Přeskočit na obsah

John M. Jumper

Z Wikipedie, otevřené encyklopedie
John Jumper
Jumper v roce 2024
Jumper v roce 2024
Rodné jménoJohn Michael Jumper
Narození1985 (38–39 let)[1]
Little Rock, Arkansas, Spojené státy americkéSpojené státy americké Spojené státy americké[1]
Alma mater
PracovištěGoogle
DeepMind
Oboryumělá inteligence
strojové učení
Známý díkyAlphaFold
OceněníNature's 10 (2021)
Cena BBVA Foundation Frontiers of Knowledge (2022)
Průlomová cena ve vědách o životě (2023)
Nobelova cena za chemii (2024)
Některá data mohou pocházet z datové položky.

John Michael Jumper (* 1985, Little Rock)[1] je americký chemik a počítačový vědec. V současné době působí jako ředitel ve společnosti Google DeepMind.[2][3][4] On a jeho kolegové vytvořili AlphaFold,[5] model umělé inteligence (AI), který s vysokou přesností předpovídá struktury proteinů z jejich aminokyselinové sekvence.[6] Uvedl, že tým AlphaFold plánuje uvolnit 100 milionů struktur proteinů.[7]

Vědecký časopis Nature ho v roce 2021 zařadil ve svém každoročním seznamu Nature's 10 mezi deset „lidí, na kterých záleželo“ ve vědě.[6][8] On a Demis Hassabis si rozdělili polovinu Nobelovy ceny za chemii za rok 2024 za předpovědi struktur proteinů.[9][10]

Vzdělání

[editovat | editovat zdroj]

Jumper získal bakalářský titul se specializací na fyziku a matematiku na Vanderbiltově univerzitě v roce 2007,[11] magisterský titul v teoretické fyzice kondenzovaného stavu na Cambridgeské univerzitě v roce 2010 v rámci Marshallova stipendia,[12] magisterský titul v teoretické chemii z Chicagské univerzity v roce 2012 a doktorát filozofie v teoretické chemii z Chicagské univerzity v roce 2017.[13] Jeho doktorandy na Chicagské univerzitě byli Tobin R. Sosnick a Karl Freed.[14]

Jumperův výzkum zkoumá algoritmy pro předpovědi struktury proteinů.[2]

Související informace naleznete také v článku AlphaFold.
Tento obrázek představuje konečný produkt AlphaFoldu a porovnává jeho výsledky s ostatními konkurenty v soutěži CASP

AlphaFold[5][15] je algoritmus hlubokého učení vyvinutý Jumperem a jeho týmem v DeepMind, výzkumné laboratoři získané mateřskou společností Google Alphabet Inc. Jedná se o program umělé inteligence, který provádí předpovědi struktury proteinů.[16]

Ocenění a vyznamenání

[editovat | editovat zdroj]

V listopadu 2020 byl AlphaFold jmenován vítězem 14. soutěže Critical Assessment of Structure Prediction (CASP).[17][18][19] Tato mezinárodní soutěž srovnává algoritmy, aby určila, který z nich může nejlépe předpovědět 3D strukturu proteinů. AlphaFold soutěž vyhrál a předčil ostatní algoritmy, když dosáhl více než 90 bodů pro přibližně dvě třetiny proteinů v testu globální vzdálenosti (GDT) CASP, testu, který měří míru, do jaké je struktura předpovídaná výpočetním programem podobná struktuře určené laboratorním experimentem, přičemž 100 je úplná shoda v rámci mezní hodnoty vzdálenosti používané pro výpočet GDT.[20][21]

V roce 2021 mu byla udělena cena BBVA Foundation Frontiers of Knowledge v kategorii „Biologie a biomedicína“.[22] V roce 2022 obdržel cenu Deborah Wileyové v biomedicínských vědách[23] a v roce 2023 průlomovou cenu ve vědách o životě za vývoj AlphaFold, který přesně předpovídá strukturu proteinu.[24] V roce 2023 mu byla udělena cena Canada Gairdner International Award[25] a cena Alberta Laskera za základní lékařský výzkum.[26]

V roce 2024 si s Demisem Hassabisem rozdělili polovinu Nobelovu cenu za chemii za své předpovědi skládání proteinů, druhou polovinu získal David Baker za výpočetní návrh proteinů.[9][10]

V tomto článku byl použit překlad textu z článku John M. Jumper na anglické Wikipedii.

  1. a b c The Nobel Prize in Chemistry 2024. NobelPrize.org [online]. [cit. 2024-10-14]. Dostupné online. (anglicky) 
  2. a b John Jumper. scholar.google.com [online]. [cit. 2024-10-14]. Dostupné online. 
  3. Europe PMC. europepmc.org [online]. [cit. 2024-10-14]. Dostupné online. 
  4. EISENSTEIN, Michael. Artificial intelligence powers protein-folding predictions. Nature. 2021-11-23, roč. 599, čís. 7886, s. 706–708. Dostupné online [cit. 2024-10-14]. DOI 10.1038/d41586-021-03499-y. (anglicky) 
  5. a b JUMPER, John; EVANS, Richard; PRITZEL, Alexander. Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold. Nature. 2021-07-15. Dostupné online. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/S41586-021-03819-2. 
  6. a b MAXMEN, Amy. Nature's 10: John Jumper: Protein predictor. Nature. Springer Nature, 2021, s. 591–604. DOI 10.1038/d41586-021-03621-0. PMID 34912110. 
  7. BROWNE, Grace. DeepMind’s AI has finally shown how useful it can be. Wired. Dostupné online [cit. 2024-10-14]. ISSN 1059-1028. (anglicky) 
  8. John Jumper na LinkedIn
  9. a b The Nobel Prize in Chemistry 2024. NobelPrize.org [online]. [cit. 2024-10-14]. Dostupné online. (anglicky) 
  10. a b The Nobel Prize in Chemistry 2024. NobelPrize.org [online]. [cit. 2024-10-14]. Dostupné online. (anglicky) 
  11. AUG 8, Stephen Doster; 2023; PM, 3:42. John Jumper, developer of AlphaFold, to present an Apex Lecture on August 30. Vanderbilt University [online]. [cit. 2024-10-14]. Dostupné online. (anglicky) 
  12. University of Cambridge alumni awarded 2024 Nobel Prize in Chemistry | University of Cambridge. www.cam.ac.uk [online]. 2024-10-09 [cit. 2024-10-14]. Dostupné online. (anglicky) 
  13. UChicago alum John Jumper shares Nobel Prize for model to predict protein structures | University of Chicago News. news.uchicago.edu [online]. 2024-10-09 [cit. 2024-10-14]. Dostupné online. (anglicky) 
  14. JUMPER, John Michael. New Methods Using Rigorous Machine Learning for Coarse-Grained Protein Folding and Dynamics. 2017 [cit. 2024-10-14]. University of Chicago. Dostupné online.
  15. SENIOR, Andrew W.; EVANS, Richard; JUMPER, John. Improved protein structure prediction using potentials from deep learning. Nature. 2020-01, roč. 577, čís. 7792, s. 706–710. Dostupné online [cit. 2024-10-14]. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/s41586-019-1923-7. (anglicky) 
  16. AlphaFold. Deepmind [online]. 2024-10-09 [cit. 2024-10-14]. Dostupné online. (anglicky) 
  17. AlphaFold: a solution to a 50-year-old grand challenge in biology. Google DeepMind [online]. 2024-10-09 [cit. 2024-10-14]. Dostupné online. (anglicky) 
  18. SAMPLE, Ian; EDITOR, Ian Sample Science. Google's DeepMind predicts 3D shapes of proteins. The Guardian. 2018-12-02. Dostupné online [cit. 2024-10-14]. ISSN 0261-3077. (anglicky) 
  19. SHEAD, Sam. DeepMind solves 50-year-old ‘grand challenge’ with protein folding A.I.. CNBC [online]. 2020-11-30 [cit. 2024-10-14]. Dostupné online. (anglicky) 
  20. DeepMind’s protein-folding AI has solved a 50-year-old grand challenge of biology. MIT Technology Review [online]. [cit. 2024-10-14]. Dostupné online. (anglicky) 
  21. SERVICE, Robert F. 'The game has changed.' AI triumphs at solving protein structures [online]. Science, 2020-11-30. Dostupné online. 
  22. Find out about the BBVA Foundation Frontiers of Knowledge Award.. Premios Fronteras [online]. [cit. 2024-10-14]. Dostupné online. (anglicky) 
  23. Home. Wiley Foundation [online]. [cit. 2024-10-14]. Dostupné online. (anglicky) 
  24. Breakthrough Prize – Winners Of The 2023 Breakthrough Prizes In Life Sciences, Mathematics And Fundamental Physics Announced. breakthroughprize.org [online]. [cit. 2024-10-14]. Dostupné online. (anglicky) 
  25. FOUNDATION, The Gairdner. 2023 Canada Gairdner Award Winners Announced. The Gairdner Foundation [online]. 2023-03-30 [cit. 2024-10-14]. Dostupné online. (anglicky) 
  26. ADMIN, Lasker. AlphaFold—for predicting protein structures. Lasker Foundation [online]. [cit. 2024-10-14]. Dostupné online. (anglicky)