Rab (protein): Porovnání verzí

Z Wikipedie, otevřené encyklopedie
Interaktivně procházet historii
← Přejít na předchozí porovnáníPřejít na další porovnání →
Smazaný obsah Přidaný obsah
VizuálníWikitext
Faskal (diskuse | příspěvky)
1 850 editací
m WPCleaner v1.31 - Opraven odkaz na rozcestník - Membrána / Opraveno pomocí WP:WCW - Popis odkazu před i za jeho koncem
+zástupci
Řádek 1: Řádek 1:
[[Soubor:Protein RAB7A PDB 1t91.png|náhled|[[Rab7]] z různých pohledů]]
'''Rab''' je rodina [[Bílkovina|proteinů]], jež se řadí do nadrodiny [[Ras (protein)|Ras]] [[monomer]]ických [[G protein]]ů. U savců bylo dosud identifikováno kolem 70&nbsp;různých&nbsp;typů těchto proteinů.<ref name="pollard">{{citace monografie| titul= Cell Biology| jméno=Thomas D| příjmení=Pollard| jméno2= William C| příjmení2= Earnshaw| vydání=2|vydavatel=Saunders| rok=2007| isbn=1416022554}}</ref> Rab [[GTPáza|GTPázy]] regulují mnoho kroků [[Biologická membrána|membránové]] přepravy včetně tvorby váčků, jejich pohybu po [[aktin]]ových a [[tubulin]]ových vláknech a splývání membrán. Umožňují, aby váčky putovaly buňkou přesně na místo svého určení.
'''Rab''' je rodina [[Bílkovina|proteinů]], jež se řadí do nadrodiny [[Ras (protein)|Ras]] [[monomer]]ických [[G protein]]ů. U savců bylo dosud identifikováno kolem 70&nbsp;různých&nbsp;typů těchto proteinů.<ref name="pollard">{{citace monografie| titul= Cell Biology| jméno=Thomas D| příjmení=Pollard| jméno2= William C| příjmení2= Earnshaw| vydání=2|vydavatel=Saunders| rok=2007| isbn=1416022554}}</ref> Rab [[GTPáza|GTPázy]] regulují mnoho kroků [[Biologická membrána|membránové]] přepravy včetně tvorby váčků, jejich pohybu po [[aktin]]ových a [[tubulin]]ových vláknech a splývání membrán. Umožňují, aby váčky putovaly buňkou přesně na místo svého určení.


==Regulace==
Rab proteiny jsou opatřené [[geranylgeranyl]]ovou skupinou, která umožňuje jejich asociaci s membránou. Pokud jsou v cytoplazmě, mají na sobě navázaný [[guanosindifosfát|GDP]], neboť výměnu GDP za [[guanosintrifosfát|GTP]] inhibuje protein [[guanine nucleotide dissociation inhibitor|GDI]] (''guanine nucleotide dissociation inhibitor''). Existují však i speciální faktory, které jsou schopné zablokovat GDI, načež Rab-specifický [[Guanine exchange factor|GEF]] vymění GDP za GTP. Tato změna aktivuje Rab proteiny, které následně plní svou funkci při vytváření, transportu a splývání váčku. Na cílové membráně je aktivována GTPázová aktivita, dochází k hydrolýze GTP na GDP, načež se v cytoplazmě opět může navázat GDI inhibitor a celý proces se může opakovat.<ref name="pollard" />
Rab proteiny jsou opatřené [[geranylgeranyl]]ovou skupinou, která umožňuje jejich asociaci s membránou. Pokud jsou v cytoplazmě, mají na sobě navázaný [[guanosindifosfát|GDP]], neboť výměnu GDP za [[guanosintrifosfát|GTP]] inhibuje protein [[guanine nucleotide dissociation inhibitor|GDI]] (''guanine nucleotide dissociation inhibitor''). Existují však i speciální faktory, které jsou schopné zablokovat GDI, načež Rab-specifický [[Guanine exchange factor|GEF]] vymění GDP za GTP. Tato změna aktivuje Rab proteiny, které následně plní svou funkci při vytváření, transportu a splývání váčku. Na cílové membráně je aktivována GTPázová aktivita, dochází k hydrolýze GTP na GDP, načež se v cytoplazmě opět může navázat GDI inhibitor a celý proces se může opakovat.<ref name="pollard" />

==Zástupci==
Jedná se o rozsáhlou skupinu proteinů, dělených na jednotlivé podrodiny označené čísly 1&nbsp;–&nbsp;45 s výjimkou 16 („Rab16“ je neplatný název).<ref>{{Citace periodika
| příjmení = Diekmann
| jméno = Y.
| příjmení2 = Seixas
| jméno2 = E.
| příjmení3 = Gouw
| jméno3 = M.
| spoluautoři = et al.
| titul = Thousands of rab GTPases for the cell biologist
| periodikum = PLoS Comput Biol.
| rok = 2011
| číslo = 10
| ročník = 7
| strany = e1002217
| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3192815/?tool=pubmed
| issn = 1553-7358
}}</ref> Databáze RabDB udává v [[lidský genom|lidském genom]]u 115 genů kódujících Rab proteiny ([[Ran]] proteiny nejsou zahrnuty).<ref name="rabdb">{{Citace elektronické monografie
| titul = RabDB
| vydavatel = Computational Genomics Laboratory, Instituto Gulbenkian de Ciência
| datum_přístupu = 2015-01-02
| url = http://www.rabdb.org/browse/sp/78/?page=1&display=100
}}</ref>

{{Sloupce|4|
* [[RAB1]]
* [[RAB2]]
* [[RAB3]]
* [[RAB4]]
* [[RAB5]]
* [[RAB6]]
* [[RAB7]]
* [[RAB8]]
* [[RAB9]]
* [[RAB10]]
* [[RAB11]]
* [[RAB12]]
* [[RAB13]]
* [[RAB14]]
* [[RAB15]]
* [[RAB17]]
* [[RAB18]]
* [[RAB19]]
* [[RAB20]]
* [[RAB21]]
* [[RAB22]]
* [[RAB23]]
* [[RAB24]]
* [[RAB25]]
* [[RAB26]]
* [[RAB27]]
* [[RAB28]]
* [[RAB29]]
* [[RAB30]]
* [[RAB31]]
* [[RAB32]]
* [[RAB33]]
* [[RAB34]]
* [[RAB35]]
* [[RAB36]]
* [[RAB37]]
* [[RAB38]]
* [[RAB39]]
* [[RAB40]]
* [[RAB41]]
* [[RAB42]]
* [[RAB43]]
* [[RAB44]]
* [[RAB45]]
}}


== Reference ==
== Reference ==

Verze z 3. 1. 2015, 00:06

Rab7 z různých pohledů

Rab je rodina proteinů, jež se řadí do nadrodiny Ras monomerických G proteinů. U savců bylo dosud identifikováno kolem 70 různých typů těchto proteinů.[1] Rab GTPázy regulují mnoho kroků membránové přepravy včetně tvorby váčků, jejich pohybu po aktinových a tubulinových vláknech a splývání membrán. Umožňují, aby váčky putovaly buňkou přesně na místo svého určení.

Regulace

Rab proteiny jsou opatřené geranylgeranylovou skupinou, která umožňuje jejich asociaci s membránou. Pokud jsou v cytoplazmě, mají na sobě navázaný GDP, neboť výměnu GDP za GTP inhibuje protein GDI (guanine nucleotide dissociation inhibitor). Existují však i speciální faktory, které jsou schopné zablokovat GDI, načež Rab-specifický GEF vymění GDP za GTP. Tato změna aktivuje Rab proteiny, které následně plní svou funkci při vytváření, transportu a splývání váčku. Na cílové membráně je aktivována GTPázová aktivita, dochází k hydrolýze GTP na GDP, načež se v cytoplazmě opět může navázat GDI inhibitor a celý proces se může opakovat.[1]

Zástupci

Jedná se o rozsáhlou skupinu proteinů, dělených na jednotlivé podrodiny označené čísly 1 – 45 s výjimkou 16 („Rab16“ je neplatný název).[2] Databáze RabDB udává v lidském genomu 115 genů kódujících Rab proteiny (Ran proteiny nejsou zahrnuty).[3]

Reference

  1. ↑ a b POLLARD, Thomas D; EARNSHAW, William C. Cell Biology. 2. vyd. [s.l.]: Saunders, 2007. ISBN 1416022554. 
  2. ↑ DIEKMANN, Y.; SEIXAS, E.; GOUW, M., et al. Thousands of rab GTPases for the cell biologist. PLoS Comput Biol.. 2011, roč. 7, čís. 10, s. e1002217. Dostupné online. ISSN 1553-7358. 
  3. ↑ RabDB [online]. Computational Genomics Laboratory, Instituto Gulbenkian de Ciência [cit. 2015-01-02]. Dostupné online. 
Citováno z „https://cs.wikipedia.org/w/index.php?title=Rab_(protein)&oldid=12124527“