Amoebozoa

Z Wikipedie, otevřené encyklopedie
Skočit na: Navigace, Hledání

Wikipedie:Jak číst taxobox Amoebozoa

Arcella sp.
Arcella sp.
Vědecká klasifikace
Doména: Eukaryota
Říše: Amoebozoa
Lühe, 1913 emend.
Sesterská skupina
Opisthokonta

Amoebozoa či česky měňavkovci[1] je jedna z šesti skupin, na něž se dělí doména Eukaryota (jaderní). Počtem druhů jde o nejméně početnou skupinu. Je pojmenovaná podle toho, že se k ní řadí velké množství organismů amébovitého (měňavkovitého) typu.[2]

Popis[editovat | editovat zdroj]

Pro Amoebozoa jsou typické panožky, tedy organely pohybu. Ten je způsobován v podstatě polymerizací a depolymerizací aktinu. Panožky jsou vždy lobopodiového či filopodiového typu, nikdy však nejde o axopodie ani typické retikulopodie.

Pokud tyto organismy mají mitochondrie, pak vždy s tubulárními kristami. Jedna ze skupin však mitochondrie druhotně ztratila.

Je pravděpodobné, že společný předek Amoebozoa měl jeden bičík; proti tomu však mluví skutečnost, že většina měňavkovců má dnes bičíky dva.[2]

Na povrchu bývají kryty šupinami či schránkou, které zvyšují jejich odolnost.

Klasifikace[editovat | editovat zdroj]

Amoebozoa v současném pojetí byli vyčleněni od ostatních měňavkovitých eukaryot teprve na konci 20. století.[3] Brzy poté však byli protistology uznáni jako jedna ze základních superskupin domény Eukarya.[4]

První komplexnější fylogenetické systémy podložené molekulárními daty navrhli Thomas Cavalier-Smith[5] a Alexej V. Smirnov[6]. Druhý systém brzy získal podporu a stal se, zejména pro nebičíkaté měňavkovce, standardem přebíraným i jinými systémy.[4]

Moderní systém[editovat | editovat zdroj]

V r. 2011 byla vydána revidovaná klasifikace, na které spolupracovali autoři předchozích systémů. Systém navazuje na systém eukaryot dle Thomase Cavaliera-Smithe, bere tedy Amoebozoa jako kmen. Vypadá následovně:[7]

  • (Třída) Breviatea – rod Breviata[pozn. 1]
  • Podkmen LOBOSA
    • Třída Tubulinea (=Lobosea) (lalokonozí)
      • Řád Euamoebida
        • Čeleď Amoebidae – rody Amoeba, Chaos, Polychaos, Parachaos, Trichamoeba, Deuteramoeba, Hydramoeba
        • Čeleď Hartmannellidae – rody Cashia, Copromyxa, Copromyxella, Glaeseria, Hartmannella, Saccamoeba
      • Řád Arcellinida
      • Řád Leptomyxida
        • Čeleď Leptomyxidae – rody Leptomyxa, Rhizamoeba
        • Čeleď Flabellulidae – rody Flabellula, Paraflabellula
        • Čeleď Gephyramoebidae – rod Gephyramoeba
      • Řád Nolandida (=Poseidonida)
        • Čeleď Nolandellidae – rod Nolandella
      • Řád Echinamoebida
        • Čeleď Echinamoebidae – rod Echinamoeba
        • Čeleď Vermamoebidae – rod Vermamoeba
    • Třída Discosea
      • Podtřída Flabellinia
        • Řád Dactylopodida
          • Čeleď Paramoebidae – rody Paramoeba, Korotnevella
          • Čeleď Vexilliferidae – rody Vexillifera, Neoparamoeba, Pseudoparamoeba
        • Řád Vannellida
          • Čeleď Vannellidae – rody Vannella, Clydonella, Lingulamoeba, Pessonella, Ripella
        • Řád Himatismenida
          • Podřád Tectiferina
            • Čeleď Cochliopodiidae (=Cochliopodidae) – rody Cochliopodium, Ovalopodium
            • Čeleď Goceviidae – rody Gocevia, Paragocevia, Endostelium
          • Podřád Parvamoebina
            • Čeleď Parvamoebidae – rod Parvamoeba
        • Řád Stygamoebida
          • Čeleď Stygamoebidae – rody Stygamoeba, Vermistella
        • Řád Pellitida
          • Čeleď Pellitidae – rod Pellita
        • Řád Trichosida
          • Čeleď Trichosidae – rod Trichosphaerium
      • Podtřída Longamoebia
        • Řád Dermamoebida
          • Čeleď Mayorellidae – rod Mayorella
          • Čeleď Dermamoebidae – rody Dermamoeba, Paradermamoeba
        • Řád Thecamoebida
          • Čeleď Thecamoebidae – rody Thecamoeba, Sappinia, Stenamoeba
        • Řád Centramoebida
          • Čeleď Acanthamoebidae – rody Acanthamoeba, Protacanthamoeba
          • Čeleď Balamuthiidae – rod Balamuthia
      • Discosea incertae sedis:
        • Čeleď Hyalodiscidae – rod Hyalodiscus
        • Čeleď Stereomyxidae – rody Stereomyxa, Corallomyxa
  • Podkmen CONOSA (P)
    • Třída Variosea
      • Řád Varipodida1
        • Čeleď Filamoebidae – rody Filamoeba, Flamella
        • Čeleď Acramoebidae – rody Acramoeba, Grellamoeba
      • Řád Phalansteriida
        • Čeleď Phalansteriidae – rod Phalansterium
      • Řád Holomastigida
        • Čeleď Multiciliidae – rod Multicilia
    • Třída Archamoebea (panoženky)[9]
      • Řád Pelobiontida
        • Čeleď Entamoebidae – rody Entamoeba, Endamoeba
        • Čeleď Mastigamoebidae (dříve vyčleňována do zvláštního řádu Mastigamoebida) – rody Endolimax (dříve řazen do zvláštní čeledi Endolimacidae), Iodamoeba, Mastigella, Mastigamoeba, Mastigina, Phreatamoeba
        • Čeleď Pelomyxidae – rod Pelomyxa
        • Čeleď Rhizomastixidae - rod Rhizomastix
    • Třída Mycetozoa2 (=Eumycetozoa) (hlenky) (P)
      • Podtřída Protostelia3 (=Protostelea) (P)
        • Řád Protostelida (=Protosteliida) (P) – rody Cavostellium, Ceratiomyxa, Ceratiomyxella, Microglomus, Nematostelium, Protostelium, Tychosporium
      • Podtřída Myxogastria (=Myxogastrea =Myxomycetes)
        • Řád Myxogastrida – rody Arcyria, Badhamia, Barbyella, Brefeldia, Comatricha, Cribraria, Diachea, Diderma, Didymium, Echinostelium, Fuligo, Lamproderma, Leocarpus, Lepidoderma, Licea, Lycogala, Macbrideola, Metatrichia, Perichaena, Physarella, Physarum, Stemonitis, Trichia, Tubulifera, Willkommlangea
      • Podtřída Dictyostelia
        • Řád Dictyostelida – rody Acytostelium, Dictyostelium, Polysphondylium

Poznámky:

1 Namísto řádu Varipodida se někdy uvádějí 2 řády:[10]

  • Řád Fractovitellida
    • Čeleď Soliformoviidae – rody Soliformovum, Grellamoeba
  • Řád Gracilipodida
    • Čeleď Flamellidae – rody Flammella, Arachnula

2,3 Namísto třídy Mycetozoa se někdy uvádí užší, ale přirozená:[11]

  • Třída Macromycetozoa
    • Podtřída Myxogastria
    • Podtřída Dictyostelia (včetně Ceratiomyxa)

a namísto nepřirozené (možná i polyfyletické) podtřídy Protostelia přirozené klady:[12]

  • protosteliidní klad – rody Protostelium, Planoprotostelium
  • schizoplasmodiidní klad – rody Schizoplasmodium, Ceratiomyxella, Nematostelium
  • soliformoviidní klad – rod Soliformovum
  • cavosteliidní klad – rody Schizoplasmodiopsis, Tychosporium
  • protosporangiidní klad – rody Protosporangium, Clastostelium, Ceratiomyxa

Fylogenetický strom[editovat | editovat zdroj]

Výše uváděný systém byl publikován s tím, že zdaleka není potvrzena holofyletičnost jednotlivých taxonů, jak ukazují už variantní návrhy v poznámkách. Ty nejproblematičtější taxony jsou označeny symbolem (P), značícím velkou pravděpodobnost nepřirozenosti (parafyletičnost či dokonce polyfyletičnost skupiny), přesto dosud podle autorů nebyla spolehlivě vyloučena ani potenciální přirozenost všech uváděných taxonů.[7] Za dostatečně prokázanou lze považovat holofyletičnost pouze tří skupin vyšší úrovně než řád, a sice Tubulinea, Archamoebea a Myxogastrea,[10] s menší jistotou pak i u Macromycetozoa[11] (s tím, že není jasné, jaké klady z původních protostelidních hlenek do ní budou spadat[12]).

Následující fylogenetický strom je proto nutno považovat za jeden z možných, u kterého však mohou s dalším fylogenetickým výzkumem nastat podstatné změny. Větve, u kterých je přirozenost nejspornější, jsou označeny symbolem (P).

Amoebozoa
 Breviatea 

Breviata




 Mycetozoa (P)

Protostelida (P)


 Macromycetozoa 

Dictyostelida



Myxogastrea




 Archamoebea 

Mastigamoebida



Pelobiontida






Variosea (P)


 Lobosa 

Tubulinea



Discosea (P)







Poznámky[editovat | editovat zdroj]

  1. Některé molekulární fylogenetické studie vyčleňují Breviata spolu se sesterskou Subulatomonas a několika environmentálními vzorky do společné skupiny mimo Amoebozoa, a to buď jako bazální klad opisthokont, nebo bazální klad apusozoí nebo jako samostatný základní klad eukaryot.[8]

Reference[editovat | editovat zdroj]

  1. Amoebozoa na biolib.cz
  2. a b ČEPIČKA, Ivan; NEUSTUPA, Jiří; HAMPL, Vladimír. Protistologie: Amoebozoa [online]. Univerzita Karlova, přírodovědná fakulta: . Dostupné online.  
  3. CAVALIER-SMITH, Thomas. A revised six-kingdom system of life. Biol. Rev.. 1998, svazek 73, čís. 3, s. 203-266. Dostupné online. PMID 9809012. (anglicky) 
  4. a b ADL, Sina M., et al. The New Higher Level Classification of Eukaryotes with Emphasis on the Taxonomy of Protists. Journal of Eukaryotic Microbiology. 2005, roč. 52, čís. 5, s. 399-451. Dostupné online. (anglicky) 
  5. CAVALIER-SMITH, Thomas; CHAO, Ema E.-Y.; OATES, Brian. Molecular phylogeny of Amoebozoa and evolutionary significance of the unikont Phalansterium. European Journal of Protistology.. 4. květen 2004, svazek 40, čís. 1, s. 21-48. Dostupné online. ISSN 0932-4739. DOI:10.1016/j.ejop.2003.10.001. (anglicky) 
  6. SMIRNOV, Alexey V.; NASSONOVA, Elena; PAWLOWSKI, Jan, Berney Cédric, Fahrni José, Bolivar Ignacio. Molecular Phylogeny and Classification of the Lobose Amoebae,. Protist. 12. červenec 2005, svazek 156, čís. 2, s. 129-142. Dostupné online. ISSN 1434-4610. DOI:10.1016/j.protis.2005.06.002. (anglicky) 
  7. a b SMIRNOV, Alexey V.; CHAO, Ema E.; NASSONOVA, Elena S., CAVALIER-SMITH Thomas. Revised Classification of Naked Lobose Amoebae (Amoebozoa: Lobosa). Protist. 28. červenec 2011, svazek 162, čís. 4, s. 545-570. Dostupné online. ISSN 1434-4610. DOI:10.1016/j.protis.2011.04.004. (anglicky) 
  8. KATZ, Laura A.; GRANT, Jessica; WEGENER PARFREY, Laura, Anastasia Gant, Charles J. O’Kelly, O. Roger Anderson, Robert E. Molestina, Thomas Nerad. Subulatomonas tetraspora nov. gen. nov. sp. is a Member of a Previously Unrecognized Major Clade of Eukaryotes. Protist. 1. červenec 2011, svazek 162, čís. 5, s. 762-773. Dostupné online. ISSN 1434-4610. DOI:10.1016/j.protis.2011.05.002. (anglicky) 
  9. PTÁČKOVÁ, Eliška; KOSTYGOV, Aleksej Ju.; ČISŤJAKOVOVÁ, Ljudmila V., FALTEISEK, Lukáš; FROLOV, Aleksander O.; PATTERSON, David J.; WALKER, Giselle; ČEPIČKA, Ivan. Evolution of Archamoebae: Morphological and Molecular Evidence for Pelobionts Including Rhizomastix, Entamoeba, Iodamoeba, and Endolimax. Protist [online]. , 9. leden 2013, svazek 164, čís. 3, s. 380-410. Dostupné online. ISSN 1434-4610. DOI:10.1016/j.protis.2012.11.005. PMID 23312407.  (anglicky) 
  10. a b LAHR, Daniel J. G.; GRANT, Jessica; NGUYEN, Truc, Jian Hua Lin, Laura A. Katz. Comprehensive Phylogenetic Reconstruction of Amoebozoa Based on Concatenated Analyses of SSU-rDNA and Actin Genes. PLoS ONE [online]. , červenec 2011, svazek 6, čís. 7, e22780. Dostupné online. ISSN 1932-6203. DOI:10.1371/journal.pone.0022780.  (anglicky) 
  11. a b FIORE-DONNO, Anna Maria; NIKOLAEV, Sergey I.; NELSON, Michaela, Jan Pawlowski, Thomas Cavalier-Smith, Sandra L. Baldauf. Deep Phylogeny and Evolution of Slime Moulds (Mycetozoa). Protist. 5. srpen 2009, svazek 161, čís. 1, s. 55-70. Dostupné online. ISSN 1434-4610. DOI:10.1016/j.protis.2009.05.002. (anglicky) 
  12. a b SHADWICK, Lora L.; SPIEGEL, Frederick W.; SHADWICK, John D. L., Brown Matthew W., Silberman Jeffrey D. Eumycetozoa = Amoebozoa?: SSUrDNA Phylogeny of Protosteloid Slime Molds and Its Significance for the Amoebozoan Supergroup. PLoS ONE [online]. , srpen 2009, svazek 4, čís. 8, e6754. Dostupné online. ISSN 1932-6203. DOI:10.1371/journal.pone.0006754.  (anglicky)