Stramenopila: Porovnání verzí
Smazaný obsah Přidaný obsah
+1 interwiki |
doplnění fylogenetických vztahů |
||
| Řádek 14: | Řádek 14: | ||
| doi = 10.1017/S0006323198005167}}</ref>) je kmen [[eukaryota|eukaryotických]] organismů z říše [[Chromalveolata]]. Jedná se o značně heterogenní skupinu, někteří zástupci jsou mnohobuněční, jiní jednobuněční. Všechny však spojují dva tzv. heterokontní [[bičík]]y určitých životních stádií těchto organismů: jeden z nich je holý, druhý však rozvětvený v trojdílné [[mastigonemy]]. |
| doi = 10.1017/S0006323198005167}}</ref>) je kmen [[eukaryota|eukaryotických]] organismů z říše [[Chromalveolata]]. Jedná se o značně heterogenní skupinu, někteří zástupci jsou mnohobuněční, jiní jednobuněční. Všechny však spojují dva tzv. heterokontní [[bičík]]y určitých životních stádií těchto organismů: jeden z nich je holý, druhý však rozvětvený v trojdílné [[mastigonemy]]. |
||
Mnoho Stramenopil získalo po [[sekundární endosymbióza|sekundární endosymbiotické]] události [[plastid]]y a díky tomu mohou [[fotosyntéza|fotosyntetizovat]]; fotosyntetizující stramenopila tvoří podle posledních fylogenetických analýz přirozenou skupinu '''Ochrophyta'''.<ref>{{Citace periodika |
Mnoho Stramenopil získalo po [[sekundární endosymbióza|sekundární endosymbiotické]] události [[plastid]]y a díky tomu mohou [[fotosyntéza|fotosyntetizovat]]; fotosyntetizující stramenopila tvoří podle posledních fylogenetických analýz přirozenou skupinu '''Ochrophyta'''.<ref name="Riisberg">{{Citace periodika |
||
| příjmení = Riisberg |
| příjmení = Riisberg |
||
| jméno = Ingvild |
| jméno = Ingvild |
||
| Řádek 40: | Řádek 40: | ||
== Klasifikace == |
== Klasifikace == |
||
Podle Adla et al 2005<ref>{{citace periodika | autor = Sina M. Adl, Alastair G. B. Simpson, Mark A. Farmer, Robert A. Andersen, O. Roger Anderson, John A. Barta, Samual S. Bowser, Guy Bragerolle, Robert A. Fensome, Suzanne Fredericq, Timothy Y. James, Sergei Karpov, Paul Kugrens, John Krug, Christopher E. Lane, Louise A. Lewis, Jean Lodge, Denis H. Lynn, David G. Mann, Richard M. McCourt, Leonel Mendoza, Øjvind Moestrup, Sharon E. Mozley-Standridge, Thoams A. Nerad, Carol A. Shearer, Alexey V. Smirnov, Frederick W. Spiegel, Max F. J. R. Taylor | titul = The New Higher Level Classification of Eukaryotes with Emphasis on the Taxonomy of Protists | periodikum = Journal of Eukaryotic Microbiology | rok = 2005 | ročník = 52 | číslo = 5 | strany = 399-451 | url = http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/10.1111/j.1550-7408.2005.00053.x Abstract}}</ref> se dělí Stramenopila na tyto podskupiny: |
Podle Adla et al 2005<ref>{{citace periodika | autor = Sina M. Adl, Alastair G. B. Simpson, Mark A. Farmer, Robert A. Andersen, O. Roger Anderson, John A. Barta, Samual S. Bowser, Guy Bragerolle, Robert A. Fensome, Suzanne Fredericq, Timothy Y. James, Sergei Karpov, Paul Kugrens, John Krug, Christopher E. Lane, Louise A. Lewis, Jean Lodge, Denis H. Lynn, David G. Mann, Richard M. McCourt, Leonel Mendoza, Øjvind Moestrup, Sharon E. Mozley-Standridge, Thoams A. Nerad, Carol A. Shearer, Alexey V. Smirnov, Frederick W. Spiegel, Max F. J. R. Taylor | titul = The New Higher Level Classification of Eukaryotes with Emphasis on the Taxonomy of Protists | periodikum = Journal of Eukaryotic Microbiology | rok = 2005 | ročník = 52 | číslo = 5 | strany = 399-451 | url = http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/10.1111/j.1550-7408.2005.00053.x Abstract}}</ref> se dělí Stramenopila na tyto podskupiny: |
||
| Řádek 62: | Řádek 61: | ||
* [[Phaeophyceae]] (chaluhy) |
* [[Phaeophyceae]] (chaluhy) |
||
* [[Bacillariophyta]] (rozsivky) |
* [[Bacillariophyta]] (rozsivky) |
||
===Fylogenetické vztahy=== |
|||
[[Thomas Cavalier-Smith]] se v r. 2006 pokusil o novou klasifikaci, založenou na fylogenetických analýzách.<ref name="C-S">{{Citace periodika |
|||
| příjmení = Cavalier-Smith |
|||
| jméno = Thomas |
|||
| odkaz na autora = Thomas Cavalier-Smith |
|||
| příjmení2 = CHao |
|||
| jméno2 = Ema E.-Y. |
|||
| titul = Phylogeny and Megasystematics of Phagotrophic Heterokonts (Kingdom Chromista) |
|||
| periodikum = Journal of Molecular Evolution |
|||
| rok = 2006 |
|||
| měsíc = duben |
|||
| ročník = 62 |
|||
| typ ročníku = svazek |
|||
| číslo = 4 |
|||
| strany = 388-420 |
|||
| url = http://www.springerlink.com/content/t5w324231345611g/ |
|||
| datum přístupu = 2010-09-23 |
|||
| formát = abstrakt |
|||
| issn = 0022-2844 |
|||
| doi = 10.1007/s00239-004-0353-8 |
|||
| jazyk = anglicky |
|||
}}</ref> Vyčlenil fotosyntetizující Stramenopila do samostatného kmene Ochrophyta a zbytek rozdělil do kmenů Pseudofungi a Bigyra. Novější fylogenetické analýzy<ref name="Horn">{{Citace periodika |
|||
| příjmení = Horn |
|||
| jméno = Susanne |
|||
| příjmení2 = Ehlers |
|||
| jméno2 = Katrin |
|||
| příjmení3 = Fritzsch |
|||
| jméno3 = Guido |
|||
| spoluautoři = María Candelaria Gil-Rodríguez, Christian Wilhelm, Reinhard Schnetter |
|||
| titul = ''Synchroma grande'' spec. nov. (Synchromophyceae class. nov., Heterokontophyta): An Amoeboid Marine Alga with Unique Plastid Complexes |
|||
| periodikum = Protist |
|||
| rok = 2007 |
|||
| měsíc = červenec |
|||
| den = 18 |
|||
| ročník = 158 |
|||
| typ ročníku = svazek |
|||
| číslo = 3 |
|||
| strany = 277-293 |
|||
| url = http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B7GX3-4NYBMN1-1&_user=376791&_coverDate=07%2F18%2F2007&_rdoc=5&_fmt=high&_orig=browse&_origin=browse&_zone=rslt_list_item&_srch=doc-info(%23toc%2320475%232007%23998419996%23662072%23FLA%23display%23Volume)&_cdi=20475&_sort=d&_docanchor=&_ct=13&_acct=C000018039&_version=1&_urlVersion=0&_userid=376791&md5=5e7507d6857b5bd906be1875566b6457&searchtype=a |
|||
| datum přístupu = 2010-09-23 |
|||
| formát = abstrakt |
|||
| issn = 1434-4610 |
|||
| doi = 10.1016/j.protis.2007.02.004 |
|||
| jazyk = anglicky |
|||
}}</ref><ref name="Kai">{{Citace periodika |
|||
| příjmení = Kai |
|||
| jméno = Atsushi |
|||
| příjmení2 = Yoshii |
|||
| jméno2 = Yukie |
|||
| příjmení3 = Nakayama |
|||
| jméno3 = Takeshi |
|||
| spoluautoři = Isao Inouye |
|||
| titul = Aurearenophyceae ''classis nova'', a New Class of Heterokontophyta Based on a New Marine Unicellular Alga ''Aurearena cruciata'' gen. et sp. nov. Inhabiting Sandy Beaches |
|||
| periodikum = Protist |
|||
| rok = 2008 |
|||
| měsíc = červenec |
|||
| den = 7 |
|||
| ročník = 159 |
|||
| typ ročníku = svazek |
|||
| číslo = 3 |
|||
| strany = 435-457 |
|||
| url = http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B7GX3-4S3P8G7-1&_user=376791&_coverDate=07%2F07%2F2008&_rdoc=8&_fmt=high&_orig=browse&_origin=browse&_zone=rslt_list_item&_srch=doc-info(%23toc%2320475%232008%23998409996%23693158%23FLA%23display%23Volume)&_cdi=20475&_sort=d&_docanchor=&_ct=14&_acct=C000018039&_version=1&_urlVersion=0&_userid=376791&md5=18a12dc152b61389a4ee10e7115c9fb7&searchtype=a |
|||
| datum přístupu = 2010-09-23 |
|||
| formát = abstrakt |
|||
| issn = 1434-4610 |
|||
| doi = 10.1016/j.protis.2007.12.003 |
|||
| jazyk = anglicky |
|||
}}</ref><ref name="Riisberg"/><ref name="Brown">{{Citace elektronického periodika |
|||
| příjmení = Brown |
|||
| jméno = Joseph W. |
|||
| příjmení2 = Sorhannus |
|||
| jméno2 = Ulf |
|||
| titul = A Molecular Genetic Timescale for the Diversification of Autotrophic Stramenopiles (Ochrophyta): Substantive Underestimation of Putative Fossil Ages |
|||
| periodikum = PLoS One |
|||
| rok vydání = 2010 |
|||
| měsíc vydání = září |
|||
| den vydání = 16 |
|||
| ročník = 5 |
|||
| typ ročníku = svazek |
|||
| číslo = 9 |
|||
| datum přístupu = 2010-09-23 |
|||
| lokace = e12759 |
|||
| strany = 1-11 |
|||
| url = http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0012759 |
|||
| dostupnost2 = PDF |
|||
| url2 = http://www.plosone.org/article/fetchObjectAttachment.action?uri=info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0012759&representation=PDF |
|||
| doi = 10.1371/journal.pone.0012759 |
|||
| jazyk = anglicky |
|||
}}</ref> potvrzují [[monofyletismus|monofylii]] skupiny Ochrophyta, kmeny Pseudofungi a Bigyra a mnohé jejich dílčí podskupiny dle Cavaliera-Smithe, stejně jako některé jím nově zavedené třídy Ochrophyt (Picophagea, Hypogyristea) však dostatečnou podporu nemají. V podříši Ochrophyta byla potvrzena většina tříd, které uváděl již Adl. Rozpadly se Actinophryidae (část je v Dictyochophyceae), Chrysophyceae a Synurophyceae tvoří dohromady [[monofyletismus|monofyletickou]] skupinu, samostatně však jsou [[parafyletismus|parafyletické]]. Nově byly naopak zavedeny třídy Aurearenophyceae<ref name="Kai"/> a Synchromophyceae<ref name="Horn"/> |
|||
Současné (2. pol. r. 2010)<ref name="Brown"/><ref name="TtS">[http://www.shigen.nig.ac.jp/algae_tree/StramenopilaE.html Stramenopila na serveru Tree to Strain; 2010-09-23]</ref> fylogenetické vztahy mezi nefotosyntetizujícími skupinami jakož i mezi třídami Ochrophyt zobrazuje následující fylogenetický strom (závorka (P) označuje větve, pro které je [[monofylie]] prokázaná zatím velmi nedostatečně, může se tedy jednat o skupiny [[parafyletismus|parafyletické]]): |
|||
{{klad | style=font-size:80%;line-height:80% |
|||
|popisek1='''[[Stramenopila]]''' |
|||
|1={{klad |
|||
|1=Placidea |
|||
|2=Nucleohelea |
|||
|3=Bicosoecida |
|||
|4=[[Labyrinthulomycetes]] |
|||
|popisek5=[[Opalinata]] |
|||
|5={{klad |
|||
|1=Blastocystea |
|||
|2={{klad |
|||
|1=Proteromonadea |
|||
|2=[[Opalinea]] |
|||
}} |
|||
}} |
|||
|6={{klad |
|||
|1=Bigyromonadea (''Developayella'') |
|||
|2=Pirsonida |
|||
|popisek3=Pseudofungi (P) |
|||
|3={{klad |
|||
|1=Hyphochytriomycota |
|||
|2=[[Oomycota]]=[[Peronosporomycetes]] |
|||
}} |
|||
|popisek4=[[Ochrophyta]] |
|||
|4={{klad |
|||
|popisek1=Khakista (P) |
|||
|1={{klad |
|||
|1=Bolidophyceae |
|||
|2=[[Bacillariophyceae]] (Diatomeae) |
|||
}} |
|||
|2={{klad |
|||
|1={{klad |
|||
|1=Pelagophyceae |
|||
|2=Dictyochophyceae |
|||
}} |
|||
|popisek2=(P) |
|||
|2={{klad |
|||
|popisek1=(P) |
|||
|1={{klad |
|||
|1=Pinguiophyceae |
|||
|2={{klad |
|||
|1=Raphidophyceae |
|||
|popisek2=Fucistia |
|||
|2={{klad |
|||
|1=''Botridiopsis'' |
|||
|2={{klad |
|||
|1={{klad |
|||
|1=Schizocladiophyceae |
|||
|popisek2=[[Phaeophyceae]] |
|||
|2=[[Chaluhy#Fylogenetické vztahy|►]] |
|||
}} |
|||
|2={{klad |
|||
|1=Chrysomerophyceae |
|||
|2={{klad |
|||
|1={{klad |
|||
|1=Aurearenophyceae |
|||
|2=Phaeothamniophyceae |
|||
}} |
|||
|2=[[Xanthophyceae]] |
|||
}} |
|||
}} |
|||
}} |
|||
}} |
|||
}} |
|||
}} |
|||
|popisek2=(P) |
|||
|2={{klad |
|||
|1=Eustigmatophyceae |
|||
|2={{klad |
|||
|1=Synurophyceae+[[Chrysophyceae]] |
|||
|2=Synchromophyceae |
|||
|popisek3=(P) |
|||
|3=Picophagea |
|||
}} |
|||
}} |
|||
}} |
|||
}} |
|||
}} |
|||
}} |
|||
}} |
|||
}} |
|||
== Odkazy == |
== Odkazy == |
||
Verze z 23. 9. 2010, 16:36
 Stramenopila | |
|---|---|
 | |
| Vědecká klasifikace | |
| Doména | Eukaryota |
| Říše | Chromalveolata |
| Kmen | Stramenopila |
| Některá data mohou pocházet z datové položky. | |
Stramenopila (také Heterokontophyta, Heterokonta, v jistém smyslu též Chromista[1]) je kmen eukaryotických organismů z říše Chromalveolata. Jedná se o značně heterogenní skupinu, někteří zástupci jsou mnohobuněční, jiní jednobuněční. Všechny však spojují dva tzv. heterokontní bičíky určitých životních stádií těchto organismů: jeden z nich je holý, druhý však rozvětvený v trojdílné mastigonemy.
Mnoho Stramenopil získalo po sekundární endosymbiotické události plastidy a díky tomu mohou fotosyntetizovat; fotosyntetizující stramenopila tvoří podle posledních fylogenetických analýz přirozenou skupinu Ochrophyta.[2] Jiní však následně tyto plastidy ztratili, jako například oomycety (Oomycetes), kteří byli původně řazeni mezi houby.
Klasifikace
Podle Adla et al 2005[3] se dělí Stramenopila na tyto podskupiny:
- Opalinata (opalinky)
- Bicosoecida
- Labyrinthulomycetes (labyrintuly)
- Hyphochytriales
- Peronosporomycetes (řasovky)
- Actinophryidae
- Bolidonomas
- Chrysophyceae (zlativky)
- Dictyochophyceae
- Eustigmatales
- Pelagophyceae
- Phaeothamniophyceae
- Pinguiochrysidales
- Raphidophyceae
- Schizocladia
- Synurales
- Xanthophyceae (různobrvky)
- Phaeophyceae (chaluhy)
- Bacillariophyta (rozsivky)
Fylogenetické vztahy
Thomas Cavalier-Smith se v r. 2006 pokusil o novou klasifikaci, založenou na fylogenetických analýzách.[4] Vyčlenil fotosyntetizující Stramenopila do samostatného kmene Ochrophyta a zbytek rozdělil do kmenů Pseudofungi a Bigyra. Novější fylogenetické analýzy[5][6][2][7] potvrzují monofylii skupiny Ochrophyta, kmeny Pseudofungi a Bigyra a mnohé jejich dílčí podskupiny dle Cavaliera-Smithe, stejně jako některé jím nově zavedené třídy Ochrophyt (Picophagea, Hypogyristea) však dostatečnou podporu nemají. V podříši Ochrophyta byla potvrzena většina tříd, které uváděl již Adl. Rozpadly se Actinophryidae (část je v Dictyochophyceae), Chrysophyceae a Synurophyceae tvoří dohromady monofyletickou skupinu, samostatně však jsou parafyletické. Nově byly naopak zavedeny třídy Aurearenophyceae[6] a Synchromophyceae[5]
Současné (2. pol. r. 2010)[7][8] fylogenetické vztahy mezi nefotosyntetizujícími skupinami jakož i mezi třídami Ochrophyt zobrazuje následující fylogenetický strom (závorka (P) označuje větve, pro které je monofylie prokázaná zatím velmi nedostatečně, může se tedy jednat o skupiny parafyletické):
| Stramenopila |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Odkazy
Reference
- ↑ Cavalier-Smith, T. A revised six-kingdom system of life. Biological Reviews of the Cambridge Philosophical Society. 1998, s. 203–266. DOI 10.1017/S0006323198005167.
- ↑ a b RIISBERG, Ingvild; ORR, Russell J.S.; KLUGE, Ragnhild, Kamran Shalchian-Tabrizi, Holly A. Bowers, Vishwanath Patil, Bente Edvardsen, Kjetill S. Jakobsen. Seven Gene Phylogeny of Heterokonts. Protist. 12. únor 2009, svazek 160, čís. 2, s. 191-204. Dostupné online [abstrakt, cit. 2009-10-08]. ISSN 1434-4610. DOI 10.1016/j.protis.2008.11.004. (anglicky)
- ↑ Sina M. Adl, Alastair G. B. Simpson, Mark A. Farmer, Robert A. Andersen, O. Roger Anderson, John A. Barta, Samual S. Bowser, Guy Bragerolle, Robert A. Fensome, Suzanne Fredericq, Timothy Y. James, Sergei Karpov, Paul Kugrens, John Krug, Christopher E. Lane, Louise A. Lewis, Jean Lodge, Denis H. Lynn, David G. Mann, Richard M. McCourt, Leonel Mendoza, Øjvind Moestrup, Sharon E. Mozley-Standridge, Thoams A. Nerad, Carol A. Shearer, Alexey V. Smirnov, Frederick W. Spiegel, Max F. J. R. Taylor. The New Higher Level Classification of Eukaryotes with Emphasis on the Taxonomy of Protists. Journal of Eukaryotic Microbiology. 2005, roč. 52, čís. 5, s. 399-451. Abstract Dostupné online.
- ↑ CAVALIER-SMITH, Thomas; CHAO, Ema E.-Y. Phylogeny and Megasystematics of Phagotrophic Heterokonts (Kingdom Chromista). Journal of Molecular Evolution. Duben 2006, svazek 62, čís. 4, s. 388-420. Dostupné online [abstrakt, cit. 2010-09-23]. ISSN 0022-2844. DOI 10.1007/s00239-004-0353-8. (anglicky)
- ↑ a b HORN, Susanne; EHLERS, Katrin; FRITZSCH, Guido, María Candelaria Gil-Rodríguez, Christian Wilhelm, Reinhard Schnetter. Synchroma grande spec. nov. (Synchromophyceae class. nov., Heterokontophyta): An Amoeboid Marine Alga with Unique Plastid Complexes. Protist. 18. červenec 2007, svazek 158, čís. 3, s. 277-293. Dostupné online [abstrakt, cit. 2010-09-23]. ISSN 1434-4610. DOI 10.1016/j.protis.2007.02.004. (anglicky)
- ↑ a b KAI, Atsushi; YOSHII, Yukie; NAKAYAMA, Takeshi, Isao Inouye. Aurearenophyceae classis nova, a New Class of Heterokontophyta Based on a New Marine Unicellular Alga Aurearena cruciata gen. et sp. nov. Inhabiting Sandy Beaches. Protist. 7. červenec 2008, svazek 159, čís. 3, s. 435-457. Dostupné online [abstrakt, cit. 2010-09-23]. ISSN 1434-4610. DOI 10.1016/j.protis.2007.12.003. (anglicky)
- ↑ a b BROWN, Joseph W.; SORHANNUS, Ulf. A Molecular Genetic Timescale for the Diversification of Autotrophic Stramenopiles (Ochrophyta): Substantive Underestimation of Putative Fossil Ages. S. 1-11, e12759. PLoS One [online]. 16. září 2010 [cit. 2010-09-23]. Svazek 5, čís. 9, s. 1-11. Dostupné online. PDF [1]. DOI 10.1371/journal.pone.0012759. (anglicky)
- ↑ Stramenopila na serveru Tree to Strain; 2010-09-23
Literatura
- VOLF, Petr; HORÁK, Petr. Paraziti a jejich biologie. Praha: Triton, 2007. (Vyd. 1). ISBN 978-80-7387-008-9. S. 318.