Přeskočit na obsah

Mimivirus: Porovnání verzí

Z Wikipedie, otevřené encyklopedie
Smazaný obsah Přidaný obsah
vracim zadosti o zdroje - zadosti byly smazany bez toho, ze by byl jakykoliv zdroj dodan
doplnění, orefování, rekat.
Řádek 7: Řádek 7:
| šířka obrázku = 258px
| šířka obrázku = 258px
}}
}}
'''Mimivirus''' je [[rod (biologie)|rod]] dsDNA [[virus|virů]], výjimečný svými rozměry (průměr dvacetistěnné kapsidy 400 nm, celkově až 800nm) i výjimečně velkým [[genom|genomem]] (1 181 404 párů bází).<ref name="Xiao2009">{{Citace periodika |autor=Xiao C., Kuznetsov Y. G., Sun S., Hafenstein S. L., Kostyuchenko V. A., Chipman P. R., Suzan-Monti M., Raoult D., McPherson A., Rossmann M. G. |titul=Structural Studies of the Giant Mimivirus |periodikum=PLoS Biol. |rok =2009 | měsíc =duben | den = 28 | ročník =7 | typ ročníku =svazek |číslo=4 |strany=e92 | url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2671561/ |doi=10.1371/journal.pbio.1000092 |pmid=19402750 | jazyk = anglicky}}</ref><ref>[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=genome&cmd=Retrieve&dopt=Overview&list_uids=18057 Acanthamoeba polyphaga mimivirus, complete genome], NCBI (anglicky)</ref> Je znám jediný druh - ''Acanthamoeba polyphaga mimivirus'' (APMV). Virus byl nalezen v [[měňavkovci]] ''Acanthamoeba polyphaga'' a pro svou velikost zprvu považován za bakterii.
'''Mimivirus''' je největší{{Fakt/dne|20111013173825}} [[virus]] s nejdelším [[genom|genomem]]{{Fakt/dne|20111013173825}}, nejsložitější a pro vědce zatím nejsložitější{{Fakt/dne|20111013173825}}. Je asi osmkrát větší než ostatní obyčejné virusy a je dokonce i viditelný skoro pouhým [[oko|okem]]. Někteří [[vědec|vědci]]{{kdo?}} se domnívají, že jde o něco mezi virem a [[bakterie|bakterií]] anebo vytvořit skupinu giry, což by byly gigantické viry jako např tento.


Mimivirus patří do skupiny tzv. velkých jaderně-cytoplazmatických DNA [[viry|virů]] označované '''NCLDV''' (z anglického ''nucleocytoplasmic large DNA viruses''). Ta je někdy považována za novou, čtvrtou [[doména (biologie)|doménu]] živých organismů. Právě velký genom virů rodu [[Mimivirus]] jako typických zástupců skupiny umožnil provést molekulárně biologické srovnání s ostatními doménami, poskytující indicie pro fylogenetické vyčlenění této domény.<ref>{{Citace elektronického periodika
Není ale úplně jediný své velikosti{{Fakt/dne|20111013173825}}. Některé byli nalezeny již v [[Sargasové moře|Sargasovém moři]] nebo v [[Mexiko|Mexiku]]{{Fakt/dne|20111013173825}}.
| příjmení = Boyer
| jméno = Mickaël
| příjmení2 = Madoui
| jméno2 = Mohammed-Amine
| příjmení3 = Gimenez
| jméno3 = Gregory
| spoluautoři = Bernard La Scola, Didier Raoult.
| titul = Phylogenetic and Phyletic Studies of Informational Genes in Genomes Highlight Existence of a 4th Domain of Life Including Giant Viruses
| periodikum = PLoS One
| rok vydání = 2010
| měsíc vydání = prosinec
| den vydání = 2
| ročník = 5
| typ ročníku = svazek
| číslo = 12
| datum přístupu = 2011-05-03
| lokace = e15530
| url = http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0015530
| dostupnost2 = PDF
| url2 = http://www.plosone.org/article/fetchObjectAttachment.action;jsessionid=752F7CF737E78780594822160EF6FA10.ambra01?uri=info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0015530&representation=PDF
| issn = 1932-6203
| doi = 10.1371/journal.pone.0015530
| jazyk = anglicky
}}</ref><ref>{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Colson
| jméno = Philippe
| příjmení2 = Gimenez
| jméno2 = Gregory
| příjmení3 = Boyer
| jméno3 = Mickaël
| spoluautoři = Ghislain Fournous, Didier Raoult.
| titul = The Giant ''Cafeteria roenbergensis'' Virus That Infects a Widespread Marine Phagocytic Protist Is a New Member of the Fourth Domain of Life
| periodikum = PLoS One
| rok vydání = 2011
| měsíc vydání = duben
| den vydání = 29
| ročník = 6
| typ ročníku = svazek
| číslo = 4
| datum přístupu = 2011-05-03
| lokace = e18935
| url = http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0018935
| dostupnost2 = PDF
| url2 = http://www.plosone.org/article/fetchObjectAttachment.action?uri=info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0018935&representation=PDF
| issn = 1932-6203
| doi = 10.1371/journal.pone.0018935
| jazyk = anglicky
}}</ref> Existence nové domény je zatím přijímána skepticky.<ref>http://www.rense.com/general58/dorth.htm</ref><ref>{{Citace elektronického periodika
| příjmení = Williams
| jméno = Tom A.
| příjmení2 = Embley
| jméno2 = T. Martin
| příjmení3 = Heinz
| jméno3 = Eva
| titul = Informational Gene Phylogenies Do Not Support a Fourth Domain of Life for Nucleocytoplasmic Large DNA Viruses
| periodikum = PLoS ONE
| rok vydání = 2011
| měsíc vydání = červen
| den vydání = 16
| ročník = 6
| typ ročníku = svazek
| číslo = 6
| lokace = e21080
| strany = 1-11
| url = http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0021080
| dostupnost2 = PDF
| url2 = http://www.plosone.org/article/fetchObjectAttachment.action?uri=info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0021080&representation=PDF
| issn = 1932-6203
| doi = 10.1371/journal.pone.0021080
| jazyk = anglicky
}}</ref>


Do příbuznosti mimiviru je řazen i dosavadní (2011) rekordman ve velikosti virů - ''[[Megavirus chilensis]]''. Jeho genom je ještě o 6,5% větší než genom mimiviru - obsahuje 1 259 197 párů bází.<ref>{{Citace elektronického periodika
{{Pahýl - lékařství}}
| příjmení = Arslan,
| jméno = Defne
| příjmení2 = Legendre
| jméno2 = Matthieu
| příjmení3 = Seltzer
| jméno3 = Virginie
| spoluautoři = ABERGE Chantal, CLAVERIE Jean-Michel.
| titul = Distant Mimivirus relative with a larger genome highlights the fundamental features of Megaviridae
| periodikum = PNAS (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)
| rok vydání = 2011
| měsíc vydání = říjen
| den vydání = 10
| ročník =
| typ ročníku = svazek
| číslo =
| strany =
| poznámky = online před tiskem
| url = http://www.pnas.org/content/early/2011/10/04/1110889108.abstract?sid=80bad9f7-8744-4366-b9a6-07651567e8bd
| issn = 0027-8424
| doi = 10.1073/pnas.1110889108
| jazyk = anglicky
}}</ref><ref>[http://www.physorg.com/news/2011-10-mega-mimi-world-biggest-virus.html Mega beats Mimi for world's biggest virus], ''PhysOrg'', 10. 10. 2011 (anglicky) – popularizační článek k předchozí referenci</ref>

==Reference==
<references/>

{{Pahýl - biologie}}


[[Kategorie:Viry]]
[[Kategorie:Viry]]

Verze z 17. 10. 2011, 17:03

Jak číst taxoboxMimivirus
alternativní popis obrázku chybí
Vědecká klasifikace
Některá data mohou pocházet z datové položky.

Mimivirus je rod dsDNA virů, výjimečný svými rozměry (průměr dvacetistěnné kapsidy 400 nm, celkově až 800nm) i výjimečně velkým genomem (1 181 404 párů bází).[1][2] Je znám jediný druh - Acanthamoeba polyphaga mimivirus (APMV). Virus byl nalezen v měňavkovci Acanthamoeba polyphaga a pro svou velikost zprvu považován za bakterii.

Mimivirus patří do skupiny tzv. velkých jaderně-cytoplazmatických DNA virů označované NCLDV (z anglického nucleocytoplasmic large DNA viruses). Ta je někdy považována za novou, čtvrtou doménu živých organismů. Právě velký genom virů rodu Mimivirus jako typických zástupců skupiny umožnil provést molekulárně biologické srovnání s ostatními doménami, poskytující indicie pro fylogenetické vyčlenění této domény.[3][4] Existence nové domény je zatím přijímána skepticky.[5][6]

Do příbuznosti mimiviru je řazen i dosavadní (2011) rekordman ve velikosti virů - Megavirus chilensis. Jeho genom je ještě o 6,5% větší než genom mimiviru - obsahuje 1 259 197 párů bází.[7][8]

Reference

  1. Xiao C., Kuznetsov Y. G., Sun S., Hafenstein S. L., Kostyuchenko V. A., Chipman P. R., Suzan-Monti M., Raoult D., McPherson A., Rossmann M. G. Structural Studies of the Giant Mimivirus. PLoS Biol.. 28. duben 2009, svazek 7, čís. 4, s. e92. Dostupné online. DOI 10.1371/journal.pbio.1000092. PMID 19402750. (anglicky) 
  2. Acanthamoeba polyphaga mimivirus, complete genome, NCBI (anglicky)
  3. BOYER, Mickaël; MADOUI, Mohammed-Amine; GIMENEZ, Gregory, Bernard La Scola, Didier Raoult. Phylogenetic and Phyletic Studies of Informational Genes in Genomes Highlight Existence of a 4th Domain of Life Including Giant Viruses. E15530. PLoS One [online]. 2. prosinec 2010 [cit. 2011-05-03]. Svazek 5, čís. 12. Dostupné online. PDF [1]. ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0015530. (anglicky) 
  4. COLSON, Philippe; GIMENEZ, Gregory; BOYER, Mickaël, Ghislain Fournous, Didier Raoult. The Giant Cafeteria roenbergensis Virus That Infects a Widespread Marine Phagocytic Protist Is a New Member of the Fourth Domain of Life. E18935. PLoS One [online]. 29. duben 2011 [cit. 2011-05-03]. Svazek 6, čís. 4. Dostupné online. PDF [2]. ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0018935. (anglicky) 
  5. http://www.rense.com/general58/dorth.htm
  6. WILLIAMS, Tom A.; EMBLEY, T. Martin; HEINZ, Eva. Informational Gene Phylogenies Do Not Support a Fourth Domain of Life for Nucleocytoplasmic Large DNA Viruses. S. 1-11, e21080. PLoS ONE [online]. 16. červen 2011. Svazek 6, čís. 6, s. 1-11. Dostupné online. PDF [3]. ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0021080. (anglicky) 
  7. ARSLAN,, Defne; LEGENDRE, Matthieu; SELTZER, Virginie, ABERGE Chantal, CLAVERIE Jean-Michel. Distant Mimivirus relative with a larger genome highlights the fundamental features of Megaviridae. PNAS (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America) [online]. 10. říjen 2011. Online před tiskem. Dostupné online. ISSN 0027-8424. DOI 10.1073/pnas.1110889108. (anglicky) 
  8. Mega beats Mimi for world's biggest virus, PhysOrg, 10. 10. 2011 (anglicky) – popularizační článek k předchozí referenci

Šablona:Pahýl - biologie