Poly(A) konec

Z Wikipedie, otevřené encyklopedie
Skočit na: Navigace, Hledání
Finální maturovaná mRNA vypadá obvykle takto (patrná je oblast poly(A) konce

Poly(A) konec je sekvence asi 40–250[1][2] adeninových (A) nukleotidů, které jsou pomocí poly(A) polymerázy přidány na 3' konec RNA v procesu tzv. polyadenylace.[3] Konkrétní místo vzniku poly(A) konce se na surové RNA molekule může měnit a je někdy předmětem tzv. alternativní polyadenylace.

Jedná se o jednu z posttranskripčních modifikací „surové“ eukaryotické pre-mRNA. Mezi jednotlivými nukleotidy vznikají běžné 5'-3' vazby, jako tomu je u transkripce, ale na rozdíl od ní není potřeba žádný templát (žádná DNA, který by sloužila jako vzor). Konkrétní délku poly(A) konce určují různé přídatné poly(A) vázající proteiny.[3] RNA pro bílkoviny histonů však z neznámých důvodů žádný poly(A) ocas nemá.[2][4]

Funkce[editovat | editovat zdroj]

Poly(A) konec zvyšuje stabilitu mRNA (dokud má RNA poly(A) konec, není zpravidla degradována[5]) a taky napomáhá jejímu exportu z jádra do cytoplazmy.[6] Pro vědce má poly(A) konec ten praktický význam, že umožňuje snadnou izolaci veškeré buněčné mRNA pomocí afinitní chromatografie na oligo(dT)-celulóze.[2]

Polyadenylace[editovat | editovat zdroj]

Reference[editovat | editovat zdroj]

  1. RÉDEI, George P.. Encyclopedia of Genetics, Genomics, Proteomics, and Informatics. 3rd Edition. vyd. [s.l.] : Springer, 2008. ISBN 978-1-4020-6753-2.  
  2. a b c Oxford dictionary of biochemistry and molecular biology; revised edition. Příprava vydání R. Cammack et al. New York : Oxford university press, 2006. ISBN 0-19-852917-1.  
  3. a b Alberts, Bruce , et al.. The Molecular Biology of the Cell. [s.l.] : Garland Science, 2002. (4th. ed) ISBN 0-8153-3218-1.  
  4. KING, Robert C.; STANSFIELD, William D.; MULLIGAN, Pamela K.. A Dictionary of Genetics, Seventh Edition. [s.l.] : Oxford University Press, 2006.  
  5. Guhaniyogi J, Brewer G. Regulation of mRNA stability in mammalian cells. Gene. 2001, roč. 265, čís. 1-2, s. 11–23. Dostupné online. DOI:10.1016/S0378-1119(01)00350-X. PMID 11255003.  
  6. Genová exprese [online]. Univerzita Karlova v Praze, 1. lékařská fakulta. Dostupné online.