Palindrom (genetika)

Z Wikipedie, otevřené encyklopedie
Skočit na: Navigace, Hledání
Plastidová DNA má typické oblasti IR

Palindrom je v genetice sekvence nukleové kyseliny (DNA nebo RNA, která je stejná, pokud se čte od 5' konce k 3' konci jednoho vlákna a od 5' konce k 3' konci na komplementárním vlákně (viz direkcionalita a příklad v textu). Sekvence rozeznávaná restrikčními endonukleázami jsou často palindromatické.

Příklad palindromatické sekvence:

 5'- G  A  A  T  T  C -3'
 3'- C  T  T  A  A  G -5'

Jako palindrom se někdy nepřesně označují také invertované repetice (inverted repeat, z angl. inverted–obrácený a repeat-opakování), někdy zkráceně IR, tedy sekvence nukleotidů (v DNA či RNA), která je komplementární k jiné sekvenci, ale pořadí bází je zrcadlově obrácené. Příkladem je řetězec:

---CCTGCXXXXXXXGCAGG---

který může vytvářet vlásenku následující podoby:

---C G---
   C G
   T A
   G C
   C G
   X X
  X   X
   X X
    X


Invertované repetice je možné najít na koncích řetězce transpozonů, v určité části plastidové DNA, ale také v místech, kde může docházet k párování bází mezi řetězci.

V tomto článku byl použit překlad textu z článku Inverted repeat na anglické Wikipedii.