Klasifikace virů: Porovnání verzí

Z Wikipedie, otevřené encyklopedie
Interaktivně procházet historii
← Přejít na předchozí porovnáníPřejít na další porovnání →
Smazaný obsah Přidaný obsah
VizuálníWikitext
aktualizace dle nového vydání reference
aktualizace + ref
Řádek 416: Řádek 416:


===„Megavirales“===
===„Megavirales“===
*'''Řád (neuznaný): ''Megavirales''''' (7 čeledí, 3 neuznané čeledi, 1 nezařazený rod)<ref name="Moumouvirus" /><ref name="Colson_2013">{{Citace elektronického periodika
*'''Řád (neuznaný): ''Megavirales''''' (7 čeledí, 2 neuznané čeledi, 1 uznaný a 2 neuznané nezařazené rody)<ref name="Moumouvirus" /><ref name="Colson_2013">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Colson
| příjmení = Colson
| jméno = Philippe
| jméno = Philippe
Řádek 436: Řádek 436:
| pmid = 23812617
| pmid = 23812617
| jazyk = anglicky
| jazyk = anglicky
}}</ref><ref name="Megavirales" group="pozn." />
}}</ref>
*::*Nezařazený rod: ''Dinodnavirus''
*::*Nezařazený rod: ''Dinodnavirus''
*::*Nezařazený rod (neuznaný): ''Faustovirus''<ref name="Reteno_2015">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Reteno
| jméno = Dorine Gaëlle I.
| příjmení2 = Benamar
| jméno2 = Samia
| příjmení3 = Khalil
| jméno3 = Jacques Bou
| příjmení4 = Andreani
| jméno4 = Julien
| příjmení5 = Armstrong
| jméno5 = Nicholas
| příjmení6 = Klose
| jméno6 = Thomas
| příjmení7 = Rossmann
| jméno7 = Michael
| spoluautoři = COLSON, Philippe; RAOULT, Didier; La SCOLA, Bernard.
| titul = Faustovirus, an Asfarvirus-Related New Lineage of Giant Viruses Infecting Amoebae
| periodikum = Journal of Virology
| rok vydání = 2015
| měsíc vydání = duben
| den vydání = 15
| ročník = 89
| typ ročníku = svazek
| číslo = 13
| strany = 6585-6594
| url = http://jvi.asm.org/content/89/13/6585.full
| issn = 1098-5514
| doi = 10.1128/JVI.00115-15
| pmid =
| jazyk = anglicky
}}</ref><ref name="Benamar_2016">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Benamar
| jméno = Samia
| příjmení2 = Reteno
| jméno2 = Dorine Gaëlle I.
| příjmení3 = Bandaly
| jméno3 = Victor
| příjmení4 = Labas
| jméno4 = Noémie
| příjmení5 = Raoult
| jméno5 = Didier
| příjmení6 = La Scola
| jméno6 = Bernard
| titul = Faustoviruses: Comparative Genomics of New ''Megavirales'' Family Members
| periodikum = Frontiers in Microbiology
| rok vydání = 2016
| měsíc vydání = únor
| den vydání = 5
| ročník = 7
| typ ročníku = svazek
| číslo = 3
| strany = 1-9
| url = http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fmicb.2016.00003/full
| url2 = https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4742530/
| issn =
| doi = 10.3389/fmicb.2016.00003
| pmid =
| jazyk = anglicky
}}</ref>
*::*Nezařazený rod (neuznaný): ''Mollivirus''<ref name="Legendre_2015">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Legendre
| jméno = Matthieu
| příjmení2 = Lartigue
| jméno2 = Audrey
| příjmení3 = Bertaux
| jméno3 = Lionel
| příjmení4 = Jeudy
| jméno4 = Sandra
| příjmení5 = Bartoli
| jméno5 = Julia
| příjmení6 = Lescot
| jméno6 = Magali
| příjmení7 = Alempic
| jméno7 = Jean-Marie
| spoluautoři = RAMUS, Claire; BRULEY, Christophe; LABADIE, Karine; SHMAKOVA, Lyubov; RIVKINA, Elizaveta; COUTÉ, Yohann; ABERGEL, Chantal; CLAVERIE, Jean-Michel.
| titul = In-depth study of ''Mollivirus sibericum'', a new 30,000-y-old giant virus infecting ''Acanthamoeba''
| periodikum = Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS)
| rok vydání = 2015
| měsíc vydání = září
| den vydání = 8
| ročník = 112
| typ ročníku = svazek
| číslo = 38
| strany = E5327–E5335
| poznámky =
| url = http://www.pnas.org/content/112/38/E5327.full
| issn = 1091-6490
| doi = 10.1073/pnas.1510795112
| pmid = 26351664
| jazyk = anglicky
}}</ref>
**Nezařazená čeleď: ''Ascoviridae'' (2 rody)<ref name="Megavirales" group="pozn." />
**Nezařazená čeleď: ''Ascoviridae'' (2 rody)<ref name="Megavirales" group="pozn." />
**:*Rod: ''Ascovirus''
**:*Rod: ''Ascovirus''
Řádek 453: Řádek 544:
**:*Rod (neuznaný): ''Lausannevirus''
**:*Rod (neuznaný): ''Lausannevirus''
**:*Rod (neuznaný): ''Tunisvirus''
**:*Rod (neuznaný): ''Tunisvirus''
**Nezařazená čeleď (neuznaná): ''Megaviridae'' (1 neuznaný rod; v případě ztotožnění s neuznanou čeledí ''Mimiviridae'' 2 rody a 3 neuznané rody){{#tag:ref|Vzhledem k příbuznosti je navrhováno vyčlenění čeledí ''Ascoviridae'', ''Asfarviridae'', ''Iridoviridae'', ''Marseilleviridae'', ''Megaviridae'', ''Mimiviridae'', ''Phycodnaviridae'' a ''Poxviridae'' do zvláštního řádu '''''Megavirales'''''.<ref name="Moumouvirus" /><ref name="Colson_2013" /><ref>ICTV: [http://talk.ictvonline.org/files/proposals/taxonomy_proposals_fungal1/m/fung02/4649.aspx Taxonomy Proposals]</ref> Pracovní skupina ICTV Poxviridae Study Group zatím neodsouhlasila zařazení poxvirů do navrhovaného řádu. Do řádu by pravděpodobně také náležely navrhované čeledi ''Pandoraviridae'' (vzhledem k blízkosti k čeledi ''Phycodnaviridae'')<ref name="Yutin_2013">{{Citace elektronického periodika
**Nezařazená čeleď: ''Mimiviridae'' (2 rody, 3 neuznané rody){{#tag:ref|Vzhledem k příbuznosti je navrhováno vyčlenění čeledí ''Ascoviridae'', ''Asfarviridae'', ''Iridoviridae'', ''Marseilleviridae'', ''Mimiviridae'', ''Phycodnaviridae'' a ''Poxviridae'' do zvláštního řádu '''''Megavirales'''''.<ref name="Moumouvirus" /><ref name="Colson_2013" /> Do řádu by pravděpodobně také náležely navrhované čeledi ''Pandoraviridae'' (vzhledem k blízkosti k čeledi ''Phycodnaviridae'')<ref name="Yutin_2013">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Yutin
| příjmení = Yutin
| jméno = Natalya
| jméno = Natalya
Řádek 474: Řádek 565:
| pmid =
| pmid =
| jazyk = anglicky
| jazyk = anglicky
}}</ref> a ''Pithoviridae'' (vzhledem k blízkosti k čeledím ''Iridoviridae'' a ''Marseilleviridae'')<ref name="Claverie_2014" />, jakož i nezařazený rod ''Dinodnavirus'' (vzhledem k blízkosti k čeledi ''Asfarviridae'')<ref name="Dinodnavirus" />.|group="pozn."|name="Megavirales"}}
}}</ref> a ''Pithoviridae'' (vzhledem k blízkosti k čeledím ''Iridoviridae'' a ''Marseilleviridae'')<ref name="Claverie_2014" />, jakož i nezařazený rod ''Dinodnavirus'' (vzhledem k blízkosti k čeledi ''Asfarviridae'')<ref name="Dinodnavirus" /> a neuznané rody ''Faustovirus'' (také blízký k ''Asfarviridae'') a ''Mollivirus'' (blízký k navrhované čeledi ''Pandoraviridae'').<ref name="Fischer_2016">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Fischer
**:*Rod (neuznaný): ''Megavirus''<ref>{{Citace elektronického periodika
| jméno = Matthias G.
| titul = Giant viruses come of age
| periodikum = Current Opinion in Microbiology
| rok vydání = 2016
| měsíc vydání = březen
| den vydání = 19
| ročník = 31
| typ ročníku = svazek
| strany = 50-57
| url = http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S136952741630008X
| issn = 1369-5274
| doi = 10.1016/j.mib.2016.03.001
| pmid =
| jazyk = anglicky
}}</ref><ref name="Halary_2016">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Halary
| jméno = S.
| příjmení2 = Temmam
| jméno2 = S.
| příjmení3 = Raoult
| jméno3 = D.
| příjmení4 = Desnues
| jméno4 = C.
| titul = Viral metagenomics: are we missing the giants?
| periodikum = Current Opinion in Microbiology
| rok vydání = 2016
| měsíc vydání = březen
| den vydání = 19
| ročník = 31
| typ ročníku = svazek
| strany = 34-43
| url = http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1369527416000072
| issn = 1369-5274
| doi = 10.1016/j.mib.2016.01.005
| pmid =
| jazyk = anglicky
}}</ref>|group="pozn."|name="Megavirales"}}
**:*Rod: ''Cafeteriavirus''
**:*Rod: ''[[Mimivirus]]''
**:*Rod (neuznaný): ''[[Megavirus]]''<ref>{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Arslan
| příjmení = Arslan
| jméno = Defne
| jméno = Defne
Řádek 495: Řádek 626:
| jazyk = anglicky
| jazyk = anglicky
}}</ref>
}}</ref>
**Nezařazená čeleď: ''Mimiviridae'' (2 rody, 2 neuznané rody; v případě ztotožnění s neuznanou čeledí ''Megaviridae'' 2 rody a 3 neuznané rody)<ref name="Megavirales" group="pozn." />
**:*Rod: ''Cafeteriavirus''
**:*Rod: ''[[Mimivirus]]''
**:*Rod (neuznaný): ''Lentillevirus''<ref>{{Citace elektronického periodika
**:*Rod (neuznaný): ''Lentillevirus''<ref>{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Desnues
| příjmení = Desnues
Řádek 705: Řádek 833:
:*:*Rod: ''Ilarvirus''
:*:*Rod: ''Ilarvirus''
:*:*Rod: ''Oleavirus''
:*:*Rod: ''Oleavirus''
:*Nezařazená čeleď: ''[[:Kategorie:Bunyaviridae|Bunyaviridae]]'' (5 rodů, 2 neuznané rody){{#tag:ref|V r. 2016 bylo navrženo, aby byla čeleď ''Bunyaviridae'' pod novým názvem ''Peribunyaviridae'', společně s nově navrženými čeleděmi ''Feraviridae'', ''Fimoviridae'' (zahrnující dosud nezařazený rod ''Emaravirus''), ''Hantaviridae'', ''Jonviridae'', ''Nairoviridae'', ''Phasmaviridae'', ''Phenuiviridae'' (zahrnující dosud nezařazený rod ''Tenuivirus'') a ''Tospoviridae'' do nově vytvořeného samostatného řádu '''''Bunyavirales'''''.<ref name="Bunyaviridae Study Group_2016">Bunyaviridae Study Group: Create a new order, ''Bunyavirales'', to accommodate nine families (eight new, one renamed) comprising thirteen genera. Proposal to ICTV, Nr. 2016.030a-vM, 2016. [https://talk.ictvonline.org/files/proposals/taxonomy_proposals_plant1/m/plant02/6426 Dostupné online] (anglicky)</ref>|group="pozn."|name="Bunyavirales"}}
:*Nezařazená čeleď: ''[[:Kategorie:Bunyaviridae|Bunyaviridae]]'' (5 rodů, 2 neuznané rody)
:*:*Rod: ''[[Hantavirus]]''
:*:*Rod: ''[[Hantavirus]]''
:*:*Rod: ''Nairovirus''
:*:*Rod: ''Nairovirus''
Řádek 904: Řádek 1 032:
:*:*Rod: ''Influenzavirus B''
:*:*Rod: ''Influenzavirus B''
:*:*Rod: ''Influenzavirus C''
:*:*Rod: ''Influenzavirus C''
:*:*Rod (neuznaný): ''Influenzavirus D''<ref>ICTV: [http://talk.ictvonline.org/files/proposals/taxonomy_proposals_vertebrate1/m/vert01/4954.aspx Taxonomy Proposals]</ref>
:*:*Rod (neuznaný): ''Influenzavirus D''<ref>ICTV: [https://talk.ictvonline.org/files/proposals/animal_dsrna_and_ssrna-_viruses/m/animal_rna_minus_ec_approved/6262 Taxonomy Proposals]</ref>
:*:*Rod: ''Isavirus''
:*:*Rod: ''Isavirus''
:*:*Rod: ''Quaranjavirus''
:*:*Rod: ''Quaranjavirus''
Řádek 1 096: Řádek 1 224:
:*:*Rod: ''Tobravirus''
:*:*Rod: ''Tobravirus''


:::*Nezařazené rody: ''Albetovirus'', ''Aumaivirus'', ''Bacilladnavirus'', ''Botybirnavirus'', ''Cilevirus'', ''Deltavirus'', ''Dinodnavirus'' (pravděpodobně by patřil do neuznaného řádu ''Megavirales''<ref name="Dinodnavirus"> [http://talk.ictvonline.org/files/ictv_official_taxonomy_updates_since_the_8th_report/m/fungal-official/4091/download.aspx&sa=U&ei=ptXSUdIQxdO1BuTXgOgM&ved=0CCgQFjAB&usg=AFQjCNF_t_nyrQZhOe8K-fHM5Q_pf3lMDQ ICTV taxonomic proposal 2009.001a/fF] (anglicky)]</ref>), ''Emaravirus'', ''Higrevirus'', ''Idaeovirus'', ''Ourmiavirus'', ''Papanivirus'', ''Polemovirus'', ''Rhizidiovirus'', ''Salterprovirus'', ''Sinaivirus'', ''Sobemovirus'', ''Tenuivirus'', ''Virtovirus''
:::*Nezařazené rody: ''Albetovirus'', ''Aumaivirus'', ''Bacilladnavirus'', ''Botybirnavirus'', ''Cilevirus'', ''Deltavirus'', ''Dinodnavirus'' (pravděpodobně by patřil do neuznaného řádu ''Megavirales''<ref name="Dinodnavirus"> [http://talk.ictvonline.org/files/ictv_official_taxonomy_updates_since_the_8th_report/m/fungal-official/4091/download.aspx&sa=U&ei=ptXSUdIQxdO1BuTXgOgM&ved=0CCgQFjAB&usg=AFQjCNF_t_nyrQZhOe8K-fHM5Q_pf3lMDQ ICTV taxonomic proposal 2009.001a/fF] (anglicky)]</ref>), ''Emaravirus''<ref name="Bunyavirales" group="pozn." />, ''Higrevirus'', ''Idaeovirus'', ''Ourmiavirus'', ''Papanivirus'', ''Polemovirus'', ''Rhizidiovirus'', ''Salterprovirus'', ''Sinaivirus'', ''Sobemovirus'', ''Tenuivirus''<ref name="Bunyavirales" group="pozn." />, ''Virtovirus''


==Baltimorova klasifikace==
==Baltimorova klasifikace==
Řádek 1 148: Řádek 1 276:
*:**Čeleď: ''Iridoviridae''
*:**Čeleď: ''Iridoviridae''
*:**Čeleď: ''Marseilleviridae''
*:**Čeleď: ''Marseilleviridae''
*:**Čeleď (neuznaná): ''Megaviridae''
*:**Čeleď: ''Mimiviridae''
*:**Čeleď: ''Mimiviridae''
*:**Čeleď (neuznaná): ''Pandoraviridae''
*:**Čeleď (neuznaná): ''Pandoraviridae''
Řádek 1 155: Řádek 1 282:
*:**Čeleď: ''Poxviridae''
*:**Čeleď: ''Poxviridae''
*:**Nezařazený rod: ''Dinodnavirus''
*:**Nezařazený rod: ''Dinodnavirus''
*:**Nezařazený rod (neuznaný): ''Faustovirus''
*:**Nezařazený rod (neuznaný): ''Mollivirus''
*:*a dále:
*:*a dále:
*:**'''Řád: ''Ligamenvirales''''' (celý)
*:**'''Řád: ''Ligamenvirales''''' (celý)

Verze z 1. 12. 2016, 18:41

Klasifikace virů je vzhledem k jejich rozmanitosti a proměnlivosti problematičtější než u buněčných organismů. Existuje proto více možných přístupů a z nich vzniklých klasifikačních systémů.

Nejstarší klasifikační systémy virů vycházely z klasifikace napadaných organismů. Byla to například Holmesova klasifikace z r. 1948, aplikující linnéovskou binominální nomenklaturu a členící viry na fágy (napadající bakterie), fytofágy (napadající rostliny) a zoofágy (napadající živočichy).

Později se viry začaly klasifikovat podle strukturních fyzikálních a chemických vlastností, jako je nosič genetické informace (RNA nebo DNA), velikost, tvar a symetrie kapsidu apod. K takovým klasifikačním systémům patří např. hierarchická klasifikace LHT z roku 1962, dnes již zastaralá.

V současnosti se stále používá zjednodušená klasifikace podle nosiče genetické informace a způsobu jejího přepisu, tak zvaná Baltimorova klasifikace z r. 1971.

Aktuální snahou biologických klasifikačních systémů je přirozenost z hlediska fylogenetické příbuznosti. O tu se snaží podrobný, každoročně aktualizovaný systém Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV).

Vzhledem k tomu, že není známo příliš typů subvirových činitelů (viroidy a virové satelity včetně virofágů a virusoidů), neexistuje pro ně zpravidla zvláštní systém a klasifikují se pouze podle nosiče genetické informace, případně i její velikosti. Výjimkou je klasifikační systém viroidů podle Florese z roku 1998, používající čeledi a rody. Také systém ICTV zahrnuje i viroidy (je do něj včleněna Floresova klasifikace) a nově (od r. 2015) vybrané satelity (i virofágy) se snahou respektovat jejich pravděpodobnou fylogenetickou příbuznost k jiným virům.

Systém ICTV

Mezinárodní komise pro klasifikaci virů (International Committee on Taxonomy of Viruses - ICTV) klasifikuje viry podobně jako buněčné organismy do řádů, čeledí a rodů. Snahou je přitom respektovat fylogenetickou příbuznost, tedy na základě genetické informace sdružovat taxony dané úrovně do skupin, u kterých lze předpokládat společného předka. Nejistota u fylogenetické příbuznosti však vede k existenci mnoha nezařazených taxonů.

Standardními příponami jsou:

  • pro řád: -virales
  • pro čeleď: -viridae (-virodae v případě viroidů)
  • pro podčeleď: -virinae
  • pro rod: -virus

Podle názvoslovného kódu ICTV se názvy všech těchto taxonů píší stejně jako jména druhů kurzívou.[1]

Aktuální klasifikace (ratifikovaná v květnu r. 2016) byla vydána pro stav k červenci r. 2015. Viry jsou systematicky kategorizovány do 7 řádů a 82 čeledí nezařazených do žádného řádu. Některé rody zůstávají nezařazeny.[2]

Klasifikace ICTV zahrnuje také viroidy (nezařazené čeledi Avsunviroidae a Pospiviroidae), vybrané virofágy (nezařazená čeled Lavidaviridae) či jiné satelity (např. nezařazená čeled Sarthoviridae a nezařazené rody Albetovirus, Aumaivirus, Papanivirus, Virtovirus) a retrotranspozony (nezařazené čeledi Metaviridae a Pseudoviridae).

V následujícím přehledu jsou navíc pro úplnost uvedeny i dosud neuznané navrhované taxony, vždy označené závorkou "(neuznaný/á)". Návrh plyne z uvedené reference (zpravidla vědeckého periodika nebo webové složky ICTV s návrhy, u kterých dosud neskončil proces k jejich uznání.[3]).

Caudovirales

  • Řád: Caudovirales (3 čeledi)
    • Čeleď: Myoviridae (5 podčeledí, 28 nezařazených rodů)
      • Nezařazený rod: Agatevirus
      • Nezařazený rod: Ap22virus
      • Nezařazený rod: B4virus
      • Nezařazený rod: Bastillevirus
      • Nezařazený rod: Bc431virus
      • Nezařazený rod: Bcep78virus
      • Nezařazený rod: Bcepmuvirus
      • Nezařazený rod: Biquartavirus
      • Nezařazený rod: Bxz1virus
      • Nezařazený rod: Cd119virus
      • Nezařazený rod: Cp51virus
      • Nezařazený rod: Cvm10virus
      • Nezařazený rod: Felixo1virus
      • Nezařazený rod: Hapunavirus
      • Nezařazený rod: Kpp10virus
      • Nezařazený rod: Muvirus
      • Nezařazený rod: Myohalovirus
      • Nezařazený rod: Nit1virus
      • Nezařazený rod: P1virus
      • Nezařazený rod: Pakpunavirus
      • Nezařazený rod: Pbunavirus
      • Nezařazený rod: Phikzvirus
      • Nezařazený rod: Rheph4virus
      • Nezařazený rod: Secunda5virus
      • Nezařazený rod: Tg1virus
      • Nezařazený rod: Vhmlvirus
      • Nezařazený rod: Vi1virus
      • Nezařazený rod: Wphvirus
      • Podčeleď: Eucampyvirinae (2 rody)
        • Rod: Cp220virus
        • Rod: Cp8virus
      • Podčeleď: Peduovirinae (2 rody)
        • Rod: Hp1virus
        • Rod: P2virus
      • Podčeleď: Spounavirinae (5 rodů)
        • Rod: Kayvirus
        • Rod: P100virus
        • Rod: Silviavirus
        • Rod: Spo1virus
        • Rod: Twortvirus
      • Podčeleď: Tevenvirinae (8 rodů)
        • Rod: Cc31virus
        • Rod: Js98virus
        • Rod: Rb49virus
        • Rod: Rb69virus
        • Rod: S16virus
        • Rod: Schizot4virus
        • Rod: Sp18virus
        • Rod: T4virus
      • Podčeleď: Vequintavirinae (3 rody)
        • Rod: Cr3virus
        • Rod: Se1virus
        • Rod: V5virus
    • Čeleď: Podoviridae (2 podčeledi, 14 nezařazených rodů)
      • Nezařazený rod: Bcep22likevirus
      • Nezařazený rod: Bpp1virus
      • Nezařazený rod: Cba41virus
      • Nezařazený rod: Epsilon15virus
      • Nezařazený rod: F116virus
      • Nezařazený rod: G7cvirus
      • Nezařazený rod: Lit1virus
      • Nezařazený rod: Luz24virus
      • Nezařazený rod: N4virus
      • Nezařazený rod: Nonanavirus
      • Nezařazený rod: P22virus
      • Nezařazený rod: Pagevirus
      • Nezařazený rod: Phieco32virus
      • Nezařazený rod: Vp5virus
      • Podčeleď: Autographivirinae (4 rody)
        • Rod: Kp34virus
        • Rod: Phikmvvirus
        • Rod: Sp6virus
        • Rod: T7virus
      • Podčeleď: Picovirinae (2 rody)
        • Rod: P68virus
        • Rod: Phi29virus
    • Čeleď: Siphoviridae (2 podčeledi, 57 nezařazených rodů, 3 neuznané nezařazené rody)
      • Nezařazený rod: Andromedavirus
      • Nezařazený rod: Barnyardvirus
      • Nezařazený rod: Bignuzvirus
      • Nezařazený rod: Biseptimavirus
      • Nezařazený rod: Bronvirus
      • Nezařazený rod: C2virus
      • Nezařazený rod: C5virus
      • Nezařazený rod: Cba181virus
      • Nezařazený rod: Cbastvirus
      • Nezařazený rod: Cecivirus
      • Nezařazený rod: Charlievirus
      • Nezařazený rod: Che8virus
      • Nezařazený rod: Che9cvirus
      • Nezařazený rod: Chivirus
      • Nezařazený rod: Cjw1virus
      • Nezařazený rod: Corndogvirus
      • Nezařazený rod: D3112virus
      • Nezařazený rod: D3virus
      • Nezařazený rod: E125virus
      • Nezařazený rod: Ff47virus
      • Nezařazený rod: Hk578virus
      • Nezařazený rod: L5virus
      • Nezařazený rod: Lambdavirus
      • Nezařazený rod: Liefievirus
      • Nezařazený rod: N15virus
      • Nezařazený rod: Nonagvirus
      • Nezařazený rod: Omegavirus
      • Nezařazený rod: P23virus
      • Nezařazený rod: P70virus
      • Nezařazený rod: Pbi1virus
      • Nezařazený rod: Pg1virus
      • Nezařazený rod: Phic31virus
      • Nezařazený rod: Phicbkvirus
      • Nezařazený rod: Phietavirus
      • Nezařazený rod: Phifelvirus
      • Nezařazený rod: Phijl1virus
      • Nezařazený rod: Psavirus
      • Nezařazený rod: Psimunavirus
      • Nezařazený rod: Reyvirus
      • Nezařazený rod: Sap6virus
      • Nezařazený rod: Septima3virus
      • Nezařazený rod: Seuratvirus
      • Nezařazený rod: Sextaecvirus
      • Nezařazený rod: Sfi11virus
      • Nezařazený rod: Sfi21dt1virus
      • Nezařazený rod: Sitaravirus
      • Nezařazený rod: Sk1virus
      • Nezařazený rod: Slashvirus
      • Nezařazený rod: Spbetavirus
      • Nezařazený rod: Ssp2virus
      • Nezařazený rod: T5virus
      • Nezařazený rod: Tm4virus
      • Nezařazený rod: Tp21virus
      • Nezařazený rod: Triavirus
      • Nezařazený rod: Wbetavirus
      • Nezařazený rod: Xp10virus
      • Nezařazený rod: Yuavirus
      • Nezařazený rod (neuznaný): Lebronvirus[4]
      • Nezařazený rod (neuznaný): Likavirus[4]
      • Nezařazený rod (neuznaný): R4virus[4]
      • Podčeleď: Guernseyvirinae (3 rody)
        • Rod: Jerseyvirus
        • Rod: K1gvirus
        • Rod: Sp31virus
      • Podčeleď: Tunavirinae (5 rodů, 1 neuznaný rod)
        • Rod: Kp36virus
        • Rod: Rogue1virus
        • Rod: Rtpvirus
        • Rod: T1virus
        • Rod: Tlsvirus
        • Rod (neuznaný): Jk06virus[5]

Herpesvirales

  • Řád: Herpesvirales (3 čeledi)
    • Čeleď: Alloherpesviridae (4 rody)
      • Rod: Batrachovirus
      • Rod: Cyprinivirus
      • Rod: Ictalurivirus
      • Rod: Salmonivirus
    • Čeleď: Herpesviridae (3 podčeledi)
    • Čeleď: Malacoherpesviridae (2 rody)
      • Rod: Aurivirus
      • Rod: Ostreavirus

Ligamenvirales

  • Řád: Ligamenvirales (2 čeledi)
    • Čeleď: Lipothrixviridae (4 rody)
      • Rod: Alphalipothrixvirus
      • Rod: Betalipothrixvirus
      • Rod: Deltalipothrixvirus
      • Rod: Gammalipothrixvirus
    • Čeleď: Rudiviridae (1 rod)
      • Rod: Rudivirus

Mononegavirales

  • Řád: Mononegavirales (8 čeledí, 5 nezařazených rodů)
    • Nezařazený rod: Anphevirus
    • Nezařazený rod: Arlivirus
    • Nezařazený rod: Chengtivirus
    • Nezařazený rod: Crustavirus
    • Nezařazený rod: Wastrivirus
    • Čeleď: Bornaviridae (1 rod)
      • Rod: Bornavirus
    • Čeleď: Filoviridae (3 rody)
    • Čeleď: Mymonaviridae (1 rod)
      • Rod: Sclerotimonavirus
    • Čeleď: Nyamiviridae (2 rody)
      • Rod: Nyavirus
      • Rod: Socyvirus
    • Čeleď: Paramyxoviridae (7 rodů)
      • Rod: Aquaparamyxovirus
      • Rod: Avulavirus
      • Rod: Ferlavirus
      • Rod: Henipavirus
      • Rod: Morbillivirus
      • Rod: Respirovirus
      • Rod: Rubulavirus
    • Čeleď: Pneumoviridae (2 rody)
      • Rod: Metapneumovirus
      • Rod: Pneumovirus
    • Čeleď: Rhabdoviridae (13 rodů)
      • Rod: Cytorhabdovirus
      • Rod: Dichorhavirus
      • Rod: Ephemerovirus
      • Rod: Lyssavirus
      • Rod: Novirhabdovirus
      • Rod: Nucleorhabdovirus
      • Rod: Perhabdovirus
      • Rod: Sigmavirus
      • Rod: Sprivivirus
      • Rod: Tibrovirus
      • Rod: Tupavirus
      • Rod: Varicosavirus
      • Rod: Vesiculovirus
    • Čeleď: Sunviridae (1 rod)
      • Rod: Sunshinevirus

Nidovirales

  • Řád: Nidovirales (4 čeledi)
    • Čeleď: Arteriviridae (1 rod)
      • Rod: Arterivirus
    • Čeleď: Coronaviridae (2 podčeledi)
      • Podčeleď: Coronavirinae (4 rody)
        • Rod: Alphacoronavirus
        • Rod: Betacoronavirus
        • Rod: Deltacoronavirus
        • Rod: Gammacoronavirus
      • Podčeleď: Torovirinae (2 rody)
        • Rod: Bafinivirus
        • Rod: Torovirus
    • Čeleď: Mesoniviridae (1 rod)
      • Rod: Alphamesonivirus
    • Čeleď: Roniviridae (1 rod)
      • Rod: Okavirus

Picornavirales

  • Řád: Picornavirales (5 čeledí a 2 nezařazené rody)
    • Nezařazený rod: Bacillarnavirus
    • Nezařazený rod: Labyrnavirus
    • Čeleď: Dicistroviridae (3 rody)
      • Rod: Aparavirus
      • Rod: Cripavirus
      • Rod: Triatovirus
    • Čeleď: Iflaviridae (1 rod)
      • Rod: Iflavirus
    • Čeleď: Marnaviridae (1 rod)
      • Rod: Marnavirus
    • Čeleď: Picornaviridae (31 rodů)
      • Rod: Aphthovirus
      • Rod: Aquamavirus
      • Rod: Avihepatovirus
      • Rod: Avisivirus
      • Rod: Cardiovirus
      • Rod: Cosavirus
      • Rod: Dicipivirus
      • Rod: Enterovirus
      • Rod: Erbovirus
      • Rod: Gallivirus
      • Rod: Hepatovirus
      • Rod: Hunnivirus
      • Rod: Kobuvirus
      • Rod: Kunsagivirus
      • Rod: Limnipivirus
      • Rod: Megrivirus
      • Rod: Mischivirus
      • Rod: Mosavirus
      • Rod: Oscivirus
      • Rod: Parechovirus
      • Rod: Pasivirus
      • Rod: Passerivirus
      • Rod: Potamipivirus
      • Rod: Rosavirus
      • Rod: Sakobuvirus
      • Rod: Salivirus
      • Rod: Sapelovirus
      • Rod: Senecavirus
      • Rod: Sicinivirus
      • Rod: Teschovirus
      • Rod: Tremovirus
    • Čeleď: Secoviridae (1 podčeleď a 5 nezařazených rodů)
      • Nezařazený rod: Cheravirus
      • Nezařazený rod: Sadwavirus
      • Nezařazený rod: Sequivirus
      • Nezařazený rod: Torradovirus
      • Nezařazený rod: Waikavirus
      • Podčeleď: Comovirinae (3 rody)
        • Rod: Comovirus
        • Rod: Fabavirus
        • Rod: Nepovirus

Tymovirales

  • Řád: Tymovirales (4 čeledi)
    • Čeleď: Alphaflexiviridae (7 rodů)
      • Rod: Allexivirus
      • Rod: Botrexvirus
      • Rod: Lolavirus
      • Rod: Mandarivirus
      • Rod: Platypuvirus
      • Rod: Potexvirus
      • Rod: Sclerodarnavirus
    • Čeleď: Betaflexiviridae (2 podčeledi)
      • Podčeleď: Quinvirinae (3 rody)
        • Rod: Carlavirus
        • Rod: Foveavirus
        • Rod: Robigovirus
      • Podčeleď: Trivirinae (8 rodů)
        • Rod: Capillovirus
        • Rod: Chordovirus
        • Rod: Citrivirus
        • Rod: Divavirus
        • Rod: Prunevirus
        • Rod: Tepovirus
        • Rod: Trichovirus
        • Rod: Vitivirus
    • Čeleď: Gammaflexiviridae (1 rod)
      • Rod: Mycoflexivirus
    • Čeleď: Tymoviridae (3 rody)
      • Rod: Maculavirus
      • Rod: Marafivirus
      • Rod: Tymovirus

„Megavirales“

  • Řád (neuznaný): Megavirales (7 čeledí, 2 neuznané čeledi, 1 uznaný a 2 neuznané nezařazené rody)[6][7][pozn. 1]
    • Nezařazený rod: Dinodnavirus
    • Nezařazený rod (neuznaný): Faustovirus[8][9]
    • Nezařazený rod (neuznaný): Mollivirus[10]
    • Nezařazená čeleď: Ascoviridae (2 rody)[pozn. 1]
      • Rod: Ascovirus
      • Rod: Toursvirus
    • Nezařazená čeleď: Asfarviridae (1 rod)[pozn. 1]
      • Rod: Asfivirus
    • Nezařazená čeleď: Iridoviridae (5 rodů)[pozn. 1]
      • Rod: Chloriridovirus
      • Rod: Iridovirus
      • Rod: Lymphocystivirus
      • Rod: Megalocytivirus
      • Rod: Ranavirus
    • Nezařazená čeleď: Marseilleviridae (1 rod, 2 neuznané rody)[pozn. 1]
      • Rod: Marseillevirus
      • Rod (neuznaný): Lausannevirus
      • Rod (neuznaný): Tunisvirus
    • Nezařazená čeleď: Mimiviridae (2 rody, 3 neuznané rody)[pozn. 1]
    • Nezařazená čeleď (neuznaná): Pandoraviridae[pozn. 1] (1 neuznaný rod)[18][19]
    • Nezařazená čeleď: Phycodnaviridae (6 rodů)[pozn. 1]
      • Rod: Chlorovirus
      • Rod: Coccolithovirus
      • Rod: Phaeovirus
      • Rod: Prasinovirus
      • Rod: Prymnesiovirus
      • Rod: Raphidovirus
    • Nezařazená čeleď (neuznaná): Pithoviridae[pozn. 1] (1 neuznaný rod)[12][20][21]
      • Rod (neuznaný): Pithovirus
    • Nezařazená čeleď: Poxviridae (2 podčeledi)[pozn. 1]
      • Podčeleď: Chordopoxvirinae (10 rodů)
        • Rod: Avipoxvirus
        • Rod: Capripoxvirus
        • Rod: Cervidpoxvirus
        • Rod: Crocodylidpoxvirus
        • Rod: Leporipoxvirus
        • Rod: Molluscipoxvirus
        • Rod: Orthopoxvirus
        • Rod: Parapoxvirus
        • Rod: Suipoxvirus
        • Rod: Yatapoxvirus
      • Podčeleď: Entomopoxvirinae (3 rody)
        • Rod: Alphaentomopoxvirus
        • Rod: Betaentomopoxvirus
        • Rod: Gammaentomopoxvirus

Nezařazené čeledi a rody

  • Nezařazená čeleď: Adenoviridae (5 rodů)
    • Rod: Atadenovirus
    • Rod: Aviadenovirus
    • Rod: Ichtadenovirus
    • Rod: Mastadenovirus
    • Rod: Siadenovirus
  • Nezařazená čeleď: Alphatetraviridae (2 rody)
    • Rod: Betatetravirus
    • Rod: Omegatetravirus
  • Nezařazená čeleď: Alvernaviridae (1 rod)
    • Rod: Dinornavirus
  • Nezařazená čeleď: Amalgaviridae (1 rod)
    • Rod: Amalgavirus
  • Nezařazená čeleď: Ampullaviridae (1 rod)
    • Rod: Ampullavirus
  • Nezařazená čeleď: Anelloviridae (12 rodů)
    • Rod: Alphatorquevirus
    • Rod: Betatorquevirus
    • Rod: Deltatorquevirus
    • Rod: Epsilontorquevirus
    • Rod: Etatorquevirus
    • Rod: Gammatorquevirus
    • Rod: Gyrovirus
    • Rod: Iotatorquevirus
    • Rod: Kappatorquevirus
    • Rod: Lambdatorquevirus
    • Rod: Thetatorquevirus
    • Rod: Zetatorquevirus
  • Nezařazená čeleď: Arenaviridae (2 rody)
    • Rod: Mammarenavirus
    • Rod: Reptarenavirus
  • Nezařazená čeleď: Ascoviridae – viz neuznaný řád Megavirales výše
  • Nezařazená čeleď: Asfarviridae – viz neuznaný řád Megavirales výše
  • Nezařazená čeleď: Astroviridae (2 rody)
    • Rod: Avastrovirus
    • Rod: Mamastrovirus
  • Nezařazená čeleď: Avsunviroidae (3 rody)
    • Rod: Avsunviroid
    • Rod: Elaviroid
    • Rod: Pelamoviroid
  • Nezařazená čeleď: Baculoviridae (4 rody)
    • Rod: Alphabaculovirus
    • Rod: Betabaculovirus
    • Rod: Deltabaculovirus
    • Rod: Gammabaculovirus
  • Nezařazená čeleď: Barnaviridae (1 rod)
    • Rod: Barnavirus
  • Nezařazená čeleď: Benyviridae (1 rod)
    • Rod: Benyvirus
  • Nezařazená čeleď: Bicaudaviridae (1 rod)
    • Rod: Bicaudavirus
  • Nezařazená čeleď: Bidnaviridae (1 rod)
    • Rod: Bidensovirus
  • Nezařazená čeleď: Birnaviridae (4 rody)
    • Rod: Aquabirnavirus
    • Rod: Avibirnavirus
    • Rod: Blosnavirus
    • Rod: Entomobirnavirus
  • Nezařazená čeleď: Bromoviridae (6 rodů)
    • Rod: Alfamovirus
    • Rod: Anulavirus
    • Rod: Bromovirus
    • Rod: Cucumovirus
    • Rod: Ilarvirus
    • Rod: Oleavirus
  • Nezařazená čeleď: Bunyaviridae (5 rodů, 2 neuznané rody)[pozn. 2]
  • Nezařazená čeleď: Caliciviridae (5 rodů)
    • Rod: Lagovirus
    • Rod: Nebovirus
    • Rod: Norovirus
    • Rod: Sapovirus
    • Rod: Vesivirus
  • Nezařazená čeleď: Carmotetraviridae (1 rod)
    • Rod: Alphacarmotetravirus
  • Nezařazená čeleď: Caulimoviridae (8 rodů)
    • Rod: Badnavirus
    • Rod: Caulimovirus
    • Rod: Cavemovirus
    • Rod: Petuvirus
    • Rod: Rosadnavirus
    • Rod: Solendovirus
    • Rod: Soymovirus
    • Rod: Tungrovirus
  • Nezařazená čeleď: Chrysoviridae (1 rod)
    • Rod: Chrysovirus
  • Nezařazená čeleď: Circoviridae (2 rody)
    • Rod: Circovirus
    • Rod: Cyclovirus
  • Nezařazená čeleď: Clavaviridae (1 rod)
    • Rod: Clavavirus
  • Nezařazená čeleď: Closteroviridae (4 rody)
    • Rod: Ampelovirus
    • Rod: Closterovirus
    • Rod: Crinivirus
    • Rod: Velarivirus
  • Nezařazená čeleď: Corticoviridae (1 rod)
    • Rod: Corticovirus
  • Nezařazená čeleď: Cystoviridae (1 rod)
    • Rod: Cystovirus
  • Nezařazená čeleď: Endornaviridae (1 rod)
    • Rod: Endornavirus
  • Nezařazená čeleď: Flaviviridae (4 rody)
    • Rod: Flavivirus
    • Rod: Hepacivirus
    • Rod: Pegivirus
    • Rod: Pestivirus
  • Nezařazená čeleď: Fuselloviridae (2 rody)
    • Rod: Alphafusellovirus
    • Rod: Betafusellovirus
  • Nezařazená čeleď: Geminiviridae (7 rodů, 1 neuznaný rod)
    • Rod: Becurtovirus
    • Rod: Begomovirus
    • Rod: Curtovirus
    • Rod: Eragrovirus
    • Rod: Mastrevirus
    • Rod: Topocuvirus
    • Rod: Turncurtovirus
    • Rod (neuznaný): Graingemvirus[24]
  • Nezařazená čeleď: Genomoviridae (1 rod)
    • Rod: Gemycircularvirus
  • Nezařazená čeleď: Globuloviridae (1 rod)
    • Rod: Globulovirus
  • Nezařazená čeleď: Guttaviridae (2 rody)
    • Rod: Alphaguttavirus
    • Rod: Betaguttavirus
  • Nezařazená čeleď: Hepadnaviridae (2 rody)
  • Nezařazená čeleď: Hepeviridae (2 rody)
    • Rod: Orthohepevirus
    • Rod: Piscihepevirus
  • Nezařazená čeleď: Hypoviridae (1 rod)
    • Rod: Hypovirus
  • Nezařazená čeleď: Hytrosaviridae (2 rody)
    • Rod: Glossinavirus
    • Rod: Muscavirus
  • Nezařazená čeleď: Inoviridae (2 rody)
    • Rod: Inovirus
    • Rod: Plectrovirus
  • Nezařazená čeleď: Iridoviridae – viz neuznaný řád Megavirales výše
  • Nezařazená čeleď: Lavidaviridae (2 rody)
    • Rod: Mavirus
    • Rod: Sputnikvirus
  • Nezařazená čeleď: Leviviridae (2 rody)
    • Rod: Allolevivirus
    • Rod: Levivirus
  • Nezařazená čeleď: Luteoviridae (3 rody)
    • Rod: Enamovirus
    • Rod: Luteovirus
    • Rod: Polerovirus
  • Nezařazená čeleď: Marseilleviridae – viz neuznaný řád Megavirales výše
  • Nezařazená čeleď: Megabirnaviridae (1 rod)
    • Rod: Megabirnavirus
  • Nezařazená čeleď: Metaviridae (3 rody)
    • Rod: Errantivirus
    • Rod: Metavirus
    • Rod: Semotivirus
  • Nezařazená čeleď: Microviridae (2 podčeledi)
    • Podčeleď: Bullavirinae (3 rody)
      • Rod: Alpha3microvirus
      • Rod: G4microvirus
      • Rod: Phix174microvirus
    • Podčeleď: Gokushovirinae (3 rody)
      • Rod: Bdellomicrovirus
      • Rod: Chlamydiamicrovirus
      • Rod: Spiromicrovirus
  • Nezařazená čeleď: Mimiviridae – viz neuznaný řád Megavirales výše
  • Nezařazená čeleď: Nanoviridae (2 rody)
    • Rod: Babuvirus
    • Rod: Nanovirus
  • Nezařazená čeleď: Narnaviridae (2 rody)
    • Rod: Mitovirus
    • Rod: Narnavirus
  • Nezařazená čeleď: Nimaviridae (1 rod)
    • Rod: Whispovirus
  • Nezařazená čeleď: Nodaviridae (2 rody)
    • Rod: Alphanodavirus
    • Rod: Betanodavirus
  • Nezařazená čeleď: Nudiviridae (2 rody)
    • Rod: Alphanudivirus
    • Rod: Betaanudivirus
  • Nezařazená čeleď: Ophioviridae (1 rod)
    • Rod: Ophiovirus
  • Nezařazená čeleď: Orthomyxoviridae (6 rodů, 1 neuznaný rod)
    • Rod: Influenzavirus A
    • Rod: Influenzavirus B
    • Rod: Influenzavirus C
    • Rod (neuznaný): Influenzavirus D[25]
    • Rod: Isavirus
    • Rod: Quaranjavirus
    • Rod: Thogotovirus
  • Nezařazená čeleď: Papillomaviridae (49 rodů)
    • Rod: Alphapapillomavirus
    • Rod: Betapapillomavirus
    • Rod: Chipapillomavirus
    • Rod: Deltapapillomavirus
    • Rod: Dyochipapillomavirus
    • Rod: Dyodeltapapillomavirus
    • Rod: Dyoepsilonpapillomavirus
    • Rod: Dyoetapapillomavirus
    • Rod: Dyoiotapapillomavirus
    • Rod: Dyokappapapillomavirus
    • Rod: Dyolambdapapillomavirus
    • Rod: Dyomupapillomavirus
    • Rod: Dyonupapillomavirus
    • Rod: Dyoomegapapillomavirus
    • Rod: Dyoomikronpapillomavirus
    • Rod: Dyophipapillomavirus
    • Rod: Dyopipapillomavirus
    • Rod: Dyopsipapillomavirus
    • Rod: Dyorhopapillomavirus
    • Rod: Dyosigmapapillomavirus
    • Rod: Dyotaupapillomavirus
    • Rod: Dyothetapapillomavirus
    • Rod: Dyoupsilonpapillomavirus
    • Rod: Dyoxipapillomavirus
    • Rod: Dyozetapapillomavirus
    • Rod: Epsilonpapillomavirus
    • Rod: Etapapillomavirus
    • Rod: Gammapapillomavirus
    • Rod: Iotapapillomavirus
    • Rod: Kappapapillomavirus
    • Rod: Lambdapapillomavirus
    • Rod: Mupapillomavirus
    • Rod: Nupapillomavirus
    • Rod: Omegapapillomavirus
    • Rod: Omikronpapillomavirus
    • Rod: Phipapillomavirus
    • Rod: Pipapillomavirus
    • Rod: Psipapillomavirus
    • Rod: Rhopapillomavirus
    • Rod: Sigmapapillomavirus
    • Rod: Taupapillomavirus
    • Rod: Thetapapillomavirus
    • Rod: Treisdeltapapillomavirus
    • Rod: Treisepsilonpapillomavirus
    • Rod: Treisetapapillomavirus
    • Rod: Treiszetapapillomavirus
    • Rod: Upsilonpapillomavirus
    • Rod: Xipapillomavirus
    • Rod: Zetapapillomavirus
  • Nezařazená čeleď: Partitiviridae (5 rodů)
    • Rod: Alphapartitivirus
    • Rod: Betapartitivirus
    • Rod: Cryspovirus
    • Rod: Deltapartitivirus
    • Rod: Gammapartitivirus
  • Nezařazená čeleď: Parvoviridae (2 podčeledi)
    • Podčeleď: Densovirinae (5 rodů)
      • Rod: Ambidensovirus
      • Rod: Brevidensovirus
      • Rod: Hepandensovirus
      • Rod: Iteradensovirus
      • Rod: Penstyldensovirus
    • Podčeleď: Parvovirinae (8 rodů)
      • Rod: Amdoparvovirus
      • Rod: Aveparvovirus
      • Rod: Bocaparvovirus
      • Rod: Copiparvovirus
      • Rod: Dependoparvovirus
      • Rod: Erythroparvovirus
      • Rod: Protoparvovirus
      • Rod: Tetraparvovirus
  • Nezařazená čeleď: Permutotetraviridae (1 rod)
    • Rod: Alphapermutotetravirus
  • Nezařazená čeleď: Phycodnaviridae – viz neuznaný řád Megavirales výše
  • Nezařazená čeleď: Picobirnaviridae (1 rod)
    • Rod: Picobirnavirus
  • Nezařazená čeleď: Plasmaviridae (1 rod)
    • Rod: Plasmavirus
  • Nezařazená čeleď: Pleolipoviridae (3 rody)
    • Rod: Alphapleolipovirus
    • Rod: Betapleolipovirus
    • Rod: Gammapleolipovirus
  • Nezařazená čeleď: Polydnaviridae (2 rody)
    • Rod: Bracovirus
    • Rod: Ichnovirus
  • Nezařazená čeleď: Polyomaviridae (4 rody)
    • Rod: Alphapolyomavirus
    • Rod: Betapolyomavirus
    • Rod: Deltapolyomavirus
    • Rod: Gammapolyomavirus
  • Nezařazená čeleď: Pospiviroidae (5 rodů)
    • Rod: Apscaviroid
    • Rod: Cocadviroid
    • Rod: Coleviroid
    • Rod: Hostuviroid
    • Rod: Pospiviroid
  • Nezařazená čeleď: Potyviridae (8 rodů)
    • Rod: Brambyvirus
    • Rod: Bymovirus
    • Rod: Ipomovirus
    • Rod: Macluravirus
    • Rod: Poacevirus
    • Rod: Potyvirus
    • Rod: Rymovirus
    • Rod: Tritimovirus
  • Nezařazená čeleď: Poxviridae – viz neuznaný řád Megavirales výše
  • Nezařazená čeleď: Pseudoviridae (3 rody)
    • Rod: Hemivirus
    • Rod: Pseudovirus
    • Rod: Sirevirus
  • Nezařazená čeleď: Quadriviridae (1 rod)
    • Rod: Quadrivirus
  • Nezařazená čeleď: Reoviridae (2 podčeledi)
    • Podčeleď: Sedoreovirinae (6 rodů)
      • Rod: Cardoreovirus
      • Rod: Mimoreovirus
      • Rod: Orbivirus
      • Rod: Phytoreovirus
      • Rod: Rotavirus
      • Rod: Seadornavirus
    • Podčeleď: Spinareovirinae (9 rodů)
      • Rod: Aquareovirus
      • Rod: Coltivirus
      • Rod: Cypovirus
      • Rod: Dinovernavirus
      • Rod: Fijivirus
      • Rod: Idnoreovirus
      • Rod: Mycoreovirus
      • Rod: Orthoreovirus
      • Rod: Oryzavirus
  • Nezařazená čeleď: Retroviridae (2 podčeledi)
    • Podčeleď: Orthoretrovirinae (6 rodů)
      • Rod: Alpharetrovirus
      • Rod: Betaretrovirus
      • Rod: Deltaretrovirus
      • Rod: Epsilonretrovirus
      • Rod: Gammaretrovirus
      • Rod: Lentivirus
    • Podčeleď: Spumaretrovirinae (1 rod)
      • Rod: Spumavirus
  • Nezařazená čeleď: Sarthoviridae (1 rod)
    • Rod: Macronovirus
  • Nezařazená čeleď: Sphaerolipoviridae (3 rody)
    • Rod: Alphasphaerolipovirus
    • Rod: Betasphaerolipovirus
    • Rod: Gammasphaerolipovirus
  • Nezařazená čeleď: Spiraviridae (1 rod)
    • Rod: Alphaspiravirus
  • Nezařazená čeleď: Tectiviridae (1 rod)
    • Rod: Tectivirus
  • Nezařazená čeleď: Togaviridae (2 rody)
  • Nezařazená čeleď: Tombusviridae (16 rodů)
    • Rod: Alphacarmovirus
    • Rod: Alphanecrovirus
    • Rod: Aureusvirus
    • Rod: Avenavirus
    • Rod: Betacarmovirus
    • Rod: Betanecrovirus
    • Rod: Dianthovirus
    • Rod: Gallantivirus
    • Rod: Gammacarmovirus
    • Rod: Macanavirus
    • Rod: Machlomovirus
    • Rod: Panicovirus
    • Rod: Pelarspovirus
    • Rod: Tombusvirus
    • Rod: Umbravirus
    • Rod: Zeavirus
  • Nezařazená čeleď: Totiviridae (5 rodů)
    • Rod: Giardiavirus
    • Rod: Leishmaniavirus
    • Rod: Totivirus
    • Rod: Trichomonasvirus
    • Rod: Victorivirus
  • Nezařazená čeleď: Turriviridae (1 rod)
    • Rod: Alphaturrivirus
  • Nezařazená čeleď: Virgaviridae (7 rodů)
    • Rod: Furovirus
    • Rod: Goravirus
    • Rod: Hordeivirus
    • Rod: Pecluvirus
    • Rod: Pomovirus
    • Rod: Tobamovirus
    • Rod: Tobravirus
  • Nezařazené rody: Albetovirus, Aumaivirus, Bacilladnavirus, Botybirnavirus, Cilevirus, Deltavirus, Dinodnavirus (pravděpodobně by patřil do neuznaného řádu Megavirales[13]), Emaravirus[pozn. 2], Higrevirus, Idaeovirus, Ourmiavirus, Papanivirus, Polemovirus, Rhizidiovirus, Salterprovirus, Sinaivirus, Sobemovirus, Tenuivirus[pozn. 2], Virtovirus

Baltimorova klasifikace

Baltimorova klasifikace virů je založena na způsobu syntézy virové mRNA podle virového genomu
Podrobnější informace naleznete v článku Baltimorova klasifikace.

Baltimorova klasifikace je systém klasifikace virů podle typu genetického materiálu, který je obsažen ve virových částicích, a způsobu jeho přepisu do virové mRNA. Klasifikaci poprvé navrhl v roce 1971 David Baltimore, pozdější nositel Nobelovy ceny za fyziologii a lékařství.[26] Jedná se o jednoduché a běžně používané třídění, které lze nadřadit systému ICTV. To ale neznamená, že se jedná o fylogeneticky přirozené taxony.[pozn. 3] V původním návrhu Davida Baltimora bylo šest skupin virů (I.-VI.), sedmá skupina byla vytvořena pro později objevenou skupinu hepadnavirů s unikátně stavěným genomem. Systém umožňuje zjednodušit si nesmírně komplikované a rozmanité typy životních cyklů, jimiž viry oplývají.[28]

  • Skupina I.: dsDNA viry, tedy viry s dvouvláknovou DNA
    Patří sem:
    • tzv. "head-tail" viry, tedy celé řády
      • Řád: Caudovirales
      • Řád: Herpesvirales
    • tzv. NCLDV (nucleocytoplasmic large DNA viruses), tedy celý neuznaný řád Megavirales, tedy:
      • Čeleď: Ascoviridae
      • Čeleď: Asfarviridae
      • Čeleď: Iridoviridae
      • Čeleď: Marseilleviridae
      • Čeleď: Mimiviridae
      • Čeleď (neuznaná): Pandoraviridae
      • Čeleď: Phycodnaviridae
      • Čeleď (neuznaná): Pithoviridae
      • Čeleď: Poxviridae
      • Nezařazený rod: Dinodnavirus
      • Nezařazený rod (neuznaný): Faustovirus
      • Nezařazený rod (neuznaný): Mollivirus
    • a dále:
      • Řád: Ligamenvirales (celý)
      • Nezařazená čeleď: Adenoviridae
      • Nezařazená čeleď: Ampullaviridae
      • Nezařazená čeleď: Baculoviridae
      • Nezařazená čeleď: Bicaudaviridae
      • Nezařazená čeleď: Clavaviridae
      • Nezařazená čeleď: Corticoviridae
      • Nezařazená čeleď: Fuselloviridae
      • Nezařazená čeleď: Globuloviridae
      • Nezařazená čeleď: Guttaviridae
      • Nezařazená čeleď: Hytrosaviridae
      • Nezařazená čeleď: Nimaviridae
      • Nezařazená čeleď: Nudiviridae
      • Nezařazená čeleď: Papillomaviridae
      • Nezařazená čeleď: Plasmaviridae
      • Nezařazená čeleď: Polydnaviridae
      • Nezařazená čeleď: Polyomaviridae
      • Nezařazená čeleď: Sphaerolipoviridae
      • Nezařazená čeleď: Tectiviridae
      • Nezařazená čeleď: Turriviridae
      • Nezařazené rody: Rhizidiovirus, Salterprovirus
  • Skupina II.: ssDNA viry, tedy viry s jednovláknovou DNA přepisovanou do mRNA totožné polarity
    Patří sem:
    • Nezařazená čeleď: Anelloviridae
    • Nezařazená čeleď: Bidnaviridae
    • Nezařazená čeleď: Circoviridae
    • Nezařazená čeleď: Geminiviridae
    • Nezařazená čeleď: Genomoviridae
    • Nezařazená čeleď: Inoviridae
    • Nezařazená čeleď: Lavidaviridae
    • Nezařazená čeleď: Microviridae
    • Nezařazená čeleď: Nanoviridae
    • Nezařazená čeleď: Parvoviridae
    • Nezařazená čeleď: Pleolipoviridae
    • Nezařazená čeleď: Spiraviridae
    • Nezařazený rod: Bacilladnavirus
  • Skupina III.: dsRNA viry, tedy viry s dvouvláknovou RNA
    Patří sem:
    • Nezařazená čeleď: Amalgamaviridae
    • Nezařazená čeleď: Birnaviridae
    • Nezařazená čeleď: Chrysoviridae
    • Nezařazená čeleď: Cystoviridae
    • Nezařazená čeleď: Endornaviridae
    • Nezařazená čeleď: Hypoviridae
    • Nezařazená čeleď: Megabirnaviridae
    • Nezařazená čeleď: Partitiviridae
    • Nezařazená čeleď: Picobirnaviridae
    • Nezařazená čeleď: Quadriviridae
    • Nezařazená čeleď: Reoviridae
    • Nezařazená čeleď: Totiviridae
    • Nezařazený rod: Botybirnavirus
  • Skupina IV.: ssRNA viry s pozitivní polaritou, tedy viry s jednovláknovou RNA přepisovanou do mRNA totožné polarity
    Patří sem:
    • Řád: Nidovirales (celý)
    • Řád: Picornavirales (celý)
    • Řád: Tymovirales (celý)
    • Nezařazená čeleď: Alphatetraviridae
    • Nezařazená čeleď: Alvernaviridae
    • Nezařazená čeleď: Astroviridae
    • Nezařazená čeleď: Barnaviridae
    • Nezařazená čeleď: Benyviridae
    • Nezařazená čeleď: Bromoviridae
    • Nezařazená čeleď: Caliciviridae
    • Nezařazená čeleď: Carmotetraviridae
    • Nezařazená čeleď: Closteroviridae
    • Nezařazená čeleď: Flaviviridae
    • Nezařazená čeleď: Hepeviridae
    • Nezařazená čeleď: Leviviridae
    • Nezařazená čeleď: Luteoviridae
    • Nezařazená čeleď: Narnaviridae
    • Nezařazená čeleď: Nodaviridae
    • Nezařazená čeleď: Permutotetraviridae
    • Nezařazená čeleď: Potyviridae
    • Nezařazená čeleď: Sarthoviridae
    • Nezařazená čeleď: Togaviridae
    • Nezařazená čeleď: Tombusviridae
    • Nezařazená čeleď: Virgaviridae
    • Nezařazené rody: Albetovirus, Aumaivirus, Papanivirus, Cilevirus, Higrevirus, Idaeovirus, Ourmiavirus, Polemovirus, Sinaivirus, Sobemovirus, Virtovirus
  • Skupina V.: ssRNA viry s negativní polaritou, tedy viry s jednovláknovou RNA přepisovanou do mRNA opačné polarity
    Patří sem:
    • Řád: Mononegavirales (celý)
    • Nezařazená čeleď: Arenaviridae
    • Nezařazená čeleď: Bunyaviridae
    • Nezařazená čeleď: Ophioviridae
    • Nezařazená čeleď: Orthomyxoviridae
    • Nezařazené rody: Deltavirus, Emaravirus, Tenuivirus
  • Skupina VI.: ssRNA viry s reverzní transkriptázou, tedy viry s jednovláknovou RNA reverzně přepisovanou do DNA
    Patří sem:
    • Nezařazená čeleď: Metaviridae
    • Nezařazená čeleď: Pseudoviridae
    • Nezařazená čeleď: Retroviridae
  • Skupina VII.: dsDNA viry s reverzní transkriptázou, tedy viry s dvouvláknovou (částečně i jednovláknovou) DNA nejprve přepisovanou do RNA a následně reverzně přepisovanou do DNA
    Patří sem:
    • Nezařazená čeleď: Caulimoviridae
    • Nezařazená čeleď: Hepadnaviridae

Systém LHT

Systém navrhli v r. 1962 André Lwoff, R. W. Horne a P. Tournier. K zařazení druhů využili standardní taxony kmen, podkmen, třída, řád, podřád, čeleď, podčeleď a rod. Kritériem sdružování byly společně sdílené vlastnosti, nikoli napadané organismy. 5 hlavních charakteristik používaných ke klasifikaci bylo:

  • druh nukleové kyseliny genomu (DNA, RNA),
  • symetrie kapsidu (šroubovice, dvacetistěn, složitý tvar),
  • přítomnost či nepřítomnost obálky,
  • rozměry virionu a kapsidu,
  • počet kapsomer.

V témž roce byla klasifikace schválena Prozatímním výborem pro nomenklaturu virů (Provisional Committee on Nomenclature of Virus - PNVC) Mezinárodní asociace mikrobiologických společností (International Association of Microbiological Societies - IAMS).

V dnešní době se již system LHT nepoužívá, ale názvy některých taxonů přetrvávají v systému ICTV. Do úrovně čeledí vypadal následovně:[29]

  • Kmen Vira (rozdělen na 2 podkmeny)
    • Podkmen Deoxyvira (DNA viry)
      • Třída Deoxybinala (duální symetrie)
        • Řád Urovirales
          • Čeleď Phagoviridae
      • Třída Deoxyhelica (helikální symetrie - šroubovice)
        • Řád Chitovirales
          • Čeleď Poxviridae
      • Třída Deoxycubica (kubická symetrie - mnohostěn)
        • Řád Peplovirales
          • Čeleď Herpesviridae (162 kapsomer)
        • Řád Haplovirales (bez obálky)
          • Čeleď Iridoviridae (812 kapsomer)
          • Čeleď Adenoviridae (252 kapsomer)
          • Čeleď Papiloviridae (72 kapsomer)
          • Čeleď Paroviridae (32 kapsomer)
          • Čeleď Microviridae (12 kapsomer)
    • Podkmen Ribovira (RNA viry)
      • Třída Ribocubica (kubická symetrie - mnohostěn)
        • Řád Togovirales
          • Čeleď Arboviridae
        • Řád Lymovirales
          • Čeleď Napoviridae
          • Čeleď Reoviridae
      • Třída Ribohelica (helikální symetrie - šroubovice)
        • Řád Sagovirales
          • Čeleď Stomataviridae
          • Čeleď Paramyxoviridae
          • Čeleď Myxoviridae
        • Řád Rhabdovirales
          • Podřád Flexiviridales
            • Čeleď Mesoviridae
            • Čeleď Peptoviridae
          • Podřád Rigidovirales
            • Čeleď Pachyviridae
            • Čeleď Protoviridae
            • Čeleď Polichoviridae

Klasifikace viroidů

Klasifikace byla navržena Floresem a kol. v r. 1998[30] a revidována Dienerem v r. 2001.[31]

Standardními příponami jsou:

  • pro čeleď: -viroidae
  • pro rod: -viroid

Viroidy jsou členěny do dvou čeledí. Zástupci čeledi Pospiviroidae mají v genomu tzv. centrální konzervovanou oblast (CCR – central conserved region) obsahující „jádrové“ sekvence a mající specifické sekundární struktury klíčové pro replikaci. Zástupci čeledi Avsunviroidae jsou zase schopni katalyzovat samoštěpení multimerů vytvářených při replikaci.

Systém vypadá následovně:[32]

  • Čeleď Avsunviroidae
    • Rod Avsunviroid
    • Rod Pelamoviroid
    • Rod Elaviroid
  • Čeleď Pospiviroidae
    • Rod Pospiviroid
    • Rod Hostuviroid
    • Rod Cocadviroid
    • Rod Apscaviroid
    • Rod Coleviroid

Poznámky

  1. ↑ a b c d e f g h i j Vzhledem k příbuznosti je navrhováno vyčlenění čeledí Ascoviridae, Asfarviridae, Iridoviridae, Marseilleviridae, Mimiviridae, Phycodnaviridae a Poxviridae do zvláštního řádu Megavirales.[6][7] Do řádu by pravděpodobně také náležely navrhované čeledi Pandoraviridae (vzhledem k blízkosti k čeledi Phycodnaviridae)[11] a Pithoviridae (vzhledem k blízkosti k čeledím Iridoviridae a Marseilleviridae)[12], jakož i nezařazený rod Dinodnavirus (vzhledem k blízkosti k čeledi Asfarviridae)[13] a neuznané rody Faustovirus (také blízký k Asfarviridae) a Mollivirus (blízký k navrhované čeledi Pandoraviridae).[14][15]
  2. ↑ a b c V r. 2016 bylo navrženo, aby byla čeleď Bunyaviridae pod novým názvem Peribunyaviridae, společně s nově navrženými čeleděmi Feraviridae, Fimoviridae (zahrnující dosud nezařazený rod Emaravirus), Hantaviridae, Jonviridae, Nairoviridae, Phasmaviridae, Phenuiviridae (zahrnující dosud nezařazený rod Tenuivirus) a Tospoviridae do nově vytvořeného samostatného řádu Bunyavirales.[22]
  3. ↑ Např. III. skupina (ds-RNA viry) je považována za polyfyletickou, k ní patřící čeleď Amalgaviridae dokonce s velkou pravděpodobností vznikla rekombinací RNA virů dvou různých skupin Baltimorovy klasifikace.[27]

Reference

  1. ↑ The International Code of Virus Classification and Nomenclature. Kapitola IX, odstavec 3.36. ICTV, únor 2013. Dostupné online (anglicky)
  2. ↑ International Committee on Taxonomy of Viruses: Virus Taxonomy: 2015 Release
  3. ↑ International Committee on Taxonomy of Viruses: Pending Proposals
  4. ↑ a b c ADRIAENSSENS, Evelien M.; EDWARDS, Rob; NASH, John H. E., MAHADEVAN, Padmanabhan; SETO, Donald; ACKERMANN, Hans-Wolfgang; LAVIGNE, Rob; KROPINSKI, Andrew M. Integration of genomic and proteomic analyses in the classification of the Siphoviridae family. S. 144–154. Virology [online]. 14. listopad 2014. Svazek 477, s. 144–154. Dostupné online. ISSN 0042-6822. DOI doi:10.1016/j.virol.2014.10.016. PMID 25466308. (anglicky) 
  5. ↑ NIU, Yan D.; MCALLISTER, Tim A.; NASH, John H. E., Kropinski, Andrew M.; Stanford, Kim. Four Escherichia coli O157:H7 Phages: A New Bacteriophage Genus and Taxonomic Classification of T1-Like Phages. S. 1-11. PLoS ONE [online]. 25. červen 2014. Svazek 9, čís. 6: e100426, s. 1-11. Dostupné online. ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0100426. PMID 24963920. (anglicky) 
  6. ↑ a b c YOOSUF, Niyaz, et al. Related Giant Viruses in Distant Locations and Different Habitats: Acanthamoeba polyphaga moumouvirus Represents a Third Lineage of the Mimiviridae That Is Close to the Megavirus Lineage. S. 1324-1330. Genome Biol. Evol. [online]. 4. prosinec 2012. Svazek 4, čís. 12, s. 1324-1330. ISSN 1759-6653. DOI 10.1093/gbe/evs109. (anglicky) 
  7. ↑ a b COLSON, Philippe, a kol. “Megavirales”, a proposed new order for eukaryotic nucleocytoplasmic large DNA viruses. S. 2517-2521. Archives of Virology [online]. 29. červen 2013. Svazek 158, čís. 12, s. 2517-2521. Dostupné online. ISSN 1432-8798. DOI 10.1007/s00705-013-1768-6. PMID 23812617. (anglicky) 
  8. ↑ RETENO, Dorine Gaëlle I.; BENAMAR, Samia; KHALIL, Jacques Bou; ANDREANI, Julien; ARMSTRONG, Nicholas; KLOSE, Thomas; ROSSMANN, Michael, COLSON, Philippe; RAOULT, Didier; La SCOLA, Bernard. Faustovirus, an Asfarvirus-Related New Lineage of Giant Viruses Infecting Amoebae. S. 6585-6594. Journal of Virology [online]. 15. duben 2015. Svazek 89, čís. 13, s. 6585-6594. Dostupné online. ISSN 1098-5514. DOI 10.1128/JVI.00115-15. (anglicky) 
  9. ↑ BENAMAR, Samia; RETENO, Dorine Gaëlle I.; BANDALY, Victor; LABAS, Noémie; RAOULT, Didier; LA SCOLA, Bernard. Faustoviruses: Comparative Genomics of New Megavirales Family Members. S. 1-9. Frontiers in Microbiology [online]. 5. únor 2016. Svazek 7, čís. 3, s. 1-9. Dostupné online. Dostupné také na: [1]. DOI 10.3389/fmicb.2016.00003. (anglicky) 
  10. ↑ LEGENDRE, Matthieu; LARTIGUE, Audrey; BERTAUX, Lionel; JEUDY, Sandra; BARTOLI, Julia; LESCOT, Magali; ALEMPIC, Jean-Marie, RAMUS, Claire; BRULEY, Christophe; LABADIE, Karine; SHMAKOVA, Lyubov; RIVKINA, Elizaveta; COUTÉ, Yohann; ABERGEL, Chantal; CLAVERIE, Jean-Michel. In-depth study of Mollivirus sibericum, a new 30,000-y-old giant virus infecting Acanthamoeba. S. E5327–E5335. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 8. září 2015. Svazek 112, čís. 38, s. E5327–E5335. Dostupné online. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1510795112. PMID 26351664. (anglicky) 
  11. ↑ YUTIN, Natalya; KOONIN, Eugene V. Pandoraviruses are highly derived phycodnaviruses. S. 1-8. Biology Direct [online]. 23. říjen 2013. Svazek 8, čís. 25, s. 1-8. Dostupné online. PDF [2]. DOI 10.1186/1745-6150-8-25. (anglicky) 
  12. ↑ a b LEGENDRE, Matthieu; BARTOLI, Julia; SHMAKOVA, Lyubov, JEUDY, Sandra; LABADIE, Karine; ADRAIT, Annie; LESCOT, Magali; POIROT, Olivier; BERTAUX, Lionel; BRULEY, Christophe; COUTÉ, Yohann; RIVKINA, Elizaveta; ABERGEL, Chantal; CLAVERIE, Jean-Michel. Thirty-thousand-year-old distant relative of giant icosahedral DNA viruses with a pandoravirus morphology. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 3. březen 2014. Online před tiskem. Dostupné online. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1320670111. (anglicky) 
  13. ↑ a b ICTV taxonomic proposal 2009.001a/fF (anglicky)]
  14. ↑ FISCHER, Matthias G. Giant viruses come of age. S. 50-57. Current Opinion in Microbiology [online]. 19. březen 2016. Svazek 31, s. 50-57. Dostupné online. ISSN 1369-5274. DOI 10.1016/j.mib.2016.03.001. (anglicky) 
  15. ↑ HALARY, S.; TEMMAM, S.; RAOULT, D.; DESNUES, C. Viral metagenomics: are we missing the giants?. S. 34-43. Current Opinion in Microbiology [online]. 19. březen 2016. Svazek 31, s. 34-43. Dostupné online. ISSN 1369-5274. DOI 10.1016/j.mib.2016.01.005. (anglicky) 
  16. ↑ ARSLAN, Defne, et al. Distant Mimivirus relative with a larger genome highlights the fundamental features of Megaviridae. S. 17486–17491. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 18. říjen 2011. Svazek 108, čís. 42, s. 17486–17491. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1110889108. (anglicky) 
  17. ↑ DESNUES, Christelle; LA SCOLA, Bernard; YUTIN, Natalya, FOURNOUS, Ghislain; ROBERT, Catherine; AZZA, Saïd; JARDOT, Priscilla; MONTEIL, Sonia; CAMPOCASSO, Angélique; KOONIN, Eugene V.; RAOULT, Didier. Provirophages and transpovirons as the diverse mobilome of giant viruses. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 15. říjen 2012. Online před tiskem. Dostupné online. DOI 10.1073/pnas.1208835109. (anglicky) 
  18. ↑ PHILIPPE, Nadège, et al. Pandoraviruses: Amoeba Viruses with Genomes Up to 2.5 Mb Reaching That of Parasitic Eukaryotes. S. 281-286. Science [online]. 19. červenec 2013. Svazek 341, čís. 6143, s. 281-286. Dostupné online. ISSN 1095-9203. DOI 10.1126/science.1239181. (anglicky) 
  19. ↑ MIHULKA, Stanislav: Mimiviry jsou out, teď vládnou pandoraviry! O.S.E.L., 20. červenec 2013. Dostupné online
  20. ↑ YONG, Ed. Giant virus resurrected from 30,000-year-old ice. Nature News [online]. 3. březen 2014. Dostupné online. ISSN 1476-4687. DOI doi:10.1038/nature.2014.14801. (anglicky) 
  21. ↑ Vědci oživili 30 tisíc let starý virus z ledu. Týden [online]. 4. březen 2014. Dostupné online. 
  22. ↑ Bunyaviridae Study Group: Create a new order, Bunyavirales, to accommodate nine families (eight new, one renamed) comprising thirteen genera. Proposal to ICTV, Nr. 2016.030a-vM, 2016. Dostupné online (anglicky)
  23. ↑ a b MARKLEWITZ, Marco; ZIRKEL, Florian; KURTH, Andreas, DROSTEN, Christian; JUNGLEN, Sandra. Evolutionary and phenotypic analysis of live virus isolates suggests arthropod origin of a pathogenic RNA virus family. S. 7536-7541. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 2. červen 2015. Svazek 112, čís. 24, s. 7536-7541. Dostupné online. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1502036112. (anglicky) 
  24. ↑ POOJARI, Sudarsana; ALABI, Olufemi J.; FOFANOV, Viacheslav Y., NAIDU, Rayapati A. A Leafhopper-Transmissible DNA Virus with Novel Evolutionary Lineage in the Family Geminiviridae Implicated in Grapevine Redleaf Disease by Next-Generation Sequencing. S. 1-17. PLoS ONE [online]. 5. červen 2013. Svazek 8, čís. 6: e64194, s. 1-17. Dostupné online. ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0064194. (anglicky) 
  25. ↑ ICTV: Taxonomy Proposals
  26. ↑ BALTIMORE, D. Expression of animal virus genomes. Bacteriol Rev.. 1971, roč. 35, čís. 3, s. 235-41. Dostupné online. ISSN 0005-3678. 
  27. ↑ KRUPOVIC, Mart; DOLJA, Valerian V.; KOONIN, Eugene V. Plant viruses of the Amalgaviridae family evolved via recombination between viruses with double-stranded and negative-strand RNA genomes. S. 1-7. Biology Direct [online]. 29. březen 2015. Svazek 10, čís. 12, s. 1-7. Dostupné online. PDF [3]. DOI 10.1186/s13062-015-0047-8. (anglicky) 
  28. ↑ RACANIELLO, Vincent. Simplifying virus classification: The Baltimore system [online]. Virology Blog, 2009. Dostupné online. 
  29. ↑ LWOFF, André; HORNE, R. W.; TOURNIER, P. A system of viruses. S. 51-55. Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. [online]. 1962. Svazek 27, s. 51-55. PMID 13931895. (anglicky) 
  30. ↑ FLORES, R.; RANDLES, J. W.; BAR-JOSEPH, M., DIENER, T. O. A proposed scheme for viroid classification and nomenclature. S. 623-629. Arch Virol. [online]. 1998. Svazek 143, s. 623-629. (anglicky) 
  31. ↑ DIENER, T. O. The viroid: biological oddity or evolutionary fossil?. S. 137-184. Adv Virus Res. [online]. 2001. Svazek 57, s. 137-184. (anglicky) 
  32. ↑ GÓRA-SOCHACKA, Anna. Viroids: unusual small pathogenic RNAs. S. 587–607, Tabulka 1 (strana 589). Acta Biochimica Polonica [online]. 2004. Svazek 51, čís. 3, s. 587–607. Dostupné online. PDF [4]. ISSN 1734-154X. PMID 15448723. (anglicky) 

Externí odkazy

  • (anglicky) ViralZone – podrobný přehled virů s popisy a schematickými obrázky kapsidů
Citováno z „https://cs.wikipedia.org/w/index.php?title=Klasifikace_virů&oldid=14377331“