Edmanovo odbourávání

Z Wikipedie, otevřené encyklopedie
Skočit na: Navigace, Hledání
Edmanovo odbourávání, schéma chemických reakcí

Edmanovo odbourávání je metoda sekvenování proteinů (určení sekvence aminokyselin v rámci jejich polypeptidového řetězce), vyvinutá na počátku 50. let 20. století Pehrem Edmanem.[1] Při Edmanově odbourávání dochází ke specifické reakci fenylisothiokyanátu (PITC) s N-koncovou aminokyselinou, načež je možné tuto koncovou aminokyselinu pomocí kyseliny fluorovodíkové odštěpit v podobě cyklického thiazolinonu. Ten je možné převést na stabilnější produkt a následně tuto látku analyzovat (určit, o jakou aminokyselinu se jednalo, a to např. pomocí TLC, elektroforeticky či kombinací HPLC s hmotnostní spektrometrií).[2]

Výhodou Edmanova odbourávání (ve srovnání s jinými činidly reagujícími s N-koncem) je skutečnost, že je možné tento proces několikrát opakovat a postupně od N-konce sekvenovat poměrně dlouhý (až 60-70 aminokyselin) polypeptid.[3]

Reference[editovat | editovat zdroj]

  1. EDMAN, P.. Method for determination of the amino acid sequence in peptides. Acta Chem. Scand.. 1950, roč. 4, s. 283–293. DOI:10.3891/acta.chem.scand.04-0283.  
  2. VOET, Donald; VOET, Judith. Biochemie. 1.. vyd. Praha : Victoria Publishing, 1995. ISBN 80-85605-44-9.  
  3. VODRÁŽKA, Zdeněk. Biochemie. Praha : Academia, 2007. ISBN 978-80-200-0600-4.