Ubikvitin ligáza: Porovnání verzí
Smazaný obsah Přidaný obsah
m Mario7 přesunul stránku Ubiquitin ligáza na Ubikvitin ligáza s výměnou přesměrování: běžně užívaný český název |
úprava úvodu po přesunu |
||
| Řádek 1: | Řádek 1: | ||
[[Soubor:4a4c.png|náhled|Ubiquitin ligáza (E3) tmavě modře, v komplexu s enzymem E2 (světle modře) a substrátovým peptidem (zeleně)]] |
[[Soubor:4a4c.png|náhled|Ubiquitin ligáza (E3) tmavě modře, v komplexu s enzymem E2 (světle modře) a substrátovým peptidem (zeleně)]] |
||
''' |
'''Ubikvitin ligáza''' (též '''ubiquitin ligáza''' nebo '''enzym E3''') je jakýkoliv [[enzym]], který katalyzuje konečný přenos malého proteinu [[ubiquitin]]u na cílový substrát. Jedná se o poslední krok v procesu [[ubiquitinylace]] proteinů. Ubuiquitin je přenesen buď z [[SH skupina|SH skupiny]] [[cystein]]u přímo na molekule enzymu E3, nebo (u ligáz obsahujících [[RING finger]]) přímo z [[enzym E2|enzymu E2]]. Cílem je [[aminoskupina]] [[lysin]]u na substrátu, případně [[N-terminus|N-terminální]] aminoskupina proteinu. Řada ubiquitinylačních reakcí za sebou se označuje jako [[polyubiquitinylace]] a obvykle je signálem pro [[degradace proteinů|degradaci proteinu]], na který byla taková značka přidána.<ref name="ency">{{citace monografie | editoři = Lennarz,W.J., Lane, M.D. | titul = Encyclopedia of Biological Chemistry , Four-Volume Set, 1-4 | kapitola = Ubiquitin System | autor = Aaron Ciechanover ; Michael H. Glickman}}</ref> |
||
== Klasifikace == |
== Klasifikace == |
||
| Řádek 10: | Řádek 10: | ||
== Reference == |
== Reference == |
||
<references /> |
<references /> |
||
{{pahýl}} |
{{pahýl}} |
||
Verze z 16. 2. 2018, 14:44
Ubikvitin ligáza (též ubiquitin ligáza nebo enzym E3) je jakýkoliv enzym, který katalyzuje konečný přenos malého proteinu ubiquitinu na cílový substrát. Jedná se o poslední krok v procesu ubiquitinylace proteinů. Ubuiquitin je přenesen buď z SH skupiny cysteinu přímo na molekule enzymu E3, nebo (u ligáz obsahujících RING finger) přímo z enzymu E2. Cílem je aminoskupina lysinu na substrátu, případně N-terminální aminoskupina proteinu. Řada ubiquitinylačních reakcí za sebou se označuje jako polyubiquitinylace a obvykle je signálem pro degradaci proteinu, na který byla taková značka přidána.[1]
Klasifikace
Dnes je známo velké množství ubiquitin ligáz, např. v lidském genomu jich je více než 600. Ty jsou zpravidla klasifikovány do tří tříd:[2]
- RING ubiquitin ligázy – nejrozsáhlejší skupina ubiquitin ligáz, které pracují jako monomery nebo dimery. Obsahují tzv. RING finger (z angl. výrazu "really interesting new gene"), který váže zinečnatý iont, případně podobný U-box motiv, který zinek neváže. Katalyzují jednokrokový přenos z enzymu E2 na molekulu substrátu. Speciální podtřídou RING ubiquitin ligáz jsou cullin-RING ubiquitin ligázy (CRLs), které se skládají z několika podjednotek vázajících se na kostru cullinu. Další známou RING ubiquitin ligázou je APC/C komplex, resp. jeho RING podjednotka Apc11.
- HECT ubiquitin ligázy – skupina ubiquitin ligáz obsahujících tzv. motiv HECT (homologous to the E6AP carboxyl terminus). Přenáší ubiquitin z E2 nejprve na vlastní cysteinový zbytek a teprve následně na substrát. HECT jsou tvořeny dvěma laloky, jeden slouží k vazbě E2 a druhý obsahuje zmíněný katalytický cystein (oba laloky mohou během katalytického cyklu měnit svou vzájemnou prostorovou orientaci). N-terminální část je zodpovědná za substrátovou specifitu a podle jejího typu se ještě dále rozlišují Nedd4 ubiquitin ligázy (obsahující WW motiv s dvěma tryptofany) a HERC ubiquitin ligázy (které mají jednu nebo více RCC1-like domén)
- RBR ubiquitin ligázy – z anglického sousloví "RING-betweenRING-RING", odkazujícího na fakt, že obsahují RING1 doménu a RING2 doménu, mezi nimiž je tzv. "betweenRING" doména. RING1 slouží k vazbě E2, zatímco RING2 obsahuje katalytický cystein. RBR často obsahují další dodatečné domény.
Reference
- ↑ Aaron Ciechanover ; Michael H. Glickman. Encyclopedia of Biological Chemistry , Four-Volume Set, 1-4. Příprava vydání Lennarz,W.J., Lane, M.D.. [s.l.]: [s.n.] Kapitola Ubiquitin System.
- ↑ MORREALE, Francesca Ester; WALDEN, Helen. Types of Ubiquitin Ligases. Cell. 2016-03-24, roč. 165, čís. 1, s. 248–248.e1. Dostupné online [cit. 2016-03-26]. ISSN 0092-8674. DOI 10.1016/j.cell.2016.03.003. (English)
