Rodák z pražského Žižkova, který hrál v 16 letech za studentskou XI. Žižkova, v dorostu bojoval ve Slavoji Žižkov a ve 22 letech byl získán pražskou Slavií[1]. V jejím ligovém týmu se začal objevovat až v sezóně 1935/1936, kdy odehrál dvě utkání, celkově se v A-týmu v sešívaném dresu objevil včetně přípravných utkání 15x. V roce 1936 zamířil do Pardubic (spolu se slávistickými spoluhráči Heřmánkem a Klusem), aby místnímu SK pomohl v divizi českého venkova k vybojování postupu do 1. ligy.
To se také podařilo a Zoubek se stal jedním z hráčů, kteří v SK Pardubice prošli všemi ligovými sezónami. K posledním třem zápasům nastoupil v poválečné sezóně 1945/1946, po které jeho klub ze soutěže sestoupil. O rok později se ještě objevil jako hráč v klubu Kampa Pardubice. Už v roce 1940 byl pověřen trénováním mužstva[2], po válce vedl i pardubický Slavoj. Po skončení kariéry se usadil v Pardubicích.
V československé lize hrál za Slavii Praha (1935–1936) a SK Pardubice (1937–1946). V lize nastoupil v 135 utkáních a dal 9 gólů.
