Acidobacteria

Z Wikipedie, otevřené encyklopedie
Skočit na navigaci Skočit na vyhledávání
Jak číst taxoboxAcidobacteria
alternativní popis obrázku chybí
Vědecká klasifikace
Doménabakterie (Bacteria)
KmenAcidobacteria
ŘádAcidobacteriales
ČeleďAcidobacteriaceae
Rody
Některá data mohou pocházet z datové položky.

Acidobacteria je kmen bakterií.[1][2] Jak naznačuje jméno, jsou především acidofilní (žijí v kyselém prostředí). Tento kmen byl popsán teprve v roce 1997 [3] a první genom byl osekvenován v roce 2007. [4] Díky náročné kultivaci zástupců Acidobacteria nebylo získáno větší množství izolovaných druhů i přesto, že se jedná o diverzní kmen. V roce 2016 bylo popsáno 23 typových druhů v taxonomických podskupinách GP 1, 3, 4, 8, 10, 23.[5] Genomová analýza naznačuje jejich význam při rozkladu uhlíkatých sloučenin a význam v cyklu dusíku.[6]

Zdá se však, že acidobakterie mají významnou roli v nejrůznějších ekosystémech, ve kterých se vyskytují ve vyšších počtech. Jedná se např. o půdu [7] nebo rozkládající se dřevo.[8]

Druh acidobakterie Silvibacterium bohemicum pocházející ze Šumavy byl popsán v Česku.[9]

Externí odkazy[editovat | editovat zdroj]

Reference[editovat | editovat zdroj]

V tomto článku byl použit překlad textu z článku Acidobacteria na anglické Wikipedii.

  1. Barns SM, Cain EC, Sommerville L, Kuske CR. Acidobacteria phylum sequences in uranium-contaminated subsurface sediments greatly expand the known diversity within the phylum. Appl. Environ. Microbiol.. 2007, čís. 9, s. 3113–6. Dostupné online. 
  2. Quaiser A, Ochsenreiter T, Lanz C, et al. Acidobacteria form a coherent but highly diverse group within the bacterial domain: evidence from environmental genomics. Mol. Microbiol.. 2003, roč. 50, čís. 2, s. 563–75. 
  3. Kuske CR, Barns SM, Busch JD. Appl. Environ. Microbiol.. 1997, roč. 63, čís. 9, s. 3614–21. Dostupné online. 
  4. WARD, Naomi L.; CHALLACOMBE, Jean F.; JANSSEN, Peter H. Three Genomes from the Phylum Acidobacteria Provide Insight into the Lifestyles of These Microorganisms in Soils. Applied and Environmental Microbiology. 2009-02-05, roč. 75, čís. 7, s. 2046–2056. Dostupné online [cit. 2021-01-10]. ISSN 0099-2240. DOI:10.1128/aem.02294-08. 
  5. KIELAK, Anna M.; BARRETO, Cristine C.; KOWALCHUK, George A. The Ecology of Acidobacteria: Moving beyond Genes and Genomes. Frontiers in Microbiology. 2016-05-31, roč. 7. Dostupné online [cit. 2021-01-10]. ISSN 1664-302X. DOI:10.3389/fmicb.2016.00744. PMID 27303369. 
  6. EICHORST, Stephanie A.; TROJAN, Daniela; ROUX, Simon. Genomic insights into the Acidobacteria reveal strategies for their success in terrestrial environments: Genomic insights into acidobacteria. Environmental Microbiology. 2018-03, roč. 20, čís. 3, s. 1041–1063. Dostupné online [cit. 2021-01-10]. DOI:10.1111/1462-2920.14043. PMID 29327410. (anglicky) 
  7. SAIT, Michelle; HUGENHOLTZ, Philip; JANSSEN, Peter H. Cultivation of globally distributed soil bacteria from phylogenetic lineages previously only detected in cultivation-independent surveys. Environmental Microbiology. 2002-12-09, roč. 4, čís. 11, s. 654–666. Dostupné online [cit. 2021-01-10]. ISSN 1462-2912. DOI:10.1046/j.1462-2920.2002.00352.x. 
  8. KULICHEVSKAYA, Irina S.; KOSTINA, Lilia A.; VALÁŠKOVÁ, Vendula. Acidicapsa borealis gen. nov., sp. nov. and Acidicapsa ligni sp. nov., subdivision 1 Acidobacteria from Sphagnum peat and decaying wood. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2012-07-01, roč. 62, čís. Pt_7, s. 1512–1520. Dostupné online [cit. 2021-01-10]. ISSN 1466-5026. DOI:10.1099/ijs.0.034819-0. (anglicky) 
  9. LLADÓ, Salvador; BENADA, Oldrich; CAJTHAML, Tomáš. Silvibacterium bohemicum gen. nov. sp. nov., an acidobacterium isolated from coniferous soil in the Bohemian Forest National Park. Systematic and Applied Microbiology. 2016-02, roč. 39, čís. 1, s. 14–19. Dostupné online [cit. 2021-01-10]. DOI:10.1016/j.syapm.2015.12.005. (anglicky)