Číslo EC
Číslo EC (z anglického Enzyme Commision number) je numerické klasifikační schéma pro enzymy založené na chemických reakcích, které katalyzují.[1] Každé EC číslo je doplněno doporučeným názvem reprezentovaného enzymu.
Čísla EC nespecifikují daný enzym, ale enzymem katalyzovanou reakci. Je tedy možné, pokud různé enzymy (například z různých organismů) katalyzují stejnou reakci, pak získají stejné číslo EC.[2] Navíc, prostřednictvím konvergentní evoluce, zcela odlišně složené proteiny mohou katalyzovat stejnou reakci[3] a je jim bylo přiřazeno stejné číslo EC. Naproti tomu identifikátory UniProt jednoznačně specifikují protein podle jeho aminokyselinové sekvence.[4]
Formát
[editovat | editovat zdroj]Kód každého enzymu je složen z písmen "EC" následovaných čtyřmi čísly oddělenými čárkami. Tato čísla reprezentují progresivně přesnější klasifikaci enzymu. Například kód pro aminopeptidázu tripeptidu je "EC 3.4.11.4", jehož komponenty označují následující skupiny enzymů:
- EC 3 označuje hydrolázy
- EC 3.4 jsou hydrolázy působící na peptidových vazbách
- EC 3.4.11 jsou hydrolázy, které z polypeptidu odštěpují amino-terminální aminokyselinu
- EC 3.4.11.4 jsou ty, které odštěpují amino-terminální konec z tripeptidu
Hlavní druhy enzymů
[editovat | editovat zdroj]| Druhy | Katalyzovaná reakce | Typická reakce | Příklady enzymu |
|---|---|---|---|
| EC 1 | Oxidační a redukční reakce, přesun atomů vodíku a kyslíku nebo elektronů z jedné látky na druhou. | AH + B → A + BH
A + O → AO |
Alkoholdehydrogenáza |
| EC 2 | Přesun funkční skupiny z jedné látky na druhou. | AB + C → A + BC | Kináza |
| EC 3 | Vznik dvou produktů z jedné látky hydrolýzou. | AB + H2O → AOH + BH | Amyláza |
| EC 4 | Nehydrolytická přidání nebo odstranění skupin z látky. | RCOCOOH → RCOH + CO2 nebo [X-A+B-Y] → [A=B + X-Y] | Dekarboxyláza |
| EC 5 | Intramolekulární přesmyk, např změna izomerizace v rámci jedné látky. | ABC → BCA | Izomeráza |
| EC 6 | Spojení dvou molekul vznikem nových vazeb C-O, C-S, C-N nebo C-C za současného rozpadu ATP. | X + Y + ATP → XY + ADP + Pi | DNA ligáza |
| EC 7 | Přesun iontů nebo molekul přes membrány a nebo jejich separaci uvnitř membrán. | Na+/K+-ATPáza |
Odkazy
[editovat | editovat zdroj]Reference
[editovat | editovat zdroj]V tomto článku byl použit překlad textu z článku Enzyme Commission number na anglické Wikipedii.
- ↑ WEBB, Edwin C. Enzyme nomenclature 1992 : recommendations of the Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology on the nomenclature and classification of enzymes. [s.l.]: Academic Press, 1992. 886 s. Dostupné online. ISBN 978-0-12-227164-9, ISBN 978-0-12-227165-6. (anglicky)
- ↑ ENZYME (Enzyme nomenclature database) [online]. ExPASy [cit. 2025-06-05]. Dostupné online. (anglicky)
- ↑ OMELCHENKO, Marina V; GALPERIN, Michael Y; WOLF, Yuri I. Non-homologous isofunctional enzymes: A systematic analysis of alternative solutions in enzyme evolution. Biology Direct. 2010-12, roč. 5, čís. 1. Dostupné online [cit. 2025-06-05]. ISSN 1745-6150. doi:10.1186/1745-6150-5-31. PMID 20433725. (anglicky)
- ↑ APWEILER, R. UniProt: the Universal Protein knowledgebase. Nucleic Acids Research. 2004-01-01, roč. 32, čís. 90001, s. 115D–119. Dostupné online [cit. 2025-06-05]. ISSN 1362-4962. doi:10.1093/nar/gkh131. PMID 14681372. (anglicky)
- ↑ MOSS, G.P. Recommendations of the Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology on the Nomenclature and Classification of Enzymes by the Reactions they Catalyse [online]. [cit. 2025-06-05]. Dostupné online. (anglicky)
Externí odkazy
[editovat | editovat zdroj]
Obrázky, zvuky či videa k tématu Číslo EC na Wikimedia Commons
