Kompenzace fluorescence: Porovnání verzí

Z Wikipedie, otevřené encyklopedie
Interaktivně procházet historii
← Přejít na předchozí porovnáníPřejít na další porovnání →
Smazaný obsah Přidaný obsah
VizuálníWikitext
Bez shrnutí editace
Bez shrnutí editace
Řádek 4: Řádek 4:
Při vícebarevných experimentech, kdy se emisní spektra některých z fluorochromů překrývají a jsou tedy měřena více detektory, je kompenzace nezbytná <ref>Roederer, Mario. "Spectral compensation for flow cytometry: visualization artifacts, limitations, and caveats." Cytometry 45.3 (2001): 194-205. </ref>.
Při vícebarevných experimentech, kdy se emisní spektra některých z fluorochromů překrývají a jsou tedy měřena více detektory, je kompenzace nezbytná <ref>Roederer, Mario. "Spectral compensation for flow cytometry: visualization artifacts, limitations, and caveats." Cytometry 45.3 (2001): 194-205. </ref>.


Kompenzace se provádí pomocí analyzačních sofrwarů pro cytometrická data jako je FlowJo <ref>http://www.flowjo.com/</ref>, <ref>FlowLogichttp://www.inivai.com/flowlogic/</ref>, Kaluza <ref>https://www.beckmancoulter.com/wsrportal/wsrportal.portal;jsessionid=p4GyWD3FmyYSq4c5TkyTHm2DBVvvJCrlsjnRspxpHrLRpvmPndGc!-1628535361!-1671786268?_nfpb=true&_windowLabel=UCM_RENDERER&_urlType=render&wlpUCM_RENDERER_path=%2Fwsr%2Fcountry-selector%2Findex.htm&_WRpath=%252Fwsr%252Fresearch-and-discovery%252Fproducts-and-services%252Fflow-cytometry%252Fsoftware%252Fkaluza-analysis-software%252Findex.htm&intBp=true</ref>a další.
Kompenzace se provádí pomocí '''analyzačních sofrwarů''' pro cytometrická data jako je FlowJo <ref>http://www.flowjo.com/</ref>, <ref>FlowLogichttp://www.inivai.com/flowlogic/</ref>, Kaluza <ref>https://www.beckmancoulter.com/wsrportal/wsrportal.portal;jsessionid=p4GyWD3FmyYSq4c5TkyTHm2DBVvvJCrlsjnRspxpHrLRpvmPndGc!-1628535361!-1671786268?_nfpb=true&_windowLabel=UCM_RENDERER&_urlType=render&wlpUCM_RENDERER_path=%2Fwsr%2Fcountry-selector%2Findex.htm&_WRpath=%252Fwsr%252Fresearch-and-discovery%252Fproducts-and-services%252Fflow-cytometry%252Fsoftware%252Fkaluza-analysis-software%252Findex.htm&intBp=true</ref>a další.
Důležité jsou kompenzační kontroly – vzorky obarvené pouze jedním fluorochromem. Mohou jimi být buňky nebo se používají kompenzační kuličky. Dále jsou používány kontroly FMO (fluorescence minus one) které slouží ke správnému [[gating|gatování]] populací. <ref>Herzenberg, Leonore A., et al. "Interpreting flow cytometry data: a guide for the perplexed." Nature immunology 7.7 (2006): 681-685. </ref>
Důležité jsou '''kompenzační kontroly''' – vzorky obarvené pouze jedním fluorochromem. Mohou jimi být buňky nebo se používají kompenzační kuličky. Dále jsou používány '''kontroly FMO''' (fluorescence minus one) které slouží ke správnému [[gating|gatování]] populací. <ref>Herzenberg, Leonore A., et al. "Interpreting flow cytometry data: a guide for the perplexed." Nature immunology 7.7 (2006): 681-685. </ref>

Verze z 24. 9. 2015, 11:51

Kompenzace fluorescence

Kompenzace je matematická korekce přesvitu emisního spektra fluorochromu do jiného kanálu [1]

Poprvé kompenzaci dat z průtokového cytometru provedl v roce 1977 Michael Loken et al. na dvoubarevném experimentu, kdy byly myší splenocyty barveny fluoresceinem a rhodaminem. [2] Při vícebarevných experimentech, kdy se emisní spektra některých z fluorochromů překrývají a jsou tedy měřena více detektory, je kompenzace nezbytná [3].

Kompenzace se provádí pomocí analyzačních sofrwarů pro cytometrická data jako je FlowJo [4], [5], Kaluza [6]a další. Důležité jsou kompenzační kontroly – vzorky obarvené pouze jedním fluorochromem. Mohou jimi být buňky nebo se používají kompenzační kuličky. Dále jsou používány kontroly FMO (fluorescence minus one) které slouží ke správnému gatování populací. [7]

  1. ↑ Roederer, Mario. "Spectral compensation for flow cytometry: visualization artifacts, limitations, and caveats." Cytometry 45.3 (2001): 194-205.
  2. ↑ Loken, Michael R., David R. Parks, and Leonard A. Herzenberg. "Two-color immunofluorescence using a fluorescence-activated cell sorter." Journal of Histochemistry & Cytochemistry 25.7 (1977): 899-907.
  3. ↑ Roederer, Mario. "Spectral compensation for flow cytometry: visualization artifacts, limitations, and caveats." Cytometry 45.3 (2001): 194-205.
  4. ↑ http://www.flowjo.com/
  5. ↑ FlowLogichttp://www.inivai.com/flowlogic/
  6. ↑ https://www.beckmancoulter.com/wsrportal/wsrportal.portal;jsessionid=p4GyWD3FmyYSq4c5TkyTHm2DBVvvJCrlsjnRspxpHrLRpvmPndGc!-1628535361!-1671786268?_nfpb=true&_windowLabel=UCM_RENDERER&_urlType=render&wlpUCM_RENDERER_path=%2Fwsr%2Fcountry-selector%2Findex.htm&_WRpath=%252Fwsr%252Fresearch-and-discovery%252Fproducts-and-services%252Fflow-cytometry%252Fsoftware%252Fkaluza-analysis-software%252Findex.htm&intBp=true
  7. ↑ Herzenberg, Leonore A., et al. "Interpreting flow cytometry data: a guide for the perplexed." Nature immunology 7.7 (2006): 681-685.
Citováno z „https://cs.wikipedia.org/w/index.php?title=Kompenzace_fluorescence&oldid=12917039“