Gemmatimonadetes

Z Wikipedie, otevřené encyklopedie
Skočit na navigaci Skočit na vyhledávání
Jak číst taxoboxGemmatimonadetes
alternativní popis obrázku chybí
Vědecká klasifikace
Doména bakterie (Bacteria)
Kmen Gemmatimonadetes (nově Gemmatimonadota)
Zhang a kol. 2003
třídy

Gemmatimonadetes (Zhang a kol., 2003) Longimicrobia (Pascual a kol. 2016)

Některá data mohou pocházet z datové položky.

Bakteriální kmen Gemmatimonadetes (nově též Gemmatimonadota) byl formálně ustaven v roce 2003. Do současné doby obsahuje pouze pět popsaných druhů a dělí se do 2 tříd: Gemmatimonadetes a Longimicrobia. Jeho zástupci jsou aerobní a semiaerobní heterotrofní organismy. Gemmatimonadetes jsou relativně běžnou složkou půdních mikrobiálních společenstev, kde tvoří 1-2% přítomných bakterií. Nacházíme je ovšem také ve sladkých vodách, čistírnách odpadních vod a sedimentech.

Popsané druhy[editovat | editovat zdroj]

První druh kmene Gemmatimonadetes bakterie Gemmatimonas aurantiaca T-27T byla popsána roku 2003. Tato gramnegativní, tyčinkovitá a aerobní bakterie byla kultivován z aktivovaného kalu čističky odpadních vod.[1] Druhým popsaným druhem byla roku 2013 bakterie Gemmatirosa kalamazoonensis KBS708, která byla izolována z organicky obdělávané půdy v Michiganu v USA.[2]

Dalším popsaným druhem byla Gemmatimonas phototrophica AP64T, která byla roku 2014 izolována z mělkého sladkovodního jezera Tiān é hú nacházejícím se v čínské provincii Vnitřní Mongolsko[3]. Unikátní vlastností tohoto organismu je přítomnost fotosyntetických reakčních center. Tento organismus pravděpodobně získal své fotosyntetické geny horizontálním přenosem z fototrofních Proteobakterií. G. phototrophica je fakultativní fotoheterotrof. Pro svůj růst potřebuje přísun organických látek, ale je schopen pokrýt velkou část svých metabolických potřeb pomocí světelné energie.[4]

Bakterie Longimicrobium terrae CB-286315T byla izolována ze vzorku lesní půdy poblíž španělské Granady. Vzhledem ke své značné fylogenetické odlišnosti ustavila roku 2016 i novou třídu nazvanou Longimicrobia.[5] Posledním kultivovaným zástupcem Gemmatimonadetes je Roseisolibacter agri AW1220T izolovaný ze zemědělské půdy v Namibii.[6]

Reference[editovat | editovat zdroj]

  1. Zhang H, Sekiguchi Y, Hanada S, Hugenholtz P, Kim H, Kamagata Y, Nakamura K. Gemmatimonas aurantiaca gen. nov., sp. nov., a gram-negative, aerobic, polyphosphate-accumulating micro-organism, the first cultured representative of the new bacterial phylum Gemmatimonadetes phyl. nov.. Int J Syst Evol Microbiol. 2003, roč. 53, čís. Pt 4, s. 1155-63. Dostupné v archivu pořízeném dne 2008-06-07. 
  2. DeBruyn J.M.; Fawaz M.N.; Peacock, A.D.; Dunlap J.R.; Nixon L.T.; Cooper K.E.; Radosevich M. Gemmatirosa kalamazoonesis gen. nov., sp. nov., a member of the rarelycultivated bacterial phylum Gemmatimonadetes.. J Gen Appl Microbiol. 2013, roč. 59, s. 305–312. 
  3. Zeng Y.; Selyanin V.; Lukeš M.; Dean J.; Kaftan D.; Feng F.; Koblížek M. Characterization of the microaerophilic, bacteriochlorophyll a-containing bacterium Gemmatimonas phototrophica sp. nov., and emended descriptions of the genus Gemmatimonas and Gemmatimonas aurantiaca.. Int J Syst Evol Microbiol. 2015, roč. 65, s. 2410–2419. 
  4. Zeng Y.; Feng F.; Medová H.; Dean J.; Koblížek M. Functional type 2 photosynthetic reaction centers found in the rare bacterial phylum Gemmatimonadetes.. Proc Natl Acad Sci USA. 2014, roč. 111, s. 7795–7800. 
  5. Pascual J.; García-López M.; Bills G.F.; Genilloud O. Longimicrobium terrae gen. nov., sp. nov., a novel oligotrophic bacterium of the underrepresented phylum Gemmatimonadetes isolated through a system of miniaturized diffusion chambers.. Int J Syst Evol Microbiol. 2016, roč. 66, s. 1976-1985. 
  6. PASCUAL, J., Foesel B.U., Geppert A., Huber K.J., Boedeker C., Luckner M., Wanner G., Overmann J. Roseisolibacter agri gen. nov., sp. nov., a novel slow-growing member of the under-represented phylum Gemmatimonadetes. Int J Syst Evol Microbiol. 2018, roč. 68, s. 1028-1036. 

Externí odkazy[editovat | editovat zdroj]