Testování covidu-19

Z Wikipedie, otevřené encyklopedie
Skočit na navigaci Skočit na vyhledávání
Odebírání vzorku výtěrem z nosohltanu
Odebírání vzorku výtěrem z hrdla

Testování covidu-19 zahrnuje především laboratorní metody, vedoucí k průkazu akutní či prodělané infekce virem SARS-CoV-2. Vyhledávání a testování potenciálních nakažených je jedním ze základních pilířů epidemiologické surveillance[1] (sledování výskytu nemoci) a je proto důrazně doporučováno Světovou zdravotnickou organizací (WHO).

Testovací metody[editovat | editovat zdroj]

Průkaz virové RNA[editovat | editovat zdroj]

Vyhodnocování real-time PCR testů
Termocykler na vyhodnocování PCR testů

K rutinnímu průkazu infekce se používají testy, detekující přímo genetickou informaci viru (ribonukleovou kyselinu – RNA) ve vzorku od pacienta. Za vhodný vzorek se považuje výtěr z hltanu, nosohltanu, případně z dolních cest dýchacích, odebraný například během bronchoskopie či intubace pacienta.[2] Virová RNA se prokazuje metodou kvantitativní polymerázové řetězové reakce (anglicky real-time PCR nebo zkratka qPCR)[3], která umožňuje přímo kvantifikovat množství virové RNA ve vzorku. Koncem března 2020 bylo v USA ve zrychleném procesu schvalování autorizováno použití tzv. point-of-care testů ke kvalitativní detekci virové RNA, které umožní prokázat infekci během 45 minut.[4] [5]

Antigenní testy[editovat | editovat zdroj]

Podrobnější informace naleznete v článku Rychlý antigenní test na covid-19.

Antigenní testy patří do skupiny testů přímého průkazu viru. U nich se netestuje ribonukleová kyselina, nýbrž antigen, bílkovina, která se objeví na vzorku z dýchací soustavy, pokud se virus v dané chvíli aktivně replikuje. Proto je tento test vhodný k odhalení právě probíhající infekce. Provádí se výtěrem z nosohltanu. K vyhodnocení není potřeba laboratoř, výsledek je znám do 30 minut. Spolehlivost antigenního testu ale ovlivňuje například koncentrace viru či doba od nástupu nemoci. Některé nakažené tedy tento test nemusí odhalit.[6]

Pro testování SARS-CoV-2 jsou antigenní testy k dispozici od konce léta 2020.[7] Návod na používání a interpretaci výsledků antigenního testu a platné algoritmy publikovalo Ministerstvo zdravotnictví v listopadu.[8]

Průkaz protilátek[editovat | editovat zdroj]

Průkaz protilátek v krvi (séru) pacienta je tzv. sérologickým testem. Infekce SARS-CoV-2 vyvolává obdobně jako jiné infekce produkci protilátek proti bílkovinám viru buňkami imunitního systému. Většina infikovaných jedinců vyvine protilátky do 5–10 dnů od počátku příznaků infekce.[9][10] Vzhledem k tomuto relativnímu zpoždění v tvorbě protilátek se sérologické testy nehodí k akutnímu testování nemocných. Význam mají ve zpětném průkazu infekce u jedinců s lehkými či žádnými příznaky onemocnění.[11] Z tohoto pohledu jsou důležité k posouzení celkového rozsahu epidemie a jsou nedílnou součástí epidemiologické surveillance.[1] Ovšem testují se jen protilátky IgG, někdy IgM, ale imunoglobulin A prakticky nikoli, což značně podceňuje odhady rozšíření nemoci.[12]

Zajímavosti[editovat | editovat zdroj]

V noci, kdy je aktivita viru v těle nižší, jsou testy méně spolehlivé.[13]

Vývoj vlastních testů v AV ČR[editovat | editovat zdroj]

Akademie věd České republiky spustila vlastní webový portál Laboratoře proti koronaviru, který slouží ke koordinaci práce laboratoří, které se podílejí na testování vzorků.

V České republice se do vývoje vlastních testovacích kitů zapojil tým z UOCHB AV ČR, který spolu vyvinul vlastní metodu izolace virové RNA ze vzorků odebraných pacientům. Metoda je založena na použití originálních magnetických nanočástic z dílny Radka Zbořila z olomouckého RCPTM.[14] Postupně je validována ve spolupráci s 2. LF UK, nemocnicí Na Bulovce a Státním zdravotním ústavem. V projektu je zapojen i Biocev, ÚMG AV ČR a CEITEC. 7 milionů korun na výzkum a vývoj nových diagnostických testů pro onemocnění covid-19 darovala firma IOCBTech, dceřiná společnost Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR.[15]

Akademie věd České republiky spolupracuje s Genomic Research Centre, Academia Sinica, Taipei, Tchaj-wan. Ten poskytuje vědecké obci zdarma vlastní rekombinantní a glykosylovaný spike protein viru propagovaný na lidských HEK 293 buňkách v rozpustné formě bez transmembránové domény.[16]

Reference[editovat | editovat zdroj]

  1. a b Protiepidemická opatření v ohnisku nákazy – WikiSkripta. www.wikiskripta.eu [online]. [cit. 2020-03-24]. Dostupné online. 
  2. Laboratory testing for coronavirus disease (COVID-19) in suspected human cases [online]. [cit. 2020-03-24]. Dostupné online. 
  3. SR, MEFANET, síť lékařských fakult ČR a. Polymerázová řetězová reakce – WikiSkripta. www.wikiskripta.eu [online]. [cit. 2020-03-24]. Dostupné online. 
  4. COMMISSIONER, Office of the. Coronavirus (COVID-19) Update: FDA Issues first Emergency Use Authorization for Point of Care Diagnostic. FDA [online]. 2020-03-21 [cit. 2020-03-24]. Dostupné online. (anglicky) 
  5. XPRSARS-COV2-10 - Instructions for Use [online]. [cit. 2020-03-24]. Dostupné online. [nedostupný zdroj]
  6. Jan Martinek, Právo: Antigenní testy nezachytí třetinu pacientů, 2. 11. 2020
  7. SVOBODA, Vít. Smejkal o antigenních testech: Fungují, když se provádí správně. Odběr by vás měl téměř rozbrečet. iROZHLAS [online]. Český rozhlas, 2020-11-10 [cit. 2020-12-20]. Dostupné online. 
  8. MZCR, Pro zdravotníky (cit. 11. 11. 2020)
  9. TO, Kelvin Kai-Wang; TSANG, Owen Tak-Yin; LEUNG, Wai-Shing. Temporal profiles of viral load in posterior oropharyngeal saliva samples and serum antibody responses during infection by SARS-CoV-2: an observational cohort study. The Lancet Infectious Diseases. 2020-03-23, roč. 0, čís. 0. Dostupné online [cit. 2020-03-24]. ISSN 1473-3099. DOI 10.1016/S1473-3099(20)30196-1. (English) 
  10. ZHANG, Wei; DU, Rong-Hui; LI, Bei. Molecular and serological investigation of 2019-nCoV infected patients: implication of multiple shedding routes. Emerging Microbes & Infections. 2020-01-01, roč. 9, čís. 1, s. 386–389. PMID: 32065057. Dostupné online [cit. 2020-03-24]. DOI 10.1080/22221751.2020.1729071. PMID 32065057. 
  11. SUBBARAMAN, Nidhi. Coronavirus tests: researchers chase new diagnostics to fight the pandemic. Nature. 2020-03-23. Dostupné online [cit. 2020-03-24]. DOI 10.1038/d41586-020-00827-6. (anglicky) 
  12. Are antibody tests underestimating the spread of COVID-19?. medicalxpress.com [online]. 2020-09-03 [cit. 2020-12-28]. Dostupné online. (anglicky) 
  13. https://medicalxpress.com/news/2021-10-covid-virus-sensitivity-varies-body.html - COVID-19 virus test sensitivity varies with body's circadian rhythm, according to research
  14. Jan Konvalinka. www.facebook.com [online]. [cit. 2020-04-09]. Dostupné online. 
  15. PŘEHLEDNĚ: Jak Akademie věd ČR pomáhá v boji proti koronavirové nákaze - Akademie věd České republiky. www.avcr.cz [online]. [cit. 2020-04-09]. Dostupné online. 
  16. SARS-CoV-2 Free Research Materials. Ma Lab @中央研究院 Taiwan [online]. [cit. 2020-04-09]. Dostupné online. (anglicky) 

Externí odkazy[editovat | editovat zdroj]

Star of life2.svg
Wikipedie neručí za správnost lékařských informací v tomto článku. V případě potřeby vyhledejte lékaře!
Přečtěte si prosím pokyny pro využití článků o zdravotnictví.