Nukleotid

Adenosintrifosfát, jeden z nejvýznamnějších nukleotidů

Nukleotidy jsou fosforylované nukleosidy, tedy látky složené z nukleové báze (nejč. purinové nebo pyrimidinové), pětiuhlíkatého monosacharidu (ribosa nebo deoxyribosa) a jedné nebo více zbytků kyseliny fosforečné. Jsou stavebními kameny nukleových kyselin a kofaktorů, které v buňce přenášejí energii (konkrétně Gibbsovu energii), účastní se procesů biologických syntéz (mj. kondenzačních reakcí) a buněčné komunikace.

Názvosloví

Názvosloví nukleotidů odpovídá stavbě daného nukleotidu: například adenosinmonofosfát je nukleotid skládající se z adenosinu, nukleosidu tvořeného bází adeninem a ribosou, a jednoho fosfátu.

Umístění fosfátové skupiny v nukleotidech se značí číslicí s čárkou ('). Například adenosin-3'-monofosfát znamená, že fosfátová skupina je navázána na třetím atomu ribosy. Nejčastěji je fosforylován uhlík číslo 5, proto se v tomto případě označení vynechává. Adenosin-5'-monofosfát = adenosinmonofosfát.

Pro zjednodušení názvosloví byly zavedeny čtyř- nebo třípísmenné zkratky. První písmeno je malé a značí, jestli je součástí nukleotidu ribosa (nepíše se nic) nebo deoxyribosa (malé d). Je-li struktura nukleotidu cyklická, označuje se malým c (cyklický adenosin-3‘,5‘-monofosfát = cAMP) Druhé, velké písmeno označuje druh nukleové báze:

G: guanin

A: adenin

T: thymin

C: cytosin

U: uracil

Třetí a čtvrté písmeno určují počet fosfátových skupin (mono-, di-, tri-) a přítomnost fosfátu (P). Například deoxycytidintrifosfát má zkratku dCTP.

Anhydridová vazba

Fosfátové skupiny v nukleosiddifosfátech a nukleosidtrifosfátech jsou navázané jedna za druhou anhydridovou vazbou. Ty jsou schopny přenášet funkční skupiny a při hydrolýze těchto vazeb se uvolní velké množství energie (Δ G < −30 kJ/mol. Proto jsou nukleosidy sloučeninami, které umožňují aktivaci reaktantů a průběh endergonických reakcí.

Základní nukleotidy

Nukleotidy

adenosinmonofosfát AMP	adenosindifosfát ADP	adenosintrifosfát ATP
guanosinmonofosfát GMP	guanosindifosfát GDP	guanosintrifosfát GTP
uridinmonofosfát UMP	uridindifosfát UDP	uridintrifosfát UTP
cytidinmonofostát CMP	cytidindifosfát CDP	cytidintrifosfát CTP

Deoxynukleotidy

deoxyadenosinmonofosfát dAMP	deoxyadenosindifosfát dADP	deoxyadenosintrifosfát dATP
deoxyguanosinmonofosfát dGMP	deoxyguanosindifosfát dGDP	deoxyguanosintrifosfát dGTP
deoxythymininmonofosfát dTMP	deoxythymidindifosfát dTDP	deoxythymidintrifosfát dTTP
deoxycytidinmonofosfát dCMP	deoxycytidindifosfát dCDP	deoxycytidintrifosfát dCTP

Koenzymy, jejichž součástí je nukleotid

• aktivní sulfát (adenosin-3'-fosfát-5'-fosfosulfát)
• aktivní methionin (S-adenosylmethionin)
• aminoacyladenyláty
• nikotinamidadenindinukleotid (NAD⁺)
• nikotinamidadenindinukleotidfosfát (NADP⁺)
• flavinadenindinukleotid (FAD)
• koenzym A

Související články

• polynukleotidy

Literatura

• MURRAY, Robert K., et al. Harperova biochemie. Z angl. 23. vyd. přel. Jiří Kraml et al. 4. vyd. v ČR. Praha: H & H, 2002. ix, 872 s. ISBN 80-7319-013-3.
• MURRAY, Robert K., et al. Harperova biochemie. Z angl. 23. vyd. přel. Jiří Kraml et al. 3. vyd. v ČR. Praha: H & H, 2001. ix, 872 s. ISBN 80-7319-003-6.
• MURRAY, Robert K., et al. Harperova biochemie. Z angl. 23. vyd. přel. Jiří Kraml et al. 2. vyd. v ČR. Praha: H & H, 1996. ix, 872 s. ISBN 80-85787-38-5.

Galerie nukleotid na Wikimedia Commons