DAPI
| DAPI | |
|---|---|
 Struktura | |
| Obecné | |
| Systematický název | 2-(4-amidinofenyl)-1H-indol-6-carboxamidin |
| Ostatní názvy | 4′,6-Diamidin-2-fenylindol |
| Anglický název | DAPI |
| Sumární vzorec | C16H15N5 |
| Vzhled | Žlutý až oranžový prášek |
| Identifikace | |
| Registrační číslo CAS | 28718-90-3 |
| PubChem | 2954 |
| ChEBI | 51231 |
| SMILES | [N@H]=C(N)c3ccc(c2cc1ccc(cc1n2)C(=[N@H])N)cc3 |
| Vlastnosti | |
| Molární hmotnost | 277.324 |
Některá data mohou pocházet z datové položky. | |
DAPI (4',6-diamidin-2-fenylindol) je fluorescenční barvivo, které se pevně váže na AT bohaté oblasti v DNA.[1] DAPI se pro svou silnou fluorescenci a schopnost procházet buněčnou membránou běžně používá ve fluorescenční mikroskopii pro obarvení buněčných jader.
DAPI bylo poprvé syntetizováno roku 1971 v laboratoři Otto Danna při hledání léků proti trypanosomiáze, a i když jako lék nebylo používáno, výzkum DAPI ukázal, že se velmi silně váže na DNA a po vazbě fluoreskuje, což roku 1975 vedlo k objevu mitochondriální DNA při ultracentrifugaci.[2]
Mechanismus fluorescence
[editovat | editovat zdroj]
Po vazbě DAPI na DNA se až 20× zesiluje intenzita fluorescence, protože nedochází ke zhášení fluorescence molekulami vody v roztoku. Při vazbě na dvouvláknovou DNA má DAPI excitační maximum při 358 nm (ultrafialové světlo) a emisní maximum při 461 nm (modrá). DAPI se váže nejsilněji na úseky DNA bohaté na AT, kde se váže v poměru 1 molekula DAPI na 3 AT-páry.[1] Kromě toho se DAPI může vázat i na RNA, i když fluorescence je výrazně slabší a emisní maximum je posunuto k 500 nm.
Související články
[editovat | editovat zdroj]Externí odkazy
[editovat | editovat zdroj]
Obrázky, zvuky či videa k tématu DAPI na Wikimedia Commons
Reference
[editovat | editovat zdroj]V tomto článku byl použit překlad textu z článku DAPI na anglické Wikipedii.
- ↑ a b KAPUŚCIŃSKI, J.; SZER, W. Interactions of 4', 6-diamidine-2-phenylindole with synthetic polynucleotides.. Nucleic Acids Res. Aug 1979, roč. 6, čís. 11, s. 3519–34. PMID 493113.
- ↑ KAPUSCINSKI, J. DAPI: a DNA-specific fluorescent probe.. Biotech Histochem. Sep 1995, roč. 70, čís. 5, s. 220–33. PMID 8580206.