Klasifikace virů: Porovnání verzí
Smazaný obsah Přidaný obsah
m (lat., virol.) typo |
komplexní aktualizace (dle ICTV 2019) + reference |
||
| Řádek 12: | Řádek 12: | ||
== Systém ICTV == |
== Systém ICTV == |
||
Mezinárodní komise pro klasifikaci virů (International Committee on Taxonomy of Viruses - ICTV) klasifikuje jednotlivé druhy virů podobně jako buněčné organismy do kmenů (případně i podkmenů), tříd, řádů (podřádů), čeledí (podčeledí) a rodů (podrodů). Snahou je přitom respektovat fylogenetickou příbuznost, tedy na základě genetické informace sdružovat [[taxon]]y dané úrovně do skupin, u kterých lze předpokládat společného předka |
Mezinárodní komise pro klasifikaci virů (International Committee on Taxonomy of Viruses - ICTV) klasifikuje jednotlivé druhy virů podobně jako buněčné organismy do říší, kmenů (případně i podkmenů), tříd, řádů (podřádů), čeledí (podčeledí) a rodů (podrodů). {{kotva|realm}}Nejvyšším taxonem, nadřazeným říším, je '''realm'''{{#tag:ref|Český ekvivalent anglického ''realm'' není dosud ustálen. Někdy se překládá jako doména<ref name="Forstová_2019"/>, tou je však zpravidla míněn taxon, anglicky zvaný ''domain''. Takto míněná doména je však ve vztahu k virům používána výjimečně a nemá jednoznačné vymezení: Buď zahrnuje všechny viry, nebo se používá jen na skupinu velkých jaderně-cytoplazmatických DNA virů (NCLDV), pro které jedna z hypotéz předpokládá, že jsou reliktem samostatné linie, tzv. čtvrté domény buněčných organismů, které svou stavbou připomínají a jejichž redukcí vznikly.<ref name="Boyer_2010"/><ref name="Colson_2011"/><ref name="Colson_2012"/> Vzájemné vztahy NCLDV a buněčných organismů jsou však komplexnější.<ref name="Guglielmini 2019"/> I sám ICTV ve svém „Prohlášení o shodě“ na hierarchii nových úrovních taxonomie virů<ref name="Gorbalenya_2020"/> uvádí, že nejvyšší taxon je pojmenován realm, na rozdíl od domény v jiných taxonomiích, aby byl reflektován komplexní vzájemný vztah taxonomie virů vzhledem k jejich protějškům u buněčných organismů.|group="pozn."|name="realm"}}. Systém ICTV důsledně používá metagenomický přístup.<ref name="Gorbalenya_2020"/><ref name="Forstová_2019"/> Snahou je přitom respektovat fylogenetickou příbuznost, tedy na základě genetické informace sdružovat [[taxon]]y dané úrovně do skupin, u kterých lze předpokládat společného předka. |
||
Standardními příponami v [[taxonomie (biologie)|taxonomii]] jsou:<ref name="Code"/> |
Standardními příponami v [[taxonomie (biologie)|taxonomii]] jsou:<ref name="Code"/> |
||
* u virů (včetně satelitních virů a retrotranspozonů) |
* u virů (včetně satelitních virů a retrotranspozonů) |
||
** pro realm: ''-viria'' |
|||
** {{kotva|realm}} pro realm{{#tag:ref|Český ekvivalent anglického ''realm'' není dosud ustálen. Někdy se překládá jako doména<ref name="Forstová_2019"/>, tou je však zpravidla míněn taxon, anglicky zvaný ''domain''. (I takto míněná doména je ve vztahu k virům používána výjimečně a nemá jednoznačné vymezení: Buď zahrnuje všechny viry, nebo se používá jen na skupinu velkých jaderně-cytoplazmatických virů, pro které jedna z hypotéz předpokládá, že jsou reliktem samostatné linie, tzv. čtvrté domény buněčných organismů, které svou stavbou připomínají a jejichž redukcí vznikly.<ref name="Boyer_2010"/><ref name="Colson_2011"/>)|group="pozn."|name="realm"}}: ''-viria'' |
|||
** pro říši |
** pro říši: ''-virae'' |
||
** pro kmen: ''-viricota'', |
** pro kmen: ''-viricota'', |
||
** pro podkmen: ''-virales'', |
** pro podkmen: ''-virales'', |
||
| Řádek 33: | Řádek 33: | ||
** pro podčeleď: ''-satellitinae'', |
** pro podčeleď: ''-satellitinae'', |
||
** pro rod: ''-satellite''. |
** pro rod: ''-satellite''. |
||
Virologická nomenklatura nemá předepsáno [[Biologická nomenklatura#Binominální nomenklatura druhů|binomiální názvosloví pro druhy]], třebaže probíhají diskuse o jeho možném zavedení, které by mělo odstranit nejednotný přístup (názvy virových druhů jsou tvořeny mnoha různými způsoby vedoucími k výsledným jednoslovným až šestislovným názvům)).<ref name="Siddell_2020"/> |
|||
Podle názvoslovného kódu ICTV se názvy všech |
Podle názvoslovného kódu ICTV se názvy všech vyšších taxonů píší stejně jako jména druhů [[kurziva|kurzívou]].<ref name="Code"/> |
||
Aktuální klasifikace |
Aktuální klasifikace byla přijata v červenci 2019 a ratifikována v březnu 2020. Viry (druhy uznané ICTV) jsou systematicky kategorizovány do 4 realmů; vedle nich jeden řád, 24 čeledí a tři rody zůstávají nezařazeny.<ref name="ICTV_2019"/><ref name="Species_2019"/> |
||
Klasifikace ICTV zahrnuje také [[viroid]]y (nezařazené čeledi ''Avsunviroidae'' a ''Pospiviroidae''), vybrané virofágy (nezařazená čeleď ''Lavidaviridae'') a jiné satelitní viry (např. v nezařazených čeledích ''Parvoviridae'', ''Sarthoviridae'', ''Tombusviridae'' a ''Virgaviridae'' a nezařazených rodech ''Albetovirus'', ''Aumaivirus'', ''Papanivirus'', ''Virtovirus''), retrotranspozony (čeledi ''Metaviridae'' a ''Pseudoviridae'' z řádu ''Ortervirales'') a [[virusoid|satelitní nukleové kyseliny]] (nezařazené čeledi ''Alphasatellitidae'' a ''Tolecusatellitidae''). |
Klasifikace ICTV zahrnuje také [[viroid]]y (nezařazené čeledi ''Avsunviroidae'' a ''Pospiviroidae''), vybrané virofágy (nezařazená čeleď ''Lavidaviridae'') a jiné satelitní viry (např. v nezařazených čeledích ''Parvoviridae'', ''Sarthoviridae'', ''Tombusviridae'' a ''Virgaviridae'' a nezařazených rodech ''Albetovirus'', ''Aumaivirus'', ''Papanivirus'', ''Virtovirus''), retrotranspozony (čeledi ''Metaviridae'' a ''Pseudoviridae'' z řádu ''Ortervirales'') a [[virusoid|satelitní nukleové kyseliny]] (nezařazené čeledi ''Alphasatellitidae'' a ''Tolecusatellitidae''). |
||
V následujícím přehledu (do úrovně rodů) jsou navíc pro úplnost uvedeny i dosud neuznané navrhované taxony, vždy označené závorkou "(neuznaný/á)". Návrh plyne z uvedené reference (zpravidla vědeckého periodika nebo webové složky ICTV s návrhy, u kterých dosud neskončil proces k jejich uznání |
V následujícím přehledu (do úrovně rodů) jsou navíc pro úplnost uvedeny i dosud neuznané navrhované taxony, vždy označené závorkou "(neuznaný/á)". Návrh plyne z uvedené reference (zpravidla vědeckého periodika nebo webové složky ICTV s návrhy, u kterých dosud neskončil proces k jejich uznání<ref name="pending"/>). |
||
=== |
=== Duplodnaviria === |
||
Realm: ''[[Duplodnaviria]]'' (1 říše) |
|||
Realm ''[[RNA viry|Riboviria]]'' je jediný dosud uznaný realm<ref name="realm" group="pozn." /> (nejvyšší uznaný taxon systému virů), a zahrnuje všechny RNA viry (s výjimkou virů s reverzní transkriptázou). |
|||
* Říše: ''[[Heunggongvirae]]'' (2 kmeny) |
|||
** Kmen: ''[[Peploviricota]]'' (1 třída) |
|||
**:* Třída: ''[[Herviviricetes]]'' (1 řád) |
|||
**:** Řád: ''[[Herpesvirales]]'' (3 čeledi) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Alloherpesviridae]]'' (4 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Batrachovirus]]'', ''[[Cyprinivirus]]'', ''[[Ictalurivirus]]'', ''[[Salmonivirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Herpetické viry|Herpesviridae]]'' (3 podčeledi) |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Alphaherpesvirinae]]'' (5 rodů) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Iltovirus]]'', ''[[Mardivirus]]'', ''[[Scutavirus]]'', ''[[Simplexvirus]]'', ''[[Varicellovirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Betaherpesvirinae]]'' (4 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Cytomegalovirus]]'', ''[[Muromegalovirus]]'', ''[[Proboscivirus]]'', ''[[Roseolovirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Gammaherpesvirinae]]'' (4 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Lymphocryptovirus]]'', ''[[Macavirus]]'', ''[[Percavirus]]'', ''[[Rhadinovirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Malacoherpesviridae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Aurivirus]]'', ''[[Ostreavirus]]'' |
|||
** Kmen: ''[[Uroviricota]]'' (1 třída) |
|||
**:* Třída: ''[[Caudoviricetes]]'' (1 řád) |
|||
**:** Řád: ''[[Caudovirales]]'' (9 čeledí, 1 neuznaná čeleď) |
|||
**:**:* (nezařazené do čeledí) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Lilyvirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Ackermannviridae]]'' (2 podčeledi) |
|||
**:**:** (nezařazené do podčeledí) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Taipeivirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Aglimvirinae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Agtrevirus]]'', ''[[Limestonevirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Cvivirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Kuttervirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Autographiviridae]]'' (9 podčeledí) |
|||
**:**:** (nezařazené do podčeledí) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Aegirvirus]]'', ''[[Aqualcavirus]]'', ''[[Ashivirus]]'', ''[[Atuphduovirus]]'', ''[[Ayakvirus]]'', ''[[Ayaqvirus]]'', ''[[Banchanvirus]]'', ''[[Bifseptvirus]]'', ''[[Bonnellvirus]]'', ''[[Cheungvirus]]'', ''[[Chosvirus]]'', ''[[Cuernavacavirus]]'', ''[[Cyclitvirus]]'', ''[[Ermolevavirus]]'', ''[[Foturvirus]]'', ''[[Foussvirus]]'', ''[[Fussvirus]]'', ''[[Gajwadongvirus]]'', ''[[Gyeongsanvirus]]'', ''[[Igirivirus]]'', ''[[Jalkavirus]]'', ''[[Jiaoyazivirus]]'', ''[[Kafavirus]]'', ''[[Kajamvirus]]'', ''[[Kakivirus]]'', ''[[Kalppathivirus]]'', ''[[Kelmasvirus]]'', ''[[Kembevirus]]'', ''[[Krakvirus]]'', ''[[Lauvirus]]'', ''[[Limelightvirus]]'', ''[[Lingvirus]]'', ''[[Lirvirus]]'', ''[[Lullwatervirus]]'', ''[[Maculvirus]]'', ''[[Napahaivirus]]'', ''[[Nohivirus]]'', ''[[Oinezvirus]]'', ''[[Paadamvirus]]'', ''[[Pagavirus]]'', ''[[Pairvirus]]'', ''[[Pedosvirus]]'', ''[[Pekhitvirus]]'', ''[[Pelagivirus]]'', ''[[Percyvirus]]'', ''[[Piedvirus]]'', ''[[Podivirus]]'', ''[[Pollyceevirus]]'', ''[[Poseidonvirus]]'', ''[[Powvirus]]'', ''[[Pradovirus]]'', ''[[Qadamvirus]]'', ''[[Scottvirus]]'', ''[[Sednavirus]]'', ''[[Serkorvirus]]'', ''[[Sieqvirus]]'', ''[[Stompelvirus]]'', ''[[Stopalavirus]]'', ''[[Stopavirus]]'', ''[[Stupnyavirus]]'', ''[[Tangaroavirus]]'', ''[[Tawavirus]]'', ''[[Tiamatvirus]]'', ''[[Tiilvirus]]'', ''[[Tritonvirus]]'', ''[[Voetvirus]]'', ''[[Votkovvirus]]'', ''[[Waewaevirus]]'', ''[[Wuhanvirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Beijerinckvirinae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Daemvirus]]'', ''[[Friunavirus]]'', ''[[Pettyvirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Colwellvirinae]]'' (5 rodů) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Gutovirus]]'', ''[[Kaohsiungvirus]]'', ''[[Murciavirus]]'', ''[[Trungvirus]]'', ''[[Uliginvirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Corkvirinae]]'' (4 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Kantovirus]]'', ''[[Kotilavirus]]'', ''[[Phimunavirus]]'', ''[[Stompvirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Krylovirinae]]'' (4 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Kirikabuvirus]]'', ''[[Phikmvvirus]]'', ''[[Stubburvirus]]'', ''[[Tunggulvirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Melnykvirinae]]'' (8 rodů) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Aerosvirus]]'', ''[[Aghbyvirus]]'', ''[[Ahphunavirus]]'', ''[[Cronosvirus]]'', ''[[Panjvirus]]'', ''[[Pienvirus]]'', ''[[Pokrovskaiavirus]]'', ''[[Wanjuvirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Molineuxvirinae]]'' (6 rodů) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Acadevirus]]'', ''[[Axomammavirus]]'', ''[[Eracentumvirus]]'', ''[[Tuodvirus]]'', ''[[Vectrevirus]]'', ''[[Zindervirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Okabevirinae]]'' (5 rodů) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Ampunavirus]]'', ''[[Higashivirus]]'', ''[[Mguuvirus]]'', ''[[Risjevirus]]'', ''[[Sukuvirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Slopekvirinae]]'' (4 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Bucovirus]]'', ''[[Drulisvirus]]'', ''[[Koutsourovirus]]'', ''[[Novosibovirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Studiervirinae]]'' (23 rodů) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Aarhusvirus]]'', ''[[Apdecimavirus]]'', ''[[Berlinvirus]]'', ''[[Caroctavirus]]'', ''[[Chatterjeevirus]]'', ''[[Eapunavirus]]'', ''[[Elunavirus]]'', ''[[Foetvirus]]'', ''[[Ghunavirus]]'', ''[[Helsettvirus]]'', ''[[Jarilovirus]]'', ''[[Kayfunavirus]]'', ''[[Minipunavirus]]'', ''[[Ningirsuvirus]]'', ''[[Pektosvirus]]'', ''[[Phutvirus]]'', ''[[Pifdecavirus]]'', ''[[Pijolavirus]]'', ''[[Przondovirus]]'', ''[[Teetrevirus]]'', ''[[Teseptimavirus]]'', ''[[Troedvirus]]'', ''[[Unyawovirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď (neuznaná): ''[[Autolykiviridae]]''<ref name="Kauffman_2018"/><ref name="Ignacio-Espinoza_2018"/><ref name="Mihulka_2018"/> (1 neuznaný rod) |
|||
**:**:*:* Rod (neuznaný): ''[[Autolykivirus]]''<ref name="Kauffman_2018"/><ref name="Ignacio-Espinoza_2018"/><ref name="Mihulka_2018"/> |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Chaseviridae]]'' (6 rodů) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Carltongylesvirus]]'', ''[[Faunusvirus]]'', ''[[Loessnervirus]]'', ''[[Pahsextavirus]]'', ''[[Suwonvirus]]'', ''[[Yushanvirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Demerecviridae]]'' (3 podčeledi) |
|||
**:**:** (nezařazené do podčeledí) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Novosibvirus]]'', ''[[Pogseptimavirus]]'', ''[[Shenzhenvirus]]'', ''[[Sugarlandvirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Ermolyevavirinae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Cetovirus]]'', ''[[Jesfedecavirus]]'', ''[[Vipunavirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Markadamsvirinae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Epseptimavirus]]'', ''[[Haartmanvirus]]'', ''[[Tequintavirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Mccorquodalevirinae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Hongcheonvirus]]'', ''[[Myunavirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Drexlerviridae]]'' (4 podčeledi) |
|||
**:**:** (nezařazené do podčeledí) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Eclunavirus]]'', ''[[Gyeonggidovirus]]'', ''[[Nouzillyvirus]]'', ''[[Sauletekiovirus]]'', ''[[Vilniusvirus]]'', ''[[Webervirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Braunvirinae]]'' (4 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Christensenvirus]]'', ''[[Guelphvirus]]'', ''[[Loudonvirus]]'', ''[[Rtpvirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Rogunavirinae]]'' (4 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Eastlansingvirus]]'', ''[[Lindendrivevirus]]'', ''[[Rogunavirus]]'', ''[[Wilsonroadvirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Tempevirinae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Hanrivervirus]]'', ''[[Tlsvirus]]'', ''[[Warwickvirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Tunavirinae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Badaguanvirus]]'', ''[[Sertoctavirus]]'', ''[[Tunavirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Herelleviridae]]'' (5 podčeledí) |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Bastillevirinae]]'' (7 rodů) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Agatevirus]]'', ''[[Bastillevirus]]'', ''[[Bequatrovirus]]'', ''[[Caeruleovirus]]'', ''[[Nitunavirus]]'', ''[[Tsarbombavirus]]'', ''[[Wphvirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Brockvirinae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Kochikohdavirus]]'', ''[[Schiekvirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Jasinkavirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Pecentumvirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Spounavirinae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Okubovirus]]'', ''[[Siminovitchvirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Twortvirinae]]'' (7 rodů) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Baoshanvirus]]'', ''[[Harbinvirus]]'', ''[[Kayvirus]]'', ''[[Sciuriunavirus]]'', ''[[Sepunavirus]]'', ''[[Silviavirus]]'', ''[[Twortvirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Myoviridae]]'' (5 podčeledí) |
|||
**:**:** (nezařazené do podčeledí) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Abouovirus]]'', ''[[Acionnavirus]]'', ''[[Agricanvirus]]'', ''[[Ahtivirus]]'', ''[[Alcyoneusvirus]]'', ''[[Alexandravirus]]'', ''[[Anamdongvirus]]'', ''[[Anaposvirus]]'', ''[[Aokuangvirus]]'', ''[[Aphroditevirus]]'', ''[[Asteriusvirus]]'', ''[[Atlauavirus]]'', ''[[Aurunvirus]]'', ''[[Baikalvirus]]'', ''[[Barbavirus]]'', ''[[Bcepmuvirus]]'', ''[[Bellamyvirus]]'', ''[[Bendigovirus]]'', ''[[Biquartavirus]]'', ''[[Bixzunavirus]]'', ''[[Brigitvirus]]'', ''[[Brizovirus]]'', ''[[Brunovirus]]'', ''[[Busanvirus]]'', ''[[Carpasinavirus]]'', ''[[Chakrabartyvirus]]'', ''[[Charybdisvirus]]'', ''[[Chiangmaivirus]]'', ''[[Cymopoleiavirus]]'', ''[[Derbicusvirus]]'', ''[[Elvirus]]'', ''[[Emdodecavirus]]'', ''[[Eneladusvirus]]'', ''[[Eponavirus]]'', ''[[Erskinevirus]]'', ''[[Eurybiavirus]]'', ''[[Ficleduovirus]]'', ''[[Flaumdravirus]]'', ''[[Gofduovirus]]'', ''[[Goslarvirus]]'', ''[[Hapunavirus]]'', ''[[Heilongjiangvirus]]'', ''[[Iapetusvirus]]'', ''[[Iodovirus]]'', ''[[Ionavirus]]'', ''[[Jedunavirus]]'', ''[[Jilinvirus]]'', ''[[Jimmervirus]]'', ''[[Kanaloavirus]]'', ''[[Kleczkowskavirus]]'', ''[[Lagaffevirus]]'', ''[[Leucotheavirus]]'', ''[[Libanvirus]]'', ''[[Llyrvirus]]'', ''[[Loughboroughvirus]]'', ''[[Lubbockvirus]]'', ''[[Machinavirus]]'', ''[[Marthavirus]]'', ''[[Mazuvirus]]'', ''[[Metrivirus]]'', ''[[Mieseafarmvirus]]'', ''[[Mimasvirus]]'', ''[[Mushuvirus]]'', ''[[Muvirus]]'', ''[[Myohalovirus]]'', ''[[Naesvirus]]'', ''[[Namakavirus]]'', ''[[Nankokuvirus]]'', ''[[Neptunevirus]]'', ''[[Nereusvirus]]'', ''[[Nerrivikvirus]]'', ''[[Nodensvirus]]'', ''[[Noxifervirus]]'', ''[[Obolenskvirus]]'', ''[[Otagovirus]]'', ''[[Pakpunavirus]]'', ''[[Palaemonvirus]]'', ''[[Pbunavirus]]'', ''[[Peatvirus]]'', ''[[Petsuvirus]]'', ''[[Phabquatrovirus]]'', ''[[Phapecoctavirus]]'', ''[[Phikzvirus]]'', ''[[Plaisancevirus]]'', ''[[Polybotosvirus]]'', ''[[Pontusvirus]]'', ''[[Popoffvirus]]'', ''[[Punavirus]]'', ''[[Qingdaovirus]]'', ''[[Radnorvirus]]'', ''[[Ripduovirus]]'', ''[[Risingsunvirus]]'', ''[[Rosemountvirus]]'', ''[[Saclayvirus]]'', ''[[Salacisavirus]]'', ''[[Salmondvirus]]'', ''[[Sasquatchvirus]]'', ''[[Schmittlotzvirus]]'', ''[[Seoulvirus]]'', ''[[Shalavirus]]'', ''[[Svunavirus]]'', ''[[Tabernariusvirus]]'', ''[[Tamkungvirus]]'', ''[[Taranisvirus]]'', ''[[Tefnutvirus]]'', ''[[Tegunavirus]]'', ''[[Thaumasvirus]]'', ''[[Thetisvirus]]'', ''[[Thornevirus]]'', ''[[Tidunavirus]]'', ''[[Tijeunavirus]]'', ''[[Toutatisvirus]]'', ''[[Tulanevirus]]'', ''[[Vellamovirus]]'', ''[[Vhmlvirus]]'', ''[[Viunavirus]]'', ''[[Wellingtonvirus]]'', ''[[Wifcevirus]]'', ''[[Winklervirus]]'', ''[[Yokohamavirus]]'', ''[[Yoloswagvirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Eucampyvirinae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Firehammervirus]]'', ''[[Fletchervirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Ounavirinae]]'' (4 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Felixounavirus]]'', ''[[Kolesnikvirus]]'', ''[[Mooglevirus]]'', ''[[Suspvirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Peduovirinae]]'' (26 rodů) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Aresaunavirus]]'', ''[[Baylorvirus]]'', ''[[Bielevirus]]'', ''[[Canoevirus]]'', ''[[Catalunyavirus]]'', ''[[Citexvirus]]'', ''[[Eganvirus]]'', ''[[Entnonagintavirus]]'', ''[[Felsduovirus]]'', ''[[Hpunavirus]]'', ''[[Irtavirus]]'', ''[[Kisquattuordecimvirus]]'', ''[[Kisquinquevirus]]'', ''[[Longwoodvirus]]'', ''[[Nampongvirus]]'', ''[[Peduovirus]]'', ''[[Phitrevirus]]'', ''[[Playavirus]]'', ''[[Reginaelenavirus]]'', ''[[Senquatrovirus]]'', ''[[Seongnamvirus]]'', ''[[Simpcentumvirus]]'', ''[[Stockinghallvirus]]'', ''[[Tigrvirus]]'', ''[[Vulnificusvirus]]'', ''[[Xuanwuvirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Tevenvirinae]]'' (11 rodů) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Dhakavirus]]'', ''[[Gaprivervirus]]'', ''[[Gelderlandvirus]]'', ''[[Jiaodavirus]]'', ''[[Karamvirus]]'', ''[[Krischvirus]]'', ''[[Moonvirus]]'', ''[[Mosigvirus]]'', ''[[Schizotequatrovirus]]'', ''[[Slopekvirus]]'', ''[[Tequatrovirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Vequintavirinae]]'' (4 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Avunavirus]]'', ''[[Certrevirus]]'', ''[[Seunavirus]]'', ''[[Vequintavirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Podoviridae]]'' (3 podčeledi) |
|||
**:**:** (nezařazené do podčeledí) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Baltimorevirus]]'', ''[[Bjornvirus]]'', ''[[Bruynoghevirus]]'', ''[[Enhodamvirus]]'', ''[[Enquatrovirus]]'', ''[[Fipvunavirus]]'', ''[[Fischettivirus]]'', ''[[Gamaleyavirus]]'', ''[[Giessenvirus]]'', ''[[Hollowayvirus]]'', ''[[Ithacavirus]]'', ''[[Jasminevirus]]'', ''[[Johnsonvirus]]'', ''[[Jwalphavirus]]'', ''[[Kafunavirus]]'', ''[[Kelquatrovirus]]'', ''[[Kochitakasuvirus]]'', ''[[Krylovvirus]]'', ''[[Kuravirus]]'', ''[[Lederbergvirus]]'', ''[[Lessievirus]]'', ''[[Lightbulbvirus]]'', ''[[Litunavirus]]'', ''[[Luzseptimavirus]]'', ''[[Mukerjeevirus]]'', ''[[Myxoctovirus]]'', ''[[Pagevirus]]'', ''[[Perisivirus]]'', ''[[Rauchvirus]]'', ''[[Ryyoungvirus]]'', ''[[Schmidvirus]]'', ''[[Shizishanvirus]]'', ''[[Skarprettervirus]]'', ''[[Sortsnevirus]]'', ''[[Uetakevirus]]'', ''[[Vicosavirus]]'', ''[[Xuquatrovirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Picovirinae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Cepunavirus]]'', ''[[Negarvirus]]'', ''[[Salasvirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Rakietenvirinae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Andhravirus]]'', ''[[Rosenblumvirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Sepvirinae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Diegovirus]]'', ''[[Oslovirus]]'', ''[[Traversvirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Siphoviridae]]'' (13 podčeledí) |
|||
**:**:** (nezařazené do podčeledí) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Abbeymikolonvirus]]'', ''[[Abidjanvirus]]'', ''[[Ahduovirus]]'', ''[[Amigovirus]]'', ''[[Anatolevirus]]'', ''[[Andrewvirus]]'', ''[[Andromedavirus]]'', ''[[Appavirus]]'', ''[[Apricotvirus]]'', ''[[Armstrongvirus]]'', ''[[Attisvirus]]'', ''[[Attoomivirus]]'', ''[[Austintatiousvirus]]'', ''[[Bantamvirus]]'', ''[[Barnyardvirus]]'', ''[[Beetrevirus]]'', ''[[Bernalvirus]]'', ''[[Betterkatzvirus]]'', ''[[Bingvirus]]'', ''[[Biseptimavirus]]'', ''[[Bowservirus]]'', ''[[Bridgettevirus]]'', ''[[Britbratvirus]]'', ''[[Bronvirus]]'', ''[[Brussowvirus]]'', ''[[Casadabanvirus]]'', ''[[Cbastvirus]]'', ''[[Cecivirus]]'', ''[[Ceduovirus]]'', ''[[Ceetrepovirus]]'', ''[[Cequinquevirus]]'', ''[[Chenonavirus]]'', ''[[Cheoctovirus]]'', ''[[Chivirus]]'', ''[[Chunghsingvirus]]'', ''[[Cimpunavirus]]'', ''[[Cinunavirus]]'', ''[[Coetzeevirus]]'', ''[[Coralvirus]]'', ''[[Corndogvirus]]'', ''[[Cronusvirus]]'', ''[[Daredevilvirus]]'', ''[[Decurrovirus]]'', ''[[Delepquintavirus]]'', ''[[Demosthenesvirus]]'', ''[[Detrevirus]]'', ''[[Dhillonvirus]]'', ''[[Dismasvirus]]'', ''[[Doucettevirus]]'', ''[[Edenvirus]]'', ''[[Efquatrovirus]]'', ''[[Eiauvirus]]'', ''[[Eisenstarkvirus]]'', ''[[Elerivirus]]'', ''[[Emalynvirus]]'', ''[[Eyrevirus]]'', ''[[Fairfaxidumvirus]]'', ''[[Farahnazvirus]]'', ''[[Feofaniavirus]]'', ''[[Fibralongavirus]]'', ''[[Franklinbayvirus]]'', ''[[Fromanvirus]]'', ''[[Gaiavirus]]'', ''[[Galaxyvirus]]'', ''[[Galunavirus]]'', ''[[Gamtrevirus]]'', ''[[Gesputvirus]]'', ''[[Getseptimavirus]]'', ''[[Ghobesvirus]]'', ''[[Gilesvirus]]'', ''[[Gillianvirus]]'', ''[[Godonkavirus]]'', ''[[Goodmanvirus]]'', ''[[Gordonvirus]]'', ''[[Gordtnkvirus]]'', ''[[Gorganvirus]]'', ''[[Gorjumvirus]]'', ''[[Gustavvirus]]'', ''[[Harrisonvirus]]'', ''[[Hedwigvirus]]'', ''[[Helsingorvirus]]'', ''[[Hendrixvirus]]'', ''[[Hiyaavirus]]'', ''[[Holosalinivirus]]'', ''[[Homburgvirus]]'', ''[[Ikedavirus]]'', ''[[Ilzatvirus]]'', ''[[Incheonvrus]]'', ''[[Inhavirus]]'', ''[[Jacevirus]]'', ''[[Jenstvirus]]'', ''[[Juiceboxvirus]]'', ''[[Kairosalinivirus]]'', ''[[Kelleziovirus]]'', ''[[Kilunavirus]]'', ''[[Klementvirus]]'', ''[[Kojivirus]]'', ''[[Korravirus]]'', ''[[Kostyavirus]]'', ''[[Krampusvirus]]'', ''[[Kryptosalinivirus]]'', ''[[Lacusarxvirus]]'', ''[[Lambdavirus]]'', ''[[Lanavirus]]'', ''[[Laroyevirus]]'', ''[[Lebronvirus]]''<ref name="Adriaenssens_2015"/> (neuznaný), ''[[Lentavirus]]'', ''[[Liebevirus]]'', ''[[Liefievirus]]'', ''[[Lokivirus]]'', ''[[Lomovskayavirus]]'', ''[[Luckybarnesvirus]]'', ''[[Luckytenvirus]]'', ''[[Lughvirus]]'', ''[[Lwoffvirus]]'', ''[[Magadivirus]]'', ''[[Majavirus]]'', ''[[Manhattanvirus]]'', ''[[Mapvirus]]'', ''[[Mardecavirus]]'', ''[[Marvinvirus]]'', ''[[Maxrubnervirus]]'', ''[[Mementomorivirus]]'', ''[[Metamorphoovirus]]'', ''[[Minunavirus]]'', ''[[Moineauvirus]]'', ''[[Montyvirus]]'', ''[[Mudcatvirus]]'', ''[[Murrayvirus]]'', ''[[Nanhaivirus]]'', ''[[Nazgulvirus]]'', ''[[Neferthenavirus]]'', ''[[Nickievirus]]'', ''[[Nipunavirus]]'', ''[[Nonagvirus]]'', ''[[Nonanavirus]]'', ''[[Nyceiraevirus]]'', ''[[Oengusvirus]]'', ''[[Omegavirus]]'', ''[[Oneupvirus]]'', ''[[Orchidvirus]]'', ''[[Oshimavirus]]'', ''[[Pahexavirus]]'', ''[[Pamexvirus]]'', ''[[Papyrusvirus]]'', ''[[Patiencevirus]]'', ''[[Pbi1virus]]'', ''[[Pepyhexavirus]]'', ''[[Phietavirus]]'', ''[[Phifelvirus]]'', ''[[Picardvirus]]'', ''[[Pikminvirus]]'', ''[[Poushouvirus]]'', ''[[Priunavirus]]'', ''[[Psavirus]]'', ''[[Psimunavirus]]'', ''[[Pulverervirus]]'', ''[[Quhwahvirus]]'', ''[[Raleighvirus]]'', ''[[Ravinvirus]]'', ''[[Rerduovirus]]'', ''[[Rigallicvirus]]'', ''[[Rimavirus]]'', ''[[Rogerhendrixvirus]]'', ''[[Ronaldovirus]]'', ''[[Roufvirus]]'', ''[[Rowavirus]]'', ''[[Ruthyvirus]]'', ''[[Samistivirus]]'', ''[[Samunavirus]]'', ''[[Samwavirus]]'', ''[[Sanovirus]]'', ''[[Sansavirus]]'', ''[[Saphexavirus]]'', ''[[Sashavirus]]'', ''[[Sasvirus]]'', ''[[Saundersvirus]]'', ''[[Scapunavirus]]'', ''[[Schnabeltiervirus]]'', ''[[Schubertvirus]]'', ''[[Septimatrevirus]]'', ''[[Seuratvirus]]'', ''[[Seussvirus]]'', ''[[Sextaecvirus]]'', ''[[Sitaravirus]]'', ''[[Skunavirus]]'', ''[[Slashvirus]]'', ''[[Smoothievirus]]'', ''[[Sonalivirus]]'', ''[[Soupsvirus]]'', ''[[Sourvirus]]'', ''[[Spbetavirus]]'', ''[[Squashvirus]]'', ''[[Stanholtvirus]]'', ''[[Steinhofvirus]]'', ''[[Tankvirus]]'', ''[[Terapinvirus]]'', ''[[Tigunavirus]]'', ''[[Timquatrovirus]]'', ''[[Tinduovirus]]'', ''[[Titanvirus]]'', ''[[Tortellinivirus]]'', ''[[Triavirus]]'', ''[[Trigintaduovirus]]'', ''[[Trinavirus]]'', ''[[Trinevirus]]'', ''[[Trippvirus]]'', ''[[Unahavirus]]'', ''[[Vashvirus]]'', ''[[Vegasvirus]]'', ''[[Vendettavirus]]'', ''[[Vhulanivirus]]'', ''[[Vidquintavirus]]'', ''[[Vieuvirus]]'', ''[[Vividuovirus]]'', ''[[Vojvodinavirus]]'', ''[[Wbetavirus]]'', ''[[Weaselvirus]]'', ''[[Wildcatvirus]]'', ''[[Wilnyevirus]]'', ''[[Wizardvirus]]'', ''[[Woesvirus]]'', ''[[Woodruffvirus]]'', ''[[Xiamenvirus]]'', ''[[Xipdecavirus]]'', ''[[Yangvirus]]'', ''[[Yuavirus]]'', ''[[Yvonnevirus]]'', ''[[Zetavirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Arquatrovirinae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Arequatrovirus]]'', ''[[Camvirus]]'', ''[[Likavirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Bclasvirinae]]'' (5 rodů) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Acadianvirus]]'', ''[[Coopervirus]]'', ''[[Pegunavirus]]'', ''[[Pipefishvirus]]'', ''[[Rosebushvirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Chebruvirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Brujitavirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Dclasvirinae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Hawkeyevirus]]'', ''[[Plotvirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Dolichocephalovirinae]]'' (4 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Bertelyvirus]]'', ''[[Colossusvirus]]'', ''[[Poindextervirus]]'', ''[[Shapirovirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Guernseyvirinae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Cornellvirus]]'', ''[[Jerseyvirus]]'', ''[[Kagunavirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Langleyhallvirinae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Getalongvirus]]'', ''[[Horusvirus]]'', ''[[Phistoryvirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Mccleskeyvirinae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Limdunavirus]]'', ''[[Unaquatrovirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Mclasvirinae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Bongovirus]]'', ''[[Reyvirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Nclasvirinae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Buttersvirus]]'', ''[[Charlievirus]]'', ''[[Redivirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Nymbaxtervirinae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Baxtervirus]]'', ''[[Nymphadoravirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Pclasvirinae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Bignuzvirus]]'', ''[[Fishburnevirus]]'', ''[[Phayoncevirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Tybeckvirinae]]'' (4 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Douglaswolinvirus]]'', ''[[Lenusvirus]]'', ''[[Lidleunavirus]]'', ''[[Maenadvirus]]'' |
|||
=== Monodnaviria === |
|||
Ačkoli je fylogenetická blízkost všech zahrnutých taxonů odůvodněna palm doménami RNA [[polymeráza|polymeráz]] závislých na RNA, ve stávajícím vymezení se může jednat o taxon [[parafyletismus|parafyletický]] (i v odůvodnění návrhu je zvažována možnost, že přirozenými podřízenými taxony mohou být RNA a DNA viry s reverzní transkriptázou a některé další skupiny DNA virů.<ref name="Riboviria"/> V tomto se liší od dalších taxonů systému ICTV, založených na předpokladu monofyletičnosti. I z tohoto důvodu je proto v tomto článku vyčleněn do zvláštního oddílu; dalším důvodem pro tento přístup je snaha vyhnout se nepřehlednosti systému kvůli „nevyváženosti“ způsobené jediným vysoce nadřazeným taxonem. |
|||
Realm: ''[[Monodnaviria]]'' (4 říše) |
|||
* Říše: ''[[Loebvirae]]'' (1 kmen) |
|||
** Kmen: ''[[Hofneiviricota]]'' (1 třída) |
|||
**:* Třída: ''[[Faserviricetes]]'' (1 řád) |
|||
**:** Řád: ''[[Tubulavirales]]'' (2 čeledi) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Inoviridae]]'' (23 rodů) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Affertcholeramvirus]]'', ''[[Bifilivirus]]'', ''[[Capistrivirus]]'', ''[[Coriovirus]]'', ''[[Fibrovirus]]'', ''[[Habenivirus]]'', ''[[Infulavirus]]'', ''[[Inovirus]]'', ''[[Lineavirus]]'', ''[[Parhipatevirus]]'', ''[[Primolicivirus]]'', ''[[Psecadovirus]]'', ''[[Restivirus]]'', ''[[Saetivirus]]'', ''[[Scuticavirus]]'', ''[[Staminivirus]]'', ''[[Subteminivirus]]'', ''[[Tertilicivirus]]'', ''[[Thomixvirus]]'', ''[[Versovirus]]'', ''[[Vicialiavirus]]'', ''[[Villovirus]]'', ''[[Xylivirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Plectroviridae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Plectrovirus]]'', ''[[Suturavirus]]'', ''[[Vespertiliovirus]]'' |
|||
* Říše: ''[[Sangervirae]]'' (1 kmen) |
|||
** Kmen: ''[[Phixviricota]]'' (1 třída) |
|||
**:* Třída: ''[[Malgrandaviricetes]]'' (1 řád) |
|||
**:** Řád: ''[[Petitvirales]]'' (1 čeleď) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Microviridae]]'' (2 podčeledi) |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Bullavirinae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Alphatrevirus]]'', ''[[Gequatrovirus]]'', ''[[Sinsheimervirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Gokushovirinae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Bdellomicrovirus]]'', ''[[Chlamydiamicrovirus]]'', ''[[Spiromicrovirus]]'' |
|||
* Říše: ''[[Shotokuvirae]]'' (2 kmeny) |
|||
** Kmen: ''[[Cossaviricota]]'' (3 třídy) |
|||
**:* Třída: ''[[Mouviricetes]]'' (1 řád) |
|||
**:** Řád: ''[[Polivirales]]'' (1 čeleď) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Bidnaviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Bidensovirus]]'' |
|||
**:* Třída: ''[[Papovaviricetes]]'' (2 řády) |
|||
**:** Řád: ''[[Sepolyvirales]]'' (1 čeleď) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Polyomaviridae]]'' (4 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Alphapolyomavirus]]'', ''[[Betapolyomavirus]]'', ''[[Deltapolyomavirus]]'', ''[[Gammapolyomavirus]]'' |
|||
**:** Řád: ''[[Zurhausenvirales]]'' (1 čeleď) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Papillomaviridae]]'' (2 podčeledi) |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Firstpapillomavirinae]]'' (52 rodů) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Alphapapillomavirus]]'', ''[[Betapapillomavirus]]'', ''[[Chipapillomavirus]]'', ''[[Deltapapillomavirus]]'', ''[[Dyochipapillomavirus]]'', ''[[Dyodeltapapillomavirus]]'', ''[[Dyoepsilonpapillomavirus]]'', ''[[Dyoetapapillomavirus]]'', ''[[Dyoiotapapillomavirus]]'', ''[[Dyokappapapillomavirus]]'', ''[[Dyolambdapapillomavirus]]'', ''[[Dyomupapillomavirus]]'', ''[[Dyonupapillomavirus]]'', ''[[Dyoomegapapillomavirus]]'', ''[[Dyoomikronpapillomavirus]]'', ''[[Dyophipapillomavirus]]'', ''[[Dyopipapillomavirus]]'', ''[[Dyopsipapillomavirus]]'', ''[[Dyorhopapillomavirus]]'', ''[[Dyosigmapapillomavirus]]'', ''[[Dyotaupapillomavirus]]'', ''[[Dyothetapapillomavirus]]'', ''[[Dyoupsilonpapillomavirus]]'', ''[[Dyoxipapillomavirus]]'', ''[[Dyozetapapillomavirus]]'', ''[[Epsilonpapillomavirus]]'', ''[[Etapapillomavirus]]'', ''[[Gammapapillomavirus]]'', ''[[Iotapapillomavirus]]'', ''[[Kappapapillomavirus]]'', ''[[Lambdapapillomavirus]]'', ''[[Mupapillomavirus]]'', ''[[Nupapillomavirus]]'', ''[[Omegapapillomavirus]]'', ''[[Omikronpapillomavirus]]'', ''[[Phipapillomavirus]]'', ''[[Pipapillomavirus]]'', ''[[Psipapillomavirus]]'', ''[[Rhopapillomavirus]]'', ''[[Sigmapapillomavirus]]'', ''[[Taupapillomavirus]]'', ''[[Thetapapillomavirus]]'', ''[[Treisdeltapapillomavirus]]'', ''[[Treisepsilonpapillomavirus]]'', ''[[Treisetapapillomavirus]]'', ''[[Treisiotapapillomavirus]]'', ''[[Treiskappapapillomavirus]]'', ''[[Treisthetapapillomavirus]]'', ''[[Treiszetapapillomavirus]]'', ''[[Upsilonpapillomavirus]]'', ''[[Xipapillomavirus]]'', ''[[Zetapapillomavirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Secondpapillomavirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Alefpapillomavirus]]'' |
|||
**:* Třída: ''[[Quintoviricetes]]'' (1 řád) |
|||
**:** Řád: ''[[Piccovirales]]'' (1 čeleď) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Parvoviridae]]'' (3 podčeledi) |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Densovirinae]]'' (9 rodů) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Aquambidensovirus]]'', ''[[Blattambidensovirus]]'', ''[[Hemiambidensovirus]]'', ''[[Iteradensovirus]]'', ''[[Miniambidensovirus]]'', ''[[Pefuambidensovirus]]'', ''[[Penstylhamaparvovirus]]'', ''[[Protoambidensovirus]]'', ''[[Scindoambidensovirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Hamaparvovirinae]]'' (4 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Brevihamaparvovirus]]'', ''[[Chaphamaparvovirus]]'', ''[[Hepanhamaparvovirus]]'', ''[[Ichthamaparvovirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Parvovirinae]]'' (10 rodů) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Amdoparvovirus]]'', ''[[Artiparvovirus]]'', ''[[Aveparvovirus]]'', ''[[Bocaparvovirus]]'', ''[[Copiparvovirus]]'', ''[[Dependoparvovirus]]'', ''[[Erythroparvovirus]]'', ''[[Loriparvovirus]]'', ''[[Protoparvovirus]]'', ''[[Tetraparvovirus]]'' |
|||
** Kmen: ''[[Cressdnaviricota]]'' (2 třídy) |
|||
**:* Třída: ''[[Arfiviricetes]]'' (5 řádů) |
|||
**:** Řád: ''[[Baphyvirales]]'' (1 čeleď) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Bacilladnaviridae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Diatodnavirus]]'', ''[[Kieseladnavirus]]'', ''[[Protobacilladnavirus]]'' |
|||
**:** Řád: ''[[Cirlivirales]]'' (1 čeleď) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Circoviridae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Circovirus]]'', ''[[Cyclovirus]]'' |
|||
**:** Řád: ''[[Cremevirales]]'' (1 čeleď) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Smacoviridae]]'' (6 rodů) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Bovismacovirus]]'', ''[[Cosmacovirus]]'', ''[[Dragsmacovirus]]'', ''[[Drosmacovirus]]'', ''[[Huchismacovirus]]'', ''[[Porprismacovirus]]'' |
|||
**:** Řád: ''[[Mulpavirales]]'' (1 čeleď) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Nanoviridae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Babuvirus]]'', ''[[Nanovirus]]'' |
|||
**:** Řád: ''[[Recrevirales]]'' (1 čeleď) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Redondoviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Torbevirus]]'' |
|||
**:* Třída: ''[[Repensiviricetes]]'' (1 řád) |
|||
**:** Řád: ''[[Geplafuvirales]]'' (2 čeledi, 1 neuznaná čeleď) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Geminiviridae]]'' (9 rodů, 1 neuznaný rod) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Becurtovirus]]'', ''[[Begomovirus]]'', ''[[Capulavirus]]'', ''[[Curtovirus]]'', ''[[Eragrovirus]]'', ''[[Grablovirus]]'', ''[[Graingemvirus]]''<ref name="Poojari_2013"/> (neuznaný), ''[[Mastrevirus]]'', ''[[Topocuvirus]]'', ''[[Turncurtovirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Genomoviridae]]'' (9 rodů) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Gemycircularvirus]]'', ''[[Gemyduguivirus]]'', ''[[Gemygorvirus]]'', ''[[Gemykibivirus]]'', ''[[Gemykolovirus]]'', ''[[Gemykrogvirus]]'', ''[[Gemykroznavirus]]'', ''[[Gemytondvirus]]'', ''[[Gemyvongvirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď (neuznaná): ''[[Naminiviridae]]''<ref name="Cofodevirus"/> (1 neuznaný rod) |
|||
**:**:*:* Rod (neuznaný): ''[[Cofodevirus]]''<ref name="Cofodevirus"/> |
|||
* Říše: ''[[Trapavirae]]'' (1 kmen) |
|||
** Kmen: ''[[Saleviricota]]'' (1 třída) |
|||
**:* Třída: ''[[Huolimaviricetes]]'' (1 řád) |
|||
**:** Řád: ''[[Haloruvirales]]'' (1 čeleď) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Pleolipoviridae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Alphapleolipovirus]]'', ''[[Betapleolipovirus]]'', ''[[Gammapleolipovirus]]'' |
|||
=== Riboviria === |
|||
Z následujícího přehledu taxonů jsou do realmu Negaviria řazeny: |
|||
Realm: ''[[RNA viry|Riboviria]]'' (2 říše) {{#tag:ref|Metagenomické analýzy odhalily mnoho nových fylogeneticky odlišných linií, které neodpovídají stávajícím klasifikačním schématům; lze proto očekávat vytváření nejen nových taxonů na úrovni čeledí a rodů, ale i možné hlubší změny v obsahu vyšších taxonů a topologii jejich fylogenetických stromů<ref name="Shi_2016"/>|group="pozn."}} |
|||
* celý kmen ''Negarnaviricota'' |
|||
* (nezařazené do říší) |
|||
* celé řády ''Nidovirales, Picornavirales, Tymovirales'' |
|||
*:::::::* Rod: ''[[Albetovirus]]'', ''[[Aumaivirus]]'', ''[[Papanivirus]]'', ''[[Virtovirus]]'' |
|||
* nezařazené (do žádného řádu) čeledi ''Alphatetraviridae, Alvernaviridae, Amalgaviridae, Astroviridae, Avsunviroidae, Barnaviridae, Benyviridae, Birnaviridae, Botourmiaviridae, Bromoviridae, Caliciviridae, Carmotetraviridae, Chrysoviridae, Closteroviridae, Cystoviridae, Endornaviridae, Flaviviridae, Hepeviridae, Hypoviridae, Kitaviridae, Leviviridae, Luteoviridae, Matonaviridae, Megabirnaviridae, Narnaviridae, Nodaviridae, Partitiviridae, Permutotetraviridae, Picobirnaviridae, Pospiviroidae, Potyviridae, Quadriviridae, Reoviridae, Sarthroviridae, Solemoviridae, Solinviviridae, Togaviridae, Tombusviridae, Totiviridae, Virgaviridae'' |
|||
*:::::* Čeleď: ''[[Polymycoviridae]]'' (1 rod) |
|||
* nezařazené (do žádné čeledi) rody ''Albetovirus, Aumaivirus, Botybirnavirus, Deltavirus, Idaeovirus, Papanivirus, Sinaivirus, Virtovirus'' |
|||
*:::::*:* Rod: ''[[Polymycovirus]]'' |
|||
a z definice by do něj spadaly i dosud neuznané rody ''Negevirus, Ostravirus, Qinvirus, Weivirus, Yanvirus, Yuevirus, Zhaovirus ''. |
|||
*:::::* Čeleď: ''[[Sarthroviridae]]'' (1 rod) |
|||
*:::::*:* Rod: ''[[Macronovirus]]'' |
|||
* Říše: ''[[Orthornavirae]]'' (5 kmenů) |
|||
** (nezařazené do kmene) |
|||
**::::::* Rod: ''[[Botybirnavirus]]'' |
|||
**::::* Čeleď: ''[[Birnaviridae]]'' (7 rodů) |
|||
**::::*:* Rod: ''[[Aquabirnavirus]]'', ''[[Avibirnavirus]]'', ''[[Blosnavirus]]'', ''[[Dronavirus]]'', ''[[Entomobirnavirus]]'', ''[[Ronavirus]]'', ''[[Telnavirus]]'' |
|||
**::::* Čeleď: ''[[Permutotetraviridae]]'' (1 rod) |
|||
**::::*:* Rod: ''[[Alphapermutotetravirus]]'' |
|||
** Kmen: ''[[Duplornaviricota]]'' (3 třídy) |
|||
**:* Třída: ''[[Chrymotiviricetes]]'' (1 řád) |
|||
**:** Řád: ''[[Ghabrivirales]]'' (4 čeledi) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Chrysoviridae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Alphachrysovirus]]'', ''[[Betachrysovirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Megabirnaviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Megabirnavirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Quadriviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Quadrivirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Totiviridae]]'' (5 rodů) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Giardiavirus]]'', ''[[Leishmaniavirus]]'', ''[[Totivirus]]'', ''[[Trichomonasvirus]]'', ''[[Victorivirus]]'' |
|||
**:* Třída: ''[[Resentoviricetes]]'' (1 řád) |
|||
**:** Řád: ''[[Reovirales]]'' (1 čeleď) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Reoviridae]]'' (2 podčeledi) |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Sedoreovirinae]]'' (6 rodů) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Cardoreovirus]]'', ''[[Mimoreovirus]]'', ''[[Orbivirus]]'', ''[[Phytoreovirus]]'', ''[[Rotavirus]]'', ''[[Seadornavirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Spinareovirinae]]'' (9 rodů) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Aquareovirus]]'', ''[[Coltivirus]]'', ''[[Cypovirus]]'', ''[[Dinovernavirus]]'', ''[[Fijivirus]]'', ''[[Idnoreovirus]]'', ''[[Mycoreovirus]]'', ''[[Orthoreovirus]]'', ''[[Oryzavirus]]'' |
|||
**:* Třída: ''[[Vidaverviricetes]]'' (1 řád) |
|||
**:** Řád: ''[[Mindivirales]]'' (1 čeleď) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Cystoviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Cystovirus]]'' |
|||
** Kmen: ''[[Kitrinoviricota]]'' (4 třídy) |
|||
**:* Třída: ''[[Alsuviricetes]]'' (3 řády) |
|||
**:** Řád: ''[[Hepelivirales]]'' (4 čeledi) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Alphatetraviridae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Betatetravirus]]'', ''[[Omegatetravirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Benyviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Benyvirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Hepeviridae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Orthohepevirus]]'', ''[[Piscihepevirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Matonaviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Rubivirus]]'' |
|||
**:** Řád: ''[[Martellivirales]]'' (7 čeledí) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Bromoviridae]]'' (6 rodů) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Alfamovirus]]'', ''[[Anulavirus]]'', ''[[Bromovirus]]'', ''[[Cucumovirus]]'', ''[[Ilarvirus]]'', ''[[Oleavirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Closteroviridae]]'' (4 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Ampelovirus]]'', ''[[Closterovirus]]'', ''[[Crinivirus]]'', ''[[Velarivirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Endornaviridae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Alphaendornavirus]]'', ''[[Betaendornavirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Kitaviridae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Blunervirus]]'', ''[[Cilevirus]]'', ''[[Higrevirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Mayoviridae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Idaeovirus]]'', ''[[Pteridovirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Togaviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Alphavirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Virgaviridae]]'' (7 rodů) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Furovirus]]'', ''[[Goravirus]]'', ''[[Hordeivirus]]'', ''[[Pecluvirus]]'', ''[[Pomovirus]]'', ''[[Tobamovirus]]'', ''[[Tobravirus]]'' |
|||
**:** Řád: ''[[Tymovirales]]'' (5 čeledí) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Alphaflexiviridae]]'' (7 rodů) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Allexivirus]]'', ''[[Botrexvirus]]'', ''[[Lolavirus]]'', ''[[Mandarivirus]]'', ''[[Platypuvirus]]'', ''[[Potexvirus]]'', ''[[Sclerodarnavirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Betaflexiviridae]]'' (2 podčeledi) |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Quinvirinae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Carlavirus]]'', ''[[Foveavirus]]'', ''[[Robigovirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Trivirinae]]'' (10 rodů) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Capillovirus]]'', ''[[Chordovirus]]'', ''[[Citrivirus]]'', ''[[Divavirus]]'', ''[[Prunevirus]]'', ''[[Ravavirus]]'', ''[[Tepovirus]]'', ''[[Trichovirus]]'', ''[[Vitivirus]]'', ''[[Wamavirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Deltaflexiviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Deltaflexivirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Gammaflexiviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Mycoflexivirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Tymoviridae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Maculavirus]]'', ''[[Marafivirus]]'', ''[[Tymovirus]]'' |
|||
**:* Třída: ''[[Flasuviricetes]]'' (1 řád) |
|||
**:** Řád: ''[[Amarillovirales]]'' (1 čeleď) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Flaviviridae]]'' (4 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Flavivirus]]'', ''[[Hepacivirus]]'', ''[[Pegivirus]]'', ''[[Pestivirus]]'' |
|||
**:* Třída: ''[[Magsaviricetes]]'' (1 řád) |
|||
**:** Řád: ''[[Nodamuvirales]]'' (2 čeledi) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Nodaviridae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Alphanodavirus]]'', ''[[Betanodavirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Sinhaliviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Sinaivirus]]'' |
|||
**:* Třída: ''[[Tolucaviricetes]]'' (1 řád) |
|||
**:** Řád: ''[[Tolivirales]]'' (3 čeledi) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Carmotetraviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Alphacarmotetravirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Luteoviridae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Enamovirus]]'', ''[[Luteovirus]]'', ''[[Polerovirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Tombusviridae]]'' (3 podčeledi) |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Calvusvirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Umbravirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Procedovirinae]]'' (14 rodů) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Alphacarmovirus]]'', ''[[Alphanecrovirus]]'', ''[[Aureusvirus]]'', ''[[Avenavirus]]'', ''[[Betacarmovirus]]'', ''[[Betanecrovirus]]'', ''[[Gallantivirus]]'', ''[[Gammacarmovirus]]'', ''[[Macanavirus]]'', ''[[Machlomovirus]]'', ''[[Panicovirus]]'', ''[[Pelarspovirus]]'', ''[[Tombusvirus]]'', ''[[Zeavirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Regressovirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Dianthovirus]]'' |
|||
** Kmen: ''[[Lenarviricota]]'' (4 třídy) |
|||
**:* Třída: ''[[Allassoviricetes]]'' (1 řád) |
|||
**:** Řád: ''[[Levivirales]]'' (1 čeleď) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Leviviridae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Allolevivirus]]'', ''[[Levivirus]]'' |
|||
**:* Třída: ''[[Amabiliviricetes]]'' (1 řád) |
|||
**:** Řád: ''[[Wolframvirales]]'' (1 čeleď) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Narnaviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Narnavirus]]'' |
|||
**:* Třída: ''[[Howeltoviricetes]]'' (1 řád) |
|||
**:** Řád: ''[[Cryppavirales]]'' (1 čeleď) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Mitoviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Mitovirus]]'' |
|||
**:* Třída: ''[[Miaviricetes]]'' (1 řád) |
|||
**:** Řád: ''[[Ourlivirales]]'' (1 čeleď) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Botourmiaviridae]]'' (4 rody, 1 neuznaný rod) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Botoulivirus]]'', ''[[Magoulivirus]]'', ''[[Ourmiavirus]]'', ''[[Ostravirus]]''<ref name="Grybchuk_2018"/><ref name="CT24_2018"/> (neuznaný), ''[[Scleroulivirus]]'' |
|||
** {{kotva|Negarnaviricota}}Kmen: ''[[Negarnaviricota]]'' (2 podkmeny) |
|||
*** Podkmen: ''[[Haploviricotina]]'' (4 třídy) |
|||
**** Třída: ''[[Chunqiuviricetes]]'' (1 řád) |
|||
***** Řád: ''[[Muvirales]]'' (1 čeleď) |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Qinviridae]]'' (1 rod) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Yingvirus]]'' |
|||
**** Třída: ''[[Milneviricetes]]'' (1 řád) |
|||
***** Řád: ''[[Serpentovirales]]'' (1 čeleď) |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Aspiviridae]]'' (1 rod) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Ophiovirus]]'' |
|||
**** Třída: ''[[Monjiviricetes]]'' (2 řády) |
|||
***** Řád: ''[[Jingchuvirales]]'' (1 čeleď) |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Chuviridae]]'' (1 rod) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Mivirus]]'' |
|||
***** Řád: ''[[Mononegavirales]]'' (11 čeledí) |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Artoviridae]]'' (2 rody) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Hexartovirus]]'', ''[[Peropuvirus]]'' |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Bornaviridae]]'' (3 rody) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Carbovirus]]'', ''[[Cultervirus]]'', ''[[Orthobornavirus]]'' |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Filoviry|Filoviridae]]'' (6 rodů) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Cuevavirus]]'', ''[[Dianlovirus]]'', ''[[Ebolavirus]]'', ''[[Marburgvirus]]'', ''[[Striavirus]]'', ''[[Thamnovirus]]'' |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Lispiviridae]]'' (1 rod) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Arlivirus]]'' |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Mymonaviridae]]'' (2 rody) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Hubramonavirus]]'', ''[[Sclerotimonavirus]]'' |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Nyamiviridae]]'' (6 rodů) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Berhavirus]]'', ''[[Crustavirus]]'', ''[[Nyavirus]]'', ''[[Orinovirus]]'', ''[[Socyvirus]]'', ''[[Tapwovirus]]'' |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Paramyxoviry|Paramyxoviridae]]'' (4 podčeledi) |
|||
*****:** (nezařazené do podčeledí) |
|||
*****:*** Rod: ''[[Cynoglossusvirus]]'', ''[[Hoplichthysvirus]]'', ''[[Scoliodonvirus]]'' |
|||
*****:** Podčeleď: ''[[Avulavirinae]]'' (3 rody) |
|||
*****:*** Rod: ''[[Metaavulavirus]]'', ''[[Orthoavulavirus]]'', ''[[Paraavulavirus]]'' |
|||
*****:** Podčeleď: ''[[Metaparamyxovirinae]]'' (1 rod) |
|||
*****:*** Rod: ''[[Synodonvirus]]'' |
|||
*****:** Podčeleď: ''[[Orthoparamyxovirinae]]'' (8 rodů) |
|||
*****:*** Rod: ''[[Aquaparamyxovirus]]'', ''[[Ferlavirus]]'', ''[[Henipavirus]]'', ''[[Jeilongvirus]]'', ''[[Morbillivirus]]'', ''[[Narmovirus]]'', ''[[Respirovirus]]'', ''[[Salemvirus]]'' |
|||
*****:** Podčeleď: ''[[Rubulavirinae]]'' (2 rody) |
|||
*****:*** Rod: ''[[Orthorubulavirus]]'', ''[[Pararubulavirus]]'' |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Pneumoviridae]]'' (2 rody) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Metapneumovirus]]'', ''[[Orthopneumovirus]]'' |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Rhabdoviridae]]'' (26 rodů) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Almendravirus]]'', ''[[Alphanemrhavirus]]'', ''[[Alphanucleorhabdovirus]]'', ''[[Arurhavirus]]'', ''[[Betanucleorhabdovirus]]'', ''[[Caligrhavirus]]'', ''[[Curiovirus]]'', ''[[Cytorhabdovirus]]'', ''[[Dichorhavirus]]'', ''[[Ephemerovirus]]'', ''[[Gammanucleorhabdovirus]]'', ''[[Hapavirus]]'', ''[[Ledantevirus]]'', ''[[Lyssavirus]]'', ''[[Mousrhavirus]]'', ''[[Novirhabdovirus]]'', ''[[Ohlsrhavirus]]'', ''[[Perhabdovirus]]'', ''[[Sigmavirus]]'', ''[[Sprivivirus]]'', ''[[Sripuvirus]]'', ''[[Sunrhavirus]]'', ''[[Tibrovirus]]'', ''[[Tupavirus]]'', ''[[Varicosavirus]]'', ''[[Vesiculovirus]]'' |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Sunviridae]]'' (1 rod) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Sunshinevirus]]'' |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Xinmoviridae]]'' (1 rod) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Anphevirus]]'' |
|||
**** Třída: ''[[Yunchangviricetes]]'' (1 řád) |
|||
***** Řád: ''[[Goujianvirales]]'' (1 čeleď) |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Yueviridae]]'' (1 rod) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Yuyuevirus]]'' |
|||
*** Podkmen: ''[[Polyploviricotina]]'' (2 třídy) |
|||
**** Třída: ''[[Ellioviricetes]]'' (1 řád) |
|||
***** Řád: ''[[Bunyavirales]]'' (12 čeledí) |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Arenaviridae]]'' (4 rody) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Antennavirus]]'', ''[[Hartmanivirus]]'', ''[[Mammarenavirus]]'', ''[[Reptarenavirus]]'' |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Cruliviridae]]'' (1 rod) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Lincruvirus]]'' |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Fimoviridae]]'' (1 rod) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Emaravirus]]'' |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Hantaviridae]]'' (4 podčeledi) |
|||
*****:** Podčeleď: ''[[Actantavirinae]]'' (1 rod) |
|||
*****:*** Rod: ''[[Actinovirus]]'' |
|||
*****:** Podčeleď: ''[[Agantavirinae]]'' (1 rod) |
|||
*****:*** Rod: ''[[Agnathovirus]]'' |
|||
*****:** Podčeleď: ''[[Mammantavirinae]]'' (4 rody) |
|||
*****:*** Rod: ''[[Loanvirus]]'', ''[[Mobatvirus]]'', ''[[Orthohantavirus]]'', ''[[Thottimvirus]]'' |
|||
*****:** Podčeleď: ''[[Repantavirinae]]'' (1 rod) |
|||
*****:*** Rod: ''[[Reptillovirus]]'' |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Leishbuviridae]]'' (1 rod) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Shilevirus]]'' |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Mypoviridae]]'' (1 rod) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Hubavirus]]'' |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Nairoviridae]]'' (3 rody) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Orthonairovirus]]'', ''[[Shaspivirus]]'', ''[[Striwavirus]]'' |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Peribunyaviridae]]'' (4 rody) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Herbevirus]]'', ''[[Orthobunyavirus]]'', ''[[Pacuvirus]]'', ''[[Shangavirus]]'' |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Phasmaviridae]]'' (5 rodů) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Feravirus]]'', ''[[Jonvirus]]'', ''[[Orthophasmavirus]]'', ''[[Sawastrivirus]]'', ''[[Wuhivirus]]'' |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Phenuiviridae]]'' (19 rodů) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Bandavirus]]'', ''[[Beidivirus]]'', ''[[Coguvirus]]'', ''[[Entovirus]]'', ''[[Goukovirus]]'', ''[[Horwuvirus]]'', ''[[Hudivirus]]'', ''[[Hudovirus]]'', ''[[Ixovirus]]'', ''[[Laulavirus]]'', ''[[Lentinuvirus]]'', ''[[Mobuvirus]]'', ''[[Phasivirus]]'', ''[[Phlebovirus]]'', ''[[Pidchovirus]]'', ''[[Rubodvirus]]'', ''[[Tenuivirus]]'', ''[[Uukuvirus]]'', ''[[Wenrivirus]]'' |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Tospoviridae]]'' (1 rod) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Orthotospovirus]]'' |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Wupedeviridae]]'' (1 rod) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Wumivirus]]'' |
|||
**** Třída: ''[[Insthoviricetes]]'' (1 řád) |
|||
***** Řád: ''[[Articulavirales]]'' (2 čeledi) |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Amnoonviridae]]'' (1 rod) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Tilapinevirus]]'' |
|||
*****:* Čeleď: ''[[Orthomyxoviridae]]'' (7 rodů) |
|||
*****:*:* Rod: ''[[Alphainfluenzavirus]]'', ''[[Betainfluenzavirus]]'', ''[[Deltainfluenzavirus]]'', ''[[Gammainfluenzavirus]]'', ''[[Isavirus]]'', ''[[Quaranjavirus]]'', ''[[Thogotovirus]]'' |
|||
** Kmen: ''[[Pisuviricota]]'' (3 třídy) |
|||
**:* Třída: ''[[Duplopiviricetes]]'' (1 řád) |
|||
**:** Řád: ''[[Durnavirales]]'' (4 čeledi) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Amalgaviridae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Amalgavirus]]'', ''[[Zybavirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Hypoviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Hypovirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Partitiviridae]]'' (5 rodů) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Alphapartitivirus]]'', ''[[Betapartitivirus]]'', ''[[Cryspovirus]]'', ''[[Deltapartitivirus]]'', ''[[Gammapartitivirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Picobirnaviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Picobirnavirus]]'' |
|||
**:* Třída: ''[[Pisoniviricetes]]'' (3 řády) |
|||
**:** Řád: ''[[Nidovirales]]'' (8 podřádů) |
|||
**:*** Podřád: ''[[Abnidovirineae]]'' (1 čeleď) |
|||
**:**** Čeleď: ''[[Abyssoviridae]]'' (1 podčeleď) |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Tiamatvirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:****** Rod: ''[[Alphaabyssovirus]]'' |
|||
**:*** Podřád: ''[[Arnidovirineae]]'' (4 čeledi) |
|||
**:**** Čeleď: ''[[Arteriviridae]]'' (6 podčeledí) |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Crocarterivirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:****** Rod: ''[[Muarterivirus]]'' |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Equarterivirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:****** Rod: ''[[Alphaarterivirus]]'' |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Heroarterivirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:****** Rod: ''[[Lambdaarterivirus]]'' |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Simarterivirinae]]'' (6 rodů) |
|||
**:****** Rod: ''[[Deltaarterivirus]]'', ''[[Epsilonarterivirus]]'', ''[[Etaarterivirus]]'', ''[[Iotaarterivirus]]'', ''[[Thetaarterivirus]]'', ''[[Zetaarterivirus]]'' |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Variarterivirinae]]'' (3 rody) |
|||
**:****** Rod: ''[[Betaarterivirus]]'', ''[[Gammaarterivirus]]'', ''[[Nuarterivirus]]'' |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Zealarterivirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:****** Rod: ''[[Kappaarterivirus]]'' |
|||
**:**** Čeleď: ''[[Cremegaviridae]]'' (1 podčeleď) |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Rodepovirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:****** Rod: ''[[Pontunivirus]]'' |
|||
**:**** Čeleď: ''[[Gresnaviridae]]'' (1 podčeleď) |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Reternivirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:****** Rod: ''[[Cyclophivirus]]'' |
|||
**:**** Čeleď: ''[[Olifoviridae]]'' (1 podčeleď) |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Gofosavirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:****** Rod: ''[[Kukrinivirus]]'' |
|||
**:*** Podřád: ''[[Cornidovirineae]]'' (1 čeleď) |
|||
**:**** Čeleď: ''[[Coronaviridae]]'' (2 podčeledi) |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Letovirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:****** Rod: ''[[Alphaletovirus]]'' |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Koronavirus|Orthocoronavirinae]]'' (4 rody) |
|||
**:****** Rod: ''[[Alphacoronavirus]]'', ''[[Betacoronavirus]]'', ''[[Deltacoronavirus]]'', ''[[Gammacoronavirus]]'' |
|||
**:*** Podřád: ''[[Mesnidovirineae]]'' (2 čeledi) |
|||
**:**** Čeleď: ''[[Medioniviridae]]'' (2 podčeledi) |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Medionivirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:****** Rod: ''[[Turrinivirus]]'' |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Tunicanivirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:****** Rod: ''[[Bolenivirus]]'' |
|||
**:**** Čeleď: ''[[Mesoniviridae]]'' (1 podčeleď) |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Hexponivirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:****** Rod: ''[[Alphamesonivirus]]'' |
|||
**:*** Podřád: ''[[Monidovirineae]]'' (1 čeleď) |
|||
**:**** Čeleď: ''[[Mononiviridae]]'' (1 podčeleď) |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Mononivirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:****** Rod: ''[[Alphamononivirus]]'' |
|||
**:*** Podřád: ''[[Nanidovirineae]]'' (2 čeledi) |
|||
**:**** Čeleď: ''[[Nanghoshaviridae]]'' (1 podčeleď) |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Chimanivirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:****** Rod: ''[[Chimshavirus]]'' |
|||
**:**** Čeleď: ''[[Nanhypoviridae]]'' (1 podčeleď) |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Hyporhamsavirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:****** Rod: ''[[Sajorinivirus]]'' |
|||
**:*** Podřád: ''[[Ronidovirineae]]'' (2 čeledi) |
|||
**:**** Čeleď: ''[[Euroniviridae]]'' (2 podčeledi) |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Ceronivirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:****** Rod: ''[[Charybnivirus]]'' |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Crustonivirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:****** Rod: ''[[Paguronivirus]]'' |
|||
**:**** Čeleď: ''[[Roniviridae]]'' (1 podčeleď) |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Okanivirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:****** Rod: ''[[Okavirus]]'' |
|||
**:*** Podřád: ''[[Tornidovirineae]]'' (1 čeleď) |
|||
**:**** Čeleď: ''[[Tobaniviridae]]'' (4 podčeledi) |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Piscanivirinae]]'' (2 rody) |
|||
**:****** Rod: ''[[Bafinivirus]]'', ''[[Oncotshavirus]]'' |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Remotovirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:****** Rod: ''[[Bostovirus]]'' |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Serpentovirinae]]'' (4 rody) |
|||
**:****** Rod: ''[[Infratovirus]]'', ''[[Lyctovirus]]'', ''[[Pregotovirus]]'', ''[[Sectovirus]]'' |
|||
**:***** Podčeleď: ''[[Torovirinae]]'' (1 rod) |
|||
**:****** Rod: ''[[Torovirus]]'' |
|||
**:** Řád: ''[[Picornavirales]]'' (8 čeledí) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Caliciviridae]]'' (11 rodů) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Bavovirus]]'', ''[[Lagovirus]]'', ''[[Minovirus]]'', ''[[Nacovirus]]'', ''[[Nebovirus]]'', ''[[Norovirus]]'', ''[[Recovirus]]'', ''[[Salovirus]]'', ''[[Sapovirus]]'', ''[[Valovirus]]'', ''[[Vesivirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Dicistroviridae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Aparavirus]]'', ''[[Cripavirus]]'', ''[[Triatovirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Iflaviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Iflavirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Marnaviridae]]'' (7 rodů) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Bacillarnavirus]]'', ''[[Kusarnavirus]]'', ''[[Labyrnavirus]]'', ''[[Locarnavirus]]'', ''[[Marnavirus]]'', ''[[Salisharnavirus]]'', ''[[Sogarnavirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Picornaviridae]]'' (63 rodů) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Aalivirus]]'', ''[[Ailurivirus]]'', ''[[Ampivirus]]'', ''[[Anativirus]]'', ''[[Aphthovirus]]'', ''[[Aquamavirus]]'', ''[[Avihepatovirus]]'', ''[[Avisivirus]]'', ''[[Boosepivirus]]'', ''[[Bopivirus]]'', ''[[Cardiovirus]]'', ''[[Cosavirus]]'', ''[[Crahelivirus]]'', ''[[Crohivirus]]'', ''[[Dicipivirus]]'', ''[[Diresapivirus]]'', ''[[Enterovirus]]'', ''[[Erbovirus]]'', ''[[Felipivirus]]'', ''[[Fipivirus]]'', ''[[Gallivirus]]'', ''[[Gruhelivirus]]'', ''[[Grusopivirus]]'', ''[[Harkavirus]]'', ''[[Hemipivirus]]'', ''[[Hepatovirus]]'', ''[[Hunnivirus]]'', ''[[Kobuvirus]]'', ''[[Kunsagivirus]]'', ''[[Limnipivirus]]'', ''[[Livupivirus]]'', ''[[Ludopivirus]]'', ''[[Malagasivirus]]'', ''[[Megrivirus]]'', ''[[Mischivirus]]'', ''[[Mosavirus]]'', ''[[Mupivirus]]'', ''[[Myrropivirus]]'', ''[[Orivirus]]'', ''[[Oscivirus]]'', ''[[Parabovirus]]'', ''[[Parechovirus]]'', ''[[Pasivirus]]'', ''[[Passerivirus]]'', ''[[Pemapivirus]]'', ''[[Poecivirus]]'', ''[[Potamipivirus]]'', ''[[Rabovirus]]'', ''[[Rafivirus]]'', ''[[Rohelivirus]]'', ''[[Rosavirus]]'', ''[[Sakobuvirus]]'', ''[[Salivirus]]'', ''[[Sapelovirus]]'', ''[[Senecavirus]]'', ''[[Shanbavirus]]'', ''[[Sicinivirus]]'', ''[[Symapivirus]]'', ''[[Teschovirus]]'', ''[[Torchivirus]]'', ''[[Tottorivirus]]'', ''[[Tremovirus]]'', ''[[Tropivirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Polycipiviridae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Chipolycivirus]]'', ''[[Hupolycivirus]]'', ''[[Sopolycivirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Secoviridae]]'' (1 podčeleď) |
|||
**:**:** (nezařazené do podčeledí) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Cheravirus]]'', ''[[Sadwavirus]]'', ''[[Sequivirus]]'', ''[[Torradovirus]]'', ''[[Waikavirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Comovirinae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Comovirus]]'', ''[[Fabavirus]]'', ''[[Nepovirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Solinviviridae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Invictavirus]]'', ''[[Nyfulvavirus]]'' |
|||
**:** Řád: ''[[Sobelivirales]]'' (3 čeledi) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Alvernaviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Dinornavirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Barnaviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Barnavirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Solemoviridae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Polemovirus]]'', ''[[Sobemovirus]]'' |
|||
**:* Třída: ''[[Stelpaviricetes]]'' (2 řády) |
|||
**:** Řád: ''[[Patatavirales]]'' (1 čeleď) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Potyviridae]]'' (12 rodů) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Arepavirus]]'', ''[[Bevemovirus]]'', ''[[Brambyvirus]]'', ''[[Bymovirus]]'', ''[[Celavirus]]'', ''[[Ipomovirus]]'', ''[[Macluravirus]]'', ''[[Poacevirus]]'', ''[[Potyvirus]]'', ''[[Roymovirus]]'', ''[[Rymovirus]]'', ''[[Tritimovirus]]'' |
|||
**:** Řád: ''[[Stellavirales]]'' (1 čeleď) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Astroviridae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Avastrovirus]]'', ''[[Mamastrovirus]]'' |
|||
* Říše: ''[[Pararnavirae]]'' (1 kmen) |
|||
** Kmen: ''[[Artverviricota]]'' (1 třída) |
|||
**:* Třída: ''[[Revtraviricetes]]'' (2 řády) |
|||
**:** Řád: ''[[Blubervirales]]'' (1 čeleď, 1 neuznaná čeleď) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Hepadnaviridae]]'' (5 rodů) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Avihepadnavirus]]'', ''[[Herpetohepadnavirus]]'', ''[[Metahepadnavirus]]'', ''[[Orthohepadnavirus]]'', ''[[Parahepadnavirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď (neuznaná): ''[[Nackednaviridae]]''<ref name="Lauber_2017"/> (1 neuznaný rod) |
|||
**:**:*:* Rod (neuznaný): ''[[Nackednavirus]]''<ref name="Lauber_2017"/> |
|||
**:** Řád: ''[[Ortervirales]]'' (5 čeledí) |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Belpaoviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Semotivirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Caulimoviridae]]'' (10 rodů) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Badnavirus]]'', ''[[Caulimovirus]]'', ''[[Cavemovirus]]'', ''[[Dioscovirus]]'', ''[[Petuvirus]]'', ''[[Rosadnavirus]]'', ''[[Solendovirus]]'', ''[[Soymovirus]]'', ''[[Tungrovirus]]'', ''[[Vaccinivirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Metaviridae]]'' (2 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Errantivirus]]'', ''[[Metavirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Pseudoviridae]]'' (3 rody) |
|||
**:**:*:* Rod: ''[[Hemivirus]]'', ''[[Pseudovirus]]'', ''[[Sirevirus]]'' |
|||
**:**:* Čeleď: ''[[Retroviry|Retroviridae]]'' (2 podčeledi) |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Orthoretrovirinae]]'' (6 rodů) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Alpharetrovirus]]'', ''[[Betaretrovirus]]'', ''[[Deltaretrovirus]]'', ''[[Epsilonretrovirus]]'', ''[[Gammaretrovirus]]'', ''[[Lentivirus]]'' |
|||
**:**:** Podčeleď: ''[[Spumaretrovirinae]]'' (5 rodů) |
|||
**:**:*** Rod: ''[[Bovispumavirus]]'', ''[[Equispumavirus]]'', ''[[Felispumavirus]]'', ''[[Prosimiispumavirus]]'', ''[[Simiispumavirus]]'' |
|||
=== |
=== Varidnaviria === |
||
Realm: ''[[Varidnaviria]]'' (2 říše) |
|||
{{redirect|Negarnaviricota|Negaviria}} |
|||
* Říše: ''[[Bamfordvirae]]'' (2 kmeny) |
|||
Jediným dosud uznaným kmenem jsou ''Negarnaviricota'', sdružující 7 fylogeneticky příbuzných řádů. |
|||
** Kmen: ''[[Nucleocytoviricota]]''{{#tag:ref|Dříve používané názvy pro skupinu téhož vymezení: „NCLDV group“, „[[Megavirales]]“ (před zavedením taxonů vyšších než řád, proto s příponou řádu) <ref name="Colson_2012"/><ref name="Colson_2013"/><ref name="Fischer_2016"/><ref name="Halary_2016"/>|group="pozn."}} (2 třídy) {{#tag:ref|Metagenomické analýzy odhalily mnoho nových kladů na úrovni podčeledí či rodů, dosud neuznaných jako samostatné taxony<ref name="Schulz_2020"/>|group="pozn."}} |
|||
* '''Kmen: ''[[Negarnaviricota]]''''' (2 podkmeny) |
|||
**:* (nezařazené do tříd) |
|||
** Podkmen: ''[[Haploviricotina]]'' (4 třídy) |
|||
**:*::::* Rod (neuznaný): ''[[Yaravirus]]''<ref name="Yaravirus"/> |
|||
*** Třída: ''[[Chunqiuviricetes]]'' (1 řád) |
|||
** |
**:* Třída: ''[[Megaviricetes]]'' (3 řády) |
||
** |
**:** Řád: ''[[Algavirales]]'' (1 čeleď, 2 neuznané čeledi) |
||
**:**:* (nezařazené do čeledí) |
|||
****** Rod: ''[[Yingvirus]]'' |
|||
**:**:*:* Rod (neuznaný): ''[[Mollivirus]]''<ref name="Legendre_2015"/> |
|||
*** Třída: ''[[Milneviricetes]]'' (1 řád) |
|||
**** |
**:**:* Čeleď (neuznaná): ''[[Medusaviridae]]''<ref name="Yoshikawa_2019"/> (1 neuznaný rod) |
||
**:**:*:* Rod (neuznaný): ''[[Medusavirus]]''<ref name="Yoshikawa_2019"/><ref name="Mihulka_2019"/> |
|||
***** Čeleď: ''[[Aspiviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:* Čeleď (neuznaná): ''[[Pandoraviridae]]''<ref name="Yutin_2013"/><ref name="Philippe_2013"/><ref name="Mihulka_2013"/> (1 neuznaný rod) |
|||
****** Rod: ''[[Ophiovirus]]'' |
|||
**:**:*:* Rod (neuznaný): ''[[Pandoravirus]]''<ref name="Yutin_2013"/><ref name="Philippe_2013"/><ref name="Mihulka_2013"/> |
|||
*** Třída: ''[[Monjiviricetes]]'' (2 řády) |
|||
**** |
**:**:* Čeleď: ''[[Phycodnaviridae]]'' (6 rodů) |
||
**:**:*:* Rod: ''[[Chlorovirus]]'', ''[[Coccolithovirus]]'', ''[[Phaeovirus]]'', ''[[Prasinovirus]]'', ''[[Prymnesiovirus]]'', ''[[Raphidovirus]]'' |
|||
***** Čeleď: ''[[Chuviridae]]'' (1 rod) |
|||
** |
**:** Řád: ''[[Imitervirales]]'' (1 čeleď) |
||
**** |
**:**:* Čeleď: ''[[Mimiviridae]]'' (2 rody, 1 neuznaný rod, 1 neuznaná podčeleď) |
||
**:**:*:* Rod: ''[[Cafeteriavirus]]'', ''[[Mimivirus]]'' (vč. ''[[Megavirus]]''<ref name="Arslan_2011"/>, ''[[Moumouvirus]]''<ref name="Moumouvirus"/>, ''[[Lentillevirus]]''<ref name="Desnues_2012"/>, někdy navrhovaných vyčlenit do samostatných rodů) <ref name="Rodrigues_2019"/>, ''[[Tupanvirus]]''<ref name="Tupanvirus"/><ref name="Rodrigues_2019"/> (neuznaný) |
|||
***** Čeleď: ''[[Artoviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:**:** Podčeleď (neuznaná): ''[[Klosneuvirinae]]''<ref name="Schulz_2017"/> (4 neuznané rody) |
|||
****** Rod: ''[[Peropuvirus]]'' |
|||
**:**:*** Rod (neuznaný): ''[[Catovirus]]''<ref name="Schulz_2017"/>, ''[[Hokovirus]]''<ref name="Schulz_2017"/>, ''[[Indivirus]]''<ref name="Schulz_2017"/>, ''[[Klosneuvirus]]''<ref name="Schulz_2017"/> |
|||
***** Čeleď: ''[[Bornaviridae]]'' (3 rody) |
|||
**:** Řád: ''[[Pimascovirales]]''{{#tag:ref|Dříve používaný název pro skupinu téhož vymezení: „superklad MAPI“ <ref name="Guglielmini 2019"/>|group="pozn."}} (3 čeledi, 1 neuznaná čeleď) |
|||
****** Rod: ''[[Carbovirus]]'' |
|||
**** |
**:**:* Čeleď: ''[[Ascoviridae]]'' (2 rody) |
||
****** Rod: ''[[ |
**:**:*:* Rod: ''[[Ascovirus]]'', ''[[Toursvirus]]'' |
||
***** Čeleď: ''[[ |
**:**:* Čeleď: ''[[Iridoviry|Iridoviridae]]'' (2 podčeledi) |
||
****** |
**:**:** Podčeleď: ''[[Alphairidovirinae]]'' (3 rody) |
||
****** Rod: ''[[ |
**:**:*** Rod: ''[[Lymphocystivirus]]'', ''[[Megalocytivirus]]'', ''[[Ranavirus]]'' |
||
****** |
**:**:** Podčeleď: ''[[Betairidovirinae]]'' (3 rody) |
||
****** Rod: ''[[ |
**:**:*** Rod: ''[[Chloriridovirus]]'', ''[[Decapodiridovirus]]'', ''[[Iridovirus]]'' |
||
**** |
**:**:* Čeleď: ''[[Marseilleviridae]]'' (1 rod) |
||
***** |
**:**:*:* Rod: ''[[Marseillevirus]]'' (vč. ''[[Lausannevirus]]'') |
||
**:**:* Čeleď (neuznaná): ''[[Pithoviridae]]''<ref name="Claverie_2014"/><ref name="Yong_2014"/><ref name="Týden"/> (3 neuznané rody) |
|||
****** Rod: ''[[Arlivirus]]'' |
|||
**:**:*:* Rod (neuznaný): ''[[Cedratvirus]]''<ref name="Andreani_2016"/>, ''[[Orpheovirus]]''<ref name="Andreani_2018"/>, ''[[Pithovirus]]''<ref name="Claverie_2014"/> |
|||
***** Čeleď: ''[[Mymonaviridae]]'' (1 rod) |
|||
** |
**:* Třída: ''[[Pokkesviricetes]]'' (2 řády) |
||
** |
**:** Řád: ''[[Asfuvirales]]'' (1 čeleď) |
||
**** |
**:**:* Čeleď: ''[[Asfarviridae]]'' (1 rod) |
||
****** Rod: ''[[ |
**:**:*:* Rod: ''[[Asfivirus]]'' |
||
**:**:* (nezařazené do čeledí) |
|||
****** Rod: ''[[Nyavirus]]'' |
|||
**:**:*:* Rod (neuznaný): ''[[Faustovirus]]''<ref name="Reteno_2015"/><ref name="Benamar_2016"/>, ''[[Kaumoebavirus]]''<ref name="Bajrai_2016"/>, ''[[Pacmanvirus]]''<ref name="Andreani_2017"/> |
|||
****** Rod: ''[[Orinovirus]]'' |
|||
** |
**:** Řád: ''[[Chitovirales]]'' (1 čeleď) |
||
**** |
**:**:* Čeleď: ''[[Poxviry|Poxviridae]]'' (2 podčeledi) |
||
***** |
**:**:** Podčeleď: ''[[Chordopoxvirinae]]'' (18 rodů) |
||
**:**:*** Rod: ''[[Avipoxvirus]]'', ''[[Capripoxvirus]]'', ''[[Centapoxvirus]]'', ''[[Cervidpoxvirus]]'', ''[[Crocodylidpoxvirus]]'', ''[[Leporipoxvirus]]'', ''[[Macropopoxvirus]]'', ''[[Virus molluscum contagiosum|Molluscipoxvirus]]'', ''[[Mustelpoxvirus]]'', ''[[Orthopoxvirus]]'', ''[[Oryzopoxvirus]]'', ''[[Parapoxvirus]]'', ''[[Pteropopoxvirus]]'', ''[[Salmonpoxvirus]]'', ''[[Sciuripoxvirus]]'', ''[[Suipoxvirus]]'', ''[[Vespertilionpoxvirus]]'', ''[[Yatapoxvirus]]'' |
|||
****** Podčeleď: ''[[Avulavirinae]]'' (3 rody) |
|||
**** |
**:**:** Podčeleď: ''[[Entomopoxvirinae]]'' (4 rody) |
||
**:**:*** Rod: ''[[Alphaentomopoxvirus]]'', ''[[Betaentomopoxvirus]]'', ''[[Deltaentomopoxvirus]]'', ''[[Gammaentomopoxvirus]]'' |
|||
******* Rod: ''[[Orthoavulavirus]]'' |
|||
** Kmen: ''[[Preplasmiviricota]]'' (2 třídy) |
|||
** |
**:* Třída: ''[[Maveriviricetes]]'' (1 řád) |
||
** |
**:** Řád: ''[[Priklausovirales]]'' (1 čeleď) |
||
**:**:* Čeleď: ''[[Lavidaviridae]]'' (2 rody) {{#tag:ref|Metagenomické analýzy odhalily mnoho nových kladů na úrovni rodů, dosud neuznaných jako samostatné taxony<ref name="Paez-Espino_2019"/>|group="pozn."}} |
|||
****** Podčeleď: ''[[Orthoparamyxovirinae]]'' (8 rodů) |
|||
***** |
**:**:*:* Rod: ''[[Mavirus]]'', ''[[Sputnikvirus]]'' |
||
** |
**:* Třída: ''[[Tectiliviricetes]]'' (4 řády) |
||
** |
**:** Řád: ''[[Belfryvirales]]'' (1 čeleď) |
||
**** |
**:**:* Čeleď: ''[[Turriviridae]]'' (1 rod) |
||
***** |
**:**:*:* Rod: ''[[Alphaturrivirus]]'' |
||
** |
**:** Řád: ''[[Kalamavirales]]'' (1 čeleď) |
||
**** |
**:**:* Čeleď: ''[[Tectiviridae]]'' (3 rody) |
||
***** |
**:**:*:* Rod: ''[[Alphatectivirus]]'', ''[[Betatectivirus]]'', ''[[Gammatectivirus]]'' |
||
** |
**:** Řád: ''[[Rowavirales]]'' (1 čeleď) |
||
**** |
**:**:* Čeleď: ''[[Adenoviridae]]'' (5 rodů) |
||
**:**:*:* Rod: ''[[Atadenovirus]]'', ''[[Adenovirové infekce ptáků|Aviadenovirus]]'', ''[[Ichtadenovirus]]'', ''[[Mastadenovirus]]'', ''[[Siadenovirus]]'' |
|||
******* Rod: ''[[Pararubulavirus]]'' |
|||
** |
**:** Řád: ''[[Vinavirales]]'' (1 čeleď) |
||
**** |
**:**:* Čeleď: ''[[Corticoviridae]]'' (1 rod) |
||
****** Rod: ''[[ |
**:**:*:* Rod: ''[[Corticovirus]]'' |
||
* Říše: ''[[Helvetiavirae]]'' (1 kmen) |
|||
** Kmen: ''[[Dividoviricota]]'' (1 třída) |
|||
** |
**:* Třída: ''[[Laserviricetes]]'' (1 řád) |
||
** |
**:** Řád: ''[[Halopanivirales]]'' (1 čeleď) |
||
**** |
**:**:* Čeleď: ''[[Sphaerolipoviridae]]'' (3 rody) |
||
**:**:*:* Rod: ''[[Alphasphaerolipovirus]]'', ''[[Betasphaerolipovirus]]'', ''[[Gammasphaerolipovirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Cytorhabdovirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Dichorhavirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Ephemerovirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Hapavirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Ledantevirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Lyssavirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Novirhabdovirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Nucleorhabdovirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Perhabdovirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Sigmavirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Sprivivirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Sripuvirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Tibrovirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Tupavirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Varicosavirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Vesiculovirus]]'' |
|||
***** Čeleď: ''[[Sunviridae]]'' (1 rod) |
|||
****** Rod: ''[[Sunshinevirus]]'' |
|||
***** Čeleď: ''[[Xinmoviridae]]'' (1 rod) |
|||
****** Rod: ''[[Anphevirus]]'' |
|||
*** Třída: ''[[Yunchangviricetes]]'' (1 řád) |
|||
**** '''Řád: ''[[Goujianvirales]]''''' (1 čeleď) |
|||
***** Čeleď: ''[[Yueviridae]]'' (1 rod) |
|||
****** Rod: ''[[Yuyuevirus]]'' |
|||
** Podkmen: ''[[Polyploviricotina]]'' (2 třídy) |
|||
*** Třída: ''[[Ellioviricetes]]'' (1 řád) |
|||
**** '''Řád: ''[[Bunyavirales]]''''' (12 čeledí, 1 neuznaná čeleď, 1 nezařazený rod) |
|||
****:* Nezařazený rod: ''[[Coguvirus]]'' |
|||
***** Čeleď: ''[[Arenaviridae]]'' (4 rody) |
|||
****** Rod: ''[[Antennavirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Hartmanivirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Mammarenavirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Reptarenavirus]]'' |
|||
***** Čeleď: ''[[Cruliviridae]]'' (1 rod) |
|||
****** Rod: ''[[Lincruvirus]]'' |
|||
***** Čeleď: ''[[Fimoviridae]]'' (1 rod) |
|||
****** Rod: ''[[Emaravirus]]'' |
|||
***** Čeleď: ''[[Hantaviridae]]'' (4 podčeledi) |
|||
****** Podčeleď: ''[[Actantavirinae]]'' (1 rod) |
|||
******* Rod: ''[[Actinovirus]]'' |
|||
****** Podčeleď: ''[[Agantavirinae]]'' (1 rod) |
|||
******* Rod: ''[[Agnathovirus]]'' |
|||
****** Podčeleď: ''[[Mammantavirinae]]'' (4 rody) |
|||
******* Rod: ''[[Loanvirus]]'' |
|||
******* Rod: ''[[Mobatvirus]]'' |
|||
******* Rod: ''[[Hantavirus|Orthohantavirus]]'' |
|||
******* Rod: ''[[Thottimvirus]]'' |
|||
****** Podčeleď: ''[[Repantavirinae]]'' (1 rod) |
|||
******* Rod: ''[[Reptillovirus]]'' |
|||
***** Čeleď: ''[[Leishbuviridae]]'' (1 rod) |
|||
****** Rod: ''[[Shilevirus]]'' |
|||
***** Čeleď: ''[[Mypoviridae]]'' (1 rod) |
|||
****** Rod: ''[[Hubavirus]]'' |
|||
***** Čeleď: ''[[Nairoviridae]]'' (3 rody) |
|||
****** Rod: ''[[Orthonairovirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Shaspivirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Striwavirus]]'' |
|||
***** Čeleď: ''[[Peribunyaviridae]]'' (4 rody) |
|||
****** Rod: ''[[Herbevirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Orthobunyavirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Pacuvirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Shangavirus]]'' |
|||
***** Čeleď: ''[[Phasmaviridae]]'' (6 rodů) |
|||
****** Rod: ''[[Feravirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Inshuvirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Jonvirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Orthophasmavirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Sawastrivirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Wuhivirus]]'' |
|||
***** Čeleď: ''[[Phenuiviridae]]'' (15 rodů) |
|||
****** Rod: ''[[Banyangvirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Beidivirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Goukovirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Horwuvirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Hudivirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Hudovirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Kabutovirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Laulavirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Mobuvirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Phasivirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Phlebovirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Pidchovirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Tenuivirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Wenrivirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Wubeivirus]]'' |
|||
***** Čeleď: ''[[Tospoviridae]]'' (1 rod) |
|||
****** Rod: ''[[Tospovirus]]'' |
|||
***** Čeleď: ''[[Wupedeviridae]]'' (1 rod) |
|||
****** Rod: ''[[Wumivirus]]'' |
|||
*** Třída: ''[[Insthoviricetes]]'' (1 řád) |
|||
**** '''Řád: ''[[Articulavirales]]''''' (2 čeledi) |
|||
***** Čeleď: ''[[Amnoonviridae]]'' (1 rod) |
|||
****** Rod: ''[[Tilapinevirus]]'' |
|||
***** Nezařazená čeleď: ''[[Orthomyxoviridae]]'' (7 rodů) |
|||
****** Rod: ''[[Chřipkový virus A|Alphainfluenzavirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Betainfluenzavirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Deltainfluenzavirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Gammainfluenzavirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Isavirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Quaranjavirus]]'' |
|||
****** Rod: ''[[Thogotovirus]]'' |
|||
=== Nezařazené do realmů === |
|||
Ostatní řády (7 uznaných, 1 neuznaný) nenáležejí prozatím žádnému kmeni, podkmeni ani třídě. |
|||
::::* (nezařazené do řádů) |
|||
::::*:* (nezařazené do čeledí) |
|||
=== Caudovirales === |
|||
::::*:*:* Rod: ''[[Barhavirus]]'', ''[[Deltavirus]]'', ''[[Dinodnavirus]]'', ''[[Lostrhavirus]]'', ''[[Rhizidiovirus]]'', ''[[Sawgrhavirus]]'', ''[[Tornovirus]]''<ref name="STTV"/> (neuznaný), ''[[Zarhavirus]]'' |
|||
* '''Řád: ''[[Caudovirales]]''''' (5 čeledí) |
|||
** Čeleď: ''[[ |
::::*:* Čeleď: ''[[Alphasatellitidae]]'' (2 podčeledi) |
||
*** Podčeleď: ''[[ |
::::*:** Podčeleď: ''[[Geminialphasatellitinae]]'' (4 rody) |
||
::::*:*** Rod: ''[[Ageyesisatellite]]'', ''[[Clecrusatellite]]'', ''[[Colecusatellite]]'', ''[[Gosmusatellite]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Agtrevirus]]'' |
|||
* |
::::*:** Podčeleď: ''[[Nanoalphasatellitinae]]'' (7 rodů) |
||
::::*:*** Rod: ''[[Babusatellite]]'', ''[[Clostunsatellite]]'', ''[[Fabenesatellite]]'', ''[[Milvetsatellite]]'', ''[[Mivedwarsatellite]]'', ''[[Sophoyesatellite]]'', ''[[Subclovsatellite]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Cvivirinae]]'' (1 rod) |
|||
* |
::::*:* Čeleď: ''[[Ampullaviridae]]'' (1 rod) |
||
** |
::::*:*:* Rod: ''[[Ampullavirus]]'' |
||
* |
::::*:* Čeleď: ''[[Anelloviridae]]'' (14 rodů) |
||
::::*:*:* Rod: ''[[Alphatorquevirus]]'', ''[[Betatorquevirus]]'', ''[[Deltatorquevirus]]'', ''[[Epsilontorquevirus]]'', ''[[Etatorquevirus]]'', ''[[Gammatorquevirus]]'', ''[[Gyrovirus]]'', ''[[Iotatorquevirus]]'', ''[[Kappatorquevirus]]'', ''[[Lambdatorquevirus]]'', ''[[Mutorquevirus]]'', ''[[Nutorquevirus]]'', ''[[Thetatorquevirus]]'', ''[[Zetatorquevirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Agatevirus]]'' |
|||
* |
::::*:* Čeleď: ''[[Avsunviroidae]]'' (3 rody) |
||
** |
::::*:*:* Rod: ''[[Avsunviroid]]'', ''[[Elaviroid]]'', ''[[Pelamoviroid]]'' |
||
* |
::::*:* Čeleď: ''[[Baculoviridae]]'' (4 rody) |
||
::::*:*:* Rod: ''[[Alphabaculovirus]]'', ''[[Betabaculovirus]]'', ''[[Deltabaculovirus]]'', ''[[Gammabaculovirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Wphvirus]]'' |
|||
* |
::::*:* Čeleď: ''[[Bicaudaviridae]]'' (1 rod) |
||
** |
::::*:*:* Rod: ''[[Bicaudavirus]]'' |
||
* |
::::*:* Čeleď: ''[[Clavaviridae]]'' (1 rod) |
||
** |
::::*:*:* Rod: ''[[Clavavirus]]'' |
||
* |
::::*:* Čeleď: ''[[Finnlakeviridae]]'' (1 rod) |
||
** |
::::*:*:* Rod: ''[[Finnlakevirus]]'' |
||
* |
::::*:* Čeleď: ''[[Fuselloviridae]]'' (2 rody) |
||
** |
::::*:*:* Rod: ''[[Alphafusellovirus]]'', ''[[Betafusellovirus]]'' |
||
* |
::::*:* Čeleď: ''[[Globuloviridae]]'' (1 rod) |
||
** |
::::*:*:* Rod: ''[[Globulovirus]]'' |
||
** Čeleď: ''[[ |
::::*:* Čeleď: ''[[Guttaviridae]]'' (2 rody) |
||
::::*:*:* Rod: ''[[Alphaguttavirus]]'', ''[[Betaguttavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Abouovirus]]'' |
|||
::::*:* Čeleď: ''[[Halspiviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:* |
::::*:*:* Rod: ''[[Salterprovirus]]'' |
||
::::*:* Čeleď: ''[[Hytrosaviridae]]'' (2 rody) |
|||
**:* |
::::*:*:* Rod: ''[[Glossinavirus]]'', ''[[Muscavirus]]'' |
||
::::*:* Čeleď: ''[[Nimaviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:* |
::::*:*:* Rod: ''[[Whispovirus]]'' |
||
::::*:* Čeleď: ''[[Nudiviridae]]'' (2 rody) |
|||
**:* |
::::*:*:* Rod: ''[[Alphanudivirus]]'', ''[[Betanudivirus]]'' |
||
::::*:* Čeleď: ''[[Ovaliviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:* |
::::*:*:* Rod: ''[[Alphaovalivirus]]'' |
||
::::*:* Čeleď: ''[[Plasmaviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:* |
::::*:*:* Rod: ''[[Plasmavirus]]'' |
||
::::*:* Čeleď: ''[[Polydnaviridae]]'' (2 rody) |
|||
**:* |
::::*:*:* Rod: ''[[Bracovirus]]'', ''[[Ichnovirus]]'' |
||
::::*:* Čeleď: ''[[Portogloboviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:* |
::::*:*:* Rod: ''[[Alphaportoglobovirus]]'' |
||
::::*:* Čeleď: ''[[Pospiviroidae]]'' (5 rodů) |
|||
::::*:*:* Rod: ''[[Apscaviroid]]'', ''[[Cocadviroid]]'', ''[[Coleviroid]]'', ''[[Hostuviroid]]'', ''[[Pospiviroid]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Flaumdravirus]]'' |
|||
::::*:* Čeleď: ''[[Spiraviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:* |
::::*:*:* Rod: ''[[Alphaspiravirus]]'' |
||
::::*:* Čeleď: ''[[Thaspiviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:* |
::::*:*:* Rod: ''[[Nitmarvirus]]'' |
||
::::*:* Čeleď: ''[[Tolecusatellitidae]]'' (2 rody) |
|||
**:* |
::::*:*:* Rod: ''[[Betasatellite]]'', ''[[Deltasatellite]]'' |
||
::::*:* Čeleď: ''[[Tristromaviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:* |
::::*:*:* Rod: ''[[Alphatristromavirus]]'' |
||
::::* Řád: ''[[Ligamenvirales]]'' (2 čeledi) |
|||
::::*:* Čeleď: ''[[Lipothrixviridae]]'' (4 rody) |
|||
::::*:*:* Rod: ''[[Alphalipothrixvirus]]'', ''[[Betalipothrixvirus]]'', ''[[Deltalipothrixvirus]]'', ''[[Gammalipothrixvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Machinavirus]]'' |
|||
::::*:* Čeleď: ''[[Rudiviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:* |
::::*:*:* Rod: ''[[Rudivirus]]'' |
||
**:* Nezařazený rod: ''[[Mieseafarmvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Mimasvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Muvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Myohalovirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Nankokuvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Nazgulvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Nitunavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Noxifervirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Obolenskvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Otagovirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Pakpunavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Pbunavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Peatvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Phikzvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Plaisancevirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Polybotosvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Popoffvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Punavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Radnorvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Ripduovirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Risingsunvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Seoulvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Sepunavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Shalavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Siminovitchvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Svunavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Tegunavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Thornevirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Tidunavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Tijeunavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Tulanevirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Vhmlvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Vidavervirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Viunavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Winklervirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Yokohamavirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Eucampyvirinae]]'' (2 rody) |
|||
**** Rod: ''[[Firehammervirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Fletchervirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Ounavirinae]]'' (4 rody) |
|||
**** Rod: ''[[Felixounavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Kolesnikvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Mooglevirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Suspvirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Peduovirinae]]'' (2 rody) |
|||
**** Rod: ''[[Hpunavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Peduovirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Tevenvirinae]]'' (11 rodů) |
|||
**** Rod: ''[[Dhakavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Gaprivervirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Gelderlandvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Jiaodavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Karamvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Krischvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Moonvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Mosigvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Schizotequatrovirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Slopekvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Tequatrovirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Vequintavirinae]]'' (4 rody) |
|||
**** Rod: ''[[Avunavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Certrevirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Seunavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Vequintavirus]]'' |
|||
** Čeleď: ''[[Podoviridae]]'' (3 podčeledi, 31 nezařazených rodů) |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Aqualcavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Baltimorevirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Bifseptvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Bjornvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Bruynoghevirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Enhodamvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Enquatrovirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Fipvunavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Gamaleyavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Hollowayvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Ithacavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Jasminevirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Johnsonvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Jwalphavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Kafunavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Kochitakasuvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Krylovvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Kuravirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Lederbergvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Lessievirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Lightbulbvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Litunavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Luzseptimavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Myxoctovirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Pagevirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Perisivirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Rauchvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Schmidvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Tabernariusvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Uetakevirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Vicosavirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Autographivirinae]]'' (10 rodů) |
|||
**** Rod: ''[[Drulisvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Friunavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Napahaivirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Phikmvvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Phimunavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Pollyceevirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Pradovirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Przondovirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Teseptimavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Zindervirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Picovirinae]]'' (4 rody) |
|||
**** Rod: ''[[Cepunavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Negarvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Rosenblumvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Salasvirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Sepvirinae]]'' (3 rody) |
|||
**** Rod: ''[[Diegovirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Oslovirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Traversvirus]]'' |
|||
** Čeleď: ''[[Siphoviridae]]'' (11 podčeledi, 176 nezařazených rodů, 1 neuznaný nezařazený rod) |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Abidjanvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Ahduovirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Amigovirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Anatolevirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Andromedavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Attisvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Bantamvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Barnyardvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Beetrevirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Bendigovirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Bernalvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Betterkatzvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Bingvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Biseptimavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Bowservirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Britbratvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Bronvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Brussowvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Casadabanvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Cbastvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Cecivirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Ceduovirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Ceetrepovirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Cequinquevirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Cetovirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Chenonavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Cheoctovirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Chivirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Chungbukvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Chunghsingvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Cimpunavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Cinunavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Coetzeevirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Corndogvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Cronusvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Decurrovirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Delepquintavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Demosthenesvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Detrevirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Dhillonvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Dismasvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Doucettevirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Efquatrovirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Eiauvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Eisenstarkvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Elerivirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Emalynvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Eyrevirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Farahnazvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Fromanvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Gaiavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Galaxyvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Galunavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Gamtrevirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Gesputvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Getseptimavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Ghobesvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Gilesvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Gordonvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Gordtnkvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Gorganvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Gorjumvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Gustavvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Harrisonvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Hedwigvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Helsingorvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Hendrixvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Holosalinivirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Homburgvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Ikedavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Ilzatvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Incheonvrus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Inhavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Jenstvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Jesfedecavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Kairosalinivirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Kelleziovirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Klementvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Kojivirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Korravirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Kostyavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Kryptosalinivirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Lacusarxvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Lambdavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Laroyevirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod (neuznaný): ''[[Lebronvirus]]''<ref name="Adriaenssens_2015"/> |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Liefievirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Lilyvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Lokivirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Lomovskayavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Lwoffvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Magadivirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Mapvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Mardecavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Marvinvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Minunavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Moineauvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Mudcatvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Myunavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Nanhaivirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Nickievirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Nipunavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Nonagvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Nonanavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Novosibvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Nyceiraevirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Omegavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Orchidvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Oshimavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Pahexavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Pamexvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Papyrusvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Patiencevirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Pbi1virus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Pepyhexavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Phicbkvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Phietavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Phifelvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Pikminvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Poushouvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Priunavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Psavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Psimunavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Pulverervirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Ravinvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Rerduovirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Rigallicvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Rimavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Roufvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Samistivirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Samunavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Sanovirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Saphexavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Sasvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Saundersvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Scapunavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Septimatrevirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Seuratvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Sextaecvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Sitaravirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Skunavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Slashvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Smoothievirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Soupsvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Sourvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Spbetavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Stanholtvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Steinhofvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Sugarlandvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Tankvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Tequintavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Timquatrovirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Tinduovirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Titanvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Tortellinivirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Triavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Trigintaduovirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Trinavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Trippvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Unahavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Vegasvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Vendettavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Vhulanivirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Vidquintavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Vieuvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Vividuovirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Wbetavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Weaselvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Wildcatvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Wilnyevirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Wizardvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Woesvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Woodruffvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Xiamenvirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Xipdecavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Yuavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Yvonnevirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Arquatrovirinae]]'' (3 rody) |
|||
**** Rod: ''[[Arquatrovirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Camvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Likavirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Bclasvirinae]]'' (5 rodů) |
|||
**** Rod: ''[[Acadianvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Coopervirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Pegunavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Pipefishvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Rosebushvirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Chebruvirinae]]'' (1 rod) |
|||
**** Rod: ''[[Brujitavirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Dclasvirinae]]'' (2 rody) |
|||
**** Rod: ''[[Hawkeyevirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Plotvirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Guernseyvirinae]]'' (3 rody) |
|||
**** Rod: ''[[Cornellvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Jerseyvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Kagunavirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Mccleskeyvirinae]]'' (2 rody) |
|||
**** Rod: ''[[Limdunavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Unaquatrovirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Mclasvirinae]]'' (2 rody) |
|||
**** Rod: ''[[Bongovirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Reyvirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Nclasvirinae]]'' (3 rody) |
|||
**** Rod: ''[[Buttersvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Charlievirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Redivirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Nymbaxtervirinae]]'' (2 rody) |
|||
**** Rod: ''[[Baxtervirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Nymphadoravirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Pclasvirinae]]'' (3 rody) |
|||
**** Rod: ''[[Bignuzvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Fishburnevirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Phayoncevirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Tunavirinae]]'' (8 rodů) |
|||
**** Rod: ''[[Eclunavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Hanrivervirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Rogunavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Rtpvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Sertoctavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Tlsvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Tunavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Webervirus]]'' |
|||
=== Herpesvirales === |
|||
* '''Řád: ''[[Herpesvirales]]''''' (3 čeledi) |
|||
** Čeleď: ''[[Alloherpesviridae]]'' (4 rody) |
|||
**:* Rod: ''[[Batrachovirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Cyprinivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Ictalurivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Salmonivirus]]'' |
|||
** Čeleď: ''[[Herpetické viry|Herpesviridae]]'' (3 podčeledi) |
|||
*** Podčeleď: ''[[Alphaherpesvirinae]]'' (5 rodů) |
|||
**** Rod: ''[[Iltovirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Mardivirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Scutavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Herpes simplex virus|Simplexvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Varicellovirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Betaherpesvirinae]]'' (4 rody) |
|||
**** Rod: ''[[Cytomegalovirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Muromegalovirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Proboscivirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Roseolovirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Gammaherpesvirinae]]'' (4 rody) |
|||
**** Rod: ''[[Lymphocryptovirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Macavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Percavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Rhadinovirus]]'' |
|||
** Čeleď: ''[[Malacoherpesviridae]]'' (2 rody) |
|||
**:* Rod: ''[[Aurivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Ostreavirus]]'' |
|||
=== Ligamenvirales === |
|||
* '''Řád: ''[[Ligamenvirales]]''''' (2 čeledi) |
|||
** Čeleď: ''[[Lipothrixviridae]]'' (3 rody) |
|||
*** Rod: ''[[Betalipothrixvirus]]'' |
|||
*** Rod: ''[[Deltalipothrixvirus]]'' |
|||
*** Rod: ''[[Gammalipothrixvirus]]'' |
|||
** Čeleď: ''[[Rudiviridae]]'' (1 rod) |
|||
*** Rod: ''[[Rudivirus]]'' |
|||
=== Nidovirales === |
|||
* '''Řád: ''[[Nidovirales]]''''' (7 podřádů) |
|||
** '''Podřád: ''[[Abnidovirineae]]''''' (1 čeleď) |
|||
*** Čeleď: ''[[Abyssoviridae]]'' (1 podčeleď) |
|||
**** Podčeleď: ''[[Tiamatvirinae]]'' (1 rod) |
|||
***** Rod: ''[[Alphaabyssovirus]]'' |
|||
** '''Podřád: ''[[Arnidovirineae]]''''' (1 čeleď) |
|||
*** Čeleď: ''[[Arteriviridae]]'' (6 podčeledí) |
|||
**** Podčeleď: ''[[Crocarterivirinae]]'' (1 rod) |
|||
***** Rod: ''[[Muarterivirus]]'' |
|||
**** Podčeleď: ''[[Equarterivirinae]]'' (1 rod) |
|||
***** Rod: ''[[Alphaarterivirus]]'' |
|||
**** Podčeleď: ''[[Heroarterivirinae]]'' (1 rod) |
|||
***** Rod: ''[[Lambdaarterivirus]]'' |
|||
**** Podčeleď: ''[[Simarterivirinae]]'' (6 rodů) |
|||
***** Rod: ''[[Deltaarterivirus]]'' |
|||
***** Rod: ''[[Epsilonarterivirus]]'' |
|||
***** Rod: ''[[Etaarterivirus]]'' |
|||
***** Rod: ''[[Iotaarterivirus]]'' |
|||
***** Rod: ''[[Thetaarterivirus]]'' |
|||
***** Rod: ''[[Zetaarterivirus]]'' |
|||
**** Podčeleď: ''[[Variarterivirinae]]'' (2 rody) |
|||
***** Rod: ''[[Betaarterivirus]]'' |
|||
***** Rod: ''[[Gammaarterivirus]]'' |
|||
**** Podčeleď: ''[[Zealarterivirinae]]'' (1 rod) |
|||
***** Rod: ''[[Kappaarterivirus]]'' |
|||
** '''Podřád: ''[[Cornidovirineae]]''''' (1 čeleď) |
|||
*** Čeleď: ''[[Coronaviridae]]'' (2 podčeledi) |
|||
**** Podčeleď: ''[[Letovirinae]]'' (1 rod) |
|||
***** Rod: ''[[Alphaletovirus]]'' |
|||
**** Podčeleď: ''[[Koronavirus|Orthocoronavirinae]]'' (4 rody) |
|||
***** Rod: ''[[Alphacoronavirus]]'' |
|||
***** Rod: ''[[Betacoronavirus]]'' |
|||
***** Rod: ''[[Deltacoronavirus]]'' |
|||
***** Rod: ''[[Gammacoronavirus]]'' |
|||
** '''Podřád: ''[[Mesnidovirineae]]''''' (2 čeledi) |
|||
*** Čeleď: ''[[Medioniviridae]]'' (2 podčeledi) |
|||
**** Podčeleď: ''[[Medionivirinae]]'' (1 rod) |
|||
***** Rod: ''[[Turrinivirus]]'' |
|||
**** Podčeleď: ''[[Tunicanivirinae]]'' (1 rod) |
|||
***** Rod: ''[[Bolenivirus]]'' |
|||
*** Čeleď: ''[[Mesoniviridae]]'' (1 podčeleď) |
|||
**** Podčeleď: ''[[Hexponivirinae]]'' (1 rod) |
|||
***** Rod: ''[[Alphamesonivirus]]'' |
|||
** '''Podřád: ''[[Monidovirineae]]''''' (1 čeleď) |
|||
*** Čeleď: ''[[Mononiviridae]]'' (1 podčeleď) |
|||
**** Podčeleď: ''[[Mononivirinae]]'' (1 rod) |
|||
***** Rod: ''[[Alphamononivirus]]'' |
|||
** '''Podřád: ''[[Ronidovirineae]]''''' (2 čeledi) |
|||
*** Čeleď: ''[[Euroniviridae]]'' (2 podčeledi) |
|||
**** Podčeleď: ''[[Ceronivirinae]]'' (1 rod) |
|||
***** Rod: ''[[Charybnivirus]]'' |
|||
**** Podčeleď: ''[[Crustonivirinae]]'' (1 rod) |
|||
***** Rod: ''[[Paguronivirus]]'' |
|||
*** Čeleď: ''[[Roniviridae]]'' (1 rod) |
|||
**** Podčeleď: ''[[Okanivirinae]]'' (1 rod) |
|||
***** Rod: ''[[Okavirus]]'' |
|||
** '''Podřád: ''[[Tornidovirineae]]''''' (1 čeleď) |
|||
*** Čeleď: ''[[Tobaniviridae]]'' (4 podčeledi) |
|||
**** Podčeleď: ''[[Piscanivirinae]]'' (2 rody) |
|||
***** Rod: ''[[Bafinivirus]]'' |
|||
***** Rod: ''[[Oncotshavirus]]'' |
|||
**** Podčeleď: ''[[Remotovirinae]]'' (1 rod) |
|||
***** Rod: ''[[Bostovirus]]'' |
|||
**** Podčeleď: ''[[Serpentovirinae]]'' (4 rody) |
|||
***** Rod: ''[[Infratovirus]]'' |
|||
***** Rod: ''[[Pregotovirus]]'' |
|||
***** Rod: ''[[Sectovirus]]'' |
|||
***** Rod: ''[[Tiruvirus]]'' |
|||
**** Podčeleď: ''[[Torovirinae]]'' (1 rod) |
|||
***** Rod: ''[[Torovirus]]'' |
|||
=== Ortervirales === |
|||
* '''Řád: ''[[Ortervirales]]''''' (5 čeledí) |
|||
** Čeleď: ''[[Belpaoviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:* Rod: ''[[Semotivirus]]'' |
|||
** Čeleď: ''[[Caulimoviridae]]'' (8 rodů) |
|||
**:* Rod: ''[[Badnavirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Caulimovirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Cavemovirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Petuvirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Rosadnavirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Solendovirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Soymovirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Tungrovirus]]'' |
|||
** Čeleď: ''[[Metaviridae]]'' (2 rody) |
|||
**:* Rod: ''[[Errantivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Metavirus]]'' |
|||
** Čeleď: ''[[Pseudoviridae]]'' (3 rody) |
|||
**:* Rod: ''[[Hemivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Pseudovirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Sirevirus]]'' |
|||
** Čeleď: ''[[Retroviry|Retroviridae]]'' (2 podčeledi) |
|||
*** Podčeleď: ''[[Orthoretrovirinae]]'' (6 rodů) |
|||
**** Rod: ''[[Alpharetrovirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Betaretrovirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Deltaretrovirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Epsilonretrovirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Gammaretrovirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Lentivirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Spumaretrovirinae]]'' (5 rodů) |
|||
**** Rod: ''[[Bovispumavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Equispumavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Felispumavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Prosimiispumavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Simiispumavirus]]'' |
|||
=== Picornavirales === |
|||
* '''Řád: ''[[Picornavirales]]''''' (6 čeledí) |
|||
** Čeleď: ''[[Dicistroviridae]]'' (3 rody) |
|||
**:* Rod: ''[[Aparavirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Cripavirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Triatovirus]]'' |
|||
** Čeleď: ''[[Iflaviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:* Rod: ''[[Iflavirus]]'' |
|||
** Čeleď: ''[[Marnaviridae]]'' (7 rodů) |
|||
**:* Rod: ''[[Bacillarnavirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Kusarnavirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Labyrnavirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Locarnavirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Marnavirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Salisharnavirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Sogarnavirus]]'' |
|||
** Čeleď: ''[[Picornaviridae]]'' (47 rodů) |
|||
**:* Rod: ''[[Aalivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Ailurivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Ampivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Anativirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Aphthovirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Aquamavirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Avihepatovirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Avisivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Bopivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Cardiovirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Cosavirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Crohivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Dicipivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Enterovirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Erbovirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Gallivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Harkavirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Hepatovirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Hunnivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Kobuvirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Kunsagivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Limnipivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Megrivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Mischivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Mosavirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Orivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Oscivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Parechovirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Pasivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Passerivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Poecivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Potamipivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Rabovirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Rafivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Rosavirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Sakobuvirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Salivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Sapelovirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Senecavirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Shanbavirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Sicinivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Teschovirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Torchivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Tottorivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Tremovirus]]'' |
|||
** Čeleď: ''[[Polycipiviridae]]'' (3 rody) |
|||
**:* Rod: ''[[Chipolycivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Hupolycivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Sopolycivirus]]'' |
|||
** Čeleď: ''[[Secoviridae]]'' (1 podčeleď a 5 nezařazených rodů) |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Cheravirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Sadwavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Sequivirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Torradovirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Waikavirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Comovirinae]]'' (3 rody) |
|||
**** Rod: ''[[Comovirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Fabavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Nepovirus]]'' |
|||
=== Tymovirales === |
|||
* '''Řád: ''[[Tymovirales]]''''' (5 čeledí) |
|||
** Čeleď: ''[[Alphaflexiviridae]]'' (7 rodů) |
|||
**:* Rod: ''[[Allexivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Botrexvirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Lolavirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Mandarivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Platypuvirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Potexvirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Sclerodarnavirus]]'' |
|||
** Čeleď: ''[[Betaflexiviridae]]'' (2 podčeledi) |
|||
*** Podčeleď: ''[[Quinvirinae]]'' (3 rody) |
|||
**** Rod: ''[[Carlavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Foveavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Robigovirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Trivirinae]]'' (9 rodů) |
|||
**** Rod: ''[[Capillovirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Chordovirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Citrivirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Divavirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Prunevirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Tepovirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Trichovirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Vitivirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Wamavirus]]'' |
|||
** Čeleď: ''[[Deltaflexiviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:* Rod: ''[[Deltaflexivirus]]'' |
|||
** Čeleď: ''[[Gammaflexiviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:* Rod: ''[[Mycoflexivirus]]'' |
|||
** Čeleď: ''[[Tymoviridae]]'' (3 rody) |
|||
**:* Rod: ''[[Maculavirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Marafivirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Tymovirus]]'' |
|||
=== „Megavirales“ === |
|||
* '''Řád (neuznaný): ''[[Megavirales]]''''' (7 čeledí, 2 neuznané čeledi, 1 uznaný a 2 neuznané nezařazené rody)<ref name="Moumouvirus"/><ref name="Colson_2013"/>{{#tag:ref|Vzhledem k příbuznosti je navrhováno vyčlenění čeledí ''Ascoviridae'', ''Asfarviridae'', ''Iridoviridae'', ''Marseilleviridae'', ''Mimiviridae'', ''Phycodnaviridae'' a ''Poxviridae'' do zvláštního řádu '''''Megavirales'''''.<ref name="Moumouvirus"/><ref name="Colson_2013"/> Do řádu by pravděpodobně také náležely navrhované čeledi ''Medusaviridae'' a ''Pandoraviridae'' (vzhledem k blízkosti k čeledi ''Phycodnaviridae'')<ref name="Yoshikawa_2019"/><ref name="Yutin_2013"/> a ''Pithoviridae'' (vzhledem k blízkosti k čeledím ''Iridoviridae'' a ''Marseilleviridae'')<ref name="Claverie_2014"/>, jakož i nezařazený rod ''Dinodnavirus'' (vzhledem k blízkosti k čeledi ''Asfarviridae'')<ref name="Dinodnavirus"/> a neuznané rody ''Faustovirus'', ''Kaumoebavirus'', ''Pacmanvirus'' (všechny také blízké k ''Asfarviridae'')<ref name="Reteno_2015"/><ref name="Bajrai_2016"/><ref name="Andreani_2017"/> a ''Mollivirus'' (blízký k navrhované čeledi ''Pandoraviridae'').<ref name="Fischer_2016"/><ref name="Halary_2016"/>|group="pozn."|name="Megavirales"}} |
|||
*::* Nezařazený rod: ''[[Dinodnavirus]]'' |
|||
*::* Nezařazený rod (neuznaný): ''[[Faustovirus]]''<ref name="Reteno_2015"/><ref name="Benamar_2016"/> |
|||
*::* Nezařazený rod (neuznaný): ''[[Kaumoebavirus]]''<ref name="Bajrai_2016"/> |
|||
*::* Nezařazený rod (neuznaný): ''[[Mollivirus]]''<ref name="Legendre_2015"/> |
|||
*::* Nezařazený rod (neuznaný): ''[[Pacmanvirus]]''<ref name="Andreani_2017"/> |
|||
** Čeleď: ''[[Ascoviridae]]'' (2 rody) |
|||
**:* Rod: ''[[Ascovirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Toursvirus]]'' |
|||
** Čeleď: ''[[Asfarviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:* Rod: ''[[Asfivirus]]'' |
|||
** Čeleď: ''[[Iridoviry|Iridoviridae]]'' (2 podčeledi) |
|||
*** Podčeleď: ''[[Alphairidovirinae]]'' (3 rody) |
|||
**** Rod: ''[[Lymphocystivirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Megalocytivirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Ranavirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Betairidovirinae]]'' (3 rody) |
|||
**** Rod: ''[[Decapodiridovirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Chloriridovirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Iridovirus]]'' |
|||
** Čeleď: ''[[Marseilleviridae]]'' (1 rod) |
|||
**:* Rod: ''[[Marseillevirus]]'' |
|||
** Čeleď (neuznaná): ''[[Medusaviridae]]'' (1 neuznaný rod)<ref name="Yoshikawa_2019"/><ref name="Mihulka_2019"/> |
|||
**:* Nezařazený rod (neuznaný): ''[[Medusavirus]]''<ref name="Yoshikawa_2019"/><ref name="Mihulka_2019"/> |
|||
** Čeleď: ''[[Mimiviridae]]'' (1 neuznaná podčeleď, 2 nezařazené rody, 4 neuznané nezařazené rody) |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Cafeteriavirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod (neuznaný): ''[[Lentillevirus]]''<ref name="Desnues_2012"/> |
|||
**:* Nezařazený rod (neuznaný): ''[[Megavirus]]''<ref name="Arslan_2011"/> |
|||
**:* Nezařazený rod: ''[[Mimivirus]]'' |
|||
**:* Nezařazený rod (neuznaný): ''[[Moumouvirus]]''<ref name="Moumouvirus"/> |
|||
**:* Nezařazený rod (neuznaný): ''[[Tupanvirus]]''<ref name="Tupanvirus"/> |
|||
*** Podčeleď (neuznaná): ''[[Klosneuvirinae]]'' (4 neuznané rody)<ref name="Schulz_2017"/> |
|||
**** Rod (neuznaný): ''[[Catovirus]]'' |
|||
**** Rod (neuznaný): ''[[Hokovirus]]'' |
|||
**** Rod (neuznaný): ''[[Indivirus]]'' |
|||
**** Rod (neuznaný): ''[[Klosneuvirus]]'' |
|||
** Čeleď (neuznaná): ''[[Pandoraviridae]]'' (1 neuznaný rod)<ref name="Philippe_2013"/><ref name="Mihulka_2013"/> |
|||
**:* Rod (neuznaný): ''[[Pandoravirus]]'' |
|||
** Čeleď: ''[[Phycodnaviridae]]'' (6 rodů) |
|||
**:* Rod: ''[[Chlorovirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Coccolithovirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Phaeovirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Prasinovirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Prymnesiovirus]]'' |
|||
**:* Rod: ''[[Raphidovirus]]'' |
|||
** Čeleď (neuznaná): ''[[Pithoviridae]]'' (2 neuznané rody)<ref name="Claverie_2014"/><ref name="Yong_2014"/><ref name="Týden"/><ref name="Andreani_2016"/> |
|||
**:* Rod (neuznaný): ''[[Cedratvirus]]''<ref name="Andreani_2016"/> |
|||
**:* Rod (neuznaný): ''[[Pithovirus]]'' |
|||
** Čeleď: ''[[Poxviry|Poxviridae]]'' (2 podčeledi) |
|||
*** Podčeleď: ''[[Chordopoxvirinae]]'' (11 rodů) |
|||
**** Rod: ''[[Avipoxvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Capripoxvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Centapoxvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Cervidpoxvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Crocodylidpoxvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Leporipoxvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Molluscipoxvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Orthopoxvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Parapoxvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Suipoxvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Yatapoxvirus]]'' |
|||
*** Podčeleď: ''[[Entomopoxvirinae]]'' (3 rody) |
|||
**** Rod: ''[[Alphaentomopoxvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Betaentomopoxvirus]]'' |
|||
**** Rod: ''[[Gammaentomopoxvirus]]'' |
|||
=== Nezařazené čeledi a rody === |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Adenoviridae]]'' (5 rodů) |
|||
:*:* Rod: ''[[Atadenovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Aviadenovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Ichtadenovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Mastadenovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Siadenovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Alphasatellitidae]]'' (2 podčeledi) |
|||
:** Podčeleď: ''[[Geminialphasatellitinae]]'' (4 rody) |
|||
:*** Rod: ''[[Ageyesisatellite]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Clecrusatellite]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Colecusatellite]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Gosmusatellite]]'' |
|||
:** Podčeleď: ''[[Nanoalphasatellitinae]]'' (7 rodů) |
|||
:*** Rod: ''[[Babusatellite]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Clostunsatellite]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Fabenesatellite]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Milvetsatellite]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Mivedwarsatellite]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Sophoyesatellite]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Subclovsatellite]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Alphatetraviridae]]'' (2 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Betatetravirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Omegatetravirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Alvernaviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Dinornavirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Amalgaviridae]]'' (2 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Amalgavirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Zybavirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Ampullaviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Ampullavirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Anelloviridae]]'' (14 rodů) |
|||
:*:* Rod: ''[[Alphatorquevirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Betatorquevirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Deltatorquevirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Epsilontorquevirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Etatorquevirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Gammatorquevirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Gyrovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Iotatorquevirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Kappatorquevirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Lambdatorquevirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Mutorquevirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Nutorquevirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Thetatorquevirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Zetatorquevirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Ascoviridae]]'' – viz neuznaný řád [[#„Megavirales“|''Megavirales'']] výše |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Asfarviridae]]'' – viz neuznaný řád [[#„Megavirales“|''Megavirales'']] výše |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Astroviridae]]'' (2 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Avastrovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Mamastrovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď (neuznaná): ''[[Autolykiviridae]]'' (1 neuznaný rod)<ref name="Kauffman_2018"/><ref name="Ignacio-Espinoza_2018"/><ref name="Mihulka_2018"/> |
|||
:*:* Rod (neuznaný): ''[[Autolykivirus]]''<ref name="Kauffman_2018"/> |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Avsunviroidae]]'' (3 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Avsunviroid]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Elaviroid]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Pelamoviroid]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Bacilladnaviridae]]'' (3 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Diatodnavirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Kieseladnavirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Protobacilladnavirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Baculoviridae]]'' (4 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Alphabaculovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Betabaculovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Deltabaculovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Gammabaculovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Barnaviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Barnavirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Benyviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Benyvirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Bicaudaviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Bicaudavirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Bidnaviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Bidensovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Birnaviridae]]'' (4 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Aquabirnavirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Avibirnavirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Blosnavirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Entomobirnavirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Botourmiaviridae]]'' (4 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Botoulivirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Magoulivirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Ourmiavirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Scleroulivirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Bromoviridae]]'' (6 rodů) |
|||
:*:* Rod: ''[[Alfamovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Anulavirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Bromovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Cucumovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Ilarvirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Oleavirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Caliciviridae]]'' (11 rodů) |
|||
:*:* Rod: ''[[Bavovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Lagovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Minovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Nacovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Nebovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Norovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Recovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Salovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Sapovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Valovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Vesivirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Carmotetraviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Alphacarmotetravirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Chrysoviridae]]'' (2 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Alphachrysovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Betachrysovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Circoviridae]]'' (2 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Circovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Cyclovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Clavaviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Clavavirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Closteroviridae]]'' (4 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Ampelovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Closterovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Crinivirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Velarivirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Corticoviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Corticovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Cystoviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Cystovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Endornaviridae]]'' (2 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Alphaendornavirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Betaendornavirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Flaviviridae]]'' (4 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Flavivirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Hepacivirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Pegivirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Pestivirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Fuselloviridae]]'' (2 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Alphafusellovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Betafusellovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Geminiviridae]]'' (9 rodů, 1 neuznaný rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Becurtovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Begomovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Capulavirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Curtovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Eragrovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Grablovirus]]'' |
|||
:*:* Rod (neuznaný): ''[[Graingemvirus]]''<ref name="Poojari_2013"/> |
|||
:*:* Rod: ''[[Mastrevirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Topocuvirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Turncurtovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Genomoviridae]]'' (9 rodů) |
|||
:*:* Rod: ''[[Gemycircularvirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Gemyduguivirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Gemygorvirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Gemykibivirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Gemykolovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Gemykrogvirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Gemykroznavirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Gemytondvirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Gemyvongvirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Globuloviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Globulovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Guttaviridae]]'' (2 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Alphaguttavirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Betaguttavirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Hepadnaviridae]]'' (2 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Avihepadnavirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Orthohepadnavirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Hepeviridae]]'' (2 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Orthohepevirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Piscihepevirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Hypoviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Hypovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Hytrosaviridae]]'' (2 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Glossinavirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Muscavirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Inoviridae]]'' (7 rodů) |
|||
:*:* Rod: ''[[Fibrovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Habenivirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Inovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Lineavirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Plectrovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Saetivirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Vespertiliovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Iridoviridae]]'' – viz neuznaný řád [[#„Megavirales“|''Megavirales'']] výše |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Kitaviridae]]'' (3 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Blunervirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Cilevirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Higrevirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Lavidaviridae]]'' (2 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Mavirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Sputnikvirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Leviviridae]]'' (2 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Allolevivirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Levivirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Luteoviridae]]'' (3 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Enamovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Luteovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Polerovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Marseilleviridae]]'' – viz neuznaný řád [[#„Megavirales“|''Megavirales'']] výše |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Matonaviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Rubivirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď (neuznaná): ''[[Medusaviridae]]'' – viz neuznaný řád [[#„Megavirales“|''Megavirales'']] výše |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Megabirnaviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Megabirnavirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Microviridae]]'' (2 podčeledi) |
|||
:** Podčeleď: ''[[Bullavirinae]]'' (3 rody) |
|||
:*** Rod: ''[[Alphatrevirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Gequatrovirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Sinsheimervirus]]'' |
|||
:** Podčeleď: ''[[Gokushovirinae]]'' (3 rody) |
|||
:*** Rod: ''[[Bdellomicrovirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Chlamydiamicrovirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Spiromicrovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Mimiviridae]]'' – viz neuznaný řád [[#„Megavirales“|''Megavirales'']] výše |
|||
:* Nezařazená čeleď (neuznaná): ''[[Nackednaviridae]]'' (1 neuznaný rod)<ref name="Lauber_2017"/> |
|||
:*:* Rod (neuznaný): ''[[Nackednavirus]]''<ref name="Lauber_2017"/> |
|||
:* Nezařazená čeleď (neuznaná): ''[[Naminiviridae]]'' (1 neuznaný rod)<ref name="Cofodevirus"/> |
|||
:*:* Rod (neuznaný): ''[[Cofodevirus]]''<ref name="Cofodevirus"/> |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Nanoviridae]]'' (2 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Babuvirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Nanovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Narnaviridae]]'' (2 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Mitovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Narnavirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Nimaviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Whispovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Nodaviridae]]'' (2 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Alphanodavirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Betanodavirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Nudiviridae]]'' (2 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Alphanudivirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Betanudivirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Ovaliviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Alphaovalivirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď (neuznaná): ''[[Pandoraviridae]]'' – viz neuznaný řád [[#„Megavirales“|''Megavirales'']] výše |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Papillomaviridae]]'' (2 podčeledi) |
|||
:** Podčeleď: ''[[Firstpapillomavirinae]]'' (52 rodů) |
|||
:*** Rod: ''[[Alphapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Betapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Chipapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Deltapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Dyochipapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Dyodeltapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Dyoepsilonpapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Dyoetapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Dyoiotapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Dyokappapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Dyolambdapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Dyomupapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Dyonupapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Dyoomegapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Dyoomikronpapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Dyophipapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Dyopipapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Dyopsipapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Dyorhopapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Dyosigmapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Dyotaupapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Dyothetapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Dyoupsilonpapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Dyoxipapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Dyozetapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Epsilonpapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Etapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Gammapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Iotapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Kappapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Lambdapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Mupapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Nupapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Omegapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Omikronpapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Phipapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Pipapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Psipapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Rhopapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Sigmapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Taupapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Thetapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Treisdeltapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Treisepsilonpapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Treisetapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Treisiotapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Treiskappapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Treisthetapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Treiszetapapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Upsilonpapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Xipapillomavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Zetapapillomavirus]]'' |
|||
:** Podčeleď: ''[[Secondpapillomavirinae]]'' (1 rod) |
|||
:*** Rod: ''[[Alefpapillomavirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Partitiviridae]]'' (5 rodů) |
|||
:*:* Rod: ''[[Alphapartitivirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Betapartitivirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Cryspovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Deltapartitivirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Gammapartitivirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Parvoviridae]]'' (2 podčeledi) |
|||
:** Podčeleď: ''[[Densovirinae]]'' (5 rodů) |
|||
:*** Rod: ''[[Ambidensovirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Brevidensovirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Hepandensovirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Iteradensovirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Penstyldensovirus]]'' |
|||
:** Podčeleď: ''[[Parvovirinae]]'' (8 rodů) |
|||
:*** Rod: ''[[Amdoparvovirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Aveparvovirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Bocaparvovirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Copiparvovirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Dependoparvovirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Erythroparvovirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Protoparvovirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Tetraparvovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Permutotetraviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Alphapermutotetravirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Phycodnaviridae]]'' – viz neuznaný řád [[#„Megavirales“|''Megavirales'']] výše |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Picobirnaviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Picobirnavirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď (neuznaná): ''[[Pithoviridae]]'' – viz neuznaný řád [[#„Megavirales“|''Megavirales'']] výše |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Plasmaviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Plasmavirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Pleolipoviridae]]'' (3 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Alphapleolipovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Betapleolipovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Gammapleolipovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Polydnaviridae]]'' (2 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Bracovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Ichnovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Polyomaviridae]]'' (4 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Alphapolyomavirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Betapolyomavirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Deltapolyomavirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Gammapolyomavirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Portogloboviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Alphaportoglobovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Pospiviroidae]]'' (5 rodů) |
|||
:*:* Rod: ''[[Apscaviroid]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Cocadviroid]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Coleviroid]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Hostuviroid]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Pospiviroid]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Potyviridae]]'' (10 rodů) |
|||
:*:* Rod: ''[[Bevemovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Brambyvirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Bymovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Ipomovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Macluravirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Poacevirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Potyvirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Roymovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Rymovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Tritimovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Poxviridae]]'' – viz neuznaný řád [[#„Megavirales“|''Megavirales'']] výše |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Quadriviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Quadrivirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Reoviridae]]'' (2 podčeledi) |
|||
:** Podčeleď: ''[[Sedoreovirinae]]'' (6 rodů) |
|||
:*** Rod: ''[[Cardoreovirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Mimoreovirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Orbivirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Phytoreovirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Rotavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Seadornavirus]]'' |
|||
:** Podčeleď: ''[[Spinareovirinae]]'' (9 rodů) |
|||
:*** Rod: ''[[Aquareovirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Coltivirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Cypovirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Dinovernavirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Fijivirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Idnoreovirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Mycoreovirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Orthoreovirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Oryzavirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Sarthoviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Macronovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Smacoviridae]]'' (6 rodů) |
|||
:*:* Rod: ''[[Bovismacomovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Cosmacomovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Dragsmacomovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Drosmacomovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Huchismacomovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Porprismacomovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Solemoviridae]]'' (2 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Polemovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Sobemovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Solinviviridae]]'' (2 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Invictavirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Nyfulvavirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Sphaerolipoviridae]]'' (3 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Alphasphaerolipovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Betasphaerolipovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Gammasphaerolipovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Spiraviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Alphaspiravirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Tectiviridae]]'' (3 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Alphatectivirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Betatectivirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Gammatectivirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Togaviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Alphavirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Tolecusatellitidae]]'' (2 rody) |
|||
:*:* Rod: ''[[Betasatellite]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Deltasatellite]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Tombusviridae]]'' (3 podčeledi, i nezařazený rod) |
|||
:*:* Nezařazený rod: ''[[Avenavirus]]'' |
|||
:** Podčeleď: ''[[Calvusvirinae]]'' (1 rod) |
|||
:*** Rod: ''[[Umbravirus]]'' |
|||
:** Podčeleď: ''[[Procedovirinae]]'' (13 rodů) |
|||
:*** Rod: ''[[Alphacarmovirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Alphanecrovirus]]'' |
|||
:*** Rod: ''[[Aureusvirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Betacarmovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Betanecrovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Gallantivirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Gammacarmovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Macanavirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Machlomovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Panicovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Pelarspovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Tombusvirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Zeavirus]]'' |
|||
:** Podčeleď: ''[[Regressovirinae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Dianthovirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Totiviridae]]'' (5 rodů) |
|||
:*:* Rod: ''[[Giardiavirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Leishmaniavirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Totivirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Trichomonasvirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Victorivirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Tristromaviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Alphatristromavirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Turriviridae]]'' (1 rod) |
|||
:*:* Rod: ''[[Alphaturrivirus]]'' |
|||
:* Nezařazená čeleď: ''[[Virgaviridae]]'' (7 rodů) |
|||
:*:* Rod: ''[[Furovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Goravirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Hordeivirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Pecluvirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Pomovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Tobamovirus]]'' |
|||
:*:* Rod: ''[[Tobravirus]]'' |
|||
:* Nezařazené rody: ''[[Albetovirus]]'', ''[[Aumaivirus]]'', ''[[Botybirnavirus]]'', ''[[Deltavirus]]'', ''[[Dinodnavirus]]'' (patřil by do zatím neuznaného řádu [[#„Megavirales“|''Megavirales'']]<ref name="Dinodnavirus"/>), ''[[Idaeovirus]]'', ''[[Negevirus]]'' (neuznaný)<ref name="Shi_2016"/>, ''[[Ostravirus]]'' (neuznaný)<ref name="Grybchuk_2018"/><ref name="CT24_2018"/>, ''[[Papanivirus]]'', ''[[Rhizidiovirus]]'', ''[[Salterprovirus]]'', ''[[Sinaivirus]]'', ''[[Tornovirus]]'' (neuznaný, blízký čeledi ''Circoviridae'')<ref name="STTV"/>, ''[[Virtovirus]]'', ''[[Weivirus]]'' (neuznaný)<ref name="Shi_2016"/>, ''[[Yanvirus]]'' (neuznaný)<ref name="Shi_2016"/>, ''[[Zhaovirus]]'' (neuznaný)<ref name="Shi_2016"/> |
|||
== Baltimorova klasifikace == |
== Baltimorova klasifikace == |
||
| Řádek 1 390: | Řádek 741: | ||
{{Podrobně|Baltimorova klasifikace}} |
{{Podrobně|Baltimorova klasifikace}} |
||
Baltimorova klasifikace je systém klasifikace [[virus|virů]] do sedmi skupin podle typu [[genom|genetického materiálu]], který je obsažen ve [[virion|virových částicích]], a způsobu jeho přepisu do virové [[mRNA]]. Klasifikaci poprvé navrhl v roce [[1971]] [[David Baltimore]], pozdější nositel [[Nobelova cena za fyziologii nebo lékařství|Nobelovy ceny za fyziologii nebo lékařství]].<ref name="balt"/> V jeho původním návrhu bylo šest skupin virů (I.-VI.), sedmá skupina byla vytvořena pro později objevenou skupinu [[hepadnaviridae|hepadnavirů]] s unikátně stavěným genomem. Systém umožňuje zjednodušit si nesmírně komplikované a rozmanité typy forem a životních cyklů, jimiž viry oplývají |
Baltimorova klasifikace je systém klasifikace [[virus|virů]] do sedmi skupin podle typu [[genom|genetického materiálu]], který je obsažen ve [[virion|virových částicích]], a způsobu jeho přepisu do virové [[mRNA]]. Klasifikaci poprvé navrhl v roce [[1971]] [[David Baltimore]], pozdější nositel [[Nobelova cena za fyziologii nebo lékařství|Nobelovy ceny za fyziologii nebo lékařství]].<ref name="balt"/> V jeho původním návrhu bylo šest skupin virů (I.-VI.), sedmá skupina byla vytvořena pro později objevenou skupinu [[hepadnaviridae|hepadnavirů]] s unikátně stavěným genomem. Systém umožňuje zjednodušit si nesmírně komplikované a rozmanité typy forem a životních cyklů, jimiž viry oplývají,<ref name="Racaniello_2009"/> ale protože není hierarchicky strukturovaný, na skutečnou systematiku tisíců známých virů již nestačí. Vzhledem k definici skupin nemůže začlenit viroidy, v tradičním pojetí nezahrhuje ani retrotranspozony a satelitní nukleové kyseliny (pojetí ICTV tyto tři skupiny mezi viry řadí a taxonomicky je klasifikuje). |
||
Jedná se |
Jedná se tak o jednoduché, jednoúrovňové, dosud běžně používané třídění, které dříve (do r. 2019, kdy byl vytvořen první realm – ''[[RNA viry|Riboviria]]'', zahrnující skupiny III.-V.) bylo možno až na drobné výjimky nadřadit systému ICTV. To ale neznamená, že se u skupin Baltimorovy klasifikace jedná o fylogeneticky přirozené taxony;{{#tag:ref|Např. III. skupina (dsRNA viry) je považována za [[polyfyletismus|polyfyletickou]], k ní patřící čeleď ''Amalgaviridae'' dokonce s velkou pravděpodobností vznikla rekombinací RNA virů dvou různých skupin Baltimorovy klasifikace.<ref name="Krupovic_2015"/>|group="pozn."}} ani jejich vymezení podle genomu nemusí být úplně přesné vzhledem k podřazeným nižším taxonům ICTV.<ref name="Pleolipoviridae" group="pozn." /><ref name="Bunyavirales2" group="pozn." /><ref name="Ortervirales_pozn" group="pozn.">Do řádu ''Ortervilales'' spadá vedle Baltimorovy skupiny VI. i čeleď ''Caulimoviridae'' ze skupiny VII.</ref> To je důvod, proč Baltimorova klasifikace postupně zastarává. |
||
* '''Skupina I.: [[dsDNA viry]]''', tedy viry s dvouvláknovou DNA |
* '''Skupina I.: [[dsDNA viry]]''', tedy viry s dvouvláknovou DNA |
||
*: Patří sem: |
*: Patří sem: |
||
*:* realm: ''Duplodnaviria'' |
|||
*:* tzv. "head-tail" viry, tedy celé řády |
|||
*: |
*:* realm: ''Varidnaviria'' |
||
*: |
*:* třída: ''Papovaviricetes'' (realm ''Monodnaviria'') |
||
*:* tzv. NCLDV (''nucleocytoplasmic large DNA viruses''), tedy celý neuznaný řád '''''Megavirales''''', jmenovitě: |
|||
*:** Čeleď: ''Ascoviridae'' |
|||
*:** Čeleď: ''Asfarviridae'' |
|||
*:** Čeleď: ''Iridoviridae'' |
|||
*:** Čeleď: ''Marseilleviridae'' |
|||
*:** Čeleď (neuznaná): ''Medusaviridae'' |
|||
*:** Čeleď: ''Mimiviridae'' |
|||
*:** Čeleď (neuznaná): ''Pandoraviridae'' |
|||
*:** Čeleď: ''Phycodnaviridae'' |
|||
*:** Čeleď (neuznaná): ''Pithoviridae'' |
|||
*:** Čeleď: ''Poxviridae'' |
|||
*:** Nezařazený rod: ''Dinodnavirus'' |
|||
*:** Nezařazené rody (neuznané): ''Faustovirus'', ''Kaumoebavirus'', ''Mollivirus'', ''Pacmanvirus'' |
|||
*:* a dále: |
*:* a dále: |
||
*:** |
*:** nezařazený řád: ''Ligamenvirales'' |
||
*:** |
*:** nezařazená čeleď: ''Ampullaviridae'' |
||
*:** |
*:** nezařazená čeleď: ''Baculoviridae'' |
||
*:** nezařazená čeleď: ''Bicaudaviridae'' |
|||
*:** Nezařazená čeleď (neuznaná): ''Autolykiviridae''<ref name="Kauffman_2018"/><ref name="Ignacio-Espinoza_2018"/><ref name="Mihulka_2018"/> |
|||
*:** |
*:** nezařazená čeleď: ''Clavaviridae'' |
||
*:** |
*:** nezařazená čeleď: ''Fuselloviridae'' |
||
*:** |
*:** nezařazená čeleď: ''Globuloviridae'' |
||
*:** |
*:** nezařazená čeleď: ''Guttaviridae'' |
||
*:** |
*:** nezařazená čeleď: ''Halspiviridae'' |
||
*:** |
*:** nezařazená čeleď: ''Hytrosaviridae'' |
||
*:** |
*:** nezařazená čeleď: ''Nimaviridae'' |
||
*:** |
*:** nezařazená čeleď: ''Nudiviridae'' |
||
*:** |
*:** nezařazená čeleď: ''Ovaliviridae'' |
||
*:** |
*:** nezařazená čeleď: ''Plasmaviridae'' |
||
*:** |
*:** nezařazená čeleď: ''Polydnaviridae'' |
||
*:** |
*:** nezařazená čeleď: ''Portogloboviridae'' |
||
*:** |
*:** nezařazená čeleď: ''Thaspiviridae'' |
||
*:** |
*:** nezařazená čeleď: ''Tristromaviridae'' |
||
*:** nezařazené rody: ''Dinodnavirus'', ''Rhizidiovirus'' |
|||
*:** Nezařazená čeleď: ''Portogloboviridae'' |
|||
*:** Nezařazená čeleď: ''Sphaerolipoviridae'' |
|||
*:** Nezařazená čeleď: ''Tectiviridae'' |
|||
*:** Nezařazená čeleď: ''Tristromaviridae'' |
|||
*:** Nezařazená čeleď: ''Turriviridae'' |
|||
*:** Nezařazené rody: ''Rhizidiovirus'', ''Salterprovirus'' |
|||
* ''' |
* '''Skupina II.: [[ssDNA viry]]''', tedy viry s jednovláknovou DNA přepisovanou do mRNA totožné polarity |
||
*: Patří sem: |
*: Patří sem: |
||
*:* většina realmu ''Monodnaviria'', jmenovitě: |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Anelloviridae'' |
|||
*:* |
*:** říše: ''Loebvirae'' |
||
*:* |
*:** říše: ''Sangervirae'' |
||
*:** říše: ''Trapavirae'' = čeleď ''Pleolipoviridae''{{#tag:ref|Viry z čeleď ''Pleolipoviridae'', řazené tradičně do skupiny II, tedy ssDNA virů, mohou mít ve skutečnosti genom různého druhu; ''Haloarcula hispanica pleomorphic virus 1'' (HHPV-1) typu má např. kruhovou dsDNA, ''His2 virus'' lineární dsDNA, ''Halorunbrum pleomorphic virus 3'' (HRPV-3) a ''Halogeometricum pleomorphic virus 1'' (HGPV-1) mají v dsDNA úseky ssDNA.<ref name="Bamford_2017"/>|group="pozn."|name="Pleolipoviridae"}} |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Circoviridae'' |
|||
*:* |
*:** kmen: ''Cressdnaviricota'' |
||
*:* |
*:** třída: ''Mouviricetes'' = čeleď ''Bidnaviridae'' |
||
*:* |
*:** třída: ''Quintoviricetes'' |
||
*:* a dále: |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Lavidaviridae'' |
|||
*:* |
*:** nezařazená čeleď: ''Anelloviridae'' |
||
*:* |
*:** nezařazená čeleď: ''Finnlakeviridae'' |
||
*:* |
*:** nezařazená čeleď: ''Spiraviridae'' |
||
*:** nezařazené rody: ''Tornovirus'' (neuznaný) |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Parvoviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Pleolipoviridae''{{#tag:ref|Viry z čeleď ''Pleolipoviridae'', řazené do tradiční skupiny II, tedy ssDNA virů, mohou mít ve skutečnosti genom různého druhu; ''Haloarcula hispanica pleomorphic virus 1'' (HHPV-1) typu má např. kruhovou dsDNA, ''His2 virus'' lineární dsDNA, ''Halorunbrum pleomorphic virus 3'' (HRPV-3) a ''Halogeometricum pleomorphic virus 1'' (HGPV-1) mají v dsDNA úseky ssDNA.<ref name="Bamford_2017"/>|group="pozn."|name="Pleolipoviridae"}} |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Smacoviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Spiraviridae'' |
|||
*:* Nezařazené rody: ''Tornovirus'' (neuznaný) |
|||
*: Ačkoli oficiální Baltimorova klasifikace nezahrnuje [[virusoid|satelitní nukleové kyseliny]], z hlediska genomu by se ke skupině II. mohly přiřadit i |
*: Ačkoli oficiální Baltimorova klasifikace nezahrnuje [[virusoid|satelitní nukleové kyseliny]], z hlediska genomu by se ke skupině II. mohly přiřadit i |
||
::* |
::* nezařazená čeleď: ''Alphasatellitidae'' a |
||
::* |
::* nezařazená čeleď: ''Tolecusatellitidae''. |
||
* ''' |
* '''Skupina III.: [[dsRNA viry]]''', tedy viry s dvouvláknovou RNA |
||
*: Patří sem: |
*: Patří sem následující taxony z realmu ''Riboviria'': |
||
*:* |
*:* kmen: ''Duplornaviricota'' |
||
*:* |
*:* čeleď: ''Amalgaviridae'' |
||
*:* |
*:* čeleď: ''Birnaviridae'' |
||
*:* |
*:* čeleď: ''Partitiviridae'' |
||
*:* |
*:* čeleď: ''Picobirnaviridae'' |
||
*:* |
*:* čeleď: ''Polymycoviridae'' |
||
*:* |
*:* rod: ''Botybirnavirus'' |
||
*:* Nezařazená čeleď: ''Partitiviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Picobirnaviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Quadriviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Reoviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Tolecusatellitidae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Totiviridae'' |
|||
*:* Nezařazený rod: ''Botybirnavirus'' |
|||
* ''' |
* '''Skupina IV.: [[ssRNA viry s pozitivní polaritou]]''', tedy viry s jednovláknovou RNA přepisovanou do mRNA totožné polarity |
||
*: Patří sem: |
*: Patří sem následující taxony z realmu ''Riboviria'': |
||
*:* |
*:* kmen: ''Kitrinoviricota'' |
||
*:* |
*:* kmen: ''Lenarviricota'' |
||
*:* |
*:* třída: ''Pisoniviricetes'' |
||
*:* |
*:* třída: ''Stelpaviricetes'' |
||
*:* |
*:* čeleď: ''Hypoviridae'' |
||
*:* |
*:* čeleď: ''Permutotetraviridae'' |
||
*:* |
*:* čeleď: ''Sarthroviridae'' |
||
*:* rody: ''Albetovirus'', ''Aumaivirus'', ''Papanivirus'', ''Virtovirus'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Benyviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Botourmiaviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Bromoviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Caliciviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Carmotetraviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Closteroviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''[[Flaviviridae]]'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Hepeviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Kitaviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Leviviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Luteoviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Matonaviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Narnaviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Nodaviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Permutotetraviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Potyviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Sarthoviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Solemoviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Solinviviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Togaviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Tombusviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Virgaviridae'' |
|||
*:* Nezařazené rody: ''Albetovirus'', ''Aumaivirus'', ''Idaeovirus'', ''Negevirus'' (neuznaný)<ref name="Shi_2016"/>, ''Ostravirus'' (neuznaný)<ref name="Grybchuk_2018"/><ref name="CT24_2018"/>, ''Papanivirus'', ''Sinaivirus'', ''Virtovirus'', ''Weivirus'' (neuznaný)<ref name="Shi_2016"/>, ''Yanvirus'' (neuznaný)<ref name="Shi_2016"/>, ''Zhaovirus'' (neuznaný)<ref name="Shi_2016"/> |
|||
* ''' |
* '''Skupina V.: [[ssRNA viry s negativní polaritou]]''', tedy viry s jednovláknovou RNA přepisovanou do mRNA opačné polarity |
||
*: Patří sem: |
*: Patří sem: |
||
*:* kmen ''Negarnaviricota'' (realm ''Riboviria''){{#tag:ref|Viry z rodů ''Banyangvirus'', ''Entovirus'', ''Lentinuvirus'', ''Orthotospovirus'', ''Phlebovirus'', ''Rubodvirus'' a ''Uukuvirus'' a čeledi ''Arenaviridae'', jakož i některé viry z rodu ''Bandavirus'' obsahují ve svém genomu vedle ssRNA s negativní polaritou i ssRNA s pozitivní polaritou, ale tradičně i podle fylogenetické příbuznosti se řadí do Baltimorovy skupiny V.<ref name="Bunyaviridae Study Group_2016"/><ref name="Species_2019"/>|group="pozn."|name="Bunyavirales2"}} |
|||
*:* celý '''kmen ''Negarnaviricota''''', tedy celé řády |
|||
*:** '''Řád: ''Articulavirales''''' |
|||
*:** '''Řád: ''Bunyavirales''''' (celý){{#tag:ref|Viry z rodů ''Banyangvirus'', ''Phlebovirus'' a ''Tospovirus'' a čeledi ''Arenaviridae'' obsahují ve svém genomu vedle ss RNA s negativní polaritou i ssRNA s pozitivní polaritou, ale tradičně i podle fylogenetické příbuznosti se řadí do Baltimorovy skupiny V.<ref name="Bunyaviridae Study Group_2016"/><ref name="Species_2018"/>|group="pozn."|name="Bunyavirales2"}} |
|||
*:** '''Řád: ''Goujianvirales''''' |
|||
*:** '''Řád: ''Jingchuvirales''''' |
|||
*:** '''Řád: ''Mononegavirales''''' |
|||
*:** '''Řád: ''Muvirales''''' |
|||
*:** '''Řád: ''Serpentovirales''''' |
|||
*:* a dále: |
*:* a dále: |
||
*:** nezařazený rod: ''Deltavirus'' |
|||
*:** Nezařazené rody: ''Deltavirus'', ''Qinvirus'' (neuznaný)<ref name="Shi_2016"/>, ''[[Tilapinevirus]]'', ''Yuevirus'' (neuznaný)<ref name="Shi_2016"/> |
|||
* ''' |
* '''Skupina VI.: [[ssRNA viry s reverzní transkriptázou]]''', tedy viry s jednovláknovou RNA reverzně přepisovanou do DNA |
||
*: Patří sem: |
*: Patří sem: |
||
*:* |
*:* většina řádu ''Ortervirales'' (realm ''Riboviria''), jmenovitě: |
||
*:** |
*:** čeleď: ''Belpaoviridae'' |
||
*:** |
*:** čeleď: ''Retroviridae'' |
||
*: |
*: Ačkoli oficiální Baltimorova klasifikace nezahrnuje retrotranspozony, z hlediska genomu by se ke skupině VI. mohly přiřadit i: |
||
*: |
*:* čeleď: ''Metaviridae'' |
||
*: |
*:* čeleď: ''Pseudoviridae'' |
||
* ''' Skupina VII.: [[dsDNA viry s reverzní transkriptázou]]''', tedy viry s dvouvláknovou (částečně i jednovláknovou) DNA nejprve přepisovanou do RNA a následně reverzně přepisovanou do DNA |
* ''' Skupina VII.: [[dsDNA viry s reverzní transkriptázou]]''', tedy viry s dvouvláknovou (částečně i jednovláknovou) DNA nejprve přepisovanou do RNA a následně reverzně přepisovanou do DNA |
||
*: Patří sem: |
*: Patří sem: |
||
*:* řád ''Blubervirales'' = čeleď ''Hepadnaviridae'' (realm ''Riboviria'') |
|||
*:* Čeleď ''Caulimoviridae'' z řádu ''Ortervirales'' |
|||
*:* čeleď ''Caulimoviridae'' z řádu ''Ortervirales'' (realm ''Riboviria'') |
|||
*:* Nezařazená čeleď: ''Hepadnaviridae'' |
|||
*:* Nezařazená čeleď (neuznaná): ''Nackednaviridae''<ref name="Lauber_2017"/> |
|||
== Systém LHT == |
== Systém LHT == |
||
| Řádek 1 548: | Řádek 840: | ||
V témž roce byla klasifikace schválena Prozatímním výborem pro nomenklaturu virů (Provisional Committee on Nomenclature of Virus – PNVC) Mezinárodní asociace mikrobiologických společností (International Association of Microbiological Societies – IAMS). |
V témž roce byla klasifikace schválena Prozatímním výborem pro nomenklaturu virů (Provisional Committee on Nomenclature of Virus – PNVC) Mezinárodní asociace mikrobiologických společností (International Association of Microbiological Societies – IAMS). |
||
V dnešní době se již |
V dnešní době se již systém LHT nepoužívá, ale názvy některých taxonů přetrvávají v systému ICTV. Do úrovně čeledí vypadal následovně:<ref name="Lwoff_1962"/> |
||
* '''Kmen Vira''' (rozdělen na 2 podkmeny) |
* '''Kmen Vira''' (rozdělen na 2 podkmeny) |
||
| Řádek 1 683: | Řádek 975: | ||
| doi = 10.1128/JVI.00212-17 |
| doi = 10.1128/JVI.00212-17 |
||
| pmid = 28446673 |
| pmid = 28446673 |
||
| jazyk = anglicky |
|||
}}</ref> |
|||
<ref name="Andreani_2018">{{Citace elektronického periodika |
|||
| příjmení = Andreani |
|||
| jméno = Julien |
|||
| příjmení2 = Khalil |
|||
| jméno2 = Jacques Y. B. |
|||
| příjmení3 = Baptiste |
|||
| jméno3 = Emeline |
|||
| příjmení4 = Hasni |
|||
| jméno4 = Issam |
|||
| příjmení5 = Michelle |
|||
| jméno5 = Caroline |
|||
| příjmení6 = Raoult |
|||
| jméno6 = Didier |
|||
| příjmení7 = Levasseur |
|||
| jméno7 = Anthony |
|||
| příjmení8 = La Scola |
|||
| jméno8 = Bernard |
|||
| titul = Orpheovirus IHUMI-LCC2: A New Virus among the Giant Viruses |
|||
| periodikum = Frontiers in Microbiology |
|||
| vydavatel = Frontiers Media SA |
|||
| rok vydání = 2018 |
|||
| měsíc vydání = leden |
|||
| den vydání = 22 |
|||
| ročník = 8: 2643 |
|||
| url = https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2017.02643/full |
|||
| dostupnost2 = |
|||
| url2 = https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5786535/ |
|||
| url3 = https://www.researchgate.net/publication/322639164_Orpheovirus_IHUMI-LCC2_A_new_virus_among_the_giant_viruses |
|||
| issn = 1664-302X |
|||
| doi = 10.3389/fmicb.2017.02643 |
|||
| pmid = 29403444 |
|||
| jazyk = anglicky |
| jazyk = anglicky |
||
}}</ref> |
}}</ref> |
||
| Řádek 1 913: | Řádek 1 238: | ||
| issn = 1932-6203 |
| issn = 1932-6203 |
||
| doi = 10.1371/journal.pone.0018935 |
| doi = 10.1371/journal.pone.0018935 |
||
| jazyk = anglicky |
|||
}}</ref> |
|||
<ref name="Colson_2012">{{Citace elektronického periodika |
|||
| příjmení = Colson |
|||
| jméno = Philippe |
|||
| příjmení2 = Lamballerie |
|||
| jméno2 = Xavier de |
|||
| příjmení3 = Fournous |
|||
| jméno3 = Ghislain |
|||
| příjmení4 = Raoult |
|||
| jméno4 = Didier |
|||
| titul = Reclassification of Giant Viruses Composing a Fourth Domain of Life in the New Order Megavirales |
|||
| periodikum = Intervirology |
|||
| vydavatel = S. Karger AG |
|||
| rok vydání = 2012 |
|||
| měsíc vydání = duben |
|||
| den vydání = 14 |
|||
| ročník = 55 |
|||
| typ ročníku = svazek |
|||
| číslo = 5 |
|||
| strany = 321–332 |
|||
| url = https://www.karger.com/Article/FullText/336562 |
|||
| issn = 1423-0100 |
|||
| doi = 10.1159/000336562 |
|||
| pmid = 22508375 |
|||
| jazyk = anglicky |
| jazyk = anglicky |
||
}}</ref> |
}}</ref> |
||
| Řádek 1 992: | Řádek 1 342: | ||
| jazyk = anglicky |
| jazyk = anglicky |
||
}}</ref> |
}}</ref> |
||
<ref name="Dinodnavirus">[http://talk.ictvonline.org/files/ictv_official_taxonomy_updates_since_the_8th_report/m/fungal-official/4091/download.aspx&sa=U&ei=ptXSUdIQxdO1BuTXgOgM&ved=0CCgQFjAB&usg=AFQjCNF_t_nyrQZhOe8K-fHM5Q_pf3lMDQ ICTV taxonomic proposal 2009.001a/fF] (anglicky)]</ref> |
|||
<ref name="Fischer_2016">{{Citace elektronického periodika |
<ref name="Fischer_2016">{{Citace elektronického periodika |
||
| příjmení = Fischer |
| příjmení = Fischer |
||
| Řádek 2 052: | Řádek 1 401: | ||
| url2 = |
| url2 = |
||
| issn = 0044-4812 |
| issn = 0044-4812 |
||
}}</ref> |
|||
<ref name="Gorbalenya_2020">{{Citace elektronického periodika |
|||
| příjmení = Gorbalenya |
|||
| jméno = Alexander E. |
|||
| příjmení2 = Krupovic |
|||
| jméno2 = Mart |
|||
| příjmení3 = Mushegian |
|||
| jméno3 = Arcady |
|||
| spoluautoři = ''et al ''. (International Committee on Taxonomy of Viruses Executive Committee) |
|||
| titul = The new scope of virus taxonomy: partitioning the virosphere into 15 hierarchical ranks |
|||
| periodikum = Nature Microbiology |
|||
| vydavatel = Springer Nature Limited |
|||
| rok vydání = 2020 |
|||
| měsíc vydání = duben |
|||
| den vydání = 27 |
|||
| ročník = 5 |
|||
| typ ročníku = svazek |
|||
| číslo = 5 |
|||
| strany = 668–674 |
|||
| url = https://www.nature.com/articles/s41564-020-0709-x |
|||
| url2 = https://www.researchgate.net/publication/340950612_The_new_scope_of_virus_taxonomy_partitioning_the_virosphere_into_15_hierarchical_ranks |
|||
| issn = 2058-5276 |
|||
| doi = 10.1038/s41564-020-0709-x |
|||
| jazyk = anglicky |
|||
}}</ref> |
}}</ref> |
||
<ref name="Grybchuk_2018">{{Citace elektronického periodika |
<ref name="Grybchuk_2018">{{Citace elektronického periodika |
||
| Řádek 2 085: | Řádek 1 458: | ||
| doi = 10.1073/pnas.1717806115 |
| doi = 10.1073/pnas.1717806115 |
||
| pmid = 29284754 |
| pmid = 29284754 |
||
| jazyk = anglicky |
|||
}}</ref> |
|||
<ref name="Guglielmini 2019">{{Citace elektronického periodika |
|||
| příjmení = Guglielmini |
|||
| jméno = Julien |
|||
| příjmení2 = Woo |
|||
| jméno2 = Anthony C. |
|||
| příjmení3 = Krupovic |
|||
| jméno3 = Mart |
|||
| příjmení4 = Forterre |
|||
| jméno4 = Patrick |
|||
| příjmení5 = Gaia |
|||
| jméno5 = Morgan |
|||
| titul = Diversification of giant and large eukaryotic dsDNA viruses predated the origin of modern eukaryotes |
|||
| periodikum = Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) |
|||
| vydavatel = National Academy of Sciences |
|||
| rok vydání = 2019 |
|||
| měsíc vydání = září |
|||
| den vydání = 10 |
|||
| ročník = 116 |
|||
| typ ročníku = svazek |
|||
| číslo = 39 |
|||
| strany = 19585-19592 |
|||
| url = https://www.pnas.org/content/116/39/19585 |
|||
| url2 = https://www.researchgate.net/publication/328611208_Diversification_of_giant_and_large_eukaryotic_dsDNA_viruses_predated_the_origin_of_modern_eukaryotes |
|||
| dostupnost3 = preprint |
|||
| url3 = https://www.biorxiv.org/content/10.1101/455816v1.article-info |
|||
| issn = 1091-6490 |
|||
| doi = 10.1073/pnas.1912006116 |
|||
| pmid = 31506349 |
|||
| jazyk = anglicky |
| jazyk = anglicky |
||
}}</ref> |
}}</ref> |
||
| Řádek 2 110: | Řádek 1 513: | ||
| jazyk = anglicky |
| jazyk = anglicky |
||
}}</ref> |
}}</ref> |
||
<ref name=" |
<ref name="ICTV_2019">International Committee on Taxonomy of Viruses, ''Virus Taxonomy: 2019 Release''. [https://talk.ictvonline.org/taxonomy/p/taxonomy_releases Dostupné online] (anglicky)</ref> |
||
<ref name="Ignacio-Espinoza_2018">{{Citace elektronického periodika |
<ref name="Ignacio-Espinoza_2018">{{Citace elektronického periodika |
||
| příjmení = Ignacio-Espinoza |
| příjmení = Ignacio-Espinoza |
||
| Řádek 2 123: | Řádek 1 526: | ||
| měsíc vydání = leden |
| měsíc vydání = leden |
||
| den vydání = 24 |
| den vydání = 24 |
||
| ročník = |
| ročník = 554 |
||
| typ ročníku = svazek |
| typ ročníku = svazek |
||
| číslo = |
| číslo = 7690 |
||
| |
| strany = 38-39 |
||
| strany = |
|||
| poznámka = online před tiskem |
|||
| url = https://www.nature.com/articles/d41586-018-00923-8 |
| url = https://www.nature.com/articles/d41586-018-00923-8 |
||
| url2 = https://europepmc.org/article/med/29388959 |
|||
| dostupnost2 = |
|||
| url3 = https://www.researchgate.net/publication/322814495_A_non-tailed_twist_in_the_viral_tale |
|||
| url2 = |
|||
| issn = 1476-4687 |
| issn = 1476-4687 |
||
| doi = |
| doi = 10.1038/d41586-018-00923-8 |
||
| pmid = |
| pmid = 29388959 |
||
| jazyk = anglicky |
| jazyk = anglicky |
||
}}</ref> |
}}</ref> |
||
| Řádek 2 327: | Řádek 1 728: | ||
| doi = 10.1093/gbe/evs109 |
| doi = 10.1093/gbe/evs109 |
||
| pmid = |
| pmid = |
||
| jazyk = anglicky |
|||
}}</ref> |
|||
<ref name="Paez-Espino_2019">{{Citace elektronického periodika |
|||
| příjmení = Paez-Espino |
|||
| jméno = David |
|||
| příjmení2 = Zhou |
|||
| jméno2 = Jinglie |
|||
| příjmení3 = Roux |
|||
| jméno3 = Simon |
|||
| spoluautoři = ''et al '' |
|||
| titul = Diversity, evolution, and classification of virophages uncovered through global metagenomics |
|||
| periodikum = Microbiome |
|||
| vydavatel = BioMed Central Ltd |
|||
| rok vydání = 2019 |
|||
| měsíc vydání = prosinec |
|||
| den vydání = 10 |
|||
| ročník = 7 |
|||
| typ ročníku = svazek |
|||
| číslo = 1: 157 |
|||
| url = https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-019-0768-5 |
|||
| url2 = https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6905037/ |
|||
| issn = 2049-2618 |
|||
| doi = 10.1186/s40168-019-0768-5 |
|||
| pmid = 31823797 |
|||
| jazyk = anglicky |
| jazyk = anglicky |
||
}}</ref> |
}}</ref> |
||
| Řádek 2 374: | Řádek 1 799: | ||
| jazyk = anglicky |
| jazyk = anglicky |
||
}}</ref> |
}}</ref> |
||
<ref name="Racaniello_2009">{{citace elektronické monografie| titul = Simplifying virus classification: The Baltimore system| rok=2009| vydavatel=Virology Blog| |
<ref name="Racaniello_2009">{{citace elektronické monografie |
||
| příjmení = Racaniello |
|||
| jméno = Vincent |
|||
| titul = Simplifying virus classification: The Baltimore system |
|||
| rok vydání = 2009 |
|||
| vydavatel = Virology Blog |
|||
| url = http://www.virology.ws/2009/08/12/simplifying-virus-classification-the-baltimore-system/ |
|||
}}</ref> |
|||
<ref name="Reteno_2015">{{Citace elektronického periodika |
<ref name="Reteno_2015">{{Citace elektronického periodika |
||
| příjmení = Reteno |
| příjmení = Reteno |
||
| Řádek 2 406: | Řádek 1 838: | ||
| jazyk = anglicky |
| jazyk = anglicky |
||
}}</ref> |
}}</ref> |
||
<ref name="Rodrigues_2019">{{Citace elektronického periodika |
|||
<ref name="Riboviria">International Committee on Taxonomy of Viruses, ''Taxonomic proposal 2017.006G: Riboviria: establishing a single taxon that comprises RNA viruses at the basal rank of virus taxonomy''. [https://talk.ictvonline.org//taxonomy/p/taxonomy-history?taxnode_id=201857095 Dostupné online] (anglicky)</ref> |
|||
| příjmení = Rodrigues |
|||
| jméno = Rodrigo Araújo Lima |
|||
| příjmení2 = Mougari |
|||
| jméno2 = Said |
|||
| příjmení3 = Colson |
|||
| jméno3 = Phillipe |
|||
| příjmení4 = La Scola |
|||
| jméno4 = Bernard |
|||
| příjmení5 = Abrahão |
|||
| jméno5 = Jônatas Santos |
|||
| titul = “ ''Tupanvirus''”, a new genus in the family ''Mimiviridae'' |
|||
| periodikum = Archives of Virology |
|||
| vydavatel = Springer Nature Switzerland AG |
|||
| rok vydání = 2018 |
|||
| měsíc vydání = říjen |
|||
| den vydání = 5 |
|||
| ročník = 164 |
|||
| typ ročníku = svazek |
|||
| číslo = 1 |
|||
| strany = 325–331 |
|||
| url = https://link.springer.com/article/10.1007/s00705-018-4067-4 |
|||
| url2 = https://www.researchgate.net/publication/328106124_Tupanvirus_a_new_genus_in_the_family_Mimiviridae |
|||
| issn = 1432-8798 |
|||
| doi = 10.1007/s00705-018-4067-4 |
|||
| pmid = 30291500 |
|||
| jazyk = anglicky |
|||
}}</ref> |
|||
<ref name="Shi_2016">{{Citace elektronického periodika |
<ref name="Shi_2016">{{Citace elektronického periodika |
||
| příjmení = Shi |
| příjmení = Shi |
||
| Řádek 2 477: | Řádek 1 936: | ||
| jazyk = anglicky |
| jazyk = anglicky |
||
}}</ref> |
}}</ref> |
||
<ref name="Schulz_2020">{{Citace elektronického periodika |
|||
<ref name="Species_2018">ICTV Master Species List 2018b. Verze 1, 1. březen 2019. [https://talk.ictvonline.org/files/master-species-lists/m/msl/8266 Dostupné online] (anglicky)</ref> |
|||
| příjmení = Schulz |
|||
| jméno = Frederik |
|||
| příjmení2 = Roux |
|||
| jméno2 = Simon |
|||
| příjmení3 = Paez-Espino |
|||
| jméno3 = David |
|||
| spoluautoři = ''et al ''. |
|||
| titul = Giant virus diversity and host interactions through global metagenomics |
|||
| periodikum = Nature |
|||
| odkaz na periodikum = Nature |
|||
| vydavatel = Springer Nature Limited |
|||
| rok vydání = 2020 |
|||
| měsíc vydání = leden |
|||
| den vydání = 22 |
|||
| ročník = 578 |
|||
| typ ročníku = svazek |
|||
| číslo = 7795 |
|||
| strany = 432–436 |
|||
| url = https://www.nature.com/articles/s41586-020-1957-x |
|||
| url2 = https://www.researchgate.net/publication/338754981_Giant_virus_diversity_and_host_interactions_through_global_metagenomics |
|||
| issn = 1476-4687 |
|||
| doi = 10.1038/s41586-020-1957-x |
|||
| jazyk = anglicky |
|||
}}</ref> |
|||
<ref name="Siddell_2020">{{Citace elektronického periodika |
|||
| příjmení = Siddell |
|||
| jméno = Stuart G. |
|||
| příjmení2 = Walker |
|||
| jméno2 = Peter J. |
|||
| příjmení3 = Lefkowitz |
|||
| jméno3 = Elliot J. |
|||
| spoluautoři = ''et al ''. |
|||
| titul = Binomial nomenclature for virus species: a consultation |
|||
| periodikum = Archives of Virology |
|||
| vydavatel = Springer Nature Switzerland AG |
|||
| rok vydání = 2019 |
|||
| měsíc vydání = prosinec |
|||
| den vydání = 3 |
|||
| ročník = 165 |
|||
| typ ročníku = svazek |
|||
| číslo = 2 |
|||
| strany = 519–525 |
|||
| url = https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00705-019-04477-6 |
|||
| url2 = https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7026202/ |
|||
| issn = 1432-8798 |
|||
| doi = 10.1007/s00705-019-04477-6 |
|||
| pmid = 31797129 |
|||
| jazyk = anglicky |
|||
}}</ref> |
|||
<ref name="Species_2019">ICTV Master Species List 2019. Verze 1, 24. duben 2020. [https:// talk.ictvonline.org/files/master-species-lists/m/msl/9601 Dostupné online] (anglicky)</ref> |
|||
<ref name="STTV">{{Citace elektronického periodika |
<ref name="STTV">{{Citace elektronického periodika |
||
| příjmení = |
| příjmení = Ng |
||
| jméno = |
| jméno = Terry Fei Fan |
||
| autor = Terry Fei Fan Ng |
|||
| příjmení2 = Manire |
| příjmení2 = Manire |
||
| jméno2 = Charles |
| jméno2 = Charles |
||
| Řádek 2 496: | Řádek 2 004: | ||
| číslo = 6 |
| číslo = 6 |
||
| strany = 2500-2509 |
| strany = 2500-2509 |
||
| url = |
| url = https://jvi.asm.org/content/83/6/2500.long |
||
| url2 = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2648252/ |
| url2 = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2648252/ |
||
| url3 = https://www.semanticscholar.org/paper/Discovery-of-a-novel-single-stranded-DNA-virus-from-Ng-Manire/26947e2d3ef55e17e5afc83c647a90d5deeb48a8 |
|||
| issn = 1098-5514 |
| issn = 1098-5514 |
||
| doi = 10.1128/JVI.01946-08 |
| doi = 10.1128/JVI.01946-08 |
||
| pmid = |
| pmid = 19116258 |
||
| jazyk = anglicky |
| jazyk = anglicky |
||
}}</ref> |
}}</ref> |
||
| Řádek 2 542: | Řádek 2 051: | ||
| den vydání = 4 |
| den vydání = 4 |
||
| url = http://www.tyden.cz/rubriky/veda/veda-a-my/vedci-ozivili-30-tisic-let-stary-virus-z-ledu_300024.html |
| url = http://www.tyden.cz/rubriky/veda/veda-a-my/vedci-ozivili-30-tisic-let-stary-virus-z-ledu_300024.html |
||
}}</ref> |
|||
<ref name="Yaravirus">{{Citace elektronického periodika |
|||
| příjmení = Boratto |
|||
| jméno = Paulo V. M. |
|||
| příjmení2 = Oliveira |
|||
| jméno2 = Graziele P. |
|||
| příjmení3 = Machado |
|||
| jméno3 = Talita B. |
|||
| příjmení4 = Andrade |
|||
| jméno4 = Ana Cláudia S. P. |
|||
| příjmení5 = Baudoin |
|||
| jméno5 = Jean-Pierre |
|||
| příjmení6 = Klose |
|||
| jméno6 = Thomas |
|||
| příjmení7 = Schulz |
|||
| jméno7 = Frederik |
|||
| příjmení8 = Azza |
|||
| jméno8 = Saïd |
|||
| příjmení9 = Decloquement |
|||
| jméno9 = Philippe |
|||
| spoluautoři = CHABRIÈRE, Eric; COLSON, Philippe; LEVASSEUR, Anthony; La SCOLA, Bernard; ABRAHÃO, Jônatas S. |
|||
| titul = A mysterious 80 nm amoeba virus with a near-complete “ORFan genome” challenges the classification of DNA viruses |
|||
| periodikum = bioRχiv |
|||
| vydavatel = Cold Spring Harbor Laboratory |
|||
| rok vydání = 2020 |
|||
| měsíc vydání = leden |
|||
| den vydání = 28 |
|||
| poznámka = preprint |
|||
| url = https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.28.923185v1 |
|||
| url2 = https://www.researchgate.net/publication/338884094_A_mysterious_80_nm_amoeba_virus_with_a_near-complete_ORFan_genome_challenges_the_classification_of_DNA_viruses |
|||
| doi = 10.1101/2020.01.28.923185 |
|||
| jazyk = anglicky |
|||
}}</ref> |
}}</ref> |
||
<ref name="Yong_2014">{{Citace elektronického periodika |
<ref name="Yong_2014">{{Citace elektronického periodika |
||
Verze z 11. 5. 2020, 17:19
Klasifikace virů je vzhledem k jejich rozmanitosti a proměnlivosti problematičtější než u buněčných organismů. Existuje proto více možných přístupů a z nich vzniklých klasifikačních systémů.
Nejstarší klasifikační systémy virů vycházely z klasifikace napadaných organismů. Byla to například Holmesova klasifikace z r. 1948, aplikující linnéovskou biologickou nomenklaturu a členící viry na fágy (napadající bakterie), fytofágy (napadající rostliny) a zoofágy (napadající živočichy).
Později se viry začaly klasifikovat podle strukturních fyzikálních a chemických vlastností, jako je nosič genetické informace (RNA nebo DNA), velikost, tvar a symetrie kapsidy apod. K takovým klasifikačním systémům patří např. hierarchická klasifikace LHT z roku 1962, dnes již zastaralá.
Aktuální snahou biologických klasifikačních systémů je přirozenost z hlediska fylogenetické příbuznosti. O tu se snaží podrobný, každoročně aktualizovaný systém Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV).
V současnosti se stále používá zjednodušená klasifikace podle nosiče genetické informace a způsobu jejího přepisu, tak zvaná Baltimorova klasifikace z r. 1971. V některých aspektech je však již neslučitelná s moderní fylogenetickou klasifikací ICTV.
Vzhledem k tomu, že není známo příliš typů subvirových činitelů (viroidy, satelitní viry včetně virofágů, satelitní nukleové kyseliny včetně virusoidů), dlouho pro ně neexistoval odpovídající systém a byly klasifikovány pouze podle nosiče genetické informace, případně i její velikosti. Výjimkou byl klasifikační systém viroidů podle Florese z roku 1998,[1] revidovaný Dienerem v r. 2001,[2] používající čeledi a rody. Později byl včleněn do systému ICTV, do kterého jsou od r. 2015 zahrnuty i vybrané satelitní viry (včetně virofágů) a satelitní nukleové kyseliny, obojí se snahou respektovat jejich pravděpodobnou fylogenetickou příbuznost k jiným virům.[3]
Systém ICTV
Mezinárodní komise pro klasifikaci virů (International Committee on Taxonomy of Viruses - ICTV) klasifikuje jednotlivé druhy virů podobně jako buněčné organismy do říší, kmenů (případně i podkmenů), tříd, řádů (podřádů), čeledí (podčeledí) a rodů (podrodů). Nejvyšším taxonem, nadřazeným říším, je realm[pozn. 1]. Systém ICTV důsledně používá metagenomický přístup.[9][4] Snahou je přitom respektovat fylogenetickou příbuznost, tedy na základě genetické informace sdružovat taxony dané úrovně do skupin, u kterých lze předpokládat společného předka.
Standardními příponami v taxonomii jsou:[3]
- u virů (včetně satelitních virů a retrotranspozonů)
- pro realm: -viria
- pro říši: -virae
- pro kmen: -viricota,
- pro podkmen: -virales,
- pro třídu: -viricetes,
- pro řád: -virales,
- pro podřád: -virineae,
- pro čeleď: -viridae,
- pro podčeleď: -virinae,
- pro rod a podrod: -virus;
- u viroidů:
- pro čeleď: -viroidae,
- pro rod: -viroid;
- u satelitních nukleových kyselin:
- pro čeleď: -satellitidae,
- pro podčeleď: -satellitinae,
- pro rod: -satellite.
Virologická nomenklatura nemá předepsáno binomiální názvosloví pro druhy, třebaže probíhají diskuse o jeho možném zavedení, které by mělo odstranit nejednotný přístup (názvy virových druhů jsou tvořeny mnoha různými způsoby vedoucími k výsledným jednoslovným až šestislovným názvům)).[10]
Podle názvoslovného kódu ICTV se názvy všech vyšších taxonů píší stejně jako jména druhů kurzívou.[3]
Aktuální klasifikace byla přijata v červenci 2019 a ratifikována v březnu 2020. Viry (druhy uznané ICTV) jsou systematicky kategorizovány do 4 realmů; vedle nich jeden řád, 24 čeledí a tři rody zůstávají nezařazeny.[11][12]
Klasifikace ICTV zahrnuje také viroidy (nezařazené čeledi Avsunviroidae a Pospiviroidae), vybrané virofágy (nezařazená čeleď Lavidaviridae) a jiné satelitní viry (např. v nezařazených čeledích Parvoviridae, Sarthoviridae, Tombusviridae a Virgaviridae a nezařazených rodech Albetovirus, Aumaivirus, Papanivirus, Virtovirus), retrotranspozony (čeledi Metaviridae a Pseudoviridae z řádu Ortervirales) a satelitní nukleové kyseliny (nezařazené čeledi Alphasatellitidae a Tolecusatellitidae).
V následujícím přehledu (do úrovně rodů) jsou navíc pro úplnost uvedeny i dosud neuznané navrhované taxony, vždy označené závorkou "(neuznaný/á)". Návrh plyne z uvedené reference (zpravidla vědeckého periodika nebo webové složky ICTV s návrhy, u kterých dosud neskončil proces k jejich uznání[13]).
Realm: Duplodnaviria (1 říše)
- Říše: Heunggongvirae (2 kmeny)
- Kmen: Peploviricota (1 třída)
- Třída: Herviviricetes (1 řád)
- Řád: Herpesvirales (3 čeledi)
- Čeleď: Alloherpesviridae (4 rody)
- Čeleď: Herpesviridae (3 podčeledi)
- Podčeleď: Alphaherpesvirinae (5 rodů)
- Podčeleď: Betaherpesvirinae (4 rody)
- Podčeleď: Gammaherpesvirinae (4 rody)
- Čeleď: Malacoherpesviridae (2 rody)
- Rod: Aurivirus, Ostreavirus
- Řád: Herpesvirales (3 čeledi)
- Třída: Herviviricetes (1 řád)
- Kmen: Uroviricota (1 třída)
- Třída: Caudoviricetes (1 řád)
- Řád: Caudovirales (9 čeledí, 1 neuznaná čeleď)
- (nezařazené do čeledí)
- Rod: Lilyvirus
- Čeleď: Ackermannviridae (2 podčeledi)
- (nezařazené do podčeledí)
- Rod: Taipeivirus
- Podčeleď: Aglimvirinae (2 rody)
- Rod: Agtrevirus, Limestonevirus
- Podčeleď: Cvivirinae (1 rod)
- Rod: Kuttervirus
- (nezařazené do podčeledí)
- Čeleď: Autographiviridae (9 podčeledí)
- (nezařazené do podčeledí)
- Rod: Aegirvirus, Aqualcavirus, Ashivirus, Atuphduovirus, Ayakvirus, Ayaqvirus, Banchanvirus, Bifseptvirus, Bonnellvirus, Cheungvirus, Chosvirus, Cuernavacavirus, Cyclitvirus, Ermolevavirus, Foturvirus, Foussvirus, Fussvirus, Gajwadongvirus, Gyeongsanvirus, Igirivirus, Jalkavirus, Jiaoyazivirus, Kafavirus, Kajamvirus, Kakivirus, Kalppathivirus, Kelmasvirus, Kembevirus, Krakvirus, Lauvirus, Limelightvirus, Lingvirus, Lirvirus, Lullwatervirus, Maculvirus, Napahaivirus, Nohivirus, Oinezvirus, Paadamvirus, Pagavirus, Pairvirus, Pedosvirus, Pekhitvirus, Pelagivirus, Percyvirus, Piedvirus, Podivirus, Pollyceevirus, Poseidonvirus, Powvirus, Pradovirus, Qadamvirus, Scottvirus, Sednavirus, Serkorvirus, Sieqvirus, Stompelvirus, Stopalavirus, Stopavirus, Stupnyavirus, Tangaroavirus, Tawavirus, Tiamatvirus, Tiilvirus, Tritonvirus, Voetvirus, Votkovvirus, Waewaevirus, Wuhanvirus
- Podčeleď: Beijerinckvirinae (3 rody)
- Rod: Daemvirus, Friunavirus, Pettyvirus
- Podčeleď: Colwellvirinae (5 rodů)
- Podčeleď: Corkvirinae (4 rody)
- Rod: Kantovirus, Kotilavirus, Phimunavirus, Stompvirus
- Podčeleď: Krylovirinae (4 rody)
- Podčeleď: Melnykvirinae (8 rodů)
- Podčeleď: Molineuxvirinae (6 rodů)
- Podčeleď: Okabevirinae (5 rodů)
- Rod: Ampunavirus, Higashivirus, Mguuvirus, Risjevirus, Sukuvirus
- Podčeleď: Slopekvirinae (4 rody)
- Podčeleď: Studiervirinae (23 rodů)
- Rod: Aarhusvirus, Apdecimavirus, Berlinvirus, Caroctavirus, Chatterjeevirus, Eapunavirus, Elunavirus, Foetvirus, Ghunavirus, Helsettvirus, Jarilovirus, Kayfunavirus, Minipunavirus, Ningirsuvirus, Pektosvirus, Phutvirus, Pifdecavirus, Pijolavirus, Przondovirus, Teetrevirus, Teseptimavirus, Troedvirus, Unyawovirus
- (nezařazené do podčeledí)
- Čeleď (neuznaná): Autolykiviridae[14][15][16] (1 neuznaný rod)
- Rod (neuznaný): Autolykivirus[14][15][16]
- Čeleď: Chaseviridae (6 rodů)
- Čeleď: Demerecviridae (3 podčeledi)
- (nezařazené do podčeledí)
- Podčeleď: Ermolyevavirinae (3 rody)
- Rod: Cetovirus, Jesfedecavirus, Vipunavirus
- Podčeleď: Markadamsvirinae (3 rody)
- Podčeleď: Mccorquodalevirinae (2 rody)
- Rod: Hongcheonvirus, Myunavirus
- Čeleď: Drexlerviridae (4 podčeledi)
- (nezařazené do podčeledí)
- Podčeleď: Braunvirinae (4 rody)
- Podčeleď: Rogunavirinae (4 rody)
- Podčeleď: Tempevirinae (3 rody)
- Rod: Hanrivervirus, Tlsvirus, Warwickvirus
- Podčeleď: Tunavirinae (3 rody)
- Rod: Badaguanvirus, Sertoctavirus, Tunavirus
- Čeleď: Herelleviridae (5 podčeledí)
- Podčeleď: Bastillevirinae (7 rodů)
- Podčeleď: Brockvirinae (2 rody)
- Rod: Kochikohdavirus, Schiekvirus
- Podčeleď: Jasinkavirinae (1 rod)
- Rod: Pecentumvirus
- Podčeleď: Spounavirinae (2 rody)
- Rod: Okubovirus, Siminovitchvirus
- Podčeleď: Twortvirinae (7 rodů)
- Čeleď: Myoviridae (5 podčeledí)
- (nezařazené do podčeledí)
- Rod: Abouovirus, Acionnavirus, Agricanvirus, Ahtivirus, Alcyoneusvirus, Alexandravirus, Anamdongvirus, Anaposvirus, Aokuangvirus, Aphroditevirus, Asteriusvirus, Atlauavirus, Aurunvirus, Baikalvirus, Barbavirus, Bcepmuvirus, Bellamyvirus, Bendigovirus, Biquartavirus, Bixzunavirus, Brigitvirus, Brizovirus, Brunovirus, Busanvirus, Carpasinavirus, Chakrabartyvirus, Charybdisvirus, Chiangmaivirus, Cymopoleiavirus, Derbicusvirus, Elvirus, Emdodecavirus, Eneladusvirus, Eponavirus, Erskinevirus, Eurybiavirus, Ficleduovirus, Flaumdravirus, Gofduovirus, Goslarvirus, Hapunavirus, Heilongjiangvirus, Iapetusvirus, Iodovirus, Ionavirus, Jedunavirus, Jilinvirus, Jimmervirus, Kanaloavirus, Kleczkowskavirus, Lagaffevirus, Leucotheavirus, Libanvirus, Llyrvirus, Loughboroughvirus, Lubbockvirus, Machinavirus, Marthavirus, Mazuvirus, Metrivirus, Mieseafarmvirus, Mimasvirus, Mushuvirus, Muvirus, Myohalovirus, Naesvirus, Namakavirus, Nankokuvirus, Neptunevirus, Nereusvirus, Nerrivikvirus, Nodensvirus, Noxifervirus, Obolenskvirus, Otagovirus, Pakpunavirus, Palaemonvirus, Pbunavirus, Peatvirus, Petsuvirus, Phabquatrovirus, Phapecoctavirus, Phikzvirus, Plaisancevirus, Polybotosvirus, Pontusvirus, Popoffvirus, Punavirus, Qingdaovirus, Radnorvirus, Ripduovirus, Risingsunvirus, Rosemountvirus, Saclayvirus, Salacisavirus, Salmondvirus, Sasquatchvirus, Schmittlotzvirus, Seoulvirus, Shalavirus, Svunavirus, Tabernariusvirus, Tamkungvirus, Taranisvirus, Tefnutvirus, Tegunavirus, Thaumasvirus, Thetisvirus, Thornevirus, Tidunavirus, Tijeunavirus, Toutatisvirus, Tulanevirus, Vellamovirus, Vhmlvirus, Viunavirus, Wellingtonvirus, Wifcevirus, Winklervirus, Yokohamavirus, Yoloswagvirus
- Podčeleď: Eucampyvirinae (2 rody)
- Rod: Firehammervirus, Fletchervirus
- Podčeleď: Ounavirinae (4 rody)
- Podčeleď: Peduovirinae (26 rodů)
- Rod: Aresaunavirus, Baylorvirus, Bielevirus, Canoevirus, Catalunyavirus, Citexvirus, Eganvirus, Entnonagintavirus, Felsduovirus, Hpunavirus, Irtavirus, Kisquattuordecimvirus, Kisquinquevirus, Longwoodvirus, Nampongvirus, Peduovirus, Phitrevirus, Playavirus, Reginaelenavirus, Senquatrovirus, Seongnamvirus, Simpcentumvirus, Stockinghallvirus, Tigrvirus, Vulnificusvirus, Xuanwuvirus
- Podčeleď: Tevenvirinae (11 rodů)
- Podčeleď: Vequintavirinae (4 rody)
- Rod: Avunavirus, Certrevirus, Seunavirus, Vequintavirus
- (nezařazené do podčeledí)
- Čeleď: Podoviridae (3 podčeledi)
- (nezařazené do podčeledí)
- Rod: Baltimorevirus, Bjornvirus, Bruynoghevirus, Enhodamvirus, Enquatrovirus, Fipvunavirus, Fischettivirus, Gamaleyavirus, Giessenvirus, Hollowayvirus, Ithacavirus, Jasminevirus, Johnsonvirus, Jwalphavirus, Kafunavirus, Kelquatrovirus, Kochitakasuvirus, Krylovvirus, Kuravirus, Lederbergvirus, Lessievirus, Lightbulbvirus, Litunavirus, Luzseptimavirus, Mukerjeevirus, Myxoctovirus, Pagevirus, Perisivirus, Rauchvirus, Ryyoungvirus, Schmidvirus, Shizishanvirus, Skarprettervirus, Sortsnevirus, Uetakevirus, Vicosavirus, Xuquatrovirus
- Podčeleď: Picovirinae (3 rody)
- Rod: Cepunavirus, Negarvirus, Salasvirus
- Podčeleď: Rakietenvirinae (2 rody)
- Rod: Andhravirus, Rosenblumvirus
- Podčeleď: Sepvirinae (3 rody)
- Rod: Diegovirus, Oslovirus, Traversvirus
- (nezařazené do podčeledí)
- Čeleď: Siphoviridae (13 podčeledí)
- (nezařazené do podčeledí)
- Rod: Abbeymikolonvirus, Abidjanvirus, Ahduovirus, Amigovirus, Anatolevirus, Andrewvirus, Andromedavirus, Appavirus, Apricotvirus, Armstrongvirus, Attisvirus, Attoomivirus, Austintatiousvirus, Bantamvirus, Barnyardvirus, Beetrevirus, Bernalvirus, Betterkatzvirus, Bingvirus, Biseptimavirus, Bowservirus, Bridgettevirus, Britbratvirus, Bronvirus, Brussowvirus, Casadabanvirus, Cbastvirus, Cecivirus, Ceduovirus, Ceetrepovirus, Cequinquevirus, Chenonavirus, Cheoctovirus, Chivirus, Chunghsingvirus, Cimpunavirus, Cinunavirus, Coetzeevirus, Coralvirus, Corndogvirus, Cronusvirus, Daredevilvirus, Decurrovirus, Delepquintavirus, Demosthenesvirus, Detrevirus, Dhillonvirus, Dismasvirus, Doucettevirus, Edenvirus, Efquatrovirus, Eiauvirus, Eisenstarkvirus, Elerivirus, Emalynvirus, Eyrevirus, Fairfaxidumvirus, Farahnazvirus, Feofaniavirus, Fibralongavirus, Franklinbayvirus, Fromanvirus, Gaiavirus, Galaxyvirus, Galunavirus, Gamtrevirus, Gesputvirus, Getseptimavirus, Ghobesvirus, Gilesvirus, Gillianvirus, Godonkavirus, Goodmanvirus, Gordonvirus, Gordtnkvirus, Gorganvirus, Gorjumvirus, Gustavvirus, Harrisonvirus, Hedwigvirus, Helsingorvirus, Hendrixvirus, Hiyaavirus, Holosalinivirus, Homburgvirus, Ikedavirus, Ilzatvirus, Incheonvrus, Inhavirus, Jacevirus, Jenstvirus, Juiceboxvirus, Kairosalinivirus, Kelleziovirus, Kilunavirus, Klementvirus, Kojivirus, Korravirus, Kostyavirus, Krampusvirus, Kryptosalinivirus, Lacusarxvirus, Lambdavirus, Lanavirus, Laroyevirus, Lebronvirus[17] (neuznaný), Lentavirus, Liebevirus, Liefievirus, Lokivirus, Lomovskayavirus, Luckybarnesvirus, Luckytenvirus, Lughvirus, Lwoffvirus, Magadivirus, Majavirus, Manhattanvirus, Mapvirus, Mardecavirus, Marvinvirus, Maxrubnervirus, Mementomorivirus, Metamorphoovirus, Minunavirus, Moineauvirus, Montyvirus, Mudcatvirus, Murrayvirus, Nanhaivirus, Nazgulvirus, Neferthenavirus, Nickievirus, Nipunavirus, Nonagvirus, Nonanavirus, Nyceiraevirus, Oengusvirus, Omegavirus, Oneupvirus, Orchidvirus, Oshimavirus, Pahexavirus, Pamexvirus, Papyrusvirus, Patiencevirus, Pbi1virus, Pepyhexavirus, Phietavirus, Phifelvirus, Picardvirus, Pikminvirus, Poushouvirus, Priunavirus, Psavirus, Psimunavirus, Pulverervirus, Quhwahvirus, Raleighvirus, Ravinvirus, Rerduovirus, Rigallicvirus, Rimavirus, Rogerhendrixvirus, Ronaldovirus, Roufvirus, Rowavirus, Ruthyvirus, Samistivirus, Samunavirus, Samwavirus, Sanovirus, Sansavirus, Saphexavirus, Sashavirus, Sasvirus, Saundersvirus, Scapunavirus, Schnabeltiervirus, Schubertvirus, Septimatrevirus, Seuratvirus, Seussvirus, Sextaecvirus, Sitaravirus, Skunavirus, Slashvirus, Smoothievirus, Sonalivirus, Soupsvirus, Sourvirus, Spbetavirus, Squashvirus, Stanholtvirus, Steinhofvirus, Tankvirus, Terapinvirus, Tigunavirus, Timquatrovirus, Tinduovirus, Titanvirus, Tortellinivirus, Triavirus, Trigintaduovirus, Trinavirus, Trinevirus, Trippvirus, Unahavirus, Vashvirus, Vegasvirus, Vendettavirus, Vhulanivirus, Vidquintavirus, Vieuvirus, Vividuovirus, Vojvodinavirus, Wbetavirus, Weaselvirus, Wildcatvirus, Wilnyevirus, Wizardvirus, Woesvirus, Woodruffvirus, Xiamenvirus, Xipdecavirus, Yangvirus, Yuavirus, Yvonnevirus, Zetavirus
- Podčeleď: Arquatrovirinae (3 rody)
- Rod: Arequatrovirus, Camvirus, Likavirus
- Podčeleď: Bclasvirinae (5 rodů)
- Podčeleď: Chebruvirinae (1 rod)
- Rod: Brujitavirus
- Podčeleď: Dclasvirinae (2 rody)
- Rod: Hawkeyevirus, Plotvirus
- Podčeleď: Dolichocephalovirinae (4 rody)
- Podčeleď: Guernseyvirinae (3 rody)
- Rod: Cornellvirus, Jerseyvirus, Kagunavirus
- Podčeleď: Langleyhallvirinae (3 rody)
- Rod: Getalongvirus, Horusvirus, Phistoryvirus
- Podčeleď: Mccleskeyvirinae (2 rody)
- Rod: Limdunavirus, Unaquatrovirus
- Podčeleď: Mclasvirinae (2 rody)
- Rod: Bongovirus, Reyvirus
- Podčeleď: Nclasvirinae (3 rody)
- Rod: Buttersvirus, Charlievirus, Redivirus
- Podčeleď: Nymbaxtervirinae (2 rody)
- Rod: Baxtervirus, Nymphadoravirus
- Podčeleď: Pclasvirinae (3 rody)
- Podčeleď: Tybeckvirinae (4 rody)
- (nezařazené do podčeledí)
- (nezařazené do čeledí)
- Řád: Caudovirales (9 čeledí, 1 neuznaná čeleď)
- Třída: Caudoviricetes (1 řád)
- Kmen: Peploviricota (1 třída)
Realm: Monodnaviria (4 říše)
- Říše: Loebvirae (1 kmen)
- Kmen: Hofneiviricota (1 třída)
- Třída: Faserviricetes (1 řád)
- Řád: Tubulavirales (2 čeledi)
- Čeleď: Inoviridae (23 rodů)
- Rod: Affertcholeramvirus, Bifilivirus, Capistrivirus, Coriovirus, Fibrovirus, Habenivirus, Infulavirus, Inovirus, Lineavirus, Parhipatevirus, Primolicivirus, Psecadovirus, Restivirus, Saetivirus, Scuticavirus, Staminivirus, Subteminivirus, Tertilicivirus, Thomixvirus, Versovirus, Vicialiavirus, Villovirus, Xylivirus
- Čeleď: Plectroviridae (3 rody)
- Čeleď: Inoviridae (23 rodů)
- Řád: Tubulavirales (2 čeledi)
- Třída: Faserviricetes (1 řád)
- Kmen: Hofneiviricota (1 třída)
- Říše: Sangervirae (1 kmen)
- Kmen: Phixviricota (1 třída)
- Třída: Malgrandaviricetes (1 řád)
- Řád: Petitvirales (1 čeleď)
- Čeleď: Microviridae (2 podčeledi)
- Podčeleď: Bullavirinae (3 rody)
- Podčeleď: Gokushovirinae (3 rody)
- Čeleď: Microviridae (2 podčeledi)
- Řád: Petitvirales (1 čeleď)
- Třída: Malgrandaviricetes (1 řád)
- Kmen: Phixviricota (1 třída)
- Říše: Shotokuvirae (2 kmeny)
- Kmen: Cossaviricota (3 třídy)
- Třída: Mouviricetes (1 řád)
- Řád: Polivirales (1 čeleď)
- Čeleď: Bidnaviridae (1 rod)
- Rod: Bidensovirus
- Čeleď: Bidnaviridae (1 rod)
- Řád: Polivirales (1 čeleď)
- Třída: Papovaviricetes (2 řády)
- Řád: Sepolyvirales (1 čeleď)
- Čeleď: Polyomaviridae (4 rody)
- Řád: Zurhausenvirales (1 čeleď)
- Čeleď: Papillomaviridae (2 podčeledi)
- Podčeleď: Firstpapillomavirinae (52 rodů)
- Rod: Alphapapillomavirus, Betapapillomavirus, Chipapillomavirus, Deltapapillomavirus, Dyochipapillomavirus, Dyodeltapapillomavirus, Dyoepsilonpapillomavirus, Dyoetapapillomavirus, Dyoiotapapillomavirus, Dyokappapapillomavirus, Dyolambdapapillomavirus, Dyomupapillomavirus, Dyonupapillomavirus, Dyoomegapapillomavirus, Dyoomikronpapillomavirus, Dyophipapillomavirus, Dyopipapillomavirus, Dyopsipapillomavirus, Dyorhopapillomavirus, Dyosigmapapillomavirus, Dyotaupapillomavirus, Dyothetapapillomavirus, Dyoupsilonpapillomavirus, Dyoxipapillomavirus, Dyozetapapillomavirus, Epsilonpapillomavirus, Etapapillomavirus, Gammapapillomavirus, Iotapapillomavirus, Kappapapillomavirus, Lambdapapillomavirus, Mupapillomavirus, Nupapillomavirus, Omegapapillomavirus, Omikronpapillomavirus, Phipapillomavirus, Pipapillomavirus, Psipapillomavirus, Rhopapillomavirus, Sigmapapillomavirus, Taupapillomavirus, Thetapapillomavirus, Treisdeltapapillomavirus, Treisepsilonpapillomavirus, Treisetapapillomavirus, Treisiotapapillomavirus, Treiskappapapillomavirus, Treisthetapapillomavirus, Treiszetapapillomavirus, Upsilonpapillomavirus, Xipapillomavirus, Zetapapillomavirus
- Podčeleď: Secondpapillomavirinae (1 rod)
- Rod: Alefpapillomavirus
- Podčeleď: Firstpapillomavirinae (52 rodů)
- Čeleď: Papillomaviridae (2 podčeledi)
- Řád: Sepolyvirales (1 čeleď)
- Třída: Quintoviricetes (1 řád)
- Řád: Piccovirales (1 čeleď)
- Čeleď: Parvoviridae (3 podčeledi)
- Podčeleď: Densovirinae (9 rodů)
- Podčeleď: Hamaparvovirinae (4 rody)
- Podčeleď: Parvovirinae (10 rodů)
- Čeleď: Parvoviridae (3 podčeledi)
- Řád: Piccovirales (1 čeleď)
- Třída: Mouviricetes (1 řád)
- Kmen: Cressdnaviricota (2 třídy)
- Třída: Arfiviricetes (5 řádů)
- Řád: Baphyvirales (1 čeleď)
- Čeleď: Bacilladnaviridae (3 rody)
- Řád: Cirlivirales (1 čeleď)
- Čeleď: Circoviridae (2 rody)
- Rod: Circovirus, Cyclovirus
- Čeleď: Circoviridae (2 rody)
- Řád: Cremevirales (1 čeleď)
- Čeleď: Smacoviridae (6 rodů)
- Řád: Mulpavirales (1 čeleď)
- Čeleď: Nanoviridae (2 rody)
- Řád: Recrevirales (1 čeleď)
- Čeleď: Redondoviridae (1 rod)
- Rod: Torbevirus
- Čeleď: Redondoviridae (1 rod)
- Řád: Baphyvirales (1 čeleď)
- Třída: Repensiviricetes (1 řád)
- Řád: Geplafuvirales (2 čeledi, 1 neuznaná čeleď)
- Čeleď: Geminiviridae (9 rodů, 1 neuznaný rod)
- Rod: Becurtovirus, Begomovirus, Capulavirus, Curtovirus, Eragrovirus, Grablovirus, Graingemvirus[18] (neuznaný), Mastrevirus, Topocuvirus, Turncurtovirus
- Čeleď: Genomoviridae (9 rodů)
- Čeleď (neuznaná): Naminiviridae[19] (1 neuznaný rod)
- Rod (neuznaný): Cofodevirus[19]
- Čeleď: Geminiviridae (9 rodů, 1 neuznaný rod)
- Řád: Geplafuvirales (2 čeledi, 1 neuznaná čeleď)
- Třída: Arfiviricetes (5 řádů)
- Kmen: Cossaviricota (3 třídy)
- Říše: Trapavirae (1 kmen)
- Kmen: Saleviricota (1 třída)
- Třída: Huolimaviricetes (1 řád)
- Řád: Haloruvirales (1 čeleď)
- Čeleď: Pleolipoviridae (3 rody)
- Řád: Haloruvirales (1 čeleď)
- Třída: Huolimaviricetes (1 řád)
- Kmen: Saleviricota (1 třída)
Riboviria
Realm: Riboviria (2 říše) [pozn. 2]
- (nezařazené do říší)
- Rod: Albetovirus, Aumaivirus, Papanivirus, Virtovirus
- Čeleď: Polymycoviridae (1 rod)
- Rod: Polymycovirus
- Čeleď: Sarthroviridae (1 rod)
- Rod: Macronovirus
- Říše: Orthornavirae (5 kmenů)
- (nezařazené do kmene)
- Rod: Botybirnavirus
- Čeleď: Birnaviridae (7 rodů)
- Čeleď: Permutotetraviridae (1 rod)
- Kmen: Duplornaviricota (3 třídy)
- Třída: Chrymotiviricetes (1 řád)
- Řád: Ghabrivirales (4 čeledi)
- Čeleď: Chrysoviridae (2 rody)
- Čeleď: Megabirnaviridae (1 rod)
- Rod: Megabirnavirus
- Čeleď: Quadriviridae (1 rod)
- Rod: Quadrivirus
- Čeleď: Totiviridae (5 rodů)
- Řád: Ghabrivirales (4 čeledi)
- Třída: Resentoviricetes (1 řád)
- Řád: Reovirales (1 čeleď)
- Čeleď: Reoviridae (2 podčeledi)
- Podčeleď: Sedoreovirinae (6 rodů)
- Podčeleď: Spinareovirinae (9 rodů)
- Čeleď: Reoviridae (2 podčeledi)
- Řád: Reovirales (1 čeleď)
- Třída: Vidaverviricetes (1 řád)
- Řád: Mindivirales (1 čeleď)
- Čeleď: Cystoviridae (1 rod)
- Rod: Cystovirus
- Čeleď: Cystoviridae (1 rod)
- Řád: Mindivirales (1 čeleď)
- Třída: Chrymotiviricetes (1 řád)
- Kmen: Kitrinoviricota (4 třídy)
- Třída: Alsuviricetes (3 řády)
- Řád: Hepelivirales (4 čeledi)
- Čeleď: Alphatetraviridae (2 rody)
- Čeleď: Benyviridae (1 rod)
- Rod: Benyvirus
- Čeleď: Hepeviridae (2 rody)
- Rod: Orthohepevirus, Piscihepevirus
- Čeleď: Matonaviridae (1 rod)
- Rod: Rubivirus
- Řád: Martellivirales (7 čeledí)
- Čeleď: Bromoviridae (6 rodů)
- Rod: Alfamovirus, Anulavirus, Bromovirus, Cucumovirus, Ilarvirus, Oleavirus
- Čeleď: Closteroviridae (4 rody)
- Čeleď: Endornaviridae (2 rody)
- Čeleď: Kitaviridae (3 rody)
- Rod: Blunervirus, Cilevirus, Higrevirus
- Čeleď: Mayoviridae (2 rody)
- Rod: Idaeovirus, Pteridovirus
- Čeleď: Togaviridae (1 rod)
- Rod: Alphavirus
- Čeleď: Virgaviridae (7 rodů)
- Čeleď: Bromoviridae (6 rodů)
- Řád: Tymovirales (5 čeledí)
- Čeleď: Alphaflexiviridae (7 rodů)
- Čeleď: Betaflexiviridae (2 podčeledi)
- Podčeleď: Quinvirinae (3 rody)
- Rod: Carlavirus, Foveavirus, Robigovirus
- Podčeleď: Trivirinae (10 rodů)
- Podčeleď: Quinvirinae (3 rody)
- Čeleď: Deltaflexiviridae (1 rod)
- Rod: Deltaflexivirus
- Čeleď: Gammaflexiviridae (1 rod)
- Rod: Mycoflexivirus
- Čeleď: Tymoviridae (3 rody)
- Rod: Maculavirus, Marafivirus, Tymovirus
- Řád: Hepelivirales (4 čeledi)
- Třída: Flasuviricetes (1 řád)
- Řád: Amarillovirales (1 čeleď)
- Čeleď: Flaviviridae (4 rody)
- Rod: Flavivirus, Hepacivirus, Pegivirus, Pestivirus
- Čeleď: Flaviviridae (4 rody)
- Řád: Amarillovirales (1 čeleď)
- Třída: Magsaviricetes (1 řád)
- Řád: Nodamuvirales (2 čeledi)
- Čeleď: Nodaviridae (2 rody)
- Rod: Alphanodavirus, Betanodavirus
- Čeleď: Sinhaliviridae (1 rod)
- Rod: Sinaivirus
- Čeleď: Nodaviridae (2 rody)
- Řád: Nodamuvirales (2 čeledi)
- Třída: Tolucaviricetes (1 řád)
- Řád: Tolivirales (3 čeledi)
- Čeleď: Carmotetraviridae (1 rod)
- Rod: Alphacarmotetravirus
- Čeleď: Luteoviridae (3 rody)
- Rod: Enamovirus, Luteovirus, Polerovirus
- Čeleď: Tombusviridae (3 podčeledi)
- Podčeleď: Calvusvirinae (1 rod)
- Rod: Umbravirus
- Podčeleď: Procedovirinae (14 rodů)
- Podčeleď: Regressovirinae (1 rod)
- Rod: Dianthovirus
- Podčeleď: Calvusvirinae (1 rod)
- Čeleď: Carmotetraviridae (1 rod)
- Řád: Tolivirales (3 čeledi)
- Třída: Alsuviricetes (3 řády)
- Kmen: Lenarviricota (4 třídy)
- Třída: Allassoviricetes (1 řád)
- Řád: Levivirales (1 čeleď)
- Čeleď: Leviviridae (2 rody)
- Rod: Allolevivirus, Levivirus
- Čeleď: Leviviridae (2 rody)
- Řád: Levivirales (1 čeleď)
- Třída: Amabiliviricetes (1 řád)
- Řád: Wolframvirales (1 čeleď)
- Čeleď: Narnaviridae (1 rod)
- Rod: Narnavirus
- Čeleď: Narnaviridae (1 rod)
- Řád: Wolframvirales (1 čeleď)
- Třída: Howeltoviricetes (1 řád)
- Řád: Cryppavirales (1 čeleď)
- Čeleď: Mitoviridae (1 rod)
- Rod: Mitovirus
- Čeleď: Mitoviridae (1 rod)
- Řád: Cryppavirales (1 čeleď)
- Třída: Miaviricetes (1 řád)
- Řád: Ourlivirales (1 čeleď)
- Čeleď: Botourmiaviridae (4 rody, 1 neuznaný rod)
- Rod: Botoulivirus, Magoulivirus, Ourmiavirus, Ostravirus[21][22] (neuznaný), Scleroulivirus
- Čeleď: Botourmiaviridae (4 rody, 1 neuznaný rod)
- Řád: Ourlivirales (1 čeleď)
- Třída: Allassoviricetes (1 řád)
- Kmen: Negarnaviricota (2 podkmeny)
- Podkmen: Haploviricotina (4 třídy)
- Třída: Chunqiuviricetes (1 řád)
- Řád: Muvirales (1 čeleď)
- Čeleď: Qinviridae (1 rod)
- Rod: Yingvirus
- Čeleď: Qinviridae (1 rod)
- Řád: Muvirales (1 čeleď)
- Třída: Milneviricetes (1 řád)
- Řád: Serpentovirales (1 čeleď)
- Čeleď: Aspiviridae (1 rod)
- Rod: Ophiovirus
- Čeleď: Aspiviridae (1 rod)
- Řád: Serpentovirales (1 čeleď)
- Třída: Monjiviricetes (2 řády)
- Řád: Jingchuvirales (1 čeleď)
- Čeleď: Chuviridae (1 rod)
- Rod: Mivirus
- Čeleď: Chuviridae (1 rod)
- Řád: Mononegavirales (11 čeledí)
- Čeleď: Artoviridae (2 rody)
- Rod: Hexartovirus, Peropuvirus
- Čeleď: Bornaviridae (3 rody)
- Rod: Carbovirus, Cultervirus, Orthobornavirus
- Čeleď: Filoviridae (6 rodů)
- Čeleď: Lispiviridae (1 rod)
- Rod: Arlivirus
- Čeleď: Mymonaviridae (2 rody)
- Čeleď: Nyamiviridae (6 rodů)
- Rod: Berhavirus, Crustavirus, Nyavirus, Orinovirus, Socyvirus, Tapwovirus
- Čeleď: Paramyxoviridae (4 podčeledi)
- (nezařazené do podčeledí)
- Podčeleď: Avulavirinae (3 rody)
- Podčeleď: Metaparamyxovirinae (1 rod)
- Rod: Synodonvirus
- Podčeleď: Orthoparamyxovirinae (8 rodů)
- Podčeleď: Rubulavirinae (2 rody)
- Čeleď: Pneumoviridae (2 rody)
- Čeleď: Rhabdoviridae (26 rodů)
- Rod: Almendravirus, Alphanemrhavirus, Alphanucleorhabdovirus, Arurhavirus, Betanucleorhabdovirus, Caligrhavirus, Curiovirus, Cytorhabdovirus, Dichorhavirus, Ephemerovirus, Gammanucleorhabdovirus, Hapavirus, Ledantevirus, Lyssavirus, Mousrhavirus, Novirhabdovirus, Ohlsrhavirus, Perhabdovirus, Sigmavirus, Sprivivirus, Sripuvirus, Sunrhavirus, Tibrovirus, Tupavirus, Varicosavirus, Vesiculovirus
- Čeleď: Sunviridae (1 rod)
- Rod: Sunshinevirus
- Čeleď: Xinmoviridae (1 rod)
- Rod: Anphevirus
- Čeleď: Artoviridae (2 rody)
- Řád: Jingchuvirales (1 čeleď)
- Třída: Yunchangviricetes (1 řád)
- Řád: Goujianvirales (1 čeleď)
- Čeleď: Yueviridae (1 rod)
- Rod: Yuyuevirus
- Čeleď: Yueviridae (1 rod)
- Řád: Goujianvirales (1 čeleď)
- Třída: Chunqiuviricetes (1 řád)
- Podkmen: Polyploviricotina (2 třídy)
- Třída: Ellioviricetes (1 řád)
- Řád: Bunyavirales (12 čeledí)
- Čeleď: Arenaviridae (4 rody)
- Čeleď: Cruliviridae (1 rod)
- Rod: Lincruvirus
- Čeleď: Fimoviridae (1 rod)
- Rod: Emaravirus
- Čeleď: Hantaviridae (4 podčeledi)
- Podčeleď: Actantavirinae (1 rod)
- Rod: Actinovirus
- Podčeleď: Agantavirinae (1 rod)
- Rod: Agnathovirus
- Podčeleď: Mammantavirinae (4 rody)
- Podčeleď: Repantavirinae (1 rod)
- Rod: Reptillovirus
- Podčeleď: Actantavirinae (1 rod)
- Čeleď: Leishbuviridae (1 rod)
- Rod: Shilevirus
- Čeleď: Mypoviridae (1 rod)
- Rod: Hubavirus
- Čeleď: Nairoviridae (3 rody)
- Čeleď: Peribunyaviridae (4 rody)
- Čeleď: Phasmaviridae (5 rodů)
- Čeleď: Phenuiviridae (19 rodů)
- Čeleď: Tospoviridae (1 rod)
- Rod: Orthotospovirus
- Čeleď: Wupedeviridae (1 rod)
- Rod: Wumivirus
- Řád: Bunyavirales (12 čeledí)
- Třída: Insthoviricetes (1 řád)
- Řád: Articulavirales (2 čeledi)
- Čeleď: Amnoonviridae (1 rod)
- Rod: Tilapinevirus
- Čeleď: Orthomyxoviridae (7 rodů)
- Čeleď: Amnoonviridae (1 rod)
- Řád: Articulavirales (2 čeledi)
- Třída: Ellioviricetes (1 řád)
- Podkmen: Haploviricotina (4 třídy)
- Kmen: Pisuviricota (3 třídy)
- Třída: Duplopiviricetes (1 řád)
- Řád: Durnavirales (4 čeledi)
- Čeleď: Amalgaviridae (2 rody)
- Rod: Amalgavirus, Zybavirus
- Čeleď: Hypoviridae (1 rod)
- Rod: Hypovirus
- Čeleď: Partitiviridae (5 rodů)
- Čeleď: Picobirnaviridae (1 rod)
- Rod: Picobirnavirus
- Čeleď: Amalgaviridae (2 rody)
- Řád: Durnavirales (4 čeledi)
- Třída: Pisoniviricetes (3 řády)
- Řád: Nidovirales (8 podřádů)
- Podřád: Abnidovirineae (1 čeleď)
- Čeleď: Abyssoviridae (1 podčeleď)
- Podčeleď: Tiamatvirinae (1 rod)
- Rod: Alphaabyssovirus
- Podčeleď: Tiamatvirinae (1 rod)
- Čeleď: Abyssoviridae (1 podčeleď)
- Podřád: Arnidovirineae (4 čeledi)
- Čeleď: Arteriviridae (6 podčeledí)
- Podčeleď: Crocarterivirinae (1 rod)
- Rod: Muarterivirus
- Podčeleď: Equarterivirinae (1 rod)
- Rod: Alphaarterivirus
- Podčeleď: Heroarterivirinae (1 rod)
- Rod: Lambdaarterivirus
- Podčeleď: Simarterivirinae (6 rodů)
- Podčeleď: Variarterivirinae (3 rody)
- Podčeleď: Zealarterivirinae (1 rod)
- Rod: Kappaarterivirus
- Podčeleď: Crocarterivirinae (1 rod)
- Čeleď: Cremegaviridae (1 podčeleď)
- Podčeleď: Rodepovirinae (1 rod)
- Rod: Pontunivirus
- Podčeleď: Rodepovirinae (1 rod)
- Čeleď: Gresnaviridae (1 podčeleď)
- Podčeleď: Reternivirinae (1 rod)
- Rod: Cyclophivirus
- Podčeleď: Reternivirinae (1 rod)
- Čeleď: Olifoviridae (1 podčeleď)
- Podčeleď: Gofosavirinae (1 rod)
- Rod: Kukrinivirus
- Podčeleď: Gofosavirinae (1 rod)
- Čeleď: Arteriviridae (6 podčeledí)
- Podřád: Cornidovirineae (1 čeleď)
- Čeleď: Coronaviridae (2 podčeledi)
- Podčeleď: Letovirinae (1 rod)
- Rod: Alphaletovirus
- Podčeleď: Orthocoronavirinae (4 rody)
- Podčeleď: Letovirinae (1 rod)
- Čeleď: Coronaviridae (2 podčeledi)
- Podřád: Mesnidovirineae (2 čeledi)
- Čeleď: Medioniviridae (2 podčeledi)
- Podčeleď: Medionivirinae (1 rod)
- Rod: Turrinivirus
- Podčeleď: Tunicanivirinae (1 rod)
- Rod: Bolenivirus
- Podčeleď: Medionivirinae (1 rod)
- Čeleď: Mesoniviridae (1 podčeleď)
- Podčeleď: Hexponivirinae (1 rod)
- Rod: Alphamesonivirus
- Podčeleď: Hexponivirinae (1 rod)
- Čeleď: Medioniviridae (2 podčeledi)
- Podřád: Monidovirineae (1 čeleď)
- Čeleď: Mononiviridae (1 podčeleď)
- Podčeleď: Mononivirinae (1 rod)
- Rod: Alphamononivirus
- Podčeleď: Mononivirinae (1 rod)
- Čeleď: Mononiviridae (1 podčeleď)
- Podřád: Nanidovirineae (2 čeledi)
- Čeleď: Nanghoshaviridae (1 podčeleď)
- Podčeleď: Chimanivirinae (1 rod)
- Rod: Chimshavirus
- Podčeleď: Chimanivirinae (1 rod)
- Čeleď: Nanhypoviridae (1 podčeleď)
- Podčeleď: Hyporhamsavirinae (1 rod)
- Rod: Sajorinivirus
- Podčeleď: Hyporhamsavirinae (1 rod)
- Čeleď: Nanghoshaviridae (1 podčeleď)
- Podřád: Ronidovirineae (2 čeledi)
- Čeleď: Euroniviridae (2 podčeledi)
- Podčeleď: Ceronivirinae (1 rod)
- Rod: Charybnivirus
- Podčeleď: Crustonivirinae (1 rod)
- Rod: Paguronivirus
- Podčeleď: Ceronivirinae (1 rod)
- Čeleď: Roniviridae (1 podčeleď)
- Podčeleď: Okanivirinae (1 rod)
- Rod: Okavirus
- Podčeleď: Okanivirinae (1 rod)
- Čeleď: Euroniviridae (2 podčeledi)
- Podřád: Tornidovirineae (1 čeleď)
- Čeleď: Tobaniviridae (4 podčeledi)
- Podčeleď: Piscanivirinae (2 rody)
- Rod: Bafinivirus, Oncotshavirus
- Podčeleď: Remotovirinae (1 rod)
- Rod: Bostovirus
- Podčeleď: Serpentovirinae (4 rody)
- Rod: Infratovirus, Lyctovirus, Pregotovirus, Sectovirus
- Podčeleď: Torovirinae (1 rod)
- Rod: Torovirus
- Podčeleď: Piscanivirinae (2 rody)
- Čeleď: Tobaniviridae (4 podčeledi)
- Podřád: Abnidovirineae (1 čeleď)
- Řád: Picornavirales (8 čeledí)
- Čeleď: Caliciviridae (11 rodů)
- Čeleď: Dicistroviridae (3 rody)
- Rod: Aparavirus, Cripavirus, Triatovirus
- Čeleď: Iflaviridae (1 rod)
- Rod: Iflavirus
- Čeleď: Marnaviridae (7 rodů)
- Čeleď: Picornaviridae (63 rodů)
- Rod: Aalivirus, Ailurivirus, Ampivirus, Anativirus, Aphthovirus, Aquamavirus, Avihepatovirus, Avisivirus, Boosepivirus, Bopivirus, Cardiovirus, Cosavirus, Crahelivirus, Crohivirus, Dicipivirus, Diresapivirus, Enterovirus, Erbovirus, Felipivirus, Fipivirus, Gallivirus, Gruhelivirus, Grusopivirus, Harkavirus, Hemipivirus, Hepatovirus, Hunnivirus, Kobuvirus, Kunsagivirus, Limnipivirus, Livupivirus, Ludopivirus, Malagasivirus, Megrivirus, Mischivirus, Mosavirus, Mupivirus, Myrropivirus, Orivirus, Oscivirus, Parabovirus, Parechovirus, Pasivirus, Passerivirus, Pemapivirus, Poecivirus, Potamipivirus, Rabovirus, Rafivirus, Rohelivirus, Rosavirus, Sakobuvirus, Salivirus, Sapelovirus, Senecavirus, Shanbavirus, Sicinivirus, Symapivirus, Teschovirus, Torchivirus, Tottorivirus, Tremovirus, Tropivirus
- Čeleď: Polycipiviridae (3 rody)
- Čeleď: Secoviridae (1 podčeleď)
- (nezařazené do podčeledí)
- Rod: Cheravirus, Sadwavirus, Sequivirus, Torradovirus, Waikavirus
- Podčeleď: Comovirinae (3 rody)
- (nezařazené do podčeledí)
- Čeleď: Solinviviridae (2 rody)
- Rod: Invictavirus, Nyfulvavirus
- Řád: Sobelivirales (3 čeledi)
- Čeleď: Alvernaviridae (1 rod)
- Rod: Dinornavirus
- Čeleď: Barnaviridae (1 rod)
- Rod: Barnavirus
- Čeleď: Solemoviridae (2 rody)
- Rod: Polemovirus, Sobemovirus
- Čeleď: Alvernaviridae (1 rod)
- Řád: Nidovirales (8 podřádů)
- Třída: Stelpaviricetes (2 řády)
- Řád: Patatavirales (1 čeleď)
- Čeleď: Potyviridae (12 rodů)
- Řád: Stellavirales (1 čeleď)
- Čeleď: Astroviridae (2 rody)
- Rod: Avastrovirus, Mamastrovirus
- Čeleď: Astroviridae (2 rody)
- Řád: Patatavirales (1 čeleď)
- Třída: Duplopiviricetes (1 řád)
- (nezařazené do kmene)
- Říše: Pararnavirae (1 kmen)
- Kmen: Artverviricota (1 třída)
- Třída: Revtraviricetes (2 řády)
- Řád: Blubervirales (1 čeleď, 1 neuznaná čeleď)
- Čeleď: Hepadnaviridae (5 rodů)
- Čeleď (neuznaná): Nackednaviridae[23] (1 neuznaný rod)
- Rod (neuznaný): Nackednavirus[23]
- Řád: Ortervirales (5 čeledí)
- Čeleď: Belpaoviridae (1 rod)
- Rod: Semotivirus
- Čeleď: Caulimoviridae (10 rodů)
- Čeleď: Metaviridae (2 rody)
- Rod: Errantivirus, Metavirus
- Čeleď: Pseudoviridae (3 rody)
- Rod: Hemivirus, Pseudovirus, Sirevirus
- Čeleď: Retroviridae (2 podčeledi)
- Podčeleď: Orthoretrovirinae (6 rodů)
- Podčeleď: Spumaretrovirinae (5 rodů)
- Čeleď: Belpaoviridae (1 rod)
- Řád: Blubervirales (1 čeleď, 1 neuznaná čeleď)
- Třída: Revtraviricetes (2 řády)
- Kmen: Artverviricota (1 třída)
Realm: Varidnaviria (2 říše)
- Říše: Bamfordvirae (2 kmeny)
- Kmen: Nucleocytoviricota[pozn. 3] (2 třídy) [pozn. 4]
- (nezařazené do tříd)
- Třída: Megaviricetes (3 řády)
- Řád: Algavirales (1 čeleď, 2 neuznané čeledi)
- (nezařazené do čeledí)
- Rod (neuznaný): Mollivirus[29]
- Čeleď (neuznaná): Medusaviridae[30] (1 neuznaný rod)
- Rod (neuznaný): Medusavirus[30][31]
- Čeleď (neuznaná): Pandoraviridae[32][33][34] (1 neuznaný rod)
- Rod (neuznaný): Pandoravirus[32][33][34]
- Čeleď: Phycodnaviridae (6 rodů)
- (nezařazené do čeledí)
- Řád: Imitervirales (1 čeleď)
- Čeleď: Mimiviridae (2 rody, 1 neuznaný rod, 1 neuznaná podčeleď)
- Rod: Cafeteriavirus, Mimivirus (vč. Megavirus[35], Moumouvirus[36], Lentillevirus[37], někdy navrhovaných vyčlenit do samostatných rodů) [38], Tupanvirus[39][38] (neuznaný)
- Podčeleď (neuznaná): Klosneuvirinae[40] (4 neuznané rody)
- Čeleď: Mimiviridae (2 rody, 1 neuznaný rod, 1 neuznaná podčeleď)
- Řád: Pimascovirales[pozn. 5] (3 čeledi, 1 neuznaná čeleď)
- Čeleď: Ascoviridae (2 rody)
- Rod: Ascovirus, Toursvirus
- Čeleď: Iridoviridae (2 podčeledi)
- Podčeleď: Alphairidovirinae (3 rody)
- Podčeleď: Betairidovirinae (3 rody)
- Čeleď: Marseilleviridae (1 rod)
- Rod: Marseillevirus (vč. Lausannevirus)
- Čeleď (neuznaná): Pithoviridae[41][42][43] (3 neuznané rody)
- Rod (neuznaný): Cedratvirus[44], Orpheovirus[45], Pithovirus[41]
- Čeleď: Ascoviridae (2 rody)
- Řád: Algavirales (1 čeleď, 2 neuznané čeledi)
- Třída: Pokkesviricetes (2 řády)
- Řád: Asfuvirales (1 čeleď)
- Čeleď: Asfarviridae (1 rod)
- Rod: Asfivirus
- (nezařazené do čeledí)
- Rod (neuznaný): Faustovirus[46][47], Kaumoebavirus[48], Pacmanvirus[49]
- Čeleď: Asfarviridae (1 rod)
- Řád: Chitovirales (1 čeleď)
- Čeleď: Poxviridae (2 podčeledi)
- Podčeleď: Chordopoxvirinae (18 rodů)
- Podčeleď: Entomopoxvirinae (4 rody)
- Čeleď: Poxviridae (2 podčeledi)
- Řád: Asfuvirales (1 čeleď)
- Kmen: Preplasmiviricota (2 třídy)
- Třída: Maveriviricetes (1 řád)
- Řád: Priklausovirales (1 čeleď)
- Čeleď: Lavidaviridae (2 rody) [pozn. 6]
- Rod: Mavirus, Sputnikvirus
- Čeleď: Lavidaviridae (2 rody) [pozn. 6]
- Řád: Priklausovirales (1 čeleď)
- Třída: Tectiliviricetes (4 řády)
- Řád: Belfryvirales (1 čeleď)
- Čeleď: Turriviridae (1 rod)
- Rod: Alphaturrivirus
- Čeleď: Turriviridae (1 rod)
- Řád: Kalamavirales (1 čeleď)
- Čeleď: Tectiviridae (3 rody)
- Řád: Rowavirales (1 čeleď)
- Čeleď: Adenoviridae (5 rodů)
- Řád: Vinavirales (1 čeleď)
- Čeleď: Corticoviridae (1 rod)
- Rod: Corticovirus
- Čeleď: Corticoviridae (1 rod)
- Řád: Belfryvirales (1 čeleď)
- Třída: Maveriviricetes (1 řád)
- Kmen: Nucleocytoviricota[pozn. 3] (2 třídy) [pozn. 4]
- Říše: Helvetiavirae (1 kmen)
- Kmen: Dividoviricota (1 třída)
- Třída: Laserviricetes (1 řád)
- Řád: Halopanivirales (1 čeleď)
- Čeleď: Sphaerolipoviridae (3 rody)
- Řád: Halopanivirales (1 čeleď)
- Třída: Laserviricetes (1 řád)
- Kmen: Dividoviricota (1 třída)
Nezařazené do realmů
- (nezařazené do řádů)
- (nezařazené do čeledí)
- Rod: Barhavirus, Deltavirus, Dinodnavirus, Lostrhavirus, Rhizidiovirus, Sawgrhavirus, Tornovirus[51] (neuznaný), Zarhavirus
- Čeleď: Alphasatellitidae (2 podčeledi)
- Podčeleď: Geminialphasatellitinae (4 rody)
- Podčeleď: Nanoalphasatellitinae (7 rodů)
- Čeleď: Ampullaviridae (1 rod)
- Rod: Ampullavirus
- Čeleď: Anelloviridae (14 rodů)
- Čeleď: Avsunviroidae (3 rody)
- Rod: Avsunviroid, Elaviroid, Pelamoviroid
- Čeleď: Baculoviridae (4 rody)
- Čeleď: Bicaudaviridae (1 rod)
- Rod: Bicaudavirus
- Čeleď: Clavaviridae (1 rod)
- Rod: Clavavirus
- Čeleď: Finnlakeviridae (1 rod)
- Rod: Finnlakevirus
- Čeleď: Fuselloviridae (2 rody)
- Čeleď: Globuloviridae (1 rod)
- Rod: Globulovirus
- Čeleď: Guttaviridae (2 rody)
- Čeleď: Halspiviridae (1 rod)
- Rod: Salterprovirus
- Čeleď: Hytrosaviridae (2 rody)
- Rod: Glossinavirus, Muscavirus
- Čeleď: Nimaviridae (1 rod)
- Rod: Whispovirus
- Čeleď: Nudiviridae (2 rody)
- Rod: Alphanudivirus, Betanudivirus
- Čeleď: Ovaliviridae (1 rod)
- Rod: Alphaovalivirus
- Čeleď: Plasmaviridae (1 rod)
- Rod: Plasmavirus
- Čeleď: Polydnaviridae (2 rody)
- Rod: Bracovirus, Ichnovirus
- Čeleď: Portogloboviridae (1 rod)
- Rod: Alphaportoglobovirus
- Čeleď: Pospiviroidae (5 rodů)
- Čeleď: Spiraviridae (1 rod)
- Rod: Alphaspiravirus
- Čeleď: Thaspiviridae (1 rod)
- Rod: Nitmarvirus
- Čeleď: Tolecusatellitidae (2 rody)
- Rod: Betasatellite, Deltasatellite
- Čeleď: Tristromaviridae (1 rod)
- Rod: Alphatristromavirus
- (nezařazené do čeledí)
- Řád: Ligamenvirales (2 čeledi)
- Čeleď: Lipothrixviridae (4 rody)
- Čeleď: Rudiviridae (1 rod)
- Rod: Rudivirus
- (nezařazené do řádů)
Baltimorova klasifikace
Podrobnější informace naleznete v článku Baltimorova klasifikace.
Baltimorova klasifikace je systém klasifikace virů do sedmi skupin podle typu genetického materiálu, který je obsažen ve virových částicích, a způsobu jeho přepisu do virové mRNA. Klasifikaci poprvé navrhl v roce 1971 David Baltimore, pozdější nositel Nobelovy ceny za fyziologii nebo lékařství.[52] V jeho původním návrhu bylo šest skupin virů (I.-VI.), sedmá skupina byla vytvořena pro později objevenou skupinu hepadnavirů s unikátně stavěným genomem. Systém umožňuje zjednodušit si nesmírně komplikované a rozmanité typy forem a životních cyklů, jimiž viry oplývají,[53] ale protože není hierarchicky strukturovaný, na skutečnou systematiku tisíců známých virů již nestačí. Vzhledem k definici skupin nemůže začlenit viroidy, v tradičním pojetí nezahrhuje ani retrotranspozony a satelitní nukleové kyseliny (pojetí ICTV tyto tři skupiny mezi viry řadí a taxonomicky je klasifikuje).
Jedná se tak o jednoduché, jednoúrovňové, dosud běžně používané třídění, které dříve (do r. 2019, kdy byl vytvořen první realm – Riboviria, zahrnující skupiny III.-V.) bylo možno až na drobné výjimky nadřadit systému ICTV. To ale neznamená, že se u skupin Baltimorovy klasifikace jedná o fylogeneticky přirozené taxony;[pozn. 7] ani jejich vymezení podle genomu nemusí být úplně přesné vzhledem k podřazeným nižším taxonům ICTV.[pozn. 8][pozn. 9][pozn. 10] To je důvod, proč Baltimorova klasifikace postupně zastarává.
- Skupina I.: dsDNA viry, tedy viry s dvouvláknovou DNA
- Patří sem:
- realm: Duplodnaviria
- realm: Varidnaviria
- třída: Papovaviricetes (realm Monodnaviria)
- a dále:
- nezařazený řád: Ligamenvirales
- nezařazená čeleď: Ampullaviridae
- nezařazená čeleď: Baculoviridae
- nezařazená čeleď: Bicaudaviridae
- nezařazená čeleď: Clavaviridae
- nezařazená čeleď: Fuselloviridae
- nezařazená čeleď: Globuloviridae
- nezařazená čeleď: Guttaviridae
- nezařazená čeleď: Halspiviridae
- nezařazená čeleď: Hytrosaviridae
- nezařazená čeleď: Nimaviridae
- nezařazená čeleď: Nudiviridae
- nezařazená čeleď: Ovaliviridae
- nezařazená čeleď: Plasmaviridae
- nezařazená čeleď: Polydnaviridae
- nezařazená čeleď: Portogloboviridae
- nezařazená čeleď: Thaspiviridae
- nezařazená čeleď: Tristromaviridae
- nezařazené rody: Dinodnavirus, Rhizidiovirus
- Patří sem:
- Skupina II.: ssDNA viry, tedy viry s jednovláknovou DNA přepisovanou do mRNA totožné polarity
- Patří sem:
- většina realmu Monodnaviria, jmenovitě:
- říše: Loebvirae
- říše: Sangervirae
- říše: Trapavirae = čeleď Pleolipoviridae[pozn. 8]
- kmen: Cressdnaviricota
- třída: Mouviricetes = čeleď Bidnaviridae
- třída: Quintoviricetes
- a dále:
- nezařazená čeleď: Anelloviridae
- nezařazená čeleď: Finnlakeviridae
- nezařazená čeleď: Spiraviridae
- nezařazené rody: Tornovirus (neuznaný)
- většina realmu Monodnaviria, jmenovitě:
- Ačkoli oficiální Baltimorova klasifikace nezahrnuje satelitní nukleové kyseliny, z hlediska genomu by se ke skupině II. mohly přiřadit i
- Patří sem:
- nezařazená čeleď: Alphasatellitidae a
- nezařazená čeleď: Tolecusatellitidae.
- Skupina III.: dsRNA viry, tedy viry s dvouvláknovou RNA
- Patří sem následující taxony z realmu Riboviria:
- kmen: Duplornaviricota
- čeleď: Amalgaviridae
- čeleď: Birnaviridae
- čeleď: Partitiviridae
- čeleď: Picobirnaviridae
- čeleď: Polymycoviridae
- rod: Botybirnavirus
- Patří sem následující taxony z realmu Riboviria:
- Skupina IV.: ssRNA viry s pozitivní polaritou, tedy viry s jednovláknovou RNA přepisovanou do mRNA totožné polarity
- Patří sem následující taxony z realmu Riboviria:
- kmen: Kitrinoviricota
- kmen: Lenarviricota
- třída: Pisoniviricetes
- třída: Stelpaviricetes
- čeleď: Hypoviridae
- čeleď: Permutotetraviridae
- čeleď: Sarthroviridae
- rody: Albetovirus, Aumaivirus, Papanivirus, Virtovirus
- Patří sem následující taxony z realmu Riboviria:
- Skupina V.: ssRNA viry s negativní polaritou, tedy viry s jednovláknovou RNA přepisovanou do mRNA opačné polarity
- Patří sem:
- kmen Negarnaviricota (realm Riboviria)[pozn. 9]
- a dále:
- nezařazený rod: Deltavirus
- Patří sem:
- Skupina VI.: ssRNA viry s reverzní transkriptázou, tedy viry s jednovláknovou RNA reverzně přepisovanou do DNA
- Patří sem:
- většina řádu Ortervirales (realm Riboviria), jmenovitě:
- čeleď: Belpaoviridae
- čeleď: Retroviridae
- většina řádu Ortervirales (realm Riboviria), jmenovitě:
- Ačkoli oficiální Baltimorova klasifikace nezahrnuje retrotranspozony, z hlediska genomu by se ke skupině VI. mohly přiřadit i:
- čeleď: Metaviridae
- čeleď: Pseudoviridae
- Patří sem:
- Skupina VII.: dsDNA viry s reverzní transkriptázou, tedy viry s dvouvláknovou (částečně i jednovláknovou) DNA nejprve přepisovanou do RNA a následně reverzně přepisovanou do DNA
- Patří sem:
- řád Blubervirales = čeleď Hepadnaviridae (realm Riboviria)
- čeleď Caulimoviridae z řádu Ortervirales (realm Riboviria)
- Patří sem:
Systém LHT
Na tuto kapitolu je přesměrováno heslo LHT.
Systém navrhli v r. 1962 André Lwoff, R. W. Horne a P. Tournier. K zařazení druhů využili standardní taxony kmen, podkmen, třída, řád, podřád, čeleď, podčeleď a rod. Kritériem sdružování byly společně sdílené vlastnosti, nikoli napadané organismy. 5 hlavních charakteristik používaných ke klasifikaci bylo:
- druh nukleové kyseliny genomu (DNA, RNA),
- symetrie kapsidy (šroubovice, dvacetistěn, složitý tvar),
- přítomnost či nepřítomnost obálky,
- rozměry virionu a kapsidy,
- počet kapsomer.
V témž roce byla klasifikace schválena Prozatímním výborem pro nomenklaturu virů (Provisional Committee on Nomenclature of Virus – PNVC) Mezinárodní asociace mikrobiologických společností (International Association of Microbiological Societies – IAMS).
V dnešní době se již systém LHT nepoužívá, ale názvy některých taxonů přetrvávají v systému ICTV. Do úrovně čeledí vypadal následovně:[57]
- Kmen Vira (rozdělen na 2 podkmeny)
- Podkmen Deoxyvira (DNA viry)
- Třída Deoxybinala (duální symetrie)
- Řád Urovirales
- Čeleď Phagoviridae
- Řád Urovirales
- Třída Deoxyhelica (helikální symetrie – šroubovice)
- Řád Chitovirales
- Čeleď Poxviridae
- Řád Chitovirales
- Třída Deoxycubica (kubická symetrie – mnohostěn)
- Řád Peplovirales
- Čeleď Herpesviridae (162 kapsomer)
- Řád Haplovirales (bez obálky)
- Čeleď Iridoviridae (812 kapsomer)
- Čeleď Adenoviridae (252 kapsomer)
- Čeleď Papiloviridae (72 kapsomer)
- Čeleď Paroviridae (32 kapsomer)
- Čeleď Microviridae (12 kapsomer)
- Řád Peplovirales
- Třída Deoxybinala (duální symetrie)
- Podkmen Ribovira (RNA viry)
- Třída Ribocubica (kubická symetrie – mnohostěn)
- Řád Togovirales
- Čeleď Arboviridae
- Řád Lymovirales
- Čeleď Napoviridae
- Čeleď Reoviridae
- Řád Togovirales
- Třída Ribohelica (helikální symetrie – šroubovice)
- Řád Sagovirales
- Čeleď Stomataviridae
- Čeleď Paramyxoviridae
- Čeleď Myxoviridae
- Řád Rhabdovirales
- Podřád Flexiviridales
- Čeleď Mesoviridae
- Čeleď Peptoviridae
- Podřád Rigidovirales
- Čeleď Pachyviridae
- Čeleď Protoviridae
- Čeleď Polichoviridae
- Podřád Flexiviridales
- Řád Sagovirales
- Třída Ribocubica (kubická symetrie – mnohostěn)
- Podkmen Deoxyvira (DNA viry)
Odkazy
Poznámky
- ↑ Český ekvivalent anglického realm není dosud ustálen. Někdy se překládá jako doména[4], tou je však zpravidla míněn taxon, anglicky zvaný domain. Takto míněná doména je však ve vztahu k virům používána výjimečně a nemá jednoznačné vymezení: Buď zahrnuje všechny viry, nebo se používá jen na skupinu velkých jaderně-cytoplazmatických DNA virů (NCLDV), pro které jedna z hypotéz předpokládá, že jsou reliktem samostatné linie, tzv. čtvrté domény buněčných organismů, které svou stavbou připomínají a jejichž redukcí vznikly.[5][6][7] Vzájemné vztahy NCLDV a buněčných organismů jsou však komplexnější.[8] I sám ICTV ve svém „Prohlášení o shodě“ na hierarchii nových úrovních taxonomie virů[9] uvádí, že nejvyšší taxon je pojmenován realm, na rozdíl od domény v jiných taxonomiích, aby byl reflektován komplexní vzájemný vztah taxonomie virů vzhledem k jejich protějškům u buněčných organismů.
- ↑ Metagenomické analýzy odhalily mnoho nových fylogeneticky odlišných linií, které neodpovídají stávajícím klasifikačním schématům; lze proto očekávat vytváření nejen nových taxonů na úrovni čeledí a rodů, ale i možné hlubší změny v obsahu vyšších taxonů a topologii jejich fylogenetických stromů[20]
- ↑ Dříve používané názvy pro skupinu téhož vymezení: „NCLDV group“, „Megavirales“ (před zavedením taxonů vyšších než řád, proto s příponou řádu) [7][24][25][26]
- ↑ Metagenomické analýzy odhalily mnoho nových kladů na úrovni podčeledí či rodů, dosud neuznaných jako samostatné taxony[27]
- ↑ Dříve používaný název pro skupinu téhož vymezení: „superklad MAPI“ [8]
- ↑ Metagenomické analýzy odhalily mnoho nových kladů na úrovni rodů, dosud neuznaných jako samostatné taxony[50]
- ↑ Např. III. skupina (dsRNA viry) je považována za polyfyletickou, k ní patřící čeleď Amalgaviridae dokonce s velkou pravděpodobností vznikla rekombinací RNA virů dvou různých skupin Baltimorovy klasifikace.[54]
- ↑ a b Viry z čeleď Pleolipoviridae, řazené tradičně do skupiny II, tedy ssDNA virů, mohou mít ve skutečnosti genom různého druhu; Haloarcula hispanica pleomorphic virus 1 (HHPV-1) typu má např. kruhovou dsDNA, His2 virus lineární dsDNA, Halorunbrum pleomorphic virus 3 (HRPV-3) a Halogeometricum pleomorphic virus 1 (HGPV-1) mají v dsDNA úseky ssDNA.[55]
Reference
- ↑ FLORES, R.; RANDLES, J. W.; BAR-JOSEPH, M., DIENER, T. O. A proposed scheme for viroid classification and nomenclature. S. 623-629. Arch Virol. [online]. 1998. Svazek 143, s. 623-629. (anglicky)
- ↑ DIENER, T. O. The viroid: biological oddity or evolutionary fossil?. S. 137-184. Adv Virus Res. [online]. 2001. Svazek 57, s. 137-184. (anglicky)
- ↑ a b c The International Code of Virus Classification and Nomenclature. Odstavce 3.23, 3.27, 3.28, 3.29, 3.30. ICTV, říjen 2018. Dostupné online (anglicky)
- ↑ a b FORSTOVÁ, Jitka; FRAIBERK, Martin. Diverzita virů. S. 212-215. Živa [online]. Academia, 17. říjen 2019. Roč. 2019, čís. 5, s. 212-215. Dostupné online. ISSN 0044-4812.
- ↑ BOYER, Mickaël; MADOUI, Mohammed-Amine; GIMENEZ, Gregory, Bernard La Scola, Didier Raoult. Phylogenetic and Phyletic Studies of Informational Genes in Genomes Highlight Existence of a 4th Domain of Life Including Giant Viruses. E15530. PLoS One [online]. 2. prosinec 2010 [cit. 2011-05-03]. Svazek 5, čís. 12. Dostupné online. PDF [1]. ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0015530. (anglicky)
- ↑ COLSON, Philippe; GIMENEZ, Gregory; BOYER, Mickaël, Ghislain Fournous, Didier Raoult. The Giant Cafeteria roenbergensis Virus That Infects a Widespread Marine Phagocytic Protist Is a New Member of the Fourth Domain of Life. E18935. PLoS One [online]. 29. duben 2011 [cit. 2011-05-03]. Svazek 6, čís. 4. Dostupné online. PDF [2]. ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0018935. (anglicky)
- ↑ a b COLSON, Philippe; LAMBALLERIE, Xavier de; FOURNOUS, Ghislain; RAOULT, Didier. Reclassification of Giant Viruses Composing a Fourth Domain of Life in the New Order Megavirales. S. 321–332. Intervirology [online]. S. Karger AG, 14. duben 2012. Svazek 55, čís. 5, s. 321–332. Dostupné online. ISSN 1423-0100. DOI 10.1159/000336562. PMID 22508375. (anglicky)
- ↑ a b GUGLIELMINI, Julien; WOO, Anthony C.; KRUPOVIC, Mart; FORTERRE, Patrick; GAIA, Morgan. Diversification of giant and large eukaryotic dsDNA viruses predated the origin of modern eukaryotes. S. 19585-19592. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. National Academy of Sciences, 10. září 2019. Svazek 116, čís. 39, s. 19585-19592. Dostupné online. Dostupné také na: [3]. preprint [4]. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1912006116. PMID 31506349. (anglicky)
- ↑ a b GORBALENYA, Alexander E.; KRUPOVIC, Mart; MUSHEGIAN, Arcady, et al . (International Committee on Taxonomy of Viruses Executive Committee). The new scope of virus taxonomy: partitioning the virosphere into 15 hierarchical ranks. S. 668–674. Nature Microbiology [online]. Springer Nature Limited, 27. duben 2020. Svazek 5, čís. 5, s. 668–674. Dostupné online. Dostupné také na: [5]. ISSN 2058-5276. DOI 10.1038/s41564-020-0709-x. (anglicky)
- ↑ SIDDELL, Stuart G.; WALKER, Peter J.; LEFKOWITZ, Elliot J., et al . Binomial nomenclature for virus species: a consultation. S. 519–525. Archives of Virology [online]. Springer Nature Switzerland AG, 3. prosinec 2019. Svazek 165, čís. 2, s. 519–525. Dostupné online. Dostupné také na: [6]. ISSN 1432-8798. DOI 10.1007/s00705-019-04477-6. PMID 31797129. (anglicky)
- ↑ International Committee on Taxonomy of Viruses, Virus Taxonomy: 2019 Release. Dostupné online (anglicky)
- ↑ a b ICTV Master Species List 2019. Verze 1, 24. duben 2020. [https:// talk.ictvonline.org/files/master-species-lists/m/msl/9601 Dostupné online] (anglicky)
- ↑ International Committee on Taxonomy of Viruses, Pending Proposals Dostupné online (anglicky)
- ↑ a b KAUFFMAN, Kathryn M.; HUSSAIN, Fatima A.; YANG, Joy; AREVALO, Philip; BROWN, Julia M.; CHANG, William K.; VANINSBERGHE, David, ELSHERBINI, Joseph; SHARMA, Radhey S.; CUTLER, Michael B.; KELLY, Libusha; POLZ, Martin F. A major lineage of non-tailed dsDNA viruses as unrecognized killers of marine bacteria. Kapitola Letters. Nature [online]. Macmillan Publishers Limited, 24. leden 2018. Online před tiskem. Dostupné online. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/nature25474. (anglicky)
- ↑ a b IGNACIO-ESPINOZA, Julio Cesar; FUHRMAN, Jed A. A non-tailed twist in the viral tale. S. 38-39. Nature [online]. Macmillan Publishers Limited, 24. leden 2018. Svazek 554, čís. 7690, s. 38-39. Dostupné online. Dostupné také na: [7]. Dále dostupné na: [8]. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/d41586-018-00923-8. PMID 29388959. (anglicky)
- ↑ a b MIHULKA, Stanislav. Nově objevené viry jsou lstiví zabijáci bakterií. OSEL.cz [online]. 27. leden 2018. Dostupné online. ISSN 1214-6307.
- ↑ ADRIAENSSENS, Evelien M.; EDWARDS, Rob; NASH, John H. E., MAHADEVAN, Padmanabhan; SETO, Donald; ACKERMANN, Hans-Wolfgang; LAVIGNE, Rob; KROPINSKI, Andrew M. Integration of genomic and proteomic analyses in the classification of the Siphoviridae family. S. 144–154. Virology [online]. 14. listopad 2014. Svazek 477, s. 144–154. Dostupné online. ISSN 0042-6822. DOI 10.1016/j.virol.2014.10.016. PMID 25466308. (anglicky)
- ↑ POOJARI, Sudarsana; ALABI, Olufemi J.; FOFANOV, Viacheslav Y., NAIDU, Rayapati A. A Leafhopper-Transmissible DNA Virus with Novel Evolutionary Lineage in the Family Geminiviridae Implicated in Grapevine Redleaf Disease by Next-Generation Sequencing. S. 1-17. PLoS ONE [online]. 5. červen 2013. Svazek 8, čís. 6: e64194, s. 1-17. Dostupné online. ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0064194. (anglicky)
- ↑ a b GRONENBORN, Bruno; RANDLES, John W.; KNIERIM, Dennis; BARRIÈRE, Quentin; VETTEN, H. Josef; WARTHMANN, Norman; CORNU, David, SILEYE, Tiata; WINTER, Stephan; TIMCHENKO, Tatiana. Analysis of DNAs associated with coconut foliar decay disease implicates a unique single-stranded DNA virus representing a new taxon. Scientific Reports [online]. Macmillan Publishers Limited, 9. duben 2018. Svazek 8: 5698. Dostupné online. ISSN 2045-2322. DOI 10.1038/s41598-018-23739-y. (anglicky)
- ↑ SHI, Mang; LIN, Xian-Dan; TIAN, Jun-Hua; CHEN, Liang-Jun; CHEN, Xiao; LI, Ci-Xiu; QIN, Xin-Cheng, LI, Jun; CAO, Jian-Ping; EDEN, John-Sebastian; BUCHMANN, Jan; WANG, Wen; XU, Jianguo; HOLMES, Edward C.; ZHANG, Yong-Zhen. Redefining the invertebrate RNA virosphere. Nature [online]. 23. listopad 2016 [cit. 2016-12-07]. Online před tiskem. Dostupné online. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/nature20167. PMID 27880757. (anglicky)
- ↑ GRYBCHUK, Danyil; AKOPYANTS, Natalia S.; KOSTYGOV, Alexei Y.; KONOVALOVAS, Aleksandras; LYE, Lon-Fye; DOBSON, Deborah E.; ZANGGER, Haroun, FASEL, Nicolas; BUTENKO, Anzhelika; FROLOV, Alexander O.; VOTÝPKA, Jan; d’AVILA-LEVY, Claudia M.; KULICH, Pavel; MORAVCOVÁ, Jana; PLEVKA, Pavel; ROGOZIN, Igor B.; SERVA, Saulius; LUKEŠ, Julius; BEVERLEY, Stephen M.; YURCHENKO, Vyacheslav. Viral discovery and diversity in trypanosomatid protozoa with a focus on relatives of the human parasite Leishmania. S. E506-E515. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 28. prosinec 2017. Svazek 115, čís. 3, s. E506-E515. Dostupné online. PDF [9]. Dále dostupné na: [10]. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1717806115. PMID 29284754. (anglicky)
- ↑ kar (ČTK). Ostrava má svůj virus. Podle vědců se OstraVirus nepodobá žádnému jinému na Zemi. Kapitola Všda. ČT24.cz [online]. Česká televize, 4. duben 2018. Dostupné online.
- ↑ a b LAUBER, Chris; SEITZ, Stefan; MATTEI, Simone; SUH, Alexander; BECK, Jürgen; HERSTEIN, Jennifer; BÖROLD, Jacob, SALZBURGER, Walter; KADERALI, Lars; BARTENSCHLAGER, Ralf; BRIGGS, John A. G. Deciphering the Origin and Evolution of Hepatitis B Viruses by Means of a Family of Non-enveloped Fish Viruses. S. 387-399.e6. Cell Host & Microbe [online]. Cell Press, Elsevier Inc., 31. srpen 2017. Svazek 22, čís. 3, s. 387-399.e6. Dostupné online. Dostupné také na: [11]. ISSN 1931-3128. DOI 10.1016/j.chom.2017.07.019. PMID 28867387. (anglicky)
- ↑ COLSON, Philippe, a kol. “Megavirales”, a proposed new order for eukaryotic nucleocytoplasmic large DNA viruses. S. 2517-2521. Archives of Virology [online]. 29. červen 2013. Svazek 158, čís. 12, s. 2517-2521. Dostupné online. ISSN 1432-8798. DOI 10.1007/s00705-013-1768-6. PMID 23812617. (anglicky)
- ↑ FISCHER, Matthias G. Giant viruses come of age. S. 50-57. Current Opinion in Microbiology [online]. 19. březen 2016. Svazek 31, s. 50-57. Dostupné online. ISSN 1369-5274. DOI 10.1016/j.mib.2016.03.001. (anglicky)
- ↑ HALARY, S.; TEMMAM, S.; RAOULT, D.; DESNUES, C. Viral metagenomics: are we missing the giants?. S. 34-43. Current Opinion in Microbiology [online]. 19. březen 2016. Svazek 31, s. 34-43. Dostupné online. ISSN 1369-5274. DOI 10.1016/j.mib.2016.01.005. (anglicky)
- ↑ SCHULZ, Frederik; ROUX, Simon; PAEZ-ESPINO, David, et al . Giant virus diversity and host interactions through global metagenomics. S. 432–436. Nature [online]. Springer Nature Limited, 22. leden 2020. Svazek 578, čís. 7795, s. 432–436. Dostupné online. Dostupné také na: [12]. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/s41586-020-1957-x. (anglicky)
- ↑ BORATTO, Paulo V. M.; OLIVEIRA, Graziele P.; MACHADO, Talita B.; ANDRADE, Ana Cláudia S. P.; BAUDOIN, Jean-Pierre; KLOSE, Thomas; SCHULZ, Frederik, CHABRIÈRE, Eric; COLSON, Philippe; LEVASSEUR, Anthony; La SCOLA, Bernard; ABRAHÃO, Jônatas S. A mysterious 80 nm amoeba virus with a near-complete “ORFan genome” challenges the classification of DNA viruses. bioRχiv [online]. Cold Spring Harbor Laboratory, 28. leden 2020. Preprint. Dostupné online. Dostupné také na: [13]. DOI 10.1101/2020.01.28.923185. (anglicky)
- ↑ LEGENDRE, Matthieu; LARTIGUE, Audrey; BERTAUX, Lionel; JEUDY, Sandra; BARTOLI, Julia; LESCOT, Magali; ALEMPIC, Jean-Marie, RAMUS, Claire; BRULEY, Christophe; LABADIE, Karine; SHMAKOVA, Lyubov; RIVKINA, Elizaveta; COUTÉ, Yohann; ABERGEL, Chantal; CLAVERIE, Jean-Michel. In-depth study of Mollivirus sibericum, a new 30,000-y-old giant virus infecting Acanthamoeba. S. E5327–E5335. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 8. září 2015. Svazek 112, čís. 38, s. E5327–E5335. Dostupné online. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1510795112. PMID 26351664. (anglicky)
- ↑ a b YOSHIKAWA, Genki; BLANC-MATHIEU, Romain; SONG, Chihong; KAYAMA, Yoko; MOCHIZUKI, Tomohiro; MURATA, Kazuyoshi; OGATA, Hiroyuki, TAKEMURA, Masaharu. Medusavirus, a novel large DNA virus discovered from hot spring water. Journal of Virology [online]. American Society for Microbiology, 6. únor 2019. Svazek 93, čís. 8: e02130-18. Dostupné online. Dostupné také na: [14]. ISSN 1098-5514. DOI 10.1128/JVI.02130-18. PMID 30728258. (anglicky)
- ↑ MIHULKA, Stanislav. Veliký Medusavirus promění bezbranné améby v kámen. OSEL.cz [online]. 25. únor 2019. Dostupné online. ISSN 1214-6307.
- ↑ a b YUTIN, Natalya; KOONIN, Eugene V. Pandoraviruses are highly derived phycodnaviruses. S. 1-8. Biology Direct [online]. 23. říjen 2013. Svazek 8, čís. 25, s. 1-8. Dostupné online. PDF [15]. DOI 10.1186/1745-6150-8-25. (anglicky)
- ↑ a b PHILIPPE, Nadège, et al. Pandoraviruses: Amoeba Viruses with Genomes Up to 2.5 Mb Reaching That of Parasitic Eukaryotes. S. 281-286. Science [online]. 19. červenec 2013. Svazek 341, čís. 6143, s. 281-286. Dostupné online. ISSN 1095-9203. DOI 10.1126/science.1239181. (anglicky)
- ↑ a b MIHULKA, Stanislav: Mimiviry jsou out, teď vládnou pandoraviry! O.S.E.L., 20. červenec 2013. Dostupné online
- ↑ ARSLAN, Defne, et al. Distant Mimivirus relative with a larger genome highlights the fundamental features of Megaviridae. S. 17486–17491. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 18. říjen 2011. Svazek 108, čís. 42, s. 17486–17491. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1110889108. (anglicky)
- ↑ YOOSUF, Niyaz, et al. Related Giant Viruses in Distant Locations and Different Habitats: Acanthamoeba polyphaga moumouvirus Represents a Third Lineage of the Mimiviridae That Is Close to the Megavirus Lineage. S. 1324-1330. Genome Biol. Evol. [online]. 4. prosinec 2012. Svazek 4, čís. 12, s. 1324-1330. ISSN 1759-6653. DOI 10.1093/gbe/evs109. (anglicky)
- ↑ DESNUES, Christelle; LA SCOLA, Bernard; YUTIN, Natalya, FOURNOUS, Ghislain; ROBERT, Catherine; AZZA, Saïd; JARDOT, Priscilla; MONTEIL, Sonia; CAMPOCASSO, Angélique; KOONIN, Eugene V.; RAOULT, Didier. Provirophages and transpovirons as the diverse mobilome of giant viruses. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 15. říjen 2012. Online před tiskem. Dostupné online. DOI 10.1073/pnas.1208835109. (anglicky)
- ↑ a b RODRIGUES, Rodrigo Araújo Lima; MOUGARI, Said; COLSON, Phillipe; LA SCOLA, Bernard; ABRAHÃO, Jônatas Santos. “ Tupanvirus”, a new genus in the family Mimiviridae. S. 325–331. Archives of Virology [online]. Springer Nature Switzerland AG, 5. říjen 2018. Svazek 164, čís. 1, s. 325–331. Dostupné online. Dostupné také na: [16]. ISSN 1432-8798. DOI 10.1007/s00705-018-4067-4. PMID 30291500. (anglicky)
- ↑ ABRAHÃO, Jônatas; SILVA, Lorena; SANTOS SILVA, Ludmila; KHALIL, Jacques Yaacoub Bou; RODRIGUES, Rodrigo; ARANTES, Thalita; ASSIS, Felipe, BORATTO, Paulo; ANDRADE, Miguel; GEESSIEN KROON, Erna; RIBEIRO, Bergmann; BERGIER, Ivan; SELIGMANN, Herve; GHIGO, Eric; COLSON, Philippe; LEVASSEUR, Anthony KROEMER, ; Guido; RAOULT, Didier; La SCOLA, Bernard. Tailed giant Tupanvirus possesses the most complete translational apparatus of the known virosphere. Nature Communications [online]. Macmillan Publishers Limited, 27. únor 2018. Svazek 9: 749. Dostupné online. ISSN 2041-1723. DOI 10.1038/s41467-018-03168-1. (anglicky)
- ↑ a b c d e SCHULZ, Frederik; YUTIN, Natalya; IVANOVA, Natalia N.; ORTEGA, Davi R.; LEE, Tae Kwon; VIERHEILIG, Julia; DAIMS, Holger, HORN, Matthias; WAGNER, Michael; JENSEN, Grant J.; KYRPIDES, Nikos C.; KOONIN, Eugene V.; WOYKE, Tanja. Giant viruses with an expanded complement of translation system components. S. 82-85. Science [online]. 7. duben 2017. Svazek 356, čís. 6333, s. 82-85. Dostupné online. ISSN 1095-9203. DOI 10.1126/science.aal4657. PMID 28386012. (anglicky)
- ↑ a b LEGENDRE, Matthieu; BARTOLI, Julia; SHMAKOVA, Lyubov, JEUDY, Sandra; LABADIE, Karine; ADRAIT, Annie; LESCOT, Magali; POIROT, Olivier; BERTAUX, Lionel; BRULEY, Christophe; COUTÉ, Yohann; RIVKINA, Elizaveta; ABERGEL, Chantal; CLAVERIE, Jean-Michel. Thirty-thousand-year-old distant relative of giant icosahedral DNA viruses with a pandoravirus morphology. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 3. březen 2014. Online před tiskem. Dostupné online. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1320670111. (anglicky)
- ↑ YONG, Ed. Giant virus resurrected from 30,000-year-old ice. Nature News [online]. 3. březen 2014. Dostupné online. ISSN 1476-4687. DOI doi:10.1038/nature.2014.14801. (anglicky)
- ↑ Vědci oživili 30 tisíc let starý virus z ledu. Týden [online]. 4. březen 2014. Dostupné online.
- ↑ ANDREANI, Julien; AHERFI, Sarah; KHALIL, Jacques Yaacoub Bou; DI PINTO, Fabrizio; BITAM, Idir; RAOULT, Didier; COLSON, Philippe, La SCOLA, Bernard. Cedratvirus, a Double-Cork Structured Giant Virus, is a Distant Relative of Pithoviruses. S. 1-11. Viruses [online]. MDPI AG, 3. listopad 2016. Svazek 8, čís. 11: 300, s. 1-11. Dostupné online. Dostupné také na: [17]. ISSN 1999-4915. DOI 10.3390/v8110300. PMID 27827884. (anglicky)
- ↑ ANDREANI, Julien; KHALIL, Jacques Y. B.; BAPTISTE, Emeline; HASNI, Issam; MICHELLE, Caroline; RAOULT, Didier; LEVASSEUR, Anthony. Orpheovirus IHUMI-LCC2: A New Virus among the Giant Viruses. Frontiers in Microbiology [online]. Frontiers Media SA, 22. leden 2018. Roč. 8: 2643. Dostupné online. Dostupné také na: [18]. Dále dostupné na: [19]. ISSN 1664-302X. DOI 10.3389/fmicb.2017.02643. PMID 29403444. (anglicky)
- ↑ RETENO, Dorine Gaëlle I.; BENAMAR, Samia; KHALIL, Jacques Bou; ANDREANI, Julien; ARMSTRONG, Nicholas; KLOSE, Thomas; ROSSMANN, Michael, COLSON, Philippe; RAOULT, Didier; La SCOLA, Bernard. Faustovirus, an Asfarvirus-Related New Lineage of Giant Viruses Infecting Amoebae. S. 6585-6594. Journal of Virology [online]. 15. duben 2015. Svazek 89, čís. 13, s. 6585-6594. Dostupné online. ISSN 1098-5514. DOI 10.1128/JVI.00115-15. (anglicky)
- ↑ BENAMAR, Samia; RETENO, Dorine Gaëlle I.; BANDALY, Victor; LABAS, Noémie; RAOULT, Didier; LA SCOLA, Bernard. Faustoviruses: Comparative Genomics of New Megavirales Family Members. S. 1-9. Frontiers in Microbiology [online]. 5. únor 2016. Svazek 7, čís. 3, s. 1-9. Dostupné online. Dostupné také na: [20]. DOI 10.3389/fmicb.2016.00003. (anglicky)
- ↑ BAJRAI, Leena H.; BENAMAR, Samia; AZHAR, Esam I.; ROBERT, Catherine; LEVASSEUR, Anthony; RAOULT, Didier; LA SCOLA, Bernard. Kaumoebavirus, a New Virus That Clusters with Faustoviruses and Asfarviridae. S. 1-10. Viruses [online]. MDPI AG, 28. říjen 2016. Svazek 8, čís. 11: 278, s. 1-10. Dostupné online. Dostupné také na: [21]. ISSN 1999-4915. DOI 10.3390/v8110278. PMID 27801826. (anglicky)
- ↑ ANDREANI, Julien; KHALIL, Jacques Yaacoub Bou; SEVVANA, Madhumati; BENAMAR, Samia; DI PINTO, Fabrizio; BITAM, Idir; COLSON, Philippe, KLOSE, Thomas; ROSSMANN, Michael G.; RAOULT, Didier; La SCOLA, Bernard. Pacmanvirus, a new giant icosahedral virus at the crossroads between Asfarviridae and faustoviruses. S. 1-11. Journal of Virology [online]. American Society for Microbiology, 26. červen 2017. Svazek 91, čís. 14: e00212-17, s. 1-11. Dostupné online. Dostupné také na: [22]. ISSN 1098-5514. DOI 10.1128/JVI.00212-17. PMID 28446673. (anglicky)
- ↑ PAEZ-ESPINO, David; ZHOU, Jinglie; ROUX, Simon, et al . Diversity, evolution, and classification of virophages uncovered through global metagenomics. Microbiome [online]. BioMed Central Ltd, 10. prosinec 2019. Svazek 7, čís. 1: 157. Dostupné online. Dostupné také na: [23]. ISSN 2049-2618. DOI 10.1186/s40168-019-0768-5. PMID 31823797. (anglicky)
- ↑ NG, Terry Fei Fan; MANIRE, Charles; BORROWMAN, Kelly, LANGER, Tammy; EHRHART, Llewellyn; BREITBART, Mya. Discovery of a Novel Single-Stranded DNA Virus from a Sea Turtle Fibropapilloma by Using Viral Metagenomics. S. 2500-2509. Journal of Virology [online]. 30. prosinec 2008. Svazek 83, čís. 6, s. 2500-2509. Dostupné online. Dostupné také na: [24]. Dále dostupné na: [25]. ISSN 1098-5514. DOI 10.1128/JVI.01946-08. PMID 19116258. (anglicky)
- ↑ BALTIMORE, D. Expression of animal virus genomes. Bacteriol Rev.. 1971, roč. 35, čís. 3, s. 235-41. Dostupné online. ISSN 0005-3678.
- ↑ RACANIELLO, Vincent. Simplifying virus classification: The Baltimore system [online]. Virology Blog, 2009. Dostupné online.
- ↑ KRUPOVIC, Mart; DOLJA, Valerian V.; KOONIN, Eugene V. Plant viruses of the Amalgaviridae family evolved via recombination between viruses with double-stranded and negative-strand RNA genomes. S. 1-7. Biology Direct [online]. 29. březen 2015. Svazek 10, čís. 12, s. 1-7. Dostupné online. PDF [26]. DOI 10.1186/s13062-015-0047-8. (anglicky)
- ↑ BAMFORD, Dennis H.; PIETILÄ, Maija K.; ROINE, Elina; ATANASOVA, Nina S.; DIENSTBIER, Ana; OKSANEN, Hanna M., a ICTV Report Consortium. The Online (10th) Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses [online]. 10. vyd. 2017-09-20, rev. 2017-09-21. Kapitola Pleolipoviridae. (anglicky)
- ↑ Bunyaviridae Study Group: Create a new order, Bunyavirales, to accommodate nine families (eight new, one renamed) comprising thirteen genera. Proposal to ICTV, Nr. 2016.030a-vM, 2016. Dostupné online (anglicky)
- ↑ LWOFF, André; HORNE, R. W.; TOURNIER, P. A system of viruses. S. 51-55. Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. [online]. 1962. Svazek 27, s. 51-55. PMID 13931895. (anglicky)
Externí odkazy
Obrázky, zvuky či videa k tématu Klasifikace virů na Wikimedia Commons - (anglicky) ViralZone – podrobný přehled virů s popisy a schematickými obrázky kapsid
