megavirales Family Members. S. 1-9. Frontiers in Microbiology [online]. 5. únor 2016. Svazek 7, čís. 3, s. 1-9. Dostupné online. Dostupné také na: [20]. DOI 10.3389/fmicb.2016.00003. (anglicky)
- ↑ BAJRAI, Leena H.; BENAMAR, Samia; AZHAR, Esam I.; ROBERT, Catherine; LEVASSEUR, Anthony; RAOULT, Didier; LA SCOLA, Bernard. Kaumoebavirus, a New Virus That Clusters with Faustoviruses and Asfarviridae. S. 1-10. Viruses [online]. MDPI AG, 28. říjen 2016. Svazek 8, čís. 11: 278, s. 1-10. Dostupné online. Dostupné také na: [21]. ISSN 1999-4915. DOI 10.3390/v8110278. PMID 27801826. (anglicky)
- ↑ ANDREANI, Julien; KHALIL, Jacques Yaacoub Bou; SEVVANA, Madhumati; BENAMAR, Samia; DI PINTO, Fabrizio; BITAM, Idir; COLSON, Philippe, KLOSE, Thomas; ROSSMANN, Michael G.; RAOULT, Didier; La SCOLA, Bernard. Pacmanvirus, a new giant icosahedral virus at the crossroads between Asfarviridae and faustoviruses. S. 1-11. Journal of Virology [online]. American Society for Microbiology, 26. červen 2017. Svazek 91, čís. 14: e00212-17, s. 1-11. Dostupné online. Dostupné také na: [22]. ISSN 1098-5514. DOI 10.1128/JVI.00212-17. PMID 28446673. (anglicky)
- ↑ PAEZ-ESPINO, David; ZHOU, Jinglie; ROUX, Simon, et al . Diversity, evolution, and classification of virophages uncovered through global metagenomics. Microbiome [online]. BioMed Central Ltd, 10. prosinec 2019. Svazek 7, čís. 1: 157. Dostupné online. Dostupné také na: [23]. ISSN 2049-2618. DOI 10.1186/s40168-019-0768-5. PMID 31823797. (anglicky)
- ↑ NG, Terry Fei Fan; MANIRE, Charles; BORROWMAN, Kelly, LANGER, Tammy; EHRHART, Llewellyn; BREITBART, Mya. Discovery of a Novel Single-Stranded DNA Virus from a Sea Turtle Fibropapilloma by Using Viral Metagenomics. S. 2500-2509. Journal of Virology [online]. 30. prosinec 2008. Svazek 83, čís. 6, s. 2500-2509. Dostupné online. Dostupné také na: [24]. Dále dostupné na: [25]. ISSN 1098-5514. DOI 10.1128/JVI.01946-08. PMID 19116258. (anglicky)
- ↑ KOONIN, Eugene V.; YUTIN, Natalya. Chapter Five - Evolution of the Large Nucleocytoplasmic DNA Viruses of Eukaryotes and Convergent Origins of Viral Gigantism. S. 167-202. Advances in Virus Research [online]. Elsevier Inc., 2018-11-10. Svazek 103, s. 167-202. Dostupné online. ISSN 0065-3527. DOI 10.1016/bs.aivir.2018.09.002. (anglicky)
- ↑ KOONIN, Eugene V.; DOLJA, Valerian V.; KRUPOVIC, Mart. Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity. S. 2-25. Virology [online]. Elsevier Inc., 2015-03-12. Svazek 479–480, s. 2-25. Dostupné online. ISSN 0042-6822. DOI 10.1016/j.virol.2015.02.039. (anglicky)
- ↑ BALTIMORE, D. Expression of animal virus genomes. Bacteriol Rev.. 1971, roč. 35, čís. 3, s. 235-41. Dostupné online. ISSN 0005-3678.
- ↑ RACANIELLO, Vincent. Simplifying virus classification: The Baltimore system [online]. Virology Blog, 2009. Dostupné online.
- ↑ KRUPOVIC, Mart; DOLJA, Valerian V.; KOONIN, Eugene V. Plant viruses of the Amalgaviridae family evolved via recombination between viruses with double-stranded and negative-strand RNA genomes. S. 1-7. Biology Direct [online]. 29. březen 2015. Svazek 10, čís. 12, s. 1-7. Dostupné online. PDF [26]. DOI 10.1186/s13062-015-0047-8. (anglicky)
- ↑ BAMFORD, Dennis H.; PIETILÄ, Maija K.; ROINE, Elina; ATANASOVA, Nina S.; DIENSTBIER, Ana; OKSANEN, Hanna M., a ICTV Report Consortium. The Online (10th) Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses [online]. 10. vyd. 2017-09-20, rev. 2017-09-21. Kapitola Pleolipoviridae. (anglicky)
- ↑ Bunyaviridae Study Group: Create a new order, Bunyavirales, to accommodate nine families (eight new, one renamed) comprising thirteen genera. Proposal to ICTV, Nr. 2016.030a-vM, 2016. Dostupné online (anglicky)
- ↑ LWOFF, André; HORNE, R. W.; TOURNIER, P. A system of viruses. S. 51-55. Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. [online]. 1962. Svazek 27, s. 51-55. PMID 13931895. (anglicky)
Externí odkazy
- Obrázky, zvuky či videa k tématu Klasifikace virů na Wikimedia Commons
- (anglicky) ViralZone – podrobný přehled virů s popisy a schematickými obrázky kapsid