Klasifikace hub: Porovnání verzí

Z Wikipedie, otevřené encyklopedie
Interaktivně procházet historii
← Přejít na předchozí porovnáníPřejít na další porovnání →
Smazaný obsah Přidaný obsah
VizuálníWikitext
→‎Podříše Dikarya: drobné korekce (chyba z automatické úpravy, duplikace) před připravovanou revizí
komplexní aktualizace + nové reference
Řádek 1: Řádek 1:
'''Klasifikace [[houby|hub (Fungi)]]''' prošla v posledních desetiletích, podobně jako [[Klasifikace eukaryot|klasifikace nadřazené úrovně Eukaryota]], důkladnou revizí na základě fylogenetických studií, které pomohly odhalit vzájemné příbuzenské vztahy jednotlivých taxonů. Níže uvedená klasifikace je výsledkem spolupráce širokého kolektivu mykologů v rámci projektu Assembling the Fungal Tree of Life (AFTOL).<ref name="AFTOL">[http://aftol.org/ Internetová stránka projektu AFTOL]</ref>
'''Klasifikace [[houby|hub (Fungi)]]''' prošla v posledních desetiletích, podobně jako [[Klasifikace eukaryot|klasifikace nadřazené úrovně Eukaryota]], důkladnou revizí na základě fylogenetických studií, které pomohly odhalit vzájemné příbuzenské vztahy jednotlivých taxonů. Aktuální (2020) klasifikace vychází z několika projektů spolupráce širokých kolektivů mykologů, nejprve v rámci projektu Assembling the Fungal Tree of Life (AFTOL),<ref name="AFTOL">[http://aftol.org/ Internetová stránka projektu AFTOL]</ref> na konci druhého desetiletí 21. století pak v rámci projektu Outline of ''Fungi'' and fungus-like taxa (i s účastí mykologů z českých vědeckých pracovišť),<ref name="Wijayawardene_2020">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Wijayawardene

| jméno = Nalin N.
Podle tohoto systému se [[říše (biologie)|říše]] Fungi dělí na několik samostatných [[Kmen (biologie)|kmenů]] a podříši [[Dikarya]], která sdružuje kmeny hub [[stopkovýtrusné houby|stopkovýtrusých]] a [[Houby vřeckovýtrusné|vřeckovýtrusých]].
| příjmení2 = Hyde
| jméno2 = Kevin D.
České názvosloví je založené na BioLibu.<ref>[http://www.biolib.cz/cz/taxon/id14893/ BioLib: říše houby]</ref>
| spoluautoři = Al-Ani L. K. T., Tedersoo L., Haelewaters D., Rajeshkumar K. C., Zhao R. L., Aptroot A., Leontyev D. V., Saxena R. K., Tokarev Y. S., Dai D. Q., Letcher P. M., Stephenson S. L., Ertz D., Lumbsch H. T., Kukwa M., Issi I. V., Madrid H., Phillips A. J. L., Selbmann L., Pfliegler W. P., Horváth E., Bensch K., Kirk P. M., Kolaříková K., Raja H. A., Radek R., Papp V., Dima B., Ma J., Malosso E., Takamatsu S., Rambold G., Gannibal P. B., Triebel D., Gautam A. K., Avasthi S., Suetrong S., Timdal E., Fryar S. C., Delgado G., Réblová M., Doilom M., Dolatabadi S., Pawłowska J., Humber R. A., Kodsueb R., Sánchez-Castro I., Goto B. T., Silva D. K. A., de Souza F. A., Oehl F., da Silva G. A., Silva I. R., Błaszkowski J., Jobim K., Maia L. C., Barbosa F. R., Fiuza P. O., Divakar P. K., Shenoy B. D., Castañeda-Ruiz R. F., Somrithipol S., Lateef A. A., Karunarathna S. C., Tibpromma S., Mortimer P. E., Wanasinghe D. N., Phookamsak R., Xu J., Wang Y., Tian F., Alvarado P., Li D. W., Kušan I., Matočec N., Maharachchikumbura S. S. N., Papizadeh M., Heredia G., Wartchow F., Bakhshi M., Boehm E., Youssef N., Hustad V. P., Lawrey J. D., Santiago A. L. C. M. A., Bezerra J. D. P., Souza-Motta C. M., Firmino A. L., Tian Q., Houbraken J., Hongsanan S., Tanaka K., Dissanayake A. J., Monteiro J. S., Grossart H. P., Suija A., Weerakoon G., Etayo J., Tsurykau A., Vázquez V., Mungai P., Damm U., Li Q. R., Zhang H., Boonmee S., Lu Y. Z., Becerra A. G., Kendrick B., Brearley F. Q., Motiejūnaitė J., Sharma B., Khare R., Gaikwad S., Wijesundara D. S. A., Tang L. Z., He M. Q., Flakus A., Rodriguez-Flakus P., Zhurbenko M. P., McKenzie E. H. C., Stadler M., Bhat D. J., Liu J. K., Raza M., Jeewon R., Nassonova E. S., Prieto M., Jayalal R. G. U., Erdoğdu M., Yurkov A., Schnittler M., Shchepin O. N., Novozhilov Y. K., Silva-Filho A. G. S., Liu P., Cavender J. C., Kang Y., Mohammad S., Zhang L. F., Xu R. F., Li Y. M., Dayarathne M. C., Ekanayaka A. H., Wen T. C., Deng C. Y., Pereira O. L., Navathe S., Hawksworth D. L., Fan X. L., Dissanayake L. S., Kuhnert E., Grossart H. P., Thines M.
| titul = Outline of ''Fungi'' and fungus-like taxa
| periodikum = Mycosphere
| vydavatel = Innovative Institute for Plant Health, Zhongkai University of Agriculture and Engineering
| rok vydání = 2020
| měsíc vydání = březen
| den vydání = 18
| ročník = 11
| typ ročníku = svazek
| číslo = 1:8
| datum přístupu = 2020-09-05
| strany = 1060–1456
| url = http://www.mycosphere.org/pdf/MYCOSPHERE_11_1_8-1.pdf
| issn = 2077-7019
| doi = 10.5943/mycosphere/11/1/8
| pmid =
| jazyk = anglicky
}}</ref> vycházejícího z několika předchozích studií.<ref name="Wijayawardene_2018">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Wijayawardene
| jméno = Nalin N.
| příjmení2 = Pawłowska
| jméno2 = Julia
| příjmení3 = Letcher
| jméno3 = Peter M.
| spoluautoři = ''et al''.
| titul = Notes for genera: basal clades of Fungi (including ''Aphelidiomycota'', ''Basidiobolomycota'', ''Blastocladiomycota'', ''Calcarisporiellomycota'', ''Caulochytriomycota'', ''Chytridiomycota'', ''Entomophthoromycota'', ''Glomeromycota'', ''Kickxellomycota'', ''Monoblepharomycota'', ''Mortierellomycota'', ''Mucoromycota'', ''Neocallimastigomycota'', ''Olpidiomycota'', ''Rozellomycota'' and ''Zoopagomycota'')
| periodikum = Fungal Diversity
| vydavatel = Springer Nature Switzerland AG
| rok vydání = 2018
| měsíc vydání = září
| den vydání = 19
| ročník = 92
| typ ročníku = svazek
| číslo = 1
| strany = 43–129
| url = https://link.springer.com/article/10.1007/s13225-018-0409-5
| url2 = http://eprints.ibb.waw.pl/1573/1/2018%20Wijayawardene%20et%20al%20basal%20clades_proof.pdf
| url3 = https://www.researchgate.net/publication/327761987_Notes_for_genera_basal_clades_of_Fungi_including_Aphelidiomycota_Basidiobolomycota_Blastocladiomycota_Calcarisporiellomycota_Caulochytriomycota_Chytridiomycota_Entomophthoromycota_Glomeromycota_Kickxe
| issn = 1878-9129
| doi = 10.1007/s13225-018-0409-5
| pmid =
| jazyk = anglicky
}}</ref><ref name="Doweld_2014">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Doweld
| jméno = Alexander B.
| titul = Nomenclatural novelties
| periodikum = Index Fungorum
| rok vydání = 2014
| měsíc vydání = leden
| den vydání = 2
| číslo = 49
| url = http://www.indexfungorum.org/Publications/Index%20Fungorum%20no.49.pdf
| url2 = https://www.academia.edu/5578352/Nomenclatural_novelties_Caulochytriales''_ord._nov._Caulochytridomycetes_cl._nov._Caulochytriomycotina_subphyl._nov._and_Caulochytriomycota_phyl._nov
| issn = 2049-2375
| doi =
| pmid =
| jazyk = anglicky
}}</ref>


== Systém ==
== Systém ==
Systém (do úrovně [[Řád (biologie)|řádů]]) vychází ze zatím poslední (publikované v r. 2007) komplexní [[Fylogenetika|fylogenetické]] [[Biologická systematika|systematiky]] hub,<ref>{{Citace elektronického periodika
Systém (do úrovně [[Řád (biologie)|řádů]]) navazuje na první komplexní [[Fylogenetika|fylogenetickou]] [[Biologická systematika|systematiku]] hub (publikovanou v r. 2007),<ref>{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Hibbett
| příjmení = Hibbett
| jméno = David S.
| jméno = David S.
Řádek 24: Řádek 82:
| doi = 10.1016/j.mycres.2007.03.004
| doi = 10.1016/j.mycres.2007.03.004
| jazyk = anglicky
| jazyk = anglicky
}}</ref> zpracované v rámci projektu Assembling the Fungal Tree of Life (AFTOL).<ref name="AFTOL" />
}}</ref> zpracovanou v rámci projektu Assembling the Fungal Tree of Life (AFTOL),<ref name="AFTOL" /> ale vychází z novější verze (vydané v r. 2020), upravené a doplněné v rámci projektu Outline of ''Fungi'' and fungus-like taxa.<ref name="Wijayawardene_2020"/>
Oproti dřívějším systémům obsahuje některé zásadní změny, vycházející z fylogenetických studií. Byla předně zrušena nesystematická kategorie nedokonalých hub; systém také neobsahuje (dříve do hub tradičně řazené) skupiny, které podle [[Klasifikace eukaryot|nové systematiky Eukaryot]] patří do jiných skupin (např. Pseudofungi ve skupině [[Stramenopila]]). Nepřirozená skupina spájivých hub byla rozdělena na samostatné kmeny a podkmeny, u kterých lze přirozenost předpokládat. Ze stejného důvodu došlo k „zeštíhlení“ tradičních chytridiomycet a vyčlenění některých skupin do samostatných kmenů a podkmenů. Mezi samostatné kmeny říše hub byly zařazeny [[mikrosporidie]]. Systém obsahuje vedle samostatných kmenů fylogeneticky přirozenou podříši [[Dikarya]] zahrnující [[houby vřeckovýtrusné]] a [[Stopkovýtrusné houby|houby stopkovýtrusné]].


Oproti dřívějším obsahují nové, na fylogenetické příbuznosti založené systémy některé zásadní změny. Byla předně zrušena nesystematická kategorie [[Houby nedokonalé|nedokonalých hub (Deuteromycota, ''Fungi imperfecti'')]]; systém také neobsahuje (dříve do hub tradičně řazené) skupiny, které podle [[Klasifikace eukaryot|nové systematiky Eukaryot]] patří do jiných skupin (např. Pseudofungi ve skupině [[Stramenopila]] či [[hlenky]]). Nepřirozená skupina [[Houby spájivé|spájivých hub]] byla rozdělena na samostatné kmeny a podkmeny, u kterých lze přirozenost předpokládat. Ze stejného důvodu došlo k „zeštíhlení“ tradičních chytridiomycet a vyčlenění některých skupin do samostatných kmenů a podkmenů.
Nad rámec projektu AFTOL jsou doplněny nově objevené kmeny [[Cryptomycota]]<ref name="crypto1" /><ref name="crypto2" /> a [[Aphelida]]<ref name="Karpov_2013" /> (některými vědci řazené spolu s mikrosporidiemi mimo houby do nadřádu [[Opisthosporidia]]<ref name="Karpov_2014" />), nově popsané třídy [[Archaeorhizomycetes]]<ref name="archaeorhizo1" /><ref name="archaeorhizo2" />, Geoglossomycetes<ref name="Schoch2009" /> a Xylonomycetes<ref name="Gazis2012" /> a nově popsaný řád Stereopsidales<ref name="Sjökvist_2014" />. V roce 2015 pak byly entorrhizomycety vyděleny ze stopkovýtrusých do samostatného kmene [[Entorrhizomycota]].<ref name=" Bauer_2015">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Bauer
| jméno = Robert
| příjmení2 = Garnica
| jméno2 = Sigisfredo
| příjmení3 = Oberwinkler
| jméno3 = Franz
| spoluautoři = RIESS, Kai; WEISS, Michael; BEGEROW, Dominik.
| titul = Entorrhizomycota: A New Fungal Phylum Reveals New Perspectives on the Evolution of Fungi
| periodikum = PLoS ONE
| rok vydání = 2015
| měsíc vydání = červenec
| den vydání = 22
| ročník = 10
| typ ročníku = svazek
| číslo = 7: e0128183
| strany = 1-19
| url = http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0128183
| issn = 1932-6203
| doi = 10.1371/journal.pone.0128183
| jazyk = anglicky
}}</ref> Další nové skupiny (např. na úrovni tříd: Barbatosporomycetes, Basidiobolomycetes, Calcarisporiellomycetes, Cladochytriomycetes, Hyaloraphidiomycetes, Mesochytriomycetes, Neozygitomycetes, Lobulomycetes, Olpidiomycetes, Physodermatomycetes, Polychytriomycetes, Ramicandelaberomycetes, Rhizophlyctidomycetes, Sanchytriomycetes, Synchytriomycetes, Umbelopsidomycetes) byly přidány podle studie z r. 2018, přísněji respektující hledisko fylogenetické příbuznosti, tj. [[monofyletismus|přirozenost taxonů]] (a proto povyšující úroveň u mnoha skupin zahrnutých do samostatných bazálních kmenů); navrhované rozšíření počtu podříší zahrnuto není (nezměnilo by podstatu systému) s výjimkou několika připojených poznámek.<ref name="Tedersoo_2018">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Tedersoo
| jméno = Leho
| příjmení2 = Sánchez-Ramírez,
| jméno2 = Santiago
| příjmení3 = Kõljalg
| jméno3 = Urmas
| příjmení4 = Bahram
| jméno4 = Mohammad
| příjmení5 = Döring
| jméno5 = Markus
| příjmení6 = Schigel
| jméno6 = Dmitry
| příjmení7 = May
| jméno7 = Tom
| spoluautoři = RYBERG, Martin; ABARENKOV, Kessy.
| titul = High-level classification of the Fungi and a tool for evolutionary ecological analyses
| periodikum = Fungal Diversity
| vydavatel = Springer Netherlands
| rok vydání = 2018
| měsíc vydání = květen
| den vydání = 16
| ročník = 90
| typ ročníku = svazek
| číslo = 1
| strany = 135-159
| url = https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs13225-018-0401-0
| dostupnost2 =
| url2 =
| issn = 1878-9129
| doi = 10.1007/s13225-018-0401-0
| pmid =
| jazyk = anglicky
}}</ref>


Podle aktuálního (2020) systému se [[říše (biologie)|říše]] Fungi dělí na [[monofyletismus|fylogeneticky přirozenou]] podříši [[Dikarya]], která sdružuje kmeny hub [[stopkovýtrusné houby|stopkovýtrusých]] a [[Houby vřeckovýtrusné|vřeckovýtrusých]], a několik samostatných [[Kmen (biologie)|kmenů]], pro přehlednost zpravidla členěných do 8 podříší (s předpokládanou přirozeností). Nově jsou součástí systému hub i [[afelidie]], [[Cryptomycota|kryptomycety]] a [[mikrosporidie]], vyčleňované v některých systémech [[klasifikace eukaryot|eukaryot]] mimo houby do zvláštní skupiny (na úrovni nadkmene) [[Opisthosporidia]], dříve považované za přirozenou. {{#tag:ref|Opisthosporidia byla na základě fylogenetických analýz považována za přirozenou sesterskou skupinu hub, ve které se bazálně odvětvovaly afelidie<ref name="Karpov_2013" /> a kryptomycety (''[[Rozella]]'' a několik dalších blízkých [[Rod (biologie)|rodů]], jako ''Mitosporidium, Morellospora, Nucleophaga, Paramicrosporidium'') <ref name="crypto1">{{Citace periodika
=== Říše: FUNGI – houby ===
Poznámka: Rovnítkem jsou vyznačena synonyma (starší nebo alternativní označení); má-li synonymum od nové kategorie odlišnou [[Kategorie (biologie)|taxonomickou úroveň]], je uvedeno v závorce.
==== Samostatné kmeny ====
[[Soubor:Synchytridium endobioticum.jpg|thumb|right|300px|'''Chytridiomycota''': ''[[Synchytridium endobioticum]]'']]
* Kmen: '''[[Cryptomycota]]'''<ref name="crypto1">{{Citace periodika
| příjmení = Turner
| příjmení = Turner
| jméno = Marian
| jméno = Marian
Řádek 124: Řádek 122:
| doi = 10.1038/nature09984
| doi = 10.1038/nature09984
| jazyk = anglicky
| jazyk = anglicky
}}</ref> byly sesterskou skupinou mikrosporidií. <ref name="Karpov_2014">{{Citace elektronického periodika
}}</ref> (= Rozellida){{#tag:ref|Cryptomycota/Rozellida a Microsporidia jsou někdy řazeny do sloučeného kmene Rozellomycota = Rozellosporidia, případně společné podříše '''Rozellomyceta'''<ref name="Tedersoo_2018"/>|group="pozn."|name="Rozellomyceta"}}
* Kmen: '''[[Mikrosporidie|Microsporidia]]''' – mikrosporidie (hmyzomorky)<ref name="Rozellomyceta" group="pozn." />
* Kmen: '''[[Aphelida]]'''<ref name="Karpov_2013" /><ref name="Karpov_2014">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Karpov
| příjmení = Karpov
| jméno = Sergey A.
| jméno = Sergey A.
Řádek 149: Řádek 145:
| doi = 10.3389/fmicb.2014.00112
| doi = 10.3389/fmicb.2014.00112
| jazyk = anglicky
| jazyk = anglicky
}}</ref> Novější analýzy však naznačují její [[parafyletismus|parafylii]], přičemž nejbazálněji se odvětvují tzv. Rozellomycota, zahrnující linii mikrosporidií, od které se postupně odvětvují jednotlivé rody parafyletických kryptomycet. Afelidie jsou pak sesterskou skupinou ostatních hub. <ref name="Wijayawardene_2020"/>|group="pozn."}}
}}</ref> = Aphelidiomycota<ref name="Tedersoo_2018"/>

* Kmen: '''[[Caulochytriomycota]]'''<ref name="Wijayawardene_2020">{{Citace elektronického periodika
Nad rámec projektu AFTOL tak byly postupně doplněny nově objevené, vyčleněné či z nižší taxonomické úrovně povýšené kmeny Aphelidiomycota, Basidiobolomycota, Calcarisporiellomycota, Caulochytriomycota, Entomophthoromycota, Kickxellomycota, Monoblepharomycota, Mortierellomycota, Mucoromycota, Olpidiomycota, Rozellomycota a Zoopagomycota. V roce 2015 také byly entorrhizomycety vyděleny ze stopkovýtrusých do samostatného kmene [[Entorrhizomycota]].<ref name="Bauer_2015">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Wijayawardene
| jméno = Nalin N.
| příjmení = Bauer
| spoluautoři = ''et al''.
| jméno = Robert
| příjmení2 = Garnica
| titul = Outline of ''Fungi'' and fungus-like taxa
| periodikum = Mycosphere
| jméno2 = Sigisfredo
| příjmení3 = Oberwinkler
| vydavatel = Innovative Institute for Plant Health, Zhongkai University of Agriculture and Engineering
| rok vydání = 2020
| jméno3 = Franz
| spoluautoři = RIESS, Kai; WEISS, Michael; BEGEROW, Dominik.
| měsíc vydání = březen
| titul = Entorrhizomycota: A New Fungal Phylum Reveals New Perspectives on the Evolution of Fungi
| den vydání = 18
| ročník = 11
| periodikum = PLoS ONE
| rok vydání = 2015
| měsíc vydání = červenec
| den vydání = 22
| ročník = 10
| typ ročníku = svazek
| typ ročníku = svazek
| číslo = 1:8
| číslo = 7: e0128183
| strany = 1060–1456
| strany = 1-19
| url = http://www.mycosphere.org/pdf/MYCOSPHERE_11_1_8-1.pdf
| url = http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0128183
| issn = 2077-7019
| issn = 1932-6203
| doi = 10.5943/mycosphere/11/1/8
| doi = 10.1371/journal.pone.0128183
| pmid =
| jazyk = anglicky
| jazyk = anglicky
}}</ref> Systém se rozrostl o mnohé nově popsané třídy (např. [[Archaeorhizomycetes]]<ref name="archaeorhizo1" /><ref name="archaeorhizo2" />, Geoglossomycetes<ref name="Schoch2009" /> a Xylonomycetes<ref name="Gazis2012" /> a dále o třídy Barbatosporomycetes, Basidiobolomycetes, Calcarisporiellomycetes, Cladochytriomycetes, Hyaloraphidiomycetes, Mesochytriomycetes, Neozygitomycetes, Lobulomycetes, Olpidiomycetes, Physodermatomycetes, Polychytriomycetes, Ramicandelaberomycetes, Rhizophlyctidomycetes, Sanchytriomycetes, Synchytriomycetes, Umbelopsidomycetes, přidané podle studie z r. 2018<ref name="Tedersoo_2018">{{Citace elektronického periodika
}}</ref><ref name="Wijayawardene_2018">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Wijayawardene
| příjmení = Tedersoo
| jméno = Nalin N.
| jméno = Leho
| příjmení2 = Pawłowska
| příjmení2 = Sánchez-Ramírez,
| jméno2 = Julia
| jméno2 = Santiago
| příjmení3 = Letcher
| příjmení3 = Kõljalg
| jméno3 = Peter M.
| jméno3 = Urmas
| spoluautoři = ''et al''.
| příjmení4 = Bahram
| jméno4 = Mohammad
| titul = Notes for genera: basal clades of Fungi (including ''Aphelidiomycota'', ''Basidiobolomycota'', ''Blastocladiomycota'', ''Calcarisporiellomycota'', ''Caulochytriomycota'', ''Chytridiomycota'', ''Entomophthoromycota'', ''Glomeromycota'', ''Kickxellomycota'', ''Monoblepharomycota'', ''Mortierellomycota'', ''Mucoromycota'', ''Neocallimastigomycota'', ''Olpidiomycota'', ''Rozellomycota'' and ''Zoopagomycota'')
| příjmení5 = Döring
| jméno5 = Markus
| příjmení6 = Schigel
| jméno6 = Dmitry
| příjmení7 = May
| jméno7 = Tom
| spoluautoři = RYBERG, Martin; ABARENKOV, Kessy.
| titul = High-level classification of the Fungi and a tool for evolutionary ecological analyses
| periodikum = Fungal Diversity
| periodikum = Fungal Diversity
| vydavatel = Springer Nature Switzerland AG
| vydavatel = Springer Netherlands
| rok vydání = 2018
| rok vydání = 2018
| měsíc vydání = září
| měsíc vydání = květen
| den vydání = 19
| den vydání = 16
| ročník = 92
| ročník = 90
| typ ročníku = svazek
| typ ročníku = svazek
| číslo = 1
| číslo = 1
| strany = 43–129
| strany = 135-159
| url = https://link.springer.com/article/10.1007/s13225-018-0409-5
| url = https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs13225-018-0401-0
| dostupnost2 =
| url2 = http://eprints.ibb.waw.pl/1573/1/2018%20Wijayawardene%20et%20al%20basal%20clades_proof.pdf
| url2 =
| url3 = https://www.researchgate.net/publication/327761987_Notes_for_genera_basal_clades_of_Fungi_including_Aphelidiomycota_Basidiobolomycota_Blastocladiomycota_Calcarisporiellomycota_Caulochytriomycota_Chytridiomycota_Entomophthoromycota_Glomeromycota_Kickxe
| issn = 1878-9129
| issn = 1878-9129
| doi = 10.1007/s13225-018-0409-5
| doi = 10.1007/s13225-018-0401-0
| pmid =
| pmid =
| jazyk = anglicky
| jazyk = anglicky
}}</ref>) a ještě početnější nové řády (např. ''Stereopsidales''<ref name="Sjökvist_2014" />).
}}</ref><ref name="Doweld_2014">{{Citace elektronického periodika

| příjmení = Doweld
Lze důvodně předpokládat, že se systém bude nadále rozrůstat o nově objevené skupiny či nově formálně popsané již známé klady z environmentálních vzorků. <ref name="Tedersoo_2018"/><ref name="Tedersoo_2017"/><ref name="Nagahama_2011"/><ref name="Monchy_2011"/>
| jméno = Alexander B.

| titul = Nomenclatural novelties
'''Názvoslovné poznámky:'''
| periodikum = Index Fungorum
# Novější systémy pro houby používají taxon kmen (''phyllum'') namísto tradičního oddělení (''divisio''). Není to v rozporu s aktuálním názvoslovným kódem pro řasy, houby a rostliny, tedy tzv. „Schenzen Code“ (2018)<ref name="ICNAFP_2018">{{Citace elektronické monografie
| rok vydání = 2014
| titul = International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants (Shenzhen Code) adopted by the Nineteenth International Botanical Congress Shenzhen, China, July 2017
| měsíc vydání = leden
| odkaz na titul = Mezinárodní kód botanické nomenklatury
| den vydání = 2
| url = https://www.iapt-taxon.org/nomen/main.php?page=art16
| číslo = 49
| dostupnost2 = PDF
| url = http://www.indexfungorum.org/Publications/Index%20Fungorum%20no.49.pdf
| url2 = https://www.iaptglobal.org/the-code-pdf
| url2 = https://www.academia.edu/5578352/Nomenclatural_novelties_Caulochytriales_ord._nov._Caulochytridomycetes_cl._nov._Caulochytriomycotina_subphyl._nov._and_Caulochytriomycota_phyl._nov
| editoři = Turland, N. J.; Wiersema, J. H.; Barrie, F. R.; Greuter, W.; Hawksworth, D. L.; Herendeen, P. S.; Knapp, S.; Kusber, W.-H.; Li, D.-Z.; Marhold, K.; May, T. W.; McNeill, J.; Monro, A. M.; Prado, J.; Price, M. J.; Smith, G. F.
| issn = 2049-2375
| vydavatel = Koeltz Botanical Books
| doi =
| místo = Glashütten
| datum vydání = 2018-06-26
| edice = Regnum Vegetabile 159
| isbn =
| doi = 10.12705/Code.2018
| jazyk = anglicky
}}</ref> a jeho tzv. „San Juan Chapter F“ jakožto nezávisle aktualizovanou kapitolou pro houby (2019).<ref name="ICNAFPchF_2019">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = May
| jméno = Tom W.
| příjmení2 = Redhead
| jméno2 = Scott A.
| příjmení3 = Bensch
| jméno3 = Konstanze
| příjmení4 = Hawksworth
| jméno4 = David L.
| příjmení5 = Lendemer
| jméno5 = James
| příjmení6 = Lombard
| jméno6 = Lorenzo
| příjmení7 = Turland
| jméno7 = Nicholas J.
| titul = Chapter F of the ''International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants'' as approved by the 11<sup>th</sup> International Mycological Congress, San Juan, Puerto Rico, July 2018
| periodikum = IMA Fungus
| vydavatel = BioMed Central Ltd, part of Springer Nature
| rok vydání = 2019
| měsíc vydání = prosinec
| den vydání = 27
| ročník = 10
| typ ročníku = svazek
| číslo = 21
| url = https://imafungus.biomedcentral.com/articles/10.1186/s43008-019-0019-1
| issn = 2210-6359
| doi = 10.1186/s43008-019-0019-1
| pmid =
| pmid =
| jazyk = anglicky}}</ref>
# Rovnítkem jsou vyznačena synonyma (starší nebo alternativní označení); má-li synonymum od nové kategorie odlišnou [[Taxonomická kategorie|taxonomickou úroveň]], je uvedeno v závorce.
# Mezinárodní jména taxonů (s výjimkou mikrosporidií, vizte následující poznámku) jsou psána kurzívou pro taxony řád a níž, antikvou pro taxony třída a výš.<ref>Zásada uplatňovaná [[Česká vědecká společnost pro mykologii|Českou vědeckou společností pro mykologii]] pro jí vydávaný odborný časopis ''Czech Mycology'', akceptovaná i pro českou Wikipedii – vizte [[Diskuse k šabloně:Taxobox#Souhrnný návrh na robotické změny]]</ref>
# Názvosloví mikrosporidií se i nadále tradičně řídí názvoslovným kódem pro živočichy.<ref name="ICZN_2012">{{Citace elektronické monografie
| korporace = International Commission on Zoological Nomenclature
| odkaz na korporaci = Mezinárodní komise pro zoologickou nomenklaturu
| titul = International Code of Zoological Nomenclature
| odkaz na titul = Mezinárodní pravidla zoologické nomenklatury
| url = https://www.iczn.org/the-code/the-international-code-of-zoological-nomenclature/the-code-online/
| editoři = RIDE, W. D. L.; COGGER, H. G.; DUPUIS, C.; KRAUS, O.; MINELLI, A.; THOMPSON, F. C.; TUBBS, P. K.
| vydání = 4.
| vydavatel = The International Trust for Zoological Nomenclature
| datum vydání = 1999
| datum aktualizace = 2012
| datum přístupu = 2020-09-05
| isbn = 0-85301-006-4
| jazyk = anglicky
| jazyk = anglicky
}}</ref>
}}</ref> (dříve součást kmene Chytridiomycota, třídy Spizellomycetes)<ref name="Chytridiomyceta" group="pozn." />
# České názvosloví je založené na BioLibu.<ref>[http://www.biolib.cz/cz/taxon/id14893/ BioLib: říše houby]</ref>
** Třída: Caulochytriomycetes<ref name="Wijayawardene_2020"/><ref name="Wijayawardene_2018"/><ref name="Doweld_2014"/>
*** Řád: Caulochytriales<ref name="Wijayawardene_2020"/><ref name="Wijayawardene_2018"/><ref name="Doweld_2014"/>
* Kmen: '''[[Chytridiomycety|Chytridiomycota]]''' = Archemycota – chytridiomycety{{#tag:ref|Kmeny Caulochytriomycota, Chytridiomycota, Monoblepharomycota a Neocallimastigomycota jsou někdy vzhledem ke své příbuznosti řazeny do společné podříše '''Chytridiomyceta'''<ref name="Tedersoo_2018"/>|group="pozn."|name="Chytridiomyceta"}}
** Třída: Chytridiomycetes = Archimycetes
*** Řád: Chytridiales – chytridiotvaré
** Třída: Cladochytriomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Cladochytriales<ref name="Tedersoo_2018"/>
** Třída: Mesochytriomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Mesochytriales<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Gromochytriales<ref name="Tedersoo_2018"/>
** Třída: Lobulomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Lobulomycetales<ref name="Tedersoo_2018"/>
** Třída: Polychytriomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Polychytriales<ref name="Tedersoo_2018"/>
** Třída: Rhizophlyctidomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Rhizophlyctidales<ref name="Tedersoo_2018"/>
** Třída: Rhizophydiomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Rhizophydiales
** Třída: Spizellomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Spizellomycetales – spizelomycetotvaré
** Třída: Synchytriomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Synchytriales<ref name="Tedersoo_2018"/>
* Kmen: '''[[Monoblepharomycota]]'''<ref name="Tedersoo_2018"/> (dříve součást kmene Chytridiomycota)<ref name="Chytridiomyceta" group="pozn." />
** Třída: Monoblepharidomycetes
*** Řád: Monoblepharidales
** Třída: Hyaloraphidiomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Hyaloraphidiales<ref name="Tedersoo_2018"/>
** Třída: Sanchytriomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Sanchytriales<ref name="Tedersoo_2018"/>
* Kmen: '''[[Neocallimastigomycota]]'''<ref name="Chytridiomyceta" group="pozn." />
** Třída: Neocallimastigomycetes
*** Řád: Neocallimastigales
* Kmen: '''[[Blastocladiomycota]]''' = Allomycota
** Třída: Blastocladiomycetes = Allomycetes
*** Řád: Blastocladiales – blastokladiotvaré
** Třída: Physodermatomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Physodermatales<ref name="Tedersoo_2018"/>
* Kmen: '''[[Basidiobolomycota]]'''<ref name="Tedersoo_2018"/>
** Třída: Basidiobolomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Basidiobolales<ref name="Tedersoo_2018"/>
* Kmen: '''[[Olpidiomycota]]'''<ref name="Tedersoo_2018"/>
** Třída: Olpidiomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Olpidiales<ref name="Tedersoo_2018"/>
* Kmen: '''[[Entomophthoromycota]]''' (dříve podkmen ''[[incertae sedis]]'' Entomophthoromycotina){{#tag:ref|Kmeny Entomophthoromycota, Kickxellomycota a Zoopagomycota jsou někdy vzhledem ke své příbuznosti řazeny do společné podříše '''Zoopagomyceta'''<ref name="Tedersoo_2018"/>|group="pozn."|name="Zoopagomyceta"}}
** Třída: Entomophthoromycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Entomophthorales – hmyzomorkotvaré
** Třída: Neozygitomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Neozygitales<ref name="Tedersoo_2018"/>
* Kmen: '''[[Kickxellomycota]]''' (dříve podkmen ''[[incertae sedis]]'' Kickxellomycotina)<ref name="Zoopagomyceta" group="pozn." />
** Třída: Asellariomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Asellariales – beruškovkotvaré
** Třída: Barbatosporomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Barbatosporales<ref name="Tedersoo_2018"/>
** Třída: Dimargaritomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Dimargaritales
** Třída: Harpellomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Harpellales – harpelotvaré
** Třída: Kickxellomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Kickxellales
** Třída: Ramicandelaberomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Ramicandelaberales<ref name="Tedersoo_2018"/>
* Kmen: '''[[Zoopagomycota]]''' (dříve podkmen ''[[incertae sedis]]'' Zoopagomycotina)<ref name="Zoopagomyceta" group="pozn." />
** Třída: Zoopagomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Zoopagales – zoopagotvaré
* Kmen: '''[[Calcarisporiellomycota]]'''<ref name="Tedersoo_2018"/>{{#tag:ref|Kmeny Calcarisporiellomycota, Glomeromycota, Mortierellomycota a Mucoromycota jsou někdy vzhledem ke své příbuznosti řazeny do společné podříše '''Mucoromyceta''', přestože je pravděpodobně parafyletická - nejbazálněji se odvětvují Mortierellomycota, poté společně jako sesterské skupiny Calcarisporiellomycota a Mucoromycota, a nakonec Glomeromycota jako sesterská skupina k Dikarya.<ref name="Tedersoo_2018"/>|group="pozn."|name="Mucoromyceta"}}
** Třída: Calcarisporiellomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Calcarisporiellales<ref name="Tedersoo_2018"/>
* Kmen: '''[[Glomeromycota]]'''<ref name="Mucoromyceta" group="pozn." />
** Třída: Glomeromycetes = Glomomycetes = Geomycetes
*** Řád: Diversisporales
*** Řád: Glomerales = Glomales
** Třída: Archaeosporomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Archaeosporales = Geosiphonales
** Třída: Paraglomeromycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Paraglomerales
* Kmen: '''[[Mortierellomycota]]''' (dříve řazen do podkmene ''[[incertae sedis]]'' Mucoromycotina)<ref name="Mucoromyceta" group="pozn." />
** Třída: Mortierellomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Mortierellales
* Kmen: '''[[Mucoromycota]]''' (dříve podkmen ''[[incertae sedis]]'' Mucoromycotina)<ref name="Mucoromyceta" group="pozn." />
** Třída: Endogonomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Endogonales – endogonotvaré
** Třída: Mucoromycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Mucorales – plísňotvaré
** Třída: Umbelopsidomycetes<ref name="Tedersoo_2018"/>
*** Řád: Umbelopsidales<ref name="Tedersoo_2018"/>


==== Podříše Dikarya ====
=== Říše: FUNGI – houby ===

[[Soubor:Morchella conica 1 beentree.jpg|thumb|right|300px|'''Ascomycota''': [[Smrž špičatý|Smrž špičatý (''Morchella vulgaris'')]]]]
==== Podříše bazálních linií hub ====
* Podříše: '''[[Dikarya]]''' = Dikaryomyceta (= Dikaryomycota) = Neomycota
[[Soubor:Synchytridium endobioticum.jpg|thumb|right|300px|'''Chytridiomycota''': ''[[Synchytridium endobioticum]]'']]
** Kmen: '''[[Houby vřeckovýtrusné|Ascomycota]]''' – houby vřeckovýtrusé
Podříše jsou řazeny podle postavení ve [[fylogenetický strom|fylogenetickém stromu]] hub od nejbazálněji postavených. Nižší taxony jsou řazeny abecedně.
*** Podkmen: '''[[Taphrinomycotina]]'''

**** Třída: Taphrinomycetes
* '''Podříše: ROZELLOMYCETA'''
***** Řád: Taphrinales – kadeřavkotvaré
** '''Kmen: [[Rozellomycota]]'''
**** Třída: Neolectomycetes
*** Rozellomycota ''[[incertae sedis]]'' (dříve samostatná ale parafyletická skupina Rozellosporidia (Cryptomycota) – [[kryptomycety]])
***** Řád: Neolectales
**** bazálně se odvětvující rody ''Mitosporidium'', ''Morellospora'', ''Nucleophaga'', ''Paramicrosporidium'' a ''Rozella'' (dříve řazená do samostatné třídy Rozellidea a řádu Rozellida, v obou případech podle původní definice pravděpodobně parafyletických) a další dosud formálně nepopsané environmentální vzorky<ref name="Tedersoo_2017"/>
**** Třída: Pneumocystidomycetes
*** '''[[Mikrosporidie|Microsporidia]]''' (na úrovni podkmene, možná parafyletické) – [[mikrosporidie]] (''zastarale'' hmyzomorky)
***** Řád: Pneumocystidales
**** Třída: Chytridiopsidea<ref name="Corsaro_2019">{{Citace elektronického periodika
**** Třída: Schizosaccharomycetes – kvasinkotvaré
| příjmení = Corsaro
***** Řád: Schizosaccharomycetales
| jméno = Daniele
**** Třída: Archaeorhizomycetes<ref name="archaeorhizo1">{{Citace periodika
| příjmení = Rosling
| příjmení2 = Wylezich
| jméno = Anna
| jméno2 = Claudia
| příjmení2 = Cox
| příjmení3 = Venditti
| jméno2 = Filipa
| jméno3 = Danielle
| příjmení4 = Michel
| příjmení3 = Cruz-Martinez
| jméno3 = Karelyn
| jméno4 = Rolf
| příjmení5 = Walochnik
| spoluautoři = Katarina Ihrmark, Gwen-Aëlle Grelet, Björn D. Lindahl, Audrius Menkis, Timothy Y. James.
| jméno5 = Julia
| titul = Archaeorhizomycetes: Unearthing an Ancient Class of Ubiquitous Soil Fungi
| příjmení6 = Wegensteiner
| periodikum = Science
| jméno6 = Rudolf
| odkaz na periodikum = Science
| titul = Filling gaps in the microsporidian tree: rDNA phylogeny of ''Chytridiopsis typographi'' (Microsporidia: Chytridiopsida)
| rok = 2011
| periodikum = Parasitology Research
| měsíc = srpen
| vydavatel = Springer Nature Switzerland AG
| den = 12
| ročník = 333
| rok vydání = 2018
| měsíc vydání = listopad
| den vydání = 12
| ročník = 118
| typ ročníku = svazek
| typ ročníku = svazek
| číslo = 6044
| číslo = 1
| strany = 876-879
| strany = 169–180
| url = http://www.sciencemag.org/content/333/6044/876.abstract
| url = https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00436-018-6130-1
| url2 = https://www.researchgate.net/publication/328889289_Filling_gaps_in_the_microsporidian_tree_rDNA_phylogeny_of_Chytridiopsis_typographi_Microsporidia_Chytridiopsida
| formát = abstrakt
| issn = 0036-8075
| issn = 1432-1955
| doi = 10.1126/science.1206958
| doi = 10.1007/s00436-018-6130-1
| pmid = 30421347
| jazyk = anglicky
| jazyk = anglicky
}}</ref> (nebo Microsporidia ''[[incertae sedis]]''<ref name="Wijayawardene_2020"/>)
}}</ref><ref name="archaeorhizo2">[http://www.physorg.com/news/2011-08-hidden-soil-fungus-revealed-class.html Hidden soil fungus, now revealed, is in a class all its own], PhysOrg, 11. 8. 2011 (popularizační článek k předchozí referenci)</ref>
***** Řád: Chytridiopsida
*** Podkmen: '''[[Saccharomycotina]]'''
**** Třída: Saccharomycetes
**** Třída: Microsporidea
***** Řád: Saccharomycetales – kvasinkotvaré
***** Řád: Amblyosporida
***** Řád: Neopereziida
*** Podkmen: '''[[Pezizomycotina]]'''
***** Řád: Ovavesiculida
***** Řád: Glugeida
***** Řád: Nosematida
**** Třída: Rudimicrosporea = Metchnikovellea
***** Řád: Metchnikovellida
* '''Podříše: APHELIDIOMYCETA'''
** '''Kmen: Aphelidiomycota'''<ref name="Tedersoo_2018"/> = [[Aphelida]]<ref name="Karpov_2013" /> – [[afelidie]]
**:* Třída: Aphelidiomycetes
**:** Řád: ''Aphelidiales''
* '''Podříše: BLASTOCLADIOMYCETA'''
** '''Kmen: [[Blastocladiomycota]]''' = Allomycota
*** Třída: Blastocladiomycetes = Allomycetes
**** Řád: ''Blastocladiales'' – blastokladiotvaré
**** Řád: ''Callimastigales''
**** Řád: ''Catenomycetales''
*** Třída: Physodermatomycetes
**** Řád: ''Physodermatales''
* '''Podříše: CHYTRIDIOMYCETA'''
** '''Kmen: [[Caulochytriomycota]]''' (dříve součást kmene Chytridiomycota, třídy Spizellomycetes)
*** Třída: Caulochytriomycetes
**** Řád: ''Caulochytriales''
** '''Kmen: [[Chytridiomycety|Chytridiomycota]]''' = Archemycota – [[chytridiomycety]]
*** Třída: Cladochytriomycetes
**** Řád: ''Cladochytriales''
*** Třída: Chytridiomycetes = Archimycetes
**** Řád: ''Chytridiales'' – chytridiotvaré
**** Řád: ''Nephridiophagales''
**** Řád: ''Polyphagales''
**** Řád: ''Saccopodiales''
*** Třída: Lobulomycetes
**** Řád: ''Lobulomycetales''
*** Třída: Mesochytriomycetes
**** Řád: ''Gromochytriales''
**** Řád: ''Mesochytriales''
*** Třída: Polychytriomycetes
**** Řád: ''Polychytriales''
*** Třída: Rhizophlyctidomycetes
**** Řád: ''Rhizophlyctidales''
*** Třída: Rhizophydiomycetes
**** Řád: ''Rhizophydiales''
*** Třída: Spizellomycetes
**** Řád: ''Spizellomycetales'' – [[spizelomycetotvaré]]
*** Třída: Synchytriomycetes
**** Řád: ''Synchytriales''
** '''Kmen: [[Monoblepharomycota]]''' (dříve součást kmene Chytridiomycota)
*** Třída: Hyaloraphidiomycetes
**** Řád: ''Hyaloraphidiales''
*** Třída: Monoblepharidomycetes
**** Řád: ''Monoblepharidales''
*** Třída: Sanchytriomycetes
**** Řád: ''Sanchytriales''
** '''Kmen: [[Neocallimastigomycota]]'''
*** Třída: Neocallimastigomycetes
**** Řád: ''Neocallimastigales''
* '''Podříše: BASIDIOBOLOMYCETA'''
** '''Kmen: [[Basidiobolomycota]]'''
*** Třída: Basidiobolomycetes
**** Řád: ''Basidiobolales'' – [[basidiobolotvaré]]
* '''Podříše: OLPIDIOMYCETA'''
** '''Kmen: [[Olpidiomycota]]'''
*** Třída: Olpidiomycetes
**** Řád: ''Olpidiales''
* '''Podříše: ZOOPAGOMYCETA'''
** '''Kmen: [[Entomophthoromycota]]'''
*** Třída: Entomophthoromycetes
**** Řád: ''Entomophthorales'' – [[hmyzomorkotvaré]]
*** Třída: Neozygitomycetes
**** Řád: ''Neozygitales''
** '''Kmen: [[Kickxellomycota]]'''
*** Třída: Asellariomycetes
**** Řád: ''Asellariales'' – [[beruškovkotvaré]]
*** Třída: Barbatosporomycetes
**** Řád: ''Barbatosporales''
*** Třída: Dimargaritomycetes
**** Řád: ''Dimargaritales''
*** Třída: Harpellomycetes
**** Řád: ''Harpellales'' – [[harpelotvaré]]
*** Třída: Kickxellomycetes
**** Řád: ''Kickxellales''
*** Třída: Ramicandelaberomycetes
**** Řád: ''Ramicandelaberales''
** '''Kmen: [[Zoopagomycota]]'''
*** Třída: Zoopagomycetes
**** Řád: ''Zoopagales'' – [[zoopagotvaré]]
* '''Podříše: MUCOROMYCETA'''{{#tag:ref|Dříve se jevila parafyletická – Dikarya se podle některých analýz odvětvovala uvnitř ní, jako sesterská skupina ke Glomeromycota.<ref name="Tedersoo_2018"/> Podle novějších analýz se jeví jako přirozená.<ref name="Wijayawardene_2020"/>|group="pozn."|name="Mucoromyceta"}}
** '''Kmen: [[Calcarisporiellomycota]]'''
*** Třída: Calcarisporiellomycetes
**** Řád: ''Calcarisporiellales''
** '''Kmen: [[Glomeromycota]]'''
*** Třída: Archaeosporomycetes
**** Řád: ''Archaeosporales'' = ''Geosiphonales''
*** Třída: Glomeromycetes = Glomomycetes = Geomycetes
**** Řád: ''Diversisporales''
**** Řád: ''Gigasporales''
**** Řád: ''Glomerales'' = ''Glomales''
*** Třída: Paraglomeromycetes
**** Řád: ''Paraglomerales''
** '''Kmen: [[Mortierellomycota]]'''
*** Třída: Mortierellomycetes
**** Řád: ''Mortierellales''
** '''Kmen: [[Mucoromycota]]'''
*** Třída: Endogonomycetes
**** Řád: ''Endogonales'' – [[endogonotvaré]]
*** Třída: Mucoromycetes
**** Řád: ''Mucorales'' – [[plísňotvaré]]
*** Třída: Umbelopsidomycetes
**** Řád: ''Umbelopsidales''

==== Podříše Dikarya ====
[[Soubor:Morchella conica 1 beentree.jpg|thumb|right|300px|'''Ascomycota''': [[Smrž kuželovitý|Smrž kuželovitý (''Morchella conica'')]]]]
* '''Podříše: [[DIKARYA]] = DIKARYOMYCETA (= NEOMYCOTA)'''
** '''Kmen: [[Houby vřeckovýtrusné|Ascomycota]]''' – [[Houby vřeckovýtrusné|houby vřeckovýtrusé]]{{#tag:ref|se zralými výtrusy ve [[vřecko|vřeckách]]; někdy též uváděné jako „vřeckovýtrusné“<ref name="Váňa_2005">{{Citace monografie
| příjmení = KALINA
| jméno = Tomáš
| příjmení2 = VÁŇA
| jméno2 = Jiří
| titul = Sinice, řasy, houby, mechorosty a podobné organismy v současné biologii
| url = https://karolinum.cz/knihy/kalina-sinice-rasy-houby-mechorosty-a-podobne-organismy-v-soucasne-biologii-1208
| vydání = 1
| vydavatel = Karolinum
| místo = Praha
| rok = 2005
| měsíc = prosinec
| počet stran = 608
| přílohy = 32 s. obr. příl.
| kapitola = 3.3 Říše: Houby – Fungi (syn. Mycetalia)
| strany = 229-405
| isbn = 80-246-1036-1
| isbn2 = 978-80-246-1036-8
}}</ref>|group="pozn."}} = houby vřeckaté = askomycety<ref name="Váňa_2005"/>
*** Podkmen: '''[[Pezizomycotina]]''' (dříve též Ascomycotina)<ref name="Váňa_2005"/>
**** Třída: Arthoniomycetes
**** Třída: Arthoniomycetes
****:* Řád: Arthoniales – artoniotvaré
****:* Řád: ''Arthoniales'' – [[artoniotvaré]]
****:* Řád: ''Lichenostigmatales''
**** Třída: Candelariomycetes
****:* Řád: ''Candelariales''
**** Třída: Coniocybomycetes
****:* Řád: ''Coniocybales''
**** Třída: Dothideomycetes
**** Třída: Dothideomycetes
***** Podtřída: Dothideomycetidae
***** Podtřída: Dothideomycetidae
****** Řád: Capnodiales
****** Řád: ''Capnodiales''
****** Řád: Dothideales – vředovcotvaré
****** Řád: ''Dothideales'' – [[vředovcotvaré]]
****** Řád: Myriangiales
****** Řád: ''Myriangiales''
***** Podtřída: Pleosporomycetidae
***** Podtřída: Pleosporomycetidae
****** Řád: Pleosporales – zďovkotvaré
****** Řád: ''Gloniales''
****** Řád: ''Hysteriales'' – [[skulinatcotvaré]]
****** Řád: ''Mytilinidiales''
****** Řád: ''Pleosporales'' (včetně pův. Massariales'') – [[zďovkotvaré]]
***** Dothideomycetes ''[[incertae sedis]]'':
***** Dothideomycetes ''[[incertae sedis]]'':
****** Řád: Botryosphaeriales
****** Řád: ''Abrothallales'' = ''Lichenoconiales''
****** Řád: Hysteriales – skulinatcotvaré
****** Řád: ''Acrospermales''
****** Řád: Patellariales – miskovkotvaré
****** Řád: ''Asterinales''
****** Řád: Jahnulales
****** Řád: ''Botryosphaeriales''
****** Řád: ''Catinellales''
****** Řád: ''Cladoriellales''
****** Řád: ''Collemopsidiales''
****** Řád: ''Dyfrolomycetales''
****** Řád: ''Eremithallales''
****** Řád: ''Eremomycetales''
****** Řád: ''Jahnulales''
****** Řád: ''Kirschsteiniotheliales''
****** Řád: ''Lembosinales''
****** Řád: ''Lichenotheliales''
****** Řád: ''Microthyriales'' – [[štítoplodkotvaré]]
****** Řád: ''Minutisphaerales''
****** Řád: ''Monoblastiales''
****** Řád: ''Muyocopronales''
****** Řád: ''Murramarangomycetales''
****** Řád: ''Natipusillales''
****** Řád: ''Parmulariales''
****** Řád: ''Patellariales'' – [[miskovkotvaré]]
****** Řád: ''Phaeotrichales''
****** Řád: ''Stigmatodiscales''
****** Řád: ''Strigulales''
****** Řád: ''Superstratomycetales''
****** Řád: ''Trypetheliales''
****** Řád: ''Tubeufiales''
****** Řád: ''Valsariales''
****** Řád: ''Venturiales''
****** Řád: ''Zeloasperisporiales''
**** Třída: Eurotiomycetes
**** Třída: Eurotiomycetes
***** Podtřída: Chaetothyriomycetidae
***** Podtřída: Coryneliomycetidae
****** Řád: Chaetothyriales
****** Řád: ''Coryneliales''
****** Řád: Pyrenulales – jaderničkotvaré
****** Řád: Verrucariales – bradavnicotvaré
***** Podtřída: Eurotiomycetidae
***** Podtřída: Eurotiomycetidae
****** Řád: Coryneliales
****** Řád: ''Arachnomycetales''
****** Řád: Eurotiales – plesnivkotvaré
****** Řád: ''Eurotiales'' – [[plesnivkotvaré]]
****** Řád: Onygenales – kazirohotvaré
****** Řád: ''Onygenales'' – [[kazirohotvaré]]
***** Podtřída: Chaetothyriomycetidae
****** Řád: ''Chaetothyriales''
****** Řád: ''Phaeomoniellales''
****** Řád: ''Pyrenulales'' – [[jaderničkotvaré]]
****** Řád: ''Verrucariales'' – [[bradavnicotvaré]]
***** Podtřída: Mycocaliciomycetidae
***** Podtřída: Mycocaliciomycetidae
****** Řád: Mycocaliciales – kališkotvaré
****** Řád: ''Mycocaliciales'' – [[kališkotvaré]]
***** Podtřída: Sclerococcomycetidae
****** Řád: ''Sclerococcales''
**** Třída: Geoglossomycetes<ref name="Schoch2009">{{Citace elektronického periodika
**** Třída: Geoglossomycetes<ref name="Schoch2009">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Schoch
| příjmení = Schoch
Řádek 380: Řádek 527:
| jazyk = anglicky
| jazyk = anglicky
}}</ref>
}}</ref>
****:* Řád: Geoglossales
****:* Řád: ''Geoglossales''
**** Třída: Laboulbeniomycetes
**** Třída: Laboulbeniomycetes
****:* Řád: Laboulbeniales – roztřepenkotvaré
****:* Řád: ''Herpomycetales''
****:* Řád: Pyxidiophorales
****:* Řád: ''Laboulbeniales'' – [[roztřepenkotvaré]]
****:* Řád: ''Pyxidiophorales''
**** Třída: Lecanoromycetes
**** Třída: Lecanoromycetes
***** Podtřída: Acarosporomycetidae
***** Podtřída: Acarosporomycetidae
****** Řád: Acarosporales
****** Řád: ''Acarosporales''
***** Podtřída: [[Lecanoromycetidae]]
***** Podtřída: [[Lecanoromycetidae]]
****** Řád: Lecanorales – misničkotvaré
****** Řád: ''Caliciales''
****** Řád: Peltigerales – hávnatkotvaré
****** Řád: ''Lecanorales'' – [[misničkotvaré]]
****** Řád: Teloschistales – krásníkotvaré
****** Řád: ''Lecideales''
****** Řád: ''Leprocaulales''
****** Řád: ''Peltigerales'' – [[hávnatkotvaré]]
****** Řád: ''Rhizocarpales''
****** Řád: ''Sporastatiales''
****** Řád: ''Teloschistales'' – [[krásníkotvaré]]
***** Podtřída: Ostropomycetidae
***** Podtřída: Ostropomycetidae
****** Řád: Agyriales
****** Řád: ''Baeomycetales''
****** Řád: Baeomycetales
****** Řád: ''Graphidales''
****** Řád: Ostropales – dlouhovřeckotvaré
****** Řád: ''Gyalectales''
****** Řád: Pertusariales – děratkotvaré
****** Řád: ''Ostropales'' – [[dlouhovřeckotvaré]]
****** Řád: ''Pertusariales'' (včetně pův. ''Agyriales'') – [[děratkotvaré]]
****** Řád: ''Sarrameanales''
****** Řád: ''Schaereriales''
****** Řád: ''Thelenellales''
***** Podtřída: Umbilicariomycetidae
****** Řád: ''Umbilicariales''
***** Lecanoromycetes ''[[incertae sedis]]'':
***** Lecanoromycetes ''[[incertae sedis]]'':
****** Řád: Candelariales
****** Řád: ''Micropeltidales''
****** Řád: Umbilicariales
****** Řád: ''Turquoiseomycetales''
**** Třída: Leotiomycetes
**** Třída: Leotiomycetes
***** Řád: Cyttariales
****:* Řád: ''Cyttariales''
***** Řád: Erysiphales – padlí
****:* Řád: ''Helotiales'' (včetně pův. ''Erysiphales'' – [[padlí]])– [[voskovičkotvaré]]
***** Řád: Helotiales – voskovičkotvaré
****:* Řád: ''Chaetomellales''
***** Řád: Rhytismatales – svraštělkotvaré
****:* Řád: ''Lahmiales''
***** Řád: Thelebolales
****:* Řád: ''Lauriomycetales''
****:* Řád: ''Leotiales''
****:* Řád: ''Lichinodiales''
****:* Řád: ''Marthamycetales''
****:* Řád: ''Medeolariales''
****:* Řád: ''Micraspidales''
****:* Řád: ''Phacidiales''
****:* Řád: ''Rhytismatales'' = ''Triblidiales'' – [[svraštělkotvaré]]
****:* Řád: ''Thelebolales''
**** Třída: Lichinomycetes
**** Třída: Lichinomycetes
***** Řád: Lichinales – lišejkotvaré
****:* Řád: ''Lichinales'' – [[lišejkotvaré]]
**** Třída: Orbiliomycetes
**** Třída: Orbiliomycetes
***** Řád: Orbiliales
****:* Řád: ''Orbiliales''
**** Třída: Pezizomycetes
**** Třída: Pezizomycetes
***** Řád: Pezizales – kustřebkotvaré
****:* Řád: ''Pezizales'' – [[kustřebkotvaré]]
**** Třída: Sordariomycetes
**** Třída: Sordariomycetes
***** Podtřída: Diaporthomycetidae
****** Řád: ''Annulatascales''
****** Řád: ''Atractosporales''
****** Řád: ''Calosphaeriales''
****** Řád: ''Diaporthales'' – [[čárovkotvaré]]
****** Řád: ''Distoseptisporales''
****** Řád: ''Magnaporthales''
****** Řád: ''Myrmecridiales''
****** Řád: ''Ophiostomatales'' – [[ofiostomotvaré]]
****** Řád: ''Phomatosporales''
****** Řád: ''Sporidesmiales''
****** Řád: ''Tirisporellales''
****** Řád: ''Togniniales''
****** Řád: ''Xenospadicoidales''
***** Podtřída: Hypocreomycetidae
***** Podtřída: Hypocreomycetidae
****** Řád: Coronophorales
****** Řád: ''Coronophorales'' (včetně pův. ''Melanosporales'')
****** Řád: Hypocreales – masenkotvaré
****** Řád: ''Falcocladiales''
****** Řád: Melanosporales
****** Řád: ''Glomerellales''
****** Řád: Microascales – vřeckovičkotvaré
****** Řád: ''Hypocreales'' – [[masenkotvaré]]
***** Podtřída: Sordariomycetidae
****** Řád: ''Jobellisiales''
****** Řád: Boliniales – bolinkotvaré
****** Řád: ''Microascales'' – [[vřeckovičkotvaré]]
****** Řád: Chaetosphaeriales
****** Řád: ''Pararamichloridiales''
****** Řád: Coniochaetales
****** Řád: ''Torpedosporales''
***** Podtřída: Lulworthiomycetidae
****** Řád: Diaporthales – čárovkotvaré
****** Řád: Ophiostomatales – ofiostomotvaré
****** Řád: ''Koralionastetales''
****** Řád: Sordariales – hnojenkotvaré
****** Řád: ''Lulworthiales''
***** Podtřída: Pisorisporiomycetidae
****** Řád: ''Pisorisporiales''
***** Podtřída: Savoryellomycetidae
****** Řád: ''Conioscyphales''
****** Řád: ''Fuscosporellales''
****** Řád: ''Pleurotheciales''
****** Řád: ''Savoryellales''
***** Podtřída: Sordariomycetidae = Meliolomycetidae
****** Řád: ''Boliniales'' – [[bolinkotvaré]]
****** Řád: ''Cephalothecales''
****** Řád: ''Coniochaetales''
****** Řád: ''Chaetosphaeriales''
****** Řád: ''Meliolales''
****** Řád: ''Phyllachorales'' – [[puchýřkotvaré]]
****** Řád: ''Pseudodactylariales''
****** Řád: ''Sordariales'' – [[hnojenkotvaré]]
***** Podtřída: Xylariomycetidae
***** Podtřída: Xylariomycetidae
****** Řád: Xylariales – dřevnatkotvaré
****** Řád: ''Amphisphaeriales''
****** Řád: ''Delonicicolales''
****** Řád: ''Xylariales'' – [[dřevnatkotvaré]]
***** Sordariomycetes ''[[incertae sedis]]'':
***** Sordariomycetes ''[[incertae sedis]]'':
****** Řád: Calosphaeriales
****** Řád: ''Amplistromatales''
****** Řád: Lulworthiales
****** Řád: ''Parasympodiellales''
****** Řád: Meliolales
****** Řád: ''Spathulosporales''
****** Řád: Phyllachorales
****** Řád: ''Tracyllalales''
****** Řád: Trichosphaeriales
****** Řád: ''Trichosphaeriales''
****** Řád: ''Vermiculariopsiellales''
**** Třída: Xylobotryomycetes
****:* Řád: ''Xylobotryales''
**** Třída: Xylonomycetes<ref name="Gazis2012">{{Citace elektronického periodika
**** Třída: Xylonomycetes<ref name="Gazis2012">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Gazis
| příjmení = Gazis
Řádek 451: Řádek 653:
| jazyk = anglicky
| jazyk = anglicky
}}</ref>
}}</ref>
***** Řád: Xylonomycetales
***** původně jediný řád ''Xylonomycetales'' rozdělen na:
****** Řád: ''Symbiotaphrinales''
****** Řád: ''Xylonales''
**** Pezizomycotina ''[[incertae sedis]]'':
**** Pezizomycotina ''[[incertae sedis]]'':
***** Řád: Lahmiales
****:* Řád: ''Thelocarpales''
***** Řád: Medeolariales
****:* Řád: ''Vezdaeales''
*** Podkmen: '''[[Saccharomycotina]]''' (dříve též Hemiascomycotina)<ref name="Váňa_2005"/>
***** Řád: Triblidiales
**** Třída: Saccharomycetes
** Kmen: '''[[Stopkovýtrusné houby|Basidiomycota]]''' – houby stopkovýtrusé [[Soubor:Boletus edulis (Tillegem).jpg|thumb|right|300px|'''Basidiomycota''': [[Hřib smrkový|Hřib smrkový (''Boletus edulis'')]]]]
****:* Řád: ''Saccharomycetales'' – [[kvasinkotvaré]], pravé [[kvasinky]]
*** Podkmen: '''[[Taphrinomycotina]]''' (dříve též Archiascomycotina)<ref name="Váňa_2005"/>
**** Třída: Archaeorhizomycetes<ref name="archaeorhizo1">{{Citace periodika
| příjmení = Rosling
| jméno = Anna
| příjmení2 = Cox
| jméno2 = Filipa
| příjmení3 = Cruz-Martinez
| jméno3 = Karelyn
| spoluautoři = Katarina Ihrmark, Gwen-Aëlle Grelet, Björn D. Lindahl, Audrius Menkis, Timothy Y. James.
| titul = Archaeorhizomycetes: Unearthing an Ancient Class of Ubiquitous Soil Fungi
| periodikum = Science
| odkaz na periodikum = Science
| rok = 2011
| měsíc = srpen
| den = 12
| ročník = 333
| typ ročníku = svazek
| číslo = 6044
| strany = 876-879
| url = http://www.sciencemag.org/content/333/6044/876.abstract
| formát = abstrakt
| issn = 0036-8075
| doi = 10.1126/science.1206958
| jazyk = anglicky
}}</ref><ref name="archaeorhizo2">[http://www.physorg.com/news/2011-08-hidden-soil-fungus-revealed-class.html Hidden soil fungus, now revealed, is in a class all its own], PhysOrg, 11. 8. 2011 (popularizační článek k předchozí referenci)</ref>
****:* Řád: ''Archaeorhizomycetales''
**** Třída: Neolectomycetes
***** Řád: ''Neolectales''
**** Třída: Pneumocystidomycetes
***** Řád: ''Pneumocystidales''
**** Třída: Schizosaccharomycetes
***** Řád: ''Schizosaccharomycetales'' – [[kvasinkotvaré]]
**** Třída: Taphrinomycetes
***** Řád: ''Taphrinales'' – [[kadeřavkotvaré]]
** '''Kmen: [[Stopkovýtrusné houby|Basidiomycota]]''' – [[Stopkovýtrusné houby|houby stopkovýtrusé]]{{#tag:ref|se zralými výtrusy na stopkách [[Basidie|basidií]]; někdy též uváděné jako „stopkovýtrusné“<ref name="Váňa_2005"/>|group="pozn."}} = bazidiomycety<ref name="Váňa_2005"/> [[Soubor:Boletus edulis (Tillegem).jpg|thumb|right|300px|'''Basidiomycota''': [[Hřib smrkový|Hřib smrkový (''Boletus edulis'')]]]]
*** Podkmen: '''[[Agaricomycetes|Agaricomycotina]]''' (= Hymenomycetes)
**** Třída: [[Agaricomycetes]] (dříve též Basidiomycetes)<ref name="Váňa_2005"/> – [[stopkovýtrusé]]
***** Podtřída: Agaricomycetidae – [[houby rouškaté]]
****** Řád: ''[[Lupenotvaré|Agaricales'']] – [[pečárkotvaré]]
****** Řád: ''Amylocorticiales''
****** Řád: ''Atheliales''
****** Řád: ''Boletales'' – [[hřibotvaré]]
****** Řád: ''Lepidostromatales''
***** Podtřída: Phallomycetidae
****** Řád: ''Geastrales''
****** Řád: ''Gomphales''
****** Řád: ''Hysterangiales''
****** Řád: ''Phallales'' – [[hadovkotvaré]]
***** Agaricomycetes ''[[incertae sedis]]'':
****** Řád: ''Auriculariales'' – [[boltcovitkotvaré]]
****** Řád: ''Cantharellales'' – [[liškotvaré]]
****** Řád: ''Corticiales'' = ''Vuilleminiales''
****** Řád: ''Gloeophyllales''
****** Řád: ''Hymenochaetales'' – [[kožovkotvaré]]
****** Řád: ''Jaapiales''
****** Řád: ''Polyporales'' – [[chorošotvaré]]
****** Řád: ''Russulales'' – [[holubinkotvaré]]
****** Řád: ''Sebacinales''
****** Řád: ''Stereopsidales''<ref name="Sjökvist_2014">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Sjökvist
| jméno = Elisabet
| příjmení2 = Pfeil
| jméno2 = Bernard E.
| příjmení3 = Larsson
| jméno3 = Ellen
| spoluautoři = LARSSON, Karl-Henrik.
| titul = Stereopsidales'' - A New Order of Mushroom-Forming Fungi
| periodikum = PLoS ONE
| rok vydání = 2014
| měsíc vydání = duben
| den vydání = 28
| ročník = 9
| typ ročníku = svazek
| číslo = 4: e95227
| strany = 1-9
| url = http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0095227
| url2 = https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4002437/
| issn = 1932-6203
| doi = 10.1371/journal.pone.0095227
| pmid = 24777067
| jazyk = anglicky
}}</ref>
****** Řád: ''Thelephorales'' – [[plesňákotvaré]]
****** Řád: ''Trechisporales'' = ''Hydnodontales''
****** Řád: ''Tremellodendropsidales''
**** Třída: Bartheletiomycetes
****:* Řád: ''Bartheletiales''
**** Třída: Dacrymycetes
****:* Řád: ''Dacrymycetales'' – [[kropilkotvaré]]
****:* Řád: ''Unilacrymales''<ref name="Shirouzu_2016">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Shirouzu
| jméno = Takashi
| příjmení2 = Uno
| jméno2 = Kunihiko
| příjmení3 = Hosaka
| jméno3 = Kentaro
| spoluautoři = HOSOYA, Tsuyoshi.
| titul = Early-diverging wood-decaying fungi detected using three complementary sampling methods
| periodikum = Molecular Phylogenetics and Evolution
| rok vydání = 2016
| měsíc vydání = únor
| den vydání = 2
| ročník = 98
| typ ročníku = svazek
| strany = 11-20
| url = http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1055790316000312
| issn = 1055-7903
| doi = 10.1016/j.ympev.2016.01.015
| pmid = 26850687
| jazyk = anglicky
}}</ref>
**** Třída: Tremellomycetes – [[houby mozkovkovité]]
****:* Řád: ''Cystofilobasidiales''
****:* Řád: ''Filobasidiales''
****:* Řád: ''Holtermanniales''
****:* Řád: ''Tremellales'' – [[rosolovkotvaré]]
****:* Řád: ''Trichosporonales''
*** Podkmen: '''Pucciniomycotina''' (= [[Urediniomycetes]])
*** Podkmen: '''Pucciniomycotina''' (= [[Urediniomycetes]])
**** Třída: Pucciniomycetes (= Urediniomycetidae) – [[rzi]]
***** Řád: Septobasidiales – přepážkovkotvaré
***** Řád: Pachnocybales
***** Řád: Helicobasidiales
***** Řád: Platygloeales
***** Řád: [[Rzi|Pucciniales]] = Uredinales – rzi
**** Třída: Cystobasidiomycetes
***** Řád: Cystobasidiales
***** Řád: Erythrobasidiales
***** Řád: Naohideales
**** Třída: Agaricostilbomycetes
**** Třída: Agaricostilbomycetes
***** Řád: Agaricostilbales
****:* Řád: ''Agaricostilbales''
***** Řád: Spiculogloeales = Mycogloeales
**** Třída: Microbotryomycetes
***** Řád: Heterogastridiales
***** Řád: Microbotryales
***** Řád: Leucosporidiales
***** Řád: Sporidiobolales
**** Třída: Atractiellomycetes
**** Třída: Atractiellomycetes
***** Řád: Atractiellales
****:* Řád: ''Atractiellales''
**** Třída: Classiculomycetes
**** Třída: Classiculomycetes
***** Řád: Classiculales
****:* Řád: ''Classiculales''
**** Třída: Mixiomycetes
***** Řád: Mixiales
**** Třída: Cryptomycocolacomycetes
**** Třída: Cryptomycocolacomycetes
***** Řád: Cryptomycocolacales
****:* Řád: ''Cryptomycocolacales''
**** Třída: Cystobasidiomycetes
****:* Řád: ''Buckleyzymales''
****:* Řád: ''Cystobasidiales''
****:* Řád: ''Erythrobasidiales''
****:* Řád: ''Naohideales''
****:* Řád: ''Sakaguchiales''
**** Třída: Microbotryomycetes
****:* Řád: ''Heterogastridiales''
****:* Řád: ''Kriegeriales''
****:* Řád: ''Leucosporidiales''
****:* Řád: ''Microbotryales''
****:* Řád: ''Sporidiobolales''
**** Třída: Mixiomycetes
****:* Řád: ''Mixiales''
**** Třída: Pucciniomycetes (= Urediniomycetidae) – [[rzi]]
****:* Řád: ''Helicobasidiales''
****:* Řád: ''Pachnocybales''
****:* Řád: ''Platygloeales''
****:* Řád: ''[[Rzi|Pucciniales'']] = ''Uredinales'' – [[rzi]]
****:* Řád: ''Septobasidiales'' – [[přepážkovkotvaré]]
**** Třída: Spiculogloeomycetes
****:* Řád: ''Spiculogloeales'' = ''Mycogloeales''
**** Třída: Tritirachiomycetes
****:* Řád: ''Tritirachiales''
*** Podkmen: '''[[Sněti|Ustilaginomycotina]]'''
*** Podkmen: '''[[Sněti|Ustilaginomycotina]]'''
**** Třída: Exobasidiomycetes
****:* Řád: ''Ceraceosorales''
****:* Řád: ''Doassansiales''
****:* Řád: ''Entylomatales''
****:* Řád: ''Exobasidiales'' – [[plíškotvaré]]
****:* Řád: ''Georgefischeriales''
****:* Řád: ''Golubeviales''
****:* Řád: ''Microstromatales''
****:* Řád: ''Robbauerales''
****:* Řád: ''Tilletiales'' – [[mazlavé sněti]]
**** Třída: Malasseziomycetes<ref name="Kijpornyongpan_2018">{{Citace elektronického periodika
**** Třída: Malasseziomycetes<ref name="Kijpornyongpan_2018">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Kijpornyongpan
| příjmení = Kijpornyongpan
Řádek 519: Řádek 857:
| jazyk = anglicky
| jazyk = anglicky
}}</ref>
}}</ref>
***** Řád: Malasseziales
****:* Řád: ''Malasseziales''
**** Třída: Monilielliomycetes<ref name="Kijpornyongpan_2018" />
**** Třída: Monilielliomycetes<ref name="Kijpornyongpan_2018" />
***** Řád: Moniliellales
****:* Řád: ''Moniliellales''
**** Třída: Ustilaginomycetes – [[sněti]]
**** Třída: Ustilaginomycetes – [[sněti]]
***** Řád: Urocystales
****:* Řád: ''Uleiellales''
***** Řád: Ustilaginales – prašné sněti
****:* Řád: ''Urocystales''
****:* Řád: ''Ustilaginales'' – [[prašné sněti]]
**** Třída: Exobasidiomycetes
***** Řád: Doassansiales
****:* Řád: ''Violaceomycetales''
*** Podkmen: '''[[Wallemiomycotina]]'''
***** Řád: Entylomatales
**** Třída: Wallemiomycetes
***** Řád: Exobasidiales – plíškotvaré
***** Řád: Georgefischeriales
****:* Řád: ''Wallemiales''
** '''Kmen: [[Entorrhizomycota]]'''<ref name=" Bauer_2015" />
***** Řád: Microstromatales
**:* Třída: Entorrhizomycetes
***** Řád: Tilletiales – mazlavé sněti
**:*:* Řád: ''Entorrhizales''
*** Podkmen: '''[[Agaricomycetes|Agaricomycotina]]''' (= Hymenomycetes)
**:*:* Řád: ''Talbotiomycetales''
**** Třída: Tremellomycetes – houby mozkovkovité

***** Řád: Cystofilobasidiales
== Fylogenetické stromy ==
***** Řád: Filobasidiales
Práce na fylogenetické systematice byly pochopitelně založeny na mnoha studiích, analyzujících molekulárně biologickými metodami fylogenetickou příbuznost jednotlivých taxonů.<ref name=wang /><ref name=liu /><ref>[http://tolweb.org/Fungi/2377 Internetový projekt „Tree of Life”: Fungi]</ref><ref name=rozellida /><ref name="crypto1" /><ref name="crypto2" /><ref name="Gazis2012" /><ref name=" Ebersberger_2012">{{Citace elektronického periodika
***** Řád: Tremellales – rosolovkotvaré
| příjmení = Ebersberger
**** Třída: Dacrymycetes
| jméno = Ingo
***** Řád: Dacrymycetales – kropilkotvaré
| příjmení2 = Matos Simoes
***** Řád: Unilacrymales<ref name="Shirouzu_2016">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Shirouzu
| jméno2 = Ricardo de
| jméno = Takashi
| příjmení3 = Kupczok
| příjmení2 = Uno
| jméno3 = Anne
| spoluautoři = GUBE, Matthias; KOTHE, Erika; VOIGT, Kerstin; von HAESELER, Arndt.
| jméno2 = Kunihiko
| titul = A Consistent Phylogenetic Backbone for the Fungi
| příjmení3 = Hosaka
| periodikum = Molecular Biology and Evolution
| jméno3 = Kentaro
| rok vydání = 2011
| spoluautoři = HOSOYA, Tsuyoshi.
| měsíc vydání = listopad
| titul = Early-diverging wood-decaying fungi detected using three complementary sampling methods
| den vydání = 22
| periodikum = Molecular Phylogenetics and Evolution
| rok vydání = 2016
| ročník = 29
| měsíc vydání = únor
| typ ročníku = svazek
| den vydání = 2
| strany = 1319–1334
| ročník = 98
| url =
| typ ročníku = svazek
| dostupnost2 =
| strany = 11-20
| url2 =
| issn = 1537-1719
| url = http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1055790316000312
| doi = 10.1093/molbev/msr285
| issn = 1055-7903
| doi = 10.1016/j.ympev.2016.01.015
| pmid =
| pmid =
| jazyk = anglicky
| jazyk = anglicky
}}</ref><ref>{{Citace elektronického periodika
}}</ref>
| příjmení = Zhuang
**** Třída: [[Agaricomycetes]] – stopkovýtrusé
| jméno = Wen-Ying
***** Podtřída: Agaricomycetidae – [[houby rouškaté]]
| příjmení2 = Liu
****** Řád: [[Lupenotvaré|Agaricales]] – pečárkotvaré
| jméno2 = Chao-Yang
****** Řád: Atheliales
| titul = What an rRNA Secondary Structure Tells about Phylogeny of Fungi in Ascomycota with Emphasis on Evolution of Major Types of Ascus
****** Řád: Boletales – [[hřibotvaré]]
***** Podtřída: Phallomycetidae
****** Řád: Geastrales
****** Řád: Gomphales
****** Řád: Hysterangiales
****** Řád: Phallales – hadovkotvaré
***** Agaricomycetes ''[[incertae sedis]]'':
****** Řád: Auriculariales – boltcovitkotvaré
****** Řád: Cantharellales – liškotvaré
****** Řád: Corticiales = Vuilleminiales
****** Řád: Gloeophyllales
****** Řád: Hymenochaetales – kožovkotvaré
****** Řád: Polyporales – [[chorošotvaré]]
****** Řád: Russulales – [[holubinkotvaré]]
****** Řád: Sebacinales
****** Řád: Stereopsidales<ref name="Sjökvist_2014">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Sjökvist
| jméno = Elisabet
| příjmení2 = Pfeil
| jméno2 = Bernard E.
| příjmení3 = Larsson
| jméno3 = Ellen
| spoluautoři = LARSSON, Karl-Henrik.
| titul = Stereopsidales - A New Order of Mushroom-Forming Fungi
| periodikum = PLoS ONE
| periodikum = PLoS ONE
| rok vydání = 2012
| měsíc vydání = říjen
| den vydání = 26
| ročník = 7
| typ ročníku = svazek
| číslo = 10: e47546
| strany = 1-10
| url = https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0047546
| url2 = https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3482189/
| issn = 1932-6203
| doi = 10.1371/journal.pone.0047546
| pmid = 23110078
| jazyk = anglicky
}}</ref><ref name="Beimforde_2014">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Beimforde
| jméno = Christina
| příjmení2 = Feldberg
| jméno2 = Kathrin
| příjmení3 = Nylinder
| jméno3 = Stephan
| spoluautoři = RIKKINEN, Jouko; TUOVILA, Hanna; DÖRFELT, Heinrich; GUBE, Matthias; JACKSON, Daniel J.; REITNER, Joachim; SEYFULLAH, Leyla J.; SCHMIDT, Alexander R.
| titul = Estimating the Phanerozoic history of the Ascomycota lineages: Combining fossil and molecular data
| periodikum = Molecular Phylogenetics and Evolution
| rok vydání = 2014
| rok vydání = 2014
| měsíc vydání = duben
| měsíc vydání = duben
| den vydání = 28
| den vydání = 30
| ročník = 9
| ročník = 78
| typ ročníku = svazek
| typ ročníku = svazek
| číslo = 4: e95227
| strany = 386–398
| url = http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1055790314001523
| strany = 1-9
| dostupnost2 =
| url = http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0095227
| issn =
| url2 =
| issn = 1055-7903
| doi = 10.1371/journal.pone.0095227
| doi = 10.1016/j.ympev.2014.04.024
| pmid =
| jazyk = anglicky
| jazyk = anglicky
}}</ref><ref name=" Bauer_2015" /><ref name="Tedersoo_2018"/> Na výše uvedenou systematiku z projektu AFTOL navázala v r. 2009 [[Fylogenetika|fylogenetická]] studie 82 kompletních [[genom]]ů<ref name=wang>{{Citace elektronického periodika
}}</ref>
****** Řád: Thelephorales – plesňákotvaré
****** Řád: Trechisporales = Hydnodontales
*** Basidiomycota ''[[incertae sedis]]'':
**** Třída: Wallemiomycetes
***** Řád: Wallemiales
** Kmen: '''[[Entorrhizomycota]]'''<ref name=" Bauer_2015" />
**:* Třída: Entorrhizomycetes
**:** Řád: Entorrhizales

== Fylogenetické stromy ==
Na výše uvedenou systematiku z projektu AFTOL navázala v r. 2009 [[Fylogenetika|fylogenetická]] studie 82 kompletních [[genom]]ů<ref name=wang>{{Citace elektronického periodika
| autor = HAO WANG
| autor = HAO WANG
| spoluautoři = Zhao Xu, Lei Gao, Bailin Hao
| spoluautoři = Zhao Xu, Lei Gao, Bailin Hao
Řádek 632: Řádek 958:
| doi = 10.1186/1471-2148-9-195
| doi = 10.1186/1471-2148-9-195
| jazyk = anglicky
| jazyk = anglicky
}}</ref>. Byl potvrzen přirozený [[kladistika|klad]] [[Dikarya]] zahrnující [[houby vřeckovýtrusné]] a [[Stopkovýtrusné houby|houby stopkovýtrusné]], naopak [[houby spájivé]] (Zygomycota) se jako nepřirozená skupina rozpadly (a s nimi i nadřazená úroveň Eumycota). Také bylo potvrzeno zahrnutí [[Mikrosporidie|mikrosporidií]] do hub, problémem je však konkrétní pozice ve fylogenetickém stromu.<ref>{{Citace periodika
}}</ref>. Byl potvrzen přirozený [[kladistika|klad]] [[Dikarya]] zahrnující [[houby vřeckovýtrusné]] a [[Stopkovýtrusné houby|houby stopkovýtrusné]], naopak [[houby spájivé]] (Zygomycota) se jako nepřirozená skupina rozpadly (a s nimi i nadřazená úroveň Eumycota). Také bylo potvrzeno zahrnutí [[Mikrosporidie|mikrosporidií]] do hub.<ref>{{Citace periodika
| příjmení = Sokolova
| příjmení = Sokolova
| jméno = Ju. Ja. (Соколова Ю. Я.)
| jméno = Ju. Ja. (Соколова Ю. Я.)
Řádek 691: Řádek 1 017:
| jazyk = anglicky
| jazyk = anglicky
}}</ref> s cílem stanovit sesterskou skupinu hub a s její pomocí upřesnit bazální větvení fylogenetického stromu hub. Jako sesterská skupina hub byly potvrzeny nuklearie (Nucleariida), pro společný celek bylo navrženo jméno Holomycota.
}}</ref> s cílem stanovit sesterskou skupinu hub a s její pomocí upřesnit bazální větvení fylogenetického stromu hub. Jako sesterská skupina hub byly potvrzeny nuklearie (Nucleariida), pro společný celek bylo navrženo jméno Holomycota.
Rod ''Rozella'', zajímavý absencí chitinové buněčné stěny, byl nejprve vyčleněn z chytridií a ve studii z r. 2011 se ukázal být zástupcem nového kmene [[Cryptomycota]], jedné z bazálních evolučních větví hub.<ref name="crypto1" /><ref name="crypto2" /> Pravděpodobně jsou jeho blízkými příbuznými nejen mikrosporidie, ale překvapivě též [[afelidie]], dříve zahrnované do [[Holozoa|příbuzenstva živočichů]].<ref name="Karpov_2013">{{Citace elektronického periodika
Rod ''Rozella'', zajímavý absencí chitinové buněčné stěny, byl nejprve vyčleněn z chytridií a ve studii z r. 2011 se ukázal být zástupcem nového kmene [[Cryptomycota]], jedné z bazálních evolučních větví hub.<ref name="crypto1" /><ref name="crypto2" /> Za jeho blízké příbuzné byly považovány nejen mikrosporidie, ale překvapivě též [[afelidie]], dříve zahrnované do [[Holozoa|příbuzenstva živočichů]],<ref name="Karpov_2013">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Karpov
| příjmení = Karpov
| jméno = Sergej A.
| jméno = Sergej A.
Řádek 713: Řádek 1 039:
| pmid = 23058793
| pmid = 23058793
| jazyk = anglicky
| jazyk = anglicky
}}</ref> Studie z r. 2018 pak zahrnula i další, nově objevené skupiny (včetně bazální skupiny [[BCG1]], identifikované v mořských environmentálních vzorcích, a bazální skupiny [[BCG2]], identifikované v půdních a sladkovodních environmentálních vzorcích), a naznačila nepřirozenost skupiny Mucoromyceta.<ref name="Tedersoo_2018"/>
}}</ref> nově řazené ještě výše, jako sesterská skupina tzv. pravých hub (Eumycota). Studie z r. 2018 pak zahrnula i další, nově objevené skupiny (včetně bazální skupiny [[BCG1]], identifikované v mořských environmentálních vzorcích, a bazální skupiny [[BCG2]] a [[GS01]], identifikované v půdních a sladkovodních environmentálních vzorcích), a naznačila nepřirozenost skupiny Mucoromyceta.<ref name="Tedersoo_2018"/>


[[Fylogenetický strom]] hlavních skupin hub vypadá podle současných (r. 2018) představ následovně<ref name=wang /><ref name=liu /><ref>[http://tolweb.org/Fungi/2377 Internetový projekt „Tree of Life”: Fungi]</ref><ref name=rozellida /><ref name="crypto1" /><ref name="crypto2" /><ref name="Gazis2012" /><ref name=" Ebersberger_2012">{{Citace elektronického periodika
[[Fylogenetický strom]] hlavních skupin hub (do úrovně tříd) vypadá podle současných (r. 2020) představ následovně<ref name="Wijayawardene_2020"/> ((P) značí skupinu s nedostatečně průkaznou přirozeností, která se může ukázat [[parafyletismus|parafyletickou]], případně polyfyletickou):
| příjmení = Ebersberger
| jméno = Ingo
| příjmení2 = Matos Simoes
| jméno2 = Ricardo de
| příjmení3 = Kupczok
| jméno3 = Anne
| spoluautoři = GUBE, Matthias; KOTHE, Erika; VOIGT, Kerstin; von HAESELER, Arndt.
| titul = A Consistent Phylogenetic Backbone for the Fungi
| periodikum = Molecular Biology and Evolution
| rok vydání = 2011
| měsíc vydání = listopad
| den vydání = 22
| ročník = 29
| typ ročníku = svazek
| strany = 1319–1334
| url =
| dostupnost2 =
| url2 =
| issn = 1537-1719
| doi = 10.1093/molbev/msr285
| pmid =
| jazyk = anglicky
}}</ref><ref>{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Zhuang
| jméno = Wen-Ying
| příjmení2 = Liu
| jméno2 = Chao-Yang
| titul = What an rRNA Secondary Structure Tells about Phylogeny of Fungi in Ascomycota with Emphasis on Evolution of Major Types of Ascus
| periodikum = PLoS ONE
| rok vydání = 2012
| měsíc vydání = říjen
| den vydání = 26
| ročník = 7
| typ ročníku = svazek
| číslo = 10: e47546
| strany = 1-10
| url =
| dostupnost2 =
| url2 =
| issn =
| doi = 10.1371/journal.pone.0047546
| pmid =
| jazyk = anglicky
}}</ref><ref name="Beimforde_2014">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Beimforde
| jméno = Christina
| příjmení2 = Feldberg
| jméno2 = Kathrin
| příjmení3 = Nylinder
| jméno3 = Stephan
| spoluautoři = RIKKINEN, Jouko; TUOVILA, Hanna; DÖRFELT, Heinrich; GUBE, Matthias; JACKSON, Daniel J.; REITNER, Joachim; SEYFULLAH, Leyla J.; SCHMIDT, Alexander R.
| titul = Estimating the Phanerozoic history of the Ascomycota lineages: Combining fossil and molecular data
| periodikum = Molecular Phylogenetics and Evolution
| rok vydání = 2014
| měsíc vydání = duben
| den vydání = 30
| ročník = 78
| typ ročníku = svazek
| strany = 386–398
| url = http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1055790314001523
| dostupnost2 =
| url2 =
| issn = 1055-7903
| doi = 10.1016/j.ympev.2014.04.024
| jazyk = anglicky
}}</ref><ref name=" Bauer_2015" /><ref name="Tedersoo_2018"/> ((P) značí skupinu, která se může ukázat [[parafyletismus|parafyletickou]], případně polyfyletickou):


=== Bazální linie hub ===
=== Bazální linie hub ===
Řádek 835: Řádek 1 095:
|popisek2='''Fungi'''
|popisek2='''Fungi'''
|2={{klad
|2={{klad
|1=BCG2 + GS01{{#tag:ref|dosud formálně nepopsané bazální skupiny z půdních a sladkovodních vzorků<ref name="Tedersoo_2018"/><ref name="Monchy_2011">{{Citace elektronického periodika
|1=BCG2
| příjmení = Monchy
| jméno = Sébastien
| příjmení2 = Sanciu
| jméno2 = Giovanna
| příjmení3 = Jobard
| jméno3 = Marlène
| příjmení4 = Rasconi
| jméno4 = Serena
| příjmení5 = Gerphagnon
| jméno5 = Mélanie
| příjmení6 = Chabé
| jméno6 = Magali
| příjmení7 = Cian
| jméno7 = Amandine
| příjmení8 = Meloni
| jméno8 = Dionigia
| příjmení9 = Niquil
| jméno9 = Nathalie
| příjmení10 = Christaki
| jméno10 = Urania
| příjmení11 = Viscogliosi
| jméno11 = Eric
| příjmení12 = Sime-Ngando
| jméno12 = Télesphore
| titul = Exploring and quantifying fungal diversity in freshwater lake ecosystems using rDNA cloning/sequencing and SSU tag pyrosequencing
| periodikum = Environmental Microbiology
| vydavatel = John Wiley & Sons, Inc.
| rok vydání = 2011
| měsíc vydání = březen
| den vydání = 9
| ročník = 13
| typ ročníku = svazek
| číslo = 6
| strany = 1433-1453
| url = https://sfamjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/j.1462-2920.2011.02444.x
| url2 = https://www.researchgate.net/publication/51186129_Exploring_and_quantifying_fungal_diversity_in_freshwater_lake_ecosystems_using_rDNA_cloningsequencing_and_SSU_tag_pyrosequencing
| dostupnost3 = PDF
| url3 = https://www.academia.edu/14325470/Exploring_and_quantifying_fungal_diversity_in_freshwater_lake_ecosystems_using_rDNA_cloning_sequencing_and_SSU_tag_pyrosequencing
| issn = 1462-2920
| doi = 10.1111/j.1462-2920.2011.02444.x
| pmid = 21635672
| jazyk = anglicky
}}</ref><ref name="Tedersoo_2017">{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Tedersoo
| jméno = Leho
| příjmení2 = Bahram
| jméno2 = Mohammad
| příjmení3 = Puusepp
| jméno3 = Rasmus
| příjmení4 = Nilsson
| jméno4 = R. Henrik
| příjmení5 = James
| jméno5 = Timothy Y.
| titul = Novel soil-inhabiting clades fill gaps in the fungal tree of life
| periodikum = Microbiome
| vydavatel = BioMed Central Ltd, part of Springer Nature
| rok vydání = 2017
| měsíc vydání = duben
| den vydání = 8
| ročník = 5
| typ ročníku = svazek
| číslo = 1:42
| url = https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-017-0259-5
| url2 = https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5385062/
| url3 = https://www.researchgate.net/publication/315982814_Novel_soil-inhabiting_clades_fill_gaps_in_the_fungal_tree_of_life
| issn = 2049-2618
| doi = 10.1186/s40168-017-0259-5
| pmid = 28388929
| jazyk = anglicky
}}</ref>|group="pozn."}}
|2={{klad
|2={{klad
|1={{klad
|1={{klad
|1=BCG1{{#tag:ref|dosud formálně nepopsaná bazální skupina z mořských vzorků<ref name="Tedersoo_2018"/><ref name="Nagahama_2011">{{Citace elektronického periodika
|1=BCG1
| příjmení = Nagahama
|popisek2=Rozellomyceta{{#tag:ref|Dříve do této linie byly zahrnovány afelidie, pak nesla název Opisthosporidia="ARM"<ref name="Karpov_2013" /><ref name="Karpov_2014" />|group="pozn."}}
| jméno = Takahiko
| příjmení2 = Takahashi
| jméno2 = Eriko
| příjmení3 = Nagano
| jméno3 = Yuriko
| příjmení4 = Abdel-Wahab
| jméno4 = Mohamed A.
| příjmení5 = Miyazaki
| jméno5 = Masayuki
| titul = Molecular evidence that deep-branching fungi are major fungal components in deep-sea methane cold-seep sediments
| periodikum = Environmental Microbiology
| vydavatel = John Wiley & Sons, Inc.
| rok vydání = 2011
| měsíc vydání = květen
| den vydání = 23
| ročník = 13
| typ ročníku = svazek
| číslo = 8
| strany = 2359-2370
| url = https://sfamjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/j.1462-2920.2011.02507.x
| url2 = https://www.researchgate.net/publication/51158776_Molecular_evidence_that_deep-branching_fungi_are_major_fungal_components_in_deep-sea_methane_cold-seep_sediments
| dostupnost3 =
| issn = 1462-2920
| doi = 10.1111/j.1462-2920.2011.02507.x
| pmid = 21605311
| jazyk = anglicky
}}</ref>|group="pozn."}}
|popisek2=Rozellomycota{{#tag:ref|Dříve do této linie byly zahrnovány afelidie, pak nesla název Opisthosporidia="ARM"<ref name="Karpov_2013" /><ref name="Karpov_2014" />|group="pozn."}}
|2={{klad
|2={{klad
|1=[[Cryptomycota]]=Rozellida<ref name=rozellida>{{Citace periodika
|popisek1=(P)
|1=[[Cryptomycota]] = Rozellosporidia<ref name=rozellida>{{Citace periodika
| příjmení = Lara
| příjmení = Lara
| jméno = Enrique
| jméno = Enrique
Řádek 861: Řádek 1 220:
| jazyk = anglicky
| jazyk = anglicky
}}</ref><ref name="crypto1" /><ref name="crypto2" />
}}</ref><ref name="crypto1" /><ref name="crypto2" />
|2=[[Mikrosporidie|Microsporidia]]
|popisek2=[[Mikrosporidie|Microsporidia]]
|2={{klad
|popisek1=<ref name="Corsaro_2019"/>
|1=Chytridiopsidea
|2={{klad
|1=Rudimicrosporea/Metchnikovellea
|2=Microsporidea
}}
}}
}}
}}
}}
}}
|2={{klad
|2={{klad
|1=Aphelida=Aphelidiomycota{{#tag:ref|Dříve považované za součást Rozellomyceta<ref name="Karpov_2013" /><ref name="Karpov_2014" />|group="pozn."}}
|popisek1=Aphelidiomycota
|1=Aphelidiomycetes{{#tag:ref|Dříve považované za součást Rozellomyceta<ref name="Karpov_2013" /><ref name="Karpov_2014" />|group="pozn."}}
|popisek2=(klad Eumycota)
|2={{klad
|2={{klad
|popisek1=[[Chytridiomycety|&nbsp;Chytridiomyceta&nbsp;]]
|1={{klad
|1={{klad
|1=Neocallimastigomycota
|popisek1=Blastocladiomycota
|1={{klad
|1=Blastocladiomycetes
|2=Physodermatomycetes
}}
|popisek2=[[Chytridiomycety|Chytridiomyceta]]
|2={{klad
|2={{klad
|1=Chytridiomycetes
|popisek1=Neocallimastigomycota
|2=Monoblepharidomycetes
|1=Neocallimastigomycetes
|2={{klad
|popisek1=Monoblepharomycota
|1={{klad
|1=Monoblepharidomycetes
|2={{klad
|1=Hyaloraphidiomycetes
|2=Sanchytriomycetes
}}
}}
|2={{klad
|popisek1=Caulochytriomycota
|1=Caulochytriomycetes
|popisek2=[[Chytridiomycety|Chytridiomycota]]
|2={{klad
|popisek1=(P)
|1=Chytridiomycetes
|2={{klad
|1=Mesochytriomycetes
|2={{klad
|1={{klad
|1=Lobulomycetes
|2=Synchytriomycetes
}}
|2={{klad
|1={{klad
|1= Cladochytriomycetes
|2= Polychytriomycetes
}}
|2={{klad
|1= Rhizophydiomycetes
|2={{klad
|1= Rhizophlyctidomycetes
|2= Spizellomycetes
}}
}}
}}
}}
}}
}}
}}
}}
}}
}}
}}
}}
|popisek2=(klad Amastigomycota)
|2={{klad
|2={{klad
|popisek1=(?P)
|1={{klad
|1={{klad
|1=Blastocladiomycota
|2=(Entomophthoromycotina){{#tag:ref|variantním postavením je sesterská skupina k Zoopagomycota<ref name="Tedersoo_2018"/>|group="pozn."}}
}}
|2={{klad
|popisek1=(?P)
|1={{klad
|1={{klad
|popisek1=Basidiobolomycota
|1=Basidiobolomycetes
|popisek2=Olpidiomycota
|2=Olpidiomycetes
}}
|popisek2=Zoopagomyceta
|2={{klad
|popisek1=Entomophthoromycota
|1={{klad
|1={{klad
|1=Basidiobolomycota
|1=Entomophthoromycetes
|2=Olpidiomycota
|2=Neozygitomycetes
}}
}}
|popisek2=Zoopagomyceta (?P)
|2={{klad
|2={{klad
|popisek1=Zoopagomycota
|1=(Entomophthoromycotina){{#tag:ref|toto postavení může být artefaktem; při zanedbání dlouhých větví v analýze vychází jako sesterská skupina k Blastocladiomycota<ref name="Tedersoo_2018"/>|group="pozn."}}
|1=Zoopagomycetes
|popisek2=Kickxellomycota
|2={{klad
|2={{klad
|1=Kickxellomycotina
|1=Dimargaritomycetes
|2=Zoopagomycotina
|2={{klad
|1=Ramicandelaberomycetes
|2={{klad
|1=Barbatosporomycetes
|2={{klad
|1=Kickxellomycetes
|2={{klad
|1=Asellariomycetes
|2=Harpellomycetes
}}
}}
}}
}}
}}
}}
}}
}}
}}
}}
|2={{klad
}}
|1=Mortierellomycotina
|2={{klad
|2={{klad
|popisek1=Mucoromyceta
|1={{klad
|popisek1=[[Glomeromycota|Glomeromycota]]{{#tag:ref|v některých dřívějších systémech považovány za sesterskou skupinu Dikaryí, se kterými tvořily „klad“ Symbiomycota, který je však pravděpodobně [[polyfyletismus|polyfyletickou]] skupinou|group="pozn."}}
|1={{klad
|1={{klad
|1={{klad
|1=Calcarisporiellomycotina
|1=Archaeosporomycetes
|2=Mucoromycotina
|2=Paraglomeromycetes
}}
}}
|2=Glomeromycetes
}}
|2={{klad
|popisek1=Mortierellomycota
|1=Mortierellomycetes
|2={{klad
|2={{klad
|1=[[Glomeromycota|Glomeromycotina]]
|popisek1=Calcarisporiellomycota
|popisek2=[[Dikarya]]
|1=Calcarisporiellomycetes
|2=[[Klasifikace hub#Dikarya (Neomycota)|►]]
|popisek2=Mucoromycota
|2={{klad
|1=Endogonomycetes
|2={{klad
|1=Mucoromycetes
|2=Umbelopsidomycetes
}}
}}
}}
}}
}}
}}
}}
}}
|popisek2=Dikarya
|2=[[#Dikarya (Neomycota)|►]]
}}
}}
}}
}}
}}
}}
}}
}}
}}
}}
Řádek 926: Řádek 1 373:
|1=[[Entorrhizomycota]]
|1=[[Entorrhizomycota]]
|2={{klad
|2={{klad
|popisek1=[[Stopkovýtrusné houby|Basidiomycota]]
|popisek2=[[Stopkovýtrusné houby|Basidiomycota]]
|1={{klad
|2={{klad
|1=[[Urediniomycetes|Pucciniomycotina]]
|popisek1=[[Urediniomycetes|Pucciniomycotina]]
|1={{klad
|popisek1=(P)
|1=Pucciniomycetes
|2={{klad
|1={{klad
|1=Atractiellomycetes
|2=Classiculomycetes
|3=Cryptomycocolacomycetes
}}
|2={{klad
|1=Cystobasidiomycetes
|2={{klad
|1=Microbotryomycetes
|2={{klad
|1= Mixiomycetes
|2={{klad
|1= Tritirachiomycetes
|2={{klad
|1= Agaricostilbomycetes
|2= Spiculogloeomycetes
}}
}}
}}
}}
}}
}}
}}
|2={{klad
|2={{klad
|popisek1=[[Sněti|Ustilaginomycotina]]<ref name="Kijpornyongpan_2018" />
|1={{klad
|1={{klad
|1=Monilellomycetes
|popisek1=Wallemiomycotina
|1=Wallemiomycetes
|popisek2=[[Sněti|Ustilaginomycotina]]<ref name="Kijpornyongpan_2018" />
|2={{klad
|2={{klad
|1=Malasseziomycetes
|1=Monilellomycetes
|2={{klad
|2={{klad
|1=Exobasidiomycetes
|1=Malasseziomycetes
|2=Ustilaginomycetes
|2={{klad
|1=Exobasidiomycetes
|2=Ustilaginomycetes
}}
}}
}}
}}
}}
Řádek 947: Řádek 1 425:
|2=Dacrymycetes
|2=Dacrymycetes
}}
}}
|2=Tremellomycetes
|2={{klad
|1= Bartheletiomycetes
|2=Tremellomycetes
}}
}}
}}
}}
}}
}}
}}
|popisek2=[[Houby vřeckovýtrusné|Ascomycota]]
|popisek1=[[Houby vřeckovýtrusné|Ascomycota]]
|2={{klad
|1={{klad
|popisek1=[[Taphrinomycotina]]
|popisek1=[[Taphrinomycotina]]
|1={{klad
|1={{klad
|1=Neolectomycetes
|1=Neolectomycetes
|2=Pneumocystidomycetes
|2={{klad
|3=Archaeorhizomycetes<ref name="archaeorhizo1" />
|1=Archaeorhizomycetes<ref name="archaeorhizo1" />
|4=Taphrinomycetes
|2={{klad
|1=Taphrinomycetes
|2={{klad
|1=Pneumocystidomycetes
|2=Schizosaccharomycetes
}}
}}
}}
}}
}}
|2={{klad
|2={{klad
|popisek1=[[Schizosaccharomycotina]]
|popisek1=[[Saccharomycotina]]
|1=Schizosaccharomycetes
|1=Saccharomycetes
|popisek2=[[Pezizomycotina]]
|2={{klad
|2={{klad
|popisek1=[[Saccharomycotina]]
|1={{klad
|1=Saccharomycetes
|1=Orbiliomycetes
|popisek2=[[Pezizomycotina]]
|2=Pezizomycetes
}}
|2={{klad
|2={{klad
|1=Pezizomycetes
|1=Geoglossomycetes<ref name="Schoch2009" />
|2={{klad
|2={{klad
|1=Orbiliomycetes
|1={{klad
|2={{klad
|1={{klad
|1={{klad
|1=Arthoniomycetes
|1=Laboulbeniomycetes
|2=Dothideomycetes
|2=Leotiomycetes
}}
}}
|2={{klad
|2=Sordariomycetes
}}
|2={{klad
|1={{klad
|1={{klad
|1={{klad
|1=Leotiomycetes
|2=Sordariomycetes
|3=Laboulbeniomycetes
}}
|2={{klad
|1={{klad
|1={{klad
|1=Geoglossomycetes<ref name="Schoch2009" />
|1= Candelariomycetes
|2={{klad
|2={{klad
|1=Lichinomycetes
|1=Coniocybomycetes
|2=Coniocybomycetes
|2=Lichinomycetes
}}
}}
|3=Xylonomycetes<ref name="Gazis2012"/>
}}
}}
|2={{klad
|2={{klad
|1=Eurotiomycetes
|1=Xylonomycetes<ref name="Gazis2012"/>
|2=Lecanoromycetes
|2={{klad
|1=Lecanoromycetes
|2= Xylobotryomycetes
}}
}}
}}
}}
}}
|2={{klad
|1=Eurotiomycetes
|2={{klad
|1=Arthoniomycetes
|2=Dothideomycetes
}}
}}
}}
}}

Verze z 13. 10. 2020, 16:37

Klasifikace hub (Fungi) prošla v posledních desetiletích, podobně jako klasifikace nadřazené úrovně Eukaryota, důkladnou revizí na základě fylogenetických studií, které pomohly odhalit vzájemné příbuzenské vztahy jednotlivých taxonů. Aktuální (2020) klasifikace vychází z několika projektů spolupráce širokých kolektivů mykologů, nejprve v rámci projektu Assembling the Fungal Tree of Life (AFTOL),[1] na konci druhého desetiletí 21. století pak v rámci projektu Outline of Fungi and fungus-like taxa (i s účastí mykologů z českých vědeckých pracovišť),[2] vycházejícího z několika předchozích studií.[3][4]

Systém

Systém (do úrovně řádů) navazuje na první komplexní fylogenetickou systematiku hub (publikovanou v r. 2007),[5] zpracovanou v rámci projektu Assembling the Fungal Tree of Life (AFTOL),[1] ale vychází z novější verze (vydané v r. 2020), upravené a doplněné v rámci projektu Outline of Fungi and fungus-like taxa.[2]

Oproti dřívějším obsahují nové, na fylogenetické příbuznosti založené systémy některé zásadní změny. Byla předně zrušena nesystematická kategorie nedokonalých hub (Deuteromycota, Fungi imperfecti); systém také neobsahuje (dříve do hub tradičně řazené) skupiny, které podle nové systematiky Eukaryot patří do jiných skupin (např. Pseudofungi ve skupině Stramenopila či hlenky). Nepřirozená skupina spájivých hub byla rozdělena na samostatné kmeny a podkmeny, u kterých lze přirozenost předpokládat. Ze stejného důvodu došlo k „zeštíhlení“ tradičních chytridiomycet a vyčlenění některých skupin do samostatných kmenů a podkmenů.

Podle aktuálního (2020) systému se říše Fungi dělí na fylogeneticky přirozenou podříši Dikarya, která sdružuje kmeny hub stopkovýtrusých a vřeckovýtrusých, a několik samostatných kmenů, pro přehlednost zpravidla členěných do 8 podříší (s předpokládanou přirozeností). Nově jsou součástí systému hub i afelidie, kryptomycety a mikrosporidie, vyčleňované v některých systémech eukaryot mimo houby do zvláštní skupiny (na úrovni nadkmene) Opisthosporidia, dříve považované za přirozenou. [pozn. 1]

Nad rámec projektu AFTOL tak byly postupně doplněny nově objevené, vyčleněné či z nižší taxonomické úrovně povýšené kmeny Aphelidiomycota, Basidiobolomycota, Calcarisporiellomycota, Caulochytriomycota, Entomophthoromycota, Kickxellomycota, Monoblepharomycota, Mortierellomycota, Mucoromycota, Olpidiomycota, Rozellomycota a Zoopagomycota. V roce 2015 také byly entorrhizomycety vyděleny ze stopkovýtrusých do samostatného kmene Entorrhizomycota.[10] Systém se rozrostl o mnohé nově popsané třídy (např. Archaeorhizomycetes[11][12], Geoglossomycetes[13] a Xylonomycetes[14] a dále o třídy Barbatosporomycetes, Basidiobolomycetes, Calcarisporiellomycetes, Cladochytriomycetes, Hyaloraphidiomycetes, Mesochytriomycetes, Neozygitomycetes, Lobulomycetes, Olpidiomycetes, Physodermatomycetes, Polychytriomycetes, Ramicandelaberomycetes, Rhizophlyctidomycetes, Sanchytriomycetes, Synchytriomycetes, Umbelopsidomycetes, přidané podle studie z r. 2018[15]) a ještě početnější nové řády (např. Stereopsidales[16]).

Lze důvodně předpokládat, že se systém bude nadále rozrůstat o nově objevené skupiny či nově formálně popsané již známé klady z environmentálních vzorků. [15][17][18][19]

Názvoslovné poznámky:

  1. Novější systémy pro houby používají taxon kmen (phyllum) namísto tradičního oddělení (divisio). Není to v rozporu s aktuálním názvoslovným kódem pro řasy, houby a rostliny, tedy tzv. „Schenzen Code“ (2018)[20] a jeho tzv. „San Juan Chapter F“ jakožto nezávisle aktualizovanou kapitolou pro houby (2019).[21]
  2. Rovnítkem jsou vyznačena synonyma (starší nebo alternativní označení); má-li synonymum od nové kategorie odlišnou taxonomickou úroveň, je uvedeno v závorce.
  3. Mezinárodní jména taxonů (s výjimkou mikrosporidií, vizte následující poznámku) jsou psána kurzívou pro taxony řád a níž, antikvou pro taxony třída a výš.[22]
  4. Názvosloví mikrosporidií se i nadále tradičně řídí názvoslovným kódem pro živočichy.[23]
  5. České názvosloví je založené na BioLibu.[24]

Říše: FUNGI – houby

Podříše bazálních linií hub

Chytridiomycota: Synchytridium endobioticum

Podříše jsou řazeny podle postavení ve fylogenetickém stromu hub od nejbazálněji postavených. Nižší taxony jsou řazeny abecedně.

  • Podříše: ROZELLOMYCETA
    • Kmen: Rozellomycota
      • Rozellomycota incertae sedis (dříve samostatná ale parafyletická skupina Rozellosporidia (Cryptomycota) – kryptomycety)
        • bazálně se odvětvující rody Mitosporidium, Morellospora, Nucleophaga, Paramicrosporidium a Rozella (dříve řazená do samostatné třídy Rozellidea a řádu Rozellida, v obou případech podle původní definice pravděpodobně parafyletických) a další dosud formálně nepopsané environmentální vzorky[17]
      • Microsporidia (na úrovni podkmene, možná parafyletické) – mikrosporidie (zastarale hmyzomorky)
        • Třída: Chytridiopsidea[25] (nebo Microsporidia incertae sedis[2])
          • Řád: Chytridiopsida
        • Třída: Microsporidea
          • Řád: Amblyosporida
          • Řád: Neopereziida
          • Řád: Ovavesiculida
          • Řád: Glugeida
          • Řád: Nosematida
        • Třída: Rudimicrosporea = Metchnikovellea
          • Řád: Metchnikovellida
  • Podříše: APHELIDIOMYCETA
  • Podříše: BLASTOCLADIOMYCETA
    • Kmen: Blastocladiomycota = Allomycota
      • Třída: Blastocladiomycetes = Allomycetes
        • Řád: Blastocladiales – blastokladiotvaré
        • Řád: Callimastigales
        • Řád: Catenomycetales
      • Třída: Physodermatomycetes
        • Řád: Physodermatales
  • Podříše: CHYTRIDIOMYCETA
    • Kmen: Caulochytriomycota (dříve součást kmene Chytridiomycota, třídy Spizellomycetes)
      • Třída: Caulochytriomycetes
        • Řád: Caulochytriales
    • Kmen: Chytridiomycota = Archemycota – chytridiomycety
      • Třída: Cladochytriomycetes
        • Řád: Cladochytriales
      • Třída: Chytridiomycetes = Archimycetes
        • Řád: Chytridiales – chytridiotvaré
        • Řád: Nephridiophagales
        • Řád: Polyphagales
        • Řád: Saccopodiales
      • Třída: Lobulomycetes
        • Řád: Lobulomycetales
      • Třída: Mesochytriomycetes
        • Řád: Gromochytriales
        • Řád: Mesochytriales
      • Třída: Polychytriomycetes
        • Řád: Polychytriales
      • Třída: Rhizophlyctidomycetes
        • Řád: Rhizophlyctidales
      • Třída: Rhizophydiomycetes
        • Řád: Rhizophydiales
      • Třída: Spizellomycetes
      • Třída: Synchytriomycetes
        • Řád: Synchytriales
    • Kmen: Monoblepharomycota (dříve součást kmene Chytridiomycota)
      • Třída: Hyaloraphidiomycetes
        • Řád: Hyaloraphidiales
      • Třída: Monoblepharidomycetes
        • Řád: Monoblepharidales
      • Třída: Sanchytriomycetes
        • Řád: Sanchytriales
    • Kmen: Neocallimastigomycota
      • Třída: Neocallimastigomycetes
        • Řád: Neocallimastigales
  • Podříše: BASIDIOBOLOMYCETA
  • Podříše: OLPIDIOMYCETA
  • Podříše: ZOOPAGOMYCETA
    • Kmen: Entomophthoromycota
      • Třída: Entomophthoromycetes
      • Třída: Neozygitomycetes
        • Řád: Neozygitales
    • Kmen: Kickxellomycota
      • Třída: Asellariomycetes
      • Třída: Barbatosporomycetes
        • Řád: Barbatosporales
      • Třída: Dimargaritomycetes
        • Řád: Dimargaritales
      • Třída: Harpellomycetes
      • Třída: Kickxellomycetes
        • Řád: Kickxellales
      • Třída: Ramicandelaberomycetes
        • Řád: Ramicandelaberales
    • Kmen: Zoopagomycota
  • Podříše: MUCOROMYCETA[pozn. 2]
    • Kmen: Calcarisporiellomycota
      • Třída: Calcarisporiellomycetes
        • Řád: Calcarisporiellales
    • Kmen: Glomeromycota
      • Třída: Archaeosporomycetes
        • Řád: Archaeosporales = Geosiphonales
      • Třída: Glomeromycetes = Glomomycetes = Geomycetes
        • Řád: Diversisporales
        • Řád: Gigasporales
        • Řád: Glomerales = Glomales
      • Třída: Paraglomeromycetes
        • Řád: Paraglomerales
    • Kmen: Mortierellomycota
      • Třída: Mortierellomycetes
        • Řád: Mortierellales
    • Kmen: Mucoromycota
      • Třída: Endogonomycetes
      • Třída: Mucoromycetes
      • Třída: Umbelopsidomycetes
        • Řád: Umbelopsidales

Podříše Dikarya

Ascomycota: Smrž kuželovitý (Morchella conica)
  • Podříše: DIKARYA = DIKARYOMYCETA (= NEOMYCOTA)
    • Kmen: Ascomycota – houby vřeckovýtrusé[pozn. 3] = houby vřeckaté = askomycety[26]
      • Podkmen: Pezizomycotina (dříve též Ascomycotina)[26]
        • Třída: Arthoniomycetes
        • Třída: Candelariomycetes
          • Řád: Candelariales
        • Třída: Coniocybomycetes
          • Řád: Coniocybales
        • Třída: Dothideomycetes
          • Podtřída: Dothideomycetidae
            • Řád: Capnodiales
            • Řád: Dothideales – vředovcotvaré
            • Řád: Myriangiales
          • Podtřída: Pleosporomycetidae
            • Řád: Gloniales
            • Řád: Hysteriales – skulinatcotvaré
            • Řád: Mytilinidiales
            • Řád: Pleosporales (včetně pův. Massariales) – zďovkotvaré
          • Dothideomycetes incertae sedis:
            • Řád: Abrothallales = Lichenoconiales
            • Řád: Acrospermales
            • Řád: Asterinales
            • Řád: Botryosphaeriales
            • Řád: Catinellales
            • Řád: Cladoriellales
            • Řád: Collemopsidiales
            • Řád: Dyfrolomycetales
            • Řád: Eremithallales
            • Řád: Eremomycetales
            • Řád: Jahnulales
            • Řád: Kirschsteiniotheliales
            • Řád: Lembosinales
            • Řád: Lichenotheliales
            • Řád: Microthyriales – štítoplodkotvaré
            • Řád: Minutisphaerales
            • Řád: Monoblastiales
            • Řád: Muyocopronales
            • Řád: Murramarangomycetales
            • Řád: Natipusillales
            • Řád: Parmulariales
            • Řád: Patellariales – miskovkotvaré
            • Řád: Phaeotrichales
            • Řád: Stigmatodiscales
            • Řád: Strigulales
            • Řád: Superstratomycetales
            • Řád: Trypetheliales
            • Řád: Tubeufiales
            • Řád: Valsariales
            • Řád: Venturiales
            • Řád: Zeloasperisporiales
        • Třída: Eurotiomycetes
          • Podtřída: Coryneliomycetidae
            • Řád: Coryneliales
          • Podtřída: Eurotiomycetidae
          • Podtřída: Chaetothyriomycetidae
          • Podtřída: Mycocaliciomycetidae
          • Podtřída: Sclerococcomycetidae
            • Řád: Sclerococcales
        • Třída: Geoglossomycetes[13]
          • Řád: Geoglossales
        • Třída: Laboulbeniomycetes
        • Třída: Lecanoromycetes
          • Podtřída: Acarosporomycetidae
            • Řád: Acarosporales
          • Podtřída: Lecanoromycetidae
          • Podtřída: Ostropomycetidae
            • Řád: Baeomycetales
            • Řád: Graphidales
            • Řád: Gyalectales
            • Řád: Ostropales – dlouhovřeckotvaré
            • Řád: Pertusariales (včetně pův. Agyriales) – děratkotvaré
            • Řád: Sarrameanales
            • Řád: Schaereriales
            • Řád: Thelenellales
          • Podtřída: Umbilicariomycetidae
            • Řád: Umbilicariales
          • Lecanoromycetes incertae sedis:
            • Řád: Micropeltidales
            • Řád: Turquoiseomycetales
        • Třída: Leotiomycetes
          • Řád: Cyttariales
          • Řád: Helotiales (včetně pův. Erysiphales – padlí)– voskovičkotvaré
          • Řád: Chaetomellales
          • Řád: Lahmiales
          • Řád: Lauriomycetales
          • Řád: Leotiales
          • Řád: Lichinodiales
          • Řád: Marthamycetales
          • Řád: Medeolariales
          • Řád: Micraspidales
          • Řád: Phacidiales
          • Řád: Rhytismatales = Triblidiales – svraštělkotvaré
          • Řád: Thelebolales
        • Třída: Lichinomycetes
        • Třída: Orbiliomycetes
          • Řád: Orbiliales
        • Třída: Pezizomycetes
        • Třída: Sordariomycetes
          • Podtřída: Diaporthomycetidae
            • Řád: Annulatascales
            • Řád: Atractosporales
            • Řád: Calosphaeriales
            • Řád: Diaporthales – čárovkotvaré
            • Řád: Distoseptisporales
            • Řád: Magnaporthales
            • Řád: Myrmecridiales
            • Řád: Ophiostomatales – ofiostomotvaré
            • Řád: Phomatosporales
            • Řád: Sporidesmiales
            • Řád: Tirisporellales
            • Řád: Togniniales
            • Řád: Xenospadicoidales
          • Podtřída: Hypocreomycetidae
            • Řád: Coronophorales (včetně pův. Melanosporales)
            • Řád: Falcocladiales
            • Řád: Glomerellales
            • Řád: Hypocreales – masenkotvaré
            • Řád: Jobellisiales
            • Řád: Microascales – vřeckovičkotvaré
            • Řád: Pararamichloridiales
            • Řád: Torpedosporales
          • Podtřída: Lulworthiomycetidae
            • Řád: Koralionastetales
            • Řád: Lulworthiales
          • Podtřída: Pisorisporiomycetidae
            • Řád: Pisorisporiales
          • Podtřída: Savoryellomycetidae
            • Řád: Conioscyphales
            • Řád: Fuscosporellales
            • Řád: Pleurotheciales
            • Řád: Savoryellales
          • Podtřída: Sordariomycetidae = Meliolomycetidae
            • Řád: Boliniales – bolinkotvaré
            • Řád: Cephalothecales
            • Řád: Coniochaetales
            • Řád: Chaetosphaeriales
            • Řád: Meliolales
            • Řád: Phyllachorales – puchýřkotvaré
            • Řád: Pseudodactylariales
            • Řád: Sordariales – hnojenkotvaré
          • Podtřída: Xylariomycetidae
            • Řád: Amphisphaeriales
            • Řád: Delonicicolales
            • Řád: Xylariales – dřevnatkotvaré
          • Sordariomycetes incertae sedis:
            • Řád: Amplistromatales
            • Řád: Parasympodiellales
            • Řád: Spathulosporales
            • Řád: Tracyllalales
            • Řád: Trichosphaeriales
            • Řád: Vermiculariopsiellales
        • Třída: Xylobotryomycetes
          • Řád: Xylobotryales
        • Třída: Xylonomycetes[14]
          • původně jediný řád Xylonomycetales rozdělen na:
            • Řád: Symbiotaphrinales
            • Řád: Xylonales
        • Pezizomycotina incertae sedis:
          • Řád: Thelocarpales
          • Řád: Vezdaeales
      • Podkmen: Saccharomycotina (dříve též Hemiascomycotina)[26]
      • Podkmen: Taphrinomycotina (dříve též Archiascomycotina)[26]
        • Třída: Archaeorhizomycetes[11][12]
          • Řád: Archaeorhizomycetales
        • Třída: Neolectomycetes
          • Řád: Neolectales
        • Třída: Pneumocystidomycetes
          • Řád: Pneumocystidales
        • Třída: Schizosaccharomycetes
        • Třída: Taphrinomycetes
    • Kmen: Basidiomycota – houby stopkovýtrusé[pozn. 4] = bazidiomycety[26]
      Basidiomycota: Hřib smrkový (Boletus edulis)
      • Podkmen: Agaricomycotina (= Hymenomycetes)
      • Podkmen: Pucciniomycotina (= Urediniomycetes)
        • Třída: Agaricostilbomycetes
          • Řád: Agaricostilbales
        • Třída: Atractiellomycetes
          • Řád: Atractiellales
        • Třída: Classiculomycetes
          • Řád: Classiculales
        • Třída: Cryptomycocolacomycetes
          • Řád: Cryptomycocolacales
        • Třída: Cystobasidiomycetes
          • Řád: Buckleyzymales
          • Řád: Cystobasidiales
          • Řád: Erythrobasidiales
          • Řád: Naohideales
          • Řád: Sakaguchiales
        • Třída: Microbotryomycetes
          • Řád: Heterogastridiales
          • Řád: Kriegeriales
          • Řád: Leucosporidiales
          • Řád: Microbotryales
          • Řád: Sporidiobolales
        • Třída: Mixiomycetes
          • Řád: Mixiales
        • Třída: Pucciniomycetes (= Urediniomycetidae) – rzi
        • Třída: Spiculogloeomycetes
          • Řád: Spiculogloeales = Mycogloeales
        • Třída: Tritirachiomycetes
          • Řád: Tritirachiales
      • Podkmen: Ustilaginomycotina
        • Třída: Exobasidiomycetes
          • Řád: Ceraceosorales
          • Řád: Doassansiales
          • Řád: Entylomatales
          • Řád: Exobasidiales – plíškotvaré
          • Řád: Georgefischeriales
          • Řád: Golubeviales
          • Řád: Microstromatales
          • Řád: Robbauerales
          • Řád: Tilletiales – mazlavé sněti
        • Třída: Malasseziomycetes[28]
          • Řád: Malasseziales
        • Třída: Monilielliomycetes[28]
          • Řád: Moniliellales
        • Třída: Ustilaginomycetes – sněti
          • Řád: Uleiellales
          • Řád: Urocystales
          • Řád: Ustilaginales – prašné sněti
          • Řád: Violaceomycetales
      • Podkmen: Wallemiomycotina
        • Třída: Wallemiomycetes
          • Řád: Wallemiales
    • Kmen: Entorrhizomycota[10]
      • Třída: Entorrhizomycetes
        • Řád: Entorrhizales
        • Řád: Talbotiomycetales

Fylogenetické stromy

Práce na fylogenetické systematice byly pochopitelně založeny na mnoha studiích, analyzujících molekulárně biologickými metodami fylogenetickou příbuznost jednotlivých taxonů.[29][30][31][32][7][8][14][33][34][35][10][15] Na výše uvedenou systematiku z projektu AFTOL navázala v r. 2009 fylogenetická studie 82 kompletních genomů[29]. Byl potvrzen přirozený klad Dikarya zahrnující houby vřeckovýtrusné a houby stopkovýtrusné, naopak houby spájivé (Zygomycota) se jako nepřirozená skupina rozpadly (a s nimi i nadřazená úroveň Eumycota). Také bylo potvrzeno zahrnutí mikrosporidií do hub.[36][37] Bazální úrovně hub zkoumala fylogenetická analýza jaderných i mitochondriálních genů (publikovaná r. 2009) [30] s cílem stanovit sesterskou skupinu hub a s její pomocí upřesnit bazální větvení fylogenetického stromu hub. Jako sesterská skupina hub byly potvrzeny nuklearie (Nucleariida), pro společný celek bylo navrženo jméno Holomycota. Rod Rozella, zajímavý absencí chitinové buněčné stěny, byl nejprve vyčleněn z chytridií a ve studii z r. 2011 se ukázal být zástupcem nového kmene Cryptomycota, jedné z bazálních evolučních větví hub.[7][8] Za jeho blízké příbuzné byly považovány nejen mikrosporidie, ale překvapivě též afelidie, dříve zahrnované do příbuzenstva živočichů,[6] nově řazené ještě výše, jako sesterská skupina tzv. pravých hub (Eumycota). Studie z r. 2018 pak zahrnula i další, nově objevené skupiny (včetně bazální skupiny BCG1, identifikované v mořských environmentálních vzorcích, a bazální skupiny BCG2 a GS01, identifikované v půdních a sladkovodních environmentálních vzorcích), a naznačila nepřirozenost skupiny Mucoromyceta.[15]

Fylogenetický strom hlavních skupin hub (do úrovně tříd) vypadá podle současných (r. 2020) představ následovně[2] ((P) značí skupinu s nedostatečně průkaznou přirozeností, která se může ukázat parafyletickou, případně polyfyletickou):

Bazální linie hub

Holomycota
Cristidiscoidea[39]
 

Nucleariida

 
 

Fonticula[38]

 
 
Fungi
 

BCG2 + GS01[pozn. 5]

 
 
 
 

BCG1[pozn. 6]

 
Rozellomycota[pozn. 7]
(P)

Cryptomycota = Rozellosporidia[32][7][8]

 
Microsporidia
[25]

Chytridiopsidea

 
 
 

Rudimicrosporea/Metchnikovellea

 
 

Microsporidea

 
 
 
 
 
 
Aphelidiomycota

Aphelidiomycetes[pozn. 8]

 
(klad Eumycota)
 
Blastocladiomycota
 

Blastocladiomycetes

 
 

Physodermatomycetes

 
 
Chytridiomyceta
Neocallimastigomycota

Neocallimastigomycetes

 
 
Monoblepharomycota
 

Monoblepharidomycetes

 
 
 

Hyaloraphidiomycetes

 
 

Sanchytriomycetes

 
 
 
 
Caulochytriomycota

Caulochytriomycetes

 
Chytridiomycota
(P)

Chytridiomycetes

 
 
 

Mesochytriomycetes

 
 
 
 

Lobulomycetes

 
 

Synchytriomycetes

 
 
 
 
 

Cladochytriomycetes

 
 

Polychytriomycetes

 
 
 
 

Rhizophydiomycetes

 
 
 

Rhizophlyctidomycetes

 
 

Spizellomycetes

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
(klad Amastigomycota)
 
 
Basidiobolomycota

Basidiobolomycetes

 
Olpidiomycota

Olpidiomycetes

 
 
Zoopagomyceta
Entomophthoromycota
 

Entomophthoromycetes

 
 

Neozygitomycetes

 
 
 
Zoopagomycota

Zoopagomycetes

 
Kickxellomycota
 

Dimargaritomycetes

 
 
 

Ramicandelaberomycetes

 
 
 

Barbatosporomycetes

 
 
 

Kickxellomycetes

 
 
 

Asellariomycetes

 
 

Harpellomycetes

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Mucoromyceta
Glomeromycota[pozn. 9]
 
 

Archaeosporomycetes

 
 

Paraglomeromycetes

 
 
 

Glomeromycetes

 
 
 
Mortierellomycota

Mortierellomycetes

 
 
Calcarisporiellomycota

Calcarisporiellomycetes

 
Mucoromycota
 

Endogonomycetes

 
 
 

Mucoromycetes

 
 

Umbelopsidomycetes

 
 
 
 
 
 
Dikarya

►

 
 
 
 
 
 
 
 

Dikarya (Neomycota)

Dikarya
 

Entorrhizomycota

 
 
Ascomycota
Taphrinomycotina
 

Neolectomycetes

 
 
 

Archaeorhizomycetes[11]

 
 
 

Taphrinomycetes

 
 
 

Pneumocystidomycetes

 
 

Schizosaccharomycetes

 
 
 
 
 
 
Saccharomycotina

Saccharomycetes

 
Pezizomycotina
 
 

Orbiliomycetes

 
 

Pezizomycetes

 
 
 
 

Geoglossomycetes[13]

 
 
 
 
 

Laboulbeniomycetes

 
 

Leotiomycetes

 
 
 

Sordariomycetes

 
 
 
 
 
 
 

Candelariomycetes

 
 
 

Coniocybomycetes

 
 

Lichinomycetes

 
 
 
 
 

Xylonomycetes[14]

 
 
 

Lecanoromycetes

 
 

Xylobotryomycetes

 
 
 
 
 
 
 

Eurotiomycetes

 
 
 

Arthoniomycetes

 
 

Dothideomycetes

 
 
 
 
 
 
 
 
 
Basidiomycota
Pucciniomycotina
(P)

Pucciniomycetes

 
 
 
 

Atractiellomycetes

 
 

Classiculomycetes

 
 

Cryptomycocolacomycetes

 
 
 
 

Cystobasidiomycetes

 
 
 

Microbotryomycetes

 
 
 

Mixiomycetes

 
 
 

Tritirachiomycetes

 
 
 

Agaricostilbomycetes

 
 

Spiculogloeomycetes

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Wallemiomycotina

Wallemiomycetes

 
Ustilaginomycotina[28]
 

Monilellomycetes

 
 
 

Malasseziomycetes

 
 
 

Exobasidiomycetes

 
 

Ustilaginomycetes

 
 
 
 
 
Agaricomycotina
 
 

Agaricomycetes

 
 

Dacrymycetes

 
 
 
 

Bartheletiomycetes

 
 

Tremellomycetes

 
 
 
 
 
 
 

Poznámky

  1. ↑ Opisthosporidia byla na základě fylogenetických analýz považována za přirozenou sesterskou skupinu hub, ve které se bazálně odvětvovaly afelidie[6] a kryptomycety (Rozella a několik dalších blízkých rodů, jako Mitosporidium, Morellospora, Nucleophaga, Paramicrosporidium) [7][8] byly sesterskou skupinou mikrosporidií. [9] Novější analýzy však naznačují její parafylii, přičemž nejbazálněji se odvětvují tzv. Rozellomycota, zahrnující linii mikrosporidií, od které se postupně odvětvují jednotlivé rody parafyletických kryptomycet. Afelidie jsou pak sesterskou skupinou ostatních hub. [2]
  2. ↑ Dříve se jevila parafyletická – Dikarya se podle některých analýz odvětvovala uvnitř ní, jako sesterská skupina ke Glomeromycota.[15] Podle novějších analýz se jeví jako přirozená.[2]
  3. ↑ se zralými výtrusy ve vřeckách; někdy též uváděné jako „vřeckovýtrusné“[26]
  4. ↑ se zralými výtrusy na stopkách basidií; někdy též uváděné jako „stopkovýtrusné“[26]
  5. ↑ dosud formálně nepopsané bazální skupiny z půdních a sladkovodních vzorků[15][19][17]
  6. ↑ dosud formálně nepopsaná bazální skupina z mořských vzorků[15][18]
  7. ↑ Dříve do této linie byly zahrnovány afelidie, pak nesla název Opisthosporidia="ARM"[6][9]
  8. ↑ Dříve považované za součást Rozellomyceta[6][9]
  9. ↑ v některých dřívějších systémech považovány za sesterskou skupinu Dikaryí, se kterými tvořily „klad“ Symbiomycota, který je však pravděpodobně polyfyletickou skupinou

Reference

  1. ↑ a b Internetová stránka projektu AFTOL
  2. ↑ a b c d e f WIJAYAWARDENE, Nalin N.; HYDE, Kevin D., Al-Ani L. K. T., Tedersoo L., Haelewaters D., Rajeshkumar K. C., Zhao R. L., Aptroot A., Leontyev D. V., Saxena R. K., Tokarev Y. S., Dai D. Q., Letcher P. M., Stephenson S. L., Ertz D., Lumbsch H. T., Kukwa M., Issi I. V., Madrid H., Phillips A. J. L., Selbmann L., Pfliegler W. P., Horváth E., Bensch K., Kirk P. M., Kolaříková K., Raja H. A., Radek R., Papp V., Dima B., Ma J., Malosso E., Takamatsu S., Rambold G., Gannibal P. B., Triebel D., Gautam A. K., Avasthi S., Suetrong S., Timdal E., Fryar S. C., Delgado G., Réblová M., Doilom M., Dolatabadi S., Pawłowska J., Humber R. A., Kodsueb R., Sánchez-Castro I., Goto B. T., Silva D. K. A., de Souza F. A., Oehl F., da Silva G. A., Silva I. R., Błaszkowski J., Jobim K., Maia L. C., Barbosa F. R., Fiuza P. O., Divakar P. K., Shenoy B. D., Castañeda-Ruiz R. F., Somrithipol S., Lateef A. A., Karunarathna S. C., Tibpromma S., Mortimer P. E., Wanasinghe D. N., Phookamsak R., Xu J., Wang Y., Tian F., Alvarado P., Li D. W., Kušan I., Matočec N., Maharachchikumbura S. S. N., Papizadeh M., Heredia G., Wartchow F., Bakhshi M., Boehm E., Youssef N., Hustad V. P., Lawrey J. D., Santiago A. L. C. M. A., Bezerra J. D. P., Souza-Motta C. M., Firmino A. L., Tian Q., Houbraken J., Hongsanan S., Tanaka K., Dissanayake A. J., Monteiro J. S., Grossart H. P., Suija A., Weerakoon G., Etayo J., Tsurykau A., Vázquez V., Mungai P., Damm U., Li Q. R., Zhang H., Boonmee S., Lu Y. Z., Becerra A. G., Kendrick B., Brearley F. Q., Motiejūnaitė J., Sharma B., Khare R., Gaikwad S., Wijesundara D. S. A., Tang L. Z., He M. Q., Flakus A., Rodriguez-Flakus P., Zhurbenko M. P., McKenzie E. H. C., Stadler M., Bhat D. J., Liu J. K., Raza M., Jeewon R., Nassonova E. S., Prieto M., Jayalal R. G. U., Erdoğdu M., Yurkov A., Schnittler M., Shchepin O. N., Novozhilov Y. K., Silva-Filho A. G. S., Liu P., Cavender J. C., Kang Y., Mohammad S., Zhang L. F., Xu R. F., Li Y. M., Dayarathne M. C., Ekanayaka A. H., Wen T. C., Deng C. Y., Pereira O. L., Navathe S., Hawksworth D. L., Fan X. L., Dissanayake L. S., Kuhnert E., Grossart H. P., Thines M. Outline of Fungi and fungus-like taxa. S. 1060–1456. Mycosphere [online]. Innovative Institute for Plant Health, Zhongkai University of Agriculture and Engineering, 18. březen 2020 [cit. 2020-09-05]. Svazek 11, čís. 1:8, s. 1060–1456. Dostupné online. ISSN 2077-7019. DOI 10.5943/mycosphere/11/1/8. (anglicky) 
  3. ↑ WIJAYAWARDENE, Nalin N.; PAWŁOWSKA, Julia; LETCHER, Peter M., et al. Notes for genera: basal clades of Fungi (including Aphelidiomycota, Basidiobolomycota, Blastocladiomycota, Calcarisporiellomycota, Caulochytriomycota, Chytridiomycota, Entomophthoromycota, Glomeromycota, Kickxellomycota, Monoblepharomycota, Mortierellomycota, Mucoromycota, Neocallimastigomycota, Olpidiomycota, Rozellomycota and Zoopagomycota). S. 43–129. Fungal Diversity [online]. Springer Nature Switzerland AG, 19. září 2018. Svazek 92, čís. 1, s. 43–129. Dostupné online. Dostupné také na: [1]. Dále dostupné na: [2]. ISSN 1878-9129. DOI 10.1007/s13225-018-0409-5. (anglicky) 
  4. ↑ DOWELD, Alexander B. Nomenclatural novelties. Index Fungorum [online]. 2. leden 2014. Čís. 49. Dostupné online. Dostupné také na: _ord._nov._Caulochytridomycetes_cl._nov._Caulochytriomycotina_subphyl._nov._and_Caulochytriomycota_phyl._nov. ISSN 2049-2375. (anglicky) 
  5. ↑ HIBBETT, David S., Manfred Binder, Joseph F. Bischoff, Meredith Blackwell, Paul F. Cannon, Ove E. Eriksson, Sabine Huhndorf, Timothy James, Paul M. Kirk, Robert Lücking, H. Thorsten Lumbsch, François Lutzoni, P. Brandon Matheny, David J. McLaughlin, Martha J. Powell, Scott Redhead, Conrad L. Schoch, Joseph W. Spatafora, Joost A. Stalpers, Rytas Vilgalys, M. Catherine Aime, André Aptroot, Robert Bauer, Dominik Begerow, Gerald L. Benny, Lisa A. Castlebury, Pedro W. Crous, Yu-Cheng Dai, Walter Gams, David M. Geiser, Gareth W. Griffith, Cécile Gueidan, David L. Hawksworth, Geir Hestmark, Kentaro Hosaka, Richard A. Humber, Kevin D. Hyde, Joseph E. Ironside, Urmas Kõljalg, Cletus P. Kurtzman, Karl-Henrik Larsson, Robert Lichtwardt, Joyce Longcore, Jolanta Miądlikowska, Andrew Miller, Jean-Marc Moncalvo, Sharon Mozley-Standridge, Franz Oberwinkler, Erast Parmasto, Valérie Reeb, Jack D. Rogers, Claude Roux, Leif Ryvarden, José Paulo Sampaio, Arthur Schüßler, Junta Sugiyama, R. Greg Thorn, Leif Tibell, Wendy A. Untereiner, Christopher Walker, Zheng Wang, Alex Weir, Michael Weiss, Merlin M. White, Katarina Winka, Yi-Jian Yao, Ning Zhang. A higher-level phylogenetic classification of the Fungi. S. 509-547. Mycological Research [online]. 13. března 2007 [cit. 2009-12-03]. Svazek 111, čís. 5, s. 509-547. Dostupné online. ISSN 0953-7562. DOI 10.1016/j.mycres.2007.03.004. (anglicky) 
  6. ↑ a b c d e KARPOV, Sergej A.; MICHAJLOV, Kirill V.; MIRZAEVA, Gulnara S., MIRABDULLAEV, Iskandar M.; MAMKAEVA, Kira A.; TITOVA, Nina N.; ALJOŠIN, Vladimir V. Obligately Phagotrophic Aphelids Turned out to Branch with the Earliest-diverging Fungi. S. 195-205. Protist [online]. 9. říjen 2012. Svazek 164, čís. 2, s. 195-205. Dostupné online. ISSN 1434-4610. DOI 10.1016/j.protis.2012.08.001. PMID 23058793. (anglicky) 
  7. ↑ a b c d TURNER, Marian. The evolutionary tree of fungi grows a new branch. Nature news. 11. květen 2011. Dostupné online. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/news.2011.285. (anglicky) 
  8. ↑ a b c d JONES, Meredith D. M.; FORN, Irene; GADELHA, Catarina, Martin J. Egan, David Bass, Ramon Massana, Thomas A. Richards. Discovery of novel intermediate forms redefines the fungal tree of life. Nature. 11. květen 2011, svazek 474, čís. 7350, s. 200-203. Dostupné online [abstrakt]. ISSN 0028-0836. DOI 10.1038/nature09984. (anglicky) 
  9. ↑ a b c KARPOV, Sergey A.; MAMKAEVA, Maria A.; NASSONOVA, Elena, LILJE, Osu; GLEASON, Frank H. Morphology, phylogeny, and ecology of the aphelids (Aphelidea, Opisthokonta) and proposal for the new superphylum Opisthosporidia. S. 1-11. Frontiers in Microbiology [online]. 28. březen 2014. Svazek 5, čís. 112, s. 1-11. Dostupné online. DOI 10.3389/fmicb.2014.00112. (anglicky) 
  10. ↑ a b c BAUER, Robert; GARNICA, Sigisfredo; OBERWINKLER, Franz, RIESS, Kai; WEISS, Michael; BEGEROW, Dominik. Entorrhizomycota: A New Fungal Phylum Reveals New Perspectives on the Evolution of Fungi. S. 1-19. PLoS ONE [online]. 22. červenec 2015. Svazek 10, čís. 7: e0128183, s. 1-19. Dostupné online. ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0128183. (anglicky) 
  11. ↑ a b c ROSLING, Anna; COX, Filipa; CRUZ-MARTINEZ, Karelyn, Katarina Ihrmark, Gwen-Aëlle Grelet, Björn D. Lindahl, Audrius Menkis, Timothy Y. James. Archaeorhizomycetes: Unearthing an Ancient Class of Ubiquitous Soil Fungi. Science. 12. srpen 2011, svazek 333, čís. 6044, s. 876-879. Dostupné online [abstrakt]. ISSN 0036-8075. DOI 10.1126/science.1206958. (anglicky) 
  12. ↑ a b Hidden soil fungus, now revealed, is in a class all its own, PhysOrg, 11. 8. 2011 (popularizační článek k předchozí referenci)
  13. ↑ a b c SCHOCH, C.L.; WANG, Z.; TOWNSEND, J.P.; SPATAFORA, J.W. Geoglossomycetes cl. nov., Geoglossales ord. nov. and taxa above class rank in the Ascomycota Tree of Life. S. 129–138. Persoonia [online]. 5. červen 2009. Svazek 22, s. 129–138. Dostupné online. DOI 10.3767/003158509X461486. (anglicky) 
  14. ↑ a b c d GAZIS, R.; MIADLIKOWSKA, J.; LUTZONI, F.; ARNOLD, A.E.; CHAVERRI, P. Culture-based study of endophytes associated with rubber trees in Peru reveals a new class of Pezizomycotina: Xylonomycetes. S. 294-304. Molecular Phylogenetics and Evolution [online]. Říjen 2012. Svazek 65, čís. 1, s. 294-304. Dostupné online. ISSN 1055-7903. DOI 10.1016/j.ympev.2012.06.019. (anglicky) 
  15. ↑ a b c d e f g h TEDERSOO, Leho; SÁNCHEZ-RAMÍREZ,, Santiago; KÕLJALG, Urmas; BAHRAM, Mohammad; DÖRING, Markus; SCHIGEL, Dmitry; MAY, Tom, RYBERG, Martin; ABARENKOV, Kessy. High-level classification of the Fungi and a tool for evolutionary ecological analyses. S. 135-159. Fungal Diversity [online]. Springer Netherlands, 16. květen 2018. Svazek 90, čís. 1, s. 135-159. Dostupné online. ISSN 1878-9129. DOI 10.1007/s13225-018-0401-0. (anglicky) 
  16. ↑ a b SJÖKVIST, Elisabet; PFEIL, Bernard E.; LARSSON, Ellen, LARSSON, Karl-Henrik. Stereopsidales - A New Order of Mushroom-Forming Fungi. S. 1-9. PLoS ONE [online]. 28. duben 2014. Svazek 9, čís. 4: e95227, s. 1-9. Dostupné online. Dostupné také na: [3]. ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0095227. PMID 24777067. (anglicky) 
  17. ↑ a b c TEDERSOO, Leho; BAHRAM, Mohammad; PUUSEPP, Rasmus; NILSSON, R. Henrik; JAMES, Timothy Y. Novel soil-inhabiting clades fill gaps in the fungal tree of life. Microbiome [online]. BioMed Central Ltd, part of Springer Nature, 8. duben 2017. Svazek 5, čís. 1:42. Dostupné online. Dostupné také na: [4]. Dále dostupné na: [5]. ISSN 2049-2618. DOI 10.1186/s40168-017-0259-5. PMID 28388929. (anglicky) 
  18. ↑ a b NAGAHAMA, Takahiko; TAKAHASHI, Eriko; NAGANO, Yuriko; ABDEL-WAHAB, Mohamed A.; MIYAZAKI, Masayuki. Molecular evidence that deep-branching fungi are major fungal components in deep-sea methane cold-seep sediments. S. 2359-2370. Environmental Microbiology [online]. John Wiley & Sons, Inc., 23. květen 2011. Svazek 13, čís. 8, s. 2359-2370. Dostupné online. Dostupné také na: [6]. ISSN 1462-2920. DOI 10.1111/j.1462-2920.2011.02507.x. PMID 21605311. (anglicky) 
  19. ↑ a b MONCHY, Sébastien; SANCIU, Giovanna; JOBARD, Marlène; RASCONI, Serena; GERPHAGNON, Mélanie; CHABÉ, Magali; CIAN, Amandine. Exploring and quantifying fungal diversity in freshwater lake ecosystems using rDNA cloning/sequencing and SSU tag pyrosequencing. S. 1433-1453. Environmental Microbiology [online]. John Wiley & Sons, Inc., 9. březen 2011. Svazek 13, čís. 6, s. 1433-1453. Dostupné online. Dostupné také na: [7]. PDF [8]. ISSN 1462-2920. DOI 10.1111/j.1462-2920.2011.02444.x. PMID 21635672. (anglicky) 
  20. ↑ International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants (Shenzhen Code) adopted by the Nineteenth International Botanical Congress Shenzhen, China, July 2017 [online]. Příprava vydání Turland, N. J.; Wiersema, J. H.; Barrie, F. R.; Greuter, W.; Hawksworth, D. L.; Herendeen, P. S.; Knapp, S.; Kusber, W.-H.; Li, D.-Z.; Marhold, K.; May, T. W.; McNeill, J.; Monro, A. M.; Prado, J.; Price, M. J.; Smith, G. F.. Glashütten: Koeltz Botanical Books, 2018-06-26. (Regnum Vegetabile 159). Dostupné online. PDF [9]. DOI 10.12705/Code.2018. (anglicky) 
  21. ↑ MAY, Tom W.; REDHEAD, Scott A.; BENSCH, Konstanze; HAWKSWORTH, David L.; LENDEMER, James; LOMBARD, Lorenzo; TURLAND, Nicholas J. Chapter F of the International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants as approved by the 11th International Mycological Congress, San Juan, Puerto Rico, July 2018. IMA Fungus [online]. BioMed Central Ltd, part of Springer Nature, 27. prosinec 2019. Svazek 10, čís. 21. Dostupné online. ISSN 2210-6359. DOI 10.1186/s43008-019-0019-1. (anglicky) 
  22. ↑ Zásada uplatňovaná Českou vědeckou společností pro mykologii pro jí vydávaný odborný časopis Czech Mycology, akceptovaná i pro českou Wikipedii – vizte Diskuse k šabloně:Taxobox#Souhrnný návrh na robotické změny
  23. ↑ International Commission on Zoological Nomenclature. International Code of Zoological Nomenclature [online]. Příprava vydání RIDE, W. D. L.; COGGER, H. G.; DUPUIS, C.; KRAUS, O.; MINELLI, A.; THOMPSON, F. C.; TUBBS, P. K.. 4.. vyd. The International Trust for Zoological Nomenclature, 1999, rev. 2012 [cit. 2020-09-05]. Dostupné online. ISBN 0-85301-006-4. (anglicky) 
  24. ↑ BioLib: říše houby
  25. ↑ a b CORSARO, Daniele; WYLEZICH, Claudia; VENDITTI, Danielle; MICHEL, Rolf; WALOCHNIK, Julia; WEGENSTEINER, Rudolf. Filling gaps in the microsporidian tree: rDNA phylogeny of Chytridiopsis typographi (Microsporidia: Chytridiopsida). S. 169–180. Parasitology Research [online]. Springer Nature Switzerland AG, 12. listopad 2018. Svazek 118, čís. 1, s. 169–180. Dostupné online. Dostupné také na: [10]. ISSN 1432-1955. DOI 10.1007/s00436-018-6130-1. PMID 30421347. (anglicky) 
  26. ↑ a b c d e f g h KALINA, Tomáš; VÁŇA, Jiří. Sinice, řasy, houby, mechorosty a podobné organismy v současné biologii. 1. vyd. Praha: Karolinum, prosinec 2005. 608 s., 32 s. obr. příl. Dostupné online. ISBN 80-246-1036-1, ISBN 978-80-246-1036-8. Kapitola 3.3 Říše: Houby – Fungi (syn. Mycetalia), s. 229-405. 
  27. ↑ SHIROUZU, Takashi; UNO, Kunihiko; HOSAKA, Kentaro, HOSOYA, Tsuyoshi. Early-diverging wood-decaying fungi detected using three complementary sampling methods. S. 11-20. Molecular Phylogenetics and Evolution [online]. 2. únor 2016. Svazek 98, s. 11-20. Dostupné online. ISSN 1055-7903. DOI 10.1016/j.ympev.2016.01.015. PMID 26850687. (anglicky) 
  28. ↑ a b c KIJPORNYONGPAN, Teeratas; MONDO, Stephen J.; BARRY, Kerrie; SANDOR, Laura; LEE, Juna; LIPZEN, Anna; PANGILINAN, Jasmyn, LaBUTTI, Kurt; HAINAUT, Matthieu; HENRISSAT, Bernard; GRIGORIEV, Igor V.; SPATAFORA, Joseph W.; AIME, M. Catherine. Broad Genomic Sampling Reveals a Smut Pathogenic Ancestry of the Fungal Clade Ustilaginomycotina. S. 1840–1854. Molecular Biology and Evolution [online]. Society for Molecular Biology and Evolution, 15. květen 2018. Svazek 35, čís. 8, s. 1840–1854. Dostupné online. ISSN 1537-1719. DOI 10.1093/molbev/msy072. PMID 29771364. (anglicky) 
  29. ↑ a b HAO WANG, Zhao Xu, Lei Gao, Bailin Hao. A fungal phylogeny based on 82 complete genomes using the composition vector method. S. 1-13. BMC Evolutionary Biology [online]. 10. srpna 2009 [cit. 2009-12-03]. Svazek 9, čís. 195, s. 1-13. Dostupné online. PDF [11]. ISSN 1471-2148. DOI 10.1186/1471-2148-9-195. (anglicky) 
  30. ↑ a b YU LIU; STEENKAMP, Emma T.; BRINKMANN, Henner, Lise Forget, Herve Philippe, B. Franz Lang. Phylogenomic analyses predict sistergroup relationship of nucleariids and Fungi and paraphyly of zygomycetes with significant support. S. 1-31. BMC Evolutionary Biology [online]. 25. listopad 2009 [cit. 2009-12-02]. 9 svazek, čís. 272, s. 1-31. Dostupné online. PDF [12]. ISSN 1471-2148. DOI 10.1186/1471-2148-9-272. (anglicky) 
  31. ↑ Internetový projekt „Tree of Life”: Fungi
  32. ↑ a b LARA, Enrique; MOREIRA, David; LÓPEZ-GARCÍA, Purificación. The Environmental Clade LKM11 and Rozella Form the Deepest Branching Clade of Fungi. Protist. Leden 2010, svazek 161, čís. 1, s. 116-121. Dostupné online [cit. 2010-01-04]. DOI 10.1016/j.protis.2009.06.005. (anglicky) 
  33. ↑ EBERSBERGER, Ingo; MATOS SIMOES, Ricardo de; KUPCZOK, Anne, GUBE, Matthias; KOTHE, Erika; VOIGT, Kerstin; von HAESELER, Arndt. A Consistent Phylogenetic Backbone for the Fungi. S. 1319–1334. Molecular Biology and Evolution [online]. 22. listopad 2011. Svazek 29, s. 1319–1334. ISSN 1537-1719. DOI 10.1093/molbev/msr285. (anglicky) 
  34. ↑ ZHUANG, Wen-Ying; LIU, Chao-Yang. What an rRNA Secondary Structure Tells about Phylogeny of Fungi in Ascomycota with Emphasis on Evolution of Major Types of Ascus. S. 1-10. PLoS ONE [online]. 26. říjen 2012. Svazek 7, čís. 10: e47546, s. 1-10. Dostupné online. Dostupné také na: [13]. ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0047546. PMID 23110078. (anglicky) 
  35. ↑ BEIMFORDE, Christina; FELDBERG, Kathrin; NYLINDER, Stephan, RIKKINEN, Jouko; TUOVILA, Hanna; DÖRFELT, Heinrich; GUBE, Matthias; JACKSON, Daniel J.; REITNER, Joachim; SEYFULLAH, Leyla J.; SCHMIDT, Alexander R. Estimating the Phanerozoic history of the Ascomycota lineages: Combining fossil and molecular data. S. 386–398. Molecular Phylogenetics and Evolution [online]. 30. duben 2014. Svazek 78, s. 386–398. Dostupné online. ISSN 1055-7903. DOI 10.1016/j.ympev.2014.04.024. (anglicky) 
  36. ↑ SOKOLOVA, Ju. Ja. (Соколова Ю. Я.). Origin of Microsporidia and their systematic position among eukaryotes. Микология и фитопатология. 2009, svazek 43, čís. 3, s. 177-192. Dostupné online [abstrakt]. ISSN 0026-3648. (anglicky) 
  37. ↑ KOESTLER, Tina; EBERSBERGER, Ingo. Zygomycetes, microsporidia, and the evolutionary ancestry of sex determination. S. 186-194. Genome Biology and Evolution [online]. 9. únor 2011. Svazek 3, s. 186-194. Dostupné online. PDF [14]. ISSN 1759-6653. DOI 10.1093/gbe/evr009. (anglicky) 
  38. ↑ BROWN, Matthew W.; SPIEGEL, Frederick W.; SILBERMAN, Jeffrey D. Phylogeny of the “Forgotten” Cellular Slime Mold, Fonticula alba, Reveals a Key Evolutionary Branch within Opisthokonta. S. 2699-2709. Molecular Biology and Evolution [online]. 19. srpen 2009. Svazek 26, čís. 12, s. 2699-2709. Dostupné online. PDF [15]. ISSN 1537-1719. DOI 10.1093/molbev/msp185. (anglicky) 
  39. ↑ CAVALIER-SMITH, Thomas. Megaphylogeny, Cell Body Plans, Adaptive Zones: Causes and Timing of Eukaryote Basal Radiations. S. 26–33. Journal of eukaryotic microbiology [online]. 14. říjen 2008. Svazek 56, čís. 1, s. 26–33. Dostupné online. PDF [16]. ISSN 1550-7408. DOI 10.1111/j.1550-7408.2008.00373.x. (anglicky) 

Související články

Citováno z „https://cs.wikipedia.org/w/index.php?title=Klasifikace_hub&oldid=19069977“