Ján Stojka (* 14. července 1967, Michal na Ostrove) je bývalý slovenský fotbalista, útočník.
V československé lize hrál za Inter Bratislava. Nastoupil ve 107 ligových utkáních a dal 20 gólů. V Poháru UEFA nastoupil ve 4 utkáních a dal 2 góly. Za slovenskou reprezentaci nastoupil v roce 1993 v přátelském utkání proti Litvě.